Thiomicrospira aerophila: THIAE_00170
Help
Entry
THIAE_00170 CDS
T03589
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
tao
Thiomicrospira aerophila
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
Cadherin_4
Big_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHF02168
UniProt:
W0DY43
LinkDB
All DBs
Position
40347..43406
Genome browser
AA seq
1019 aa
AA seq
DB search
MEPTIIVNSITGQAEIRNANGEIQAIQAGDNLALGDVLVINQDSIVFLNVDGTILPFYGE
LELDVVANMQPTQAFDMDDVALNDPAVAEMLAILDGEGDLLDELEAPAAGAGVDEDGVDD
SLVRLVRVAESTDPLVFESFAAEDATTPTFDPVTATALNTDEEETAVVIIPSSIDVAMAD
VYSGNMFAVPVTGTTTGVAAGSTVIITVTDDFGNSVNGSAIVNEDGSYSTTIDFSNPNPG
SDSESFNGEQFIDQEPLLVIQPPSQPILLDGPLTVIAEVEDLNLVVINADNTAMMDTIAE
PGIVIIDDITADDIINIVESNSQITVTGTASGGDISVGDPFTAVINGNSYDGTVGENGAI
SFVVAGADLAVDKEFTISVTSSDAAGNTVVSTGTSTHTVDLEINLVNDVNTATFGSVIAS
NDDTNLLANDDEDVIAVTSVNGQSVGSEPVVVNGNFGTLTVNSDGSYSYQSTAEIKLYGF
NDGDSKLADGSILNMLTPQAMHEVSFQRDGVGVKGMGSYSSHGAPNQIIDTGNALVADLG
GTATKASFDVTRLFKTEATGELGKWYAYSSDGTLVGSGEFGRDGENGFTFKSGSNHEGTV
NIDIAGGFQYLAFEGLPYENSTNTRDGGDFFVSNIRVVDSFEYTAVDAAGNSSTATLDIT
KTQELKNLVNSLPELPNTAIPEISFDVTSEEVSNTTTISSTAKQVLNYGGGNGSKVSHEI
KLGSEADEITLNIKLTGNGSATGTVTFYKDGEKVGETSLANGNQSYSVNDGVFDSVLITH
TGTPGNGNSAIHLEGYSATVSASGFVNTITIKASVDGALLSDVEVAGLAGFNGSYALADD
GSLTYTFISEEALTPEDIAGITATISALNEGGEVLATTTTNAAGDLTIVGGDANDVISGG
AGDDILTGGAGDDILTGGAGDDVFVWTLDDVVAGQTFVDTITDFGNGADKIDVSDLLPDG
VTSDNISQYISFSSDGTDTTLSITTEVNGQQSTQEIVLQGYEVTSHEQLLSYLANIPTE
NT seq
3060 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaccgactatcattgtaaacagtatcactggccaagcggaaattcgtaacgccaat
ggcgagatccaagcgattcaagcaggcgataaccttgcgctaggcgacgtgttggtaatt
aaccaagacagcatcgtatttttaaatgtcgatggtacgattttacccttttatggtgag
ctagagctagatgtagtcgctaacatgcagccaacacaggctttcgatatggatgatgtt
gcgctgaatgatccagcggtagcggaaatgttggctattcttgatggcgaaggtgatcta
ctagatgaattagaagcaccagcagcaggcgccggtgttgatgaagacggtgtggacgat
agtttagtgcgcctagttcgtgttgccgagtccacagatccgcttgtgtttgagagtttt
gcggctgaagatgccacaaccccaacttttgatcctgtcacggctacagcgttaaataca
gacgaagaagaaacagcagtagttattattccttcaagcatcgatgtagctatggcagat
gtctatagcggtaacatgtttgctgttccagtaaccggaaccactactggcgttgccgcc
ggttcaactgtaatcattacggtgacagacgactttggtaacagtgtaaatgggtcggcc
attgttaatgaggatggcagttactcaacaactatcgatttttcgaatccaaacccaggc
tcagatagcgagtcttttaatggtgagcagttcattgatcaagaacctctacttgtgatt
caaccaccctcacagccaattttgcttgatgggccgttaactgttattgcagaggttgaa
gacttaaaccttgttgtaatcaacgctgataatacagcgatgatggatacgattgcagaa
ccaggcattgttattattgatgacattacagcagatgacatcatcaacattgtagagagt
aattcacaaataactgtaacaggaacggcttcgggtggtgatatatctgtaggtgatcca
tttacagcagtaataaatggaaattcttatgatggaacagttggtgaaaacggagctata
agttttgttgtagcaggtgctgatcttgcagttgataaagaatttacgattagtgttaca
tcgagtgatgcagcaggtaatacagttgtgagcacgggaacatcaacacatacagtagat
cttgaaattaacctagtcaatgatgttaacactgcaacatttggtagcgttattgcaagc
aatgatgatacaaatcttttggccaatgacgatgaagacgtaattgccgttacgtcagtt
aatggtcagtcagtggggtctgagccagtagttgtaaacggcaacttcggtaccttgaca
gttaacagtgatggctcatacagctatcaatctacagcggaaataaagctgtacgggttt
aatgatggtgacagcaaattggctgacggttctattttaaatatgctaacaccacaagcc
atgcacgaagtgtcattccaaagagatggcgtaggtgttaaaggaatgggtagttactca
tcacatggtgccccaaaccagatcattgatacaggcaacgcattagttgctgatttaggc
ggcacggctacaaaagcatcttttgatgtgacgcgtttattcaaaactgaagctacaggt
gaactaggtaaatggtacgcttacagctcggacggaacgctcgttggttcaggtgaattt
gggcgtgatggtgaaaatggttttacgtttaaatcaggaagcaaccatgagggtacggtt
aatattgacatagcgggtggattccaatatcttgcgttcgagggattgccttacgagaac
tctaccaacactagagacggtggtgatttctttgtaagtaatatccgtgtggttgactca
tttgaatacacggctgttgatgcggctggcaattcaagtaccgcaaccctagatattact
aaaacgcaggaattgaaaaatctagtaaacagcttaccagaattgcctaacacagctatt
ccagaaatttcatttgatgtaacaagcgaggaagtgagcaatacaactacaatttcatca
actgcaaagcaagttttaaactatggcggtggtaatggttcgaaagtatcacacgaaatt
aagcttggctctgaagcagatgagattacgctaaacattaaattgaccggaaatggcagt
gcgacaggcacggttacattttataaggatggcgaaaaagttggtgaaacctctttagcg
aatggtaaccaatcctatagtgtcaatgatggtgtctttgactccgttttaatcacccat
actggaacacctggaaatggcaattccgcaattcatttagaagggtatagcgccactgta
tctgcgtctgggtttgtcaataccattacgataaaagcaagtgtcgatggtgcgttgttg
agtgatgtcgaagtagccgggttagctggtttcaacggaagctatgctctagcagatgac
ggcagtttgacttacacatttattagtgaagaagcgctcacgccagaggatattgctggt
attacagccacaatctcggcattaaatgagggcggtgaagttttagctacaactactaca
aatgcagcgggtgatttgacgatagtgggcggtgatgcaaatgatgttatctctggtggt
gccggtgatgatatcctaaccggtggtgccggtgatgatatcctaaccggtggtgccggt
gatgacgtgtttgtttggactcttgacgacgttgttgcaggtcaaacctttgttgatacc
atcaccgactttggtaatggagccgacaagattgatgtaagtgatttgttacctgatggt
gtaacgagtgataatattagccaatatatttctttctcttcggatggaacagatactaca
ttgagcatcacgacagaagtaaatggacagcaatccacgcaggaaattgtgttgcagggt
tatgaagttactagccatgagcaattattgagttatttggctaacatcccaactgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
