Trichoderma asperellum: 36613362
Help
Entry
36613362 CDS
T10296
Symbol
TrAFT101_003190
Name
(RefSeq) uncharacterized protein
KO
K06236
collagen type I alpha
Organism
tasp Trichoderma asperellum
Pathway
tasp04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tasp00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
36613362 (TrAFT101_003190)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
tasp00536
]
36613362 (TrAFT101_003190)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
tasp00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
36613362 (TrAFT101_003190)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
WSC
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
36613362
NCBI-ProteinID:
XP_065982918
LinkDB
All DBs
Position
2:join(2637142..2637296,2637351..2638504,2638550..2640324)
Genome browser
AA seq
1027 aa
AA seq
DB search
MAVISKLLPVAAVLLGCVNNAAALAVREPVDRLDTYYRVEIGPGFTKTTSSLTDLASKHG
SAGIGKRGQEDHGPDCDCKLHTVYMTQRDFDKVNRSEGAMDQPGNGNSVESDNGPRGKTG
YQGPRGSRFAKAAPWPSNQNSTQVVQNSGYQGQNSAPTYQGQQNSAQSYQSQNSAPTYQG
QNNAPTYQGQQNSAPTYQGQQNSAQSYQGQQNSAPTYQGQQNSAPTYQGQQNSAPTYQGQ
NNAQSYQSQNNAQSYQSQNSAPTYQGQNNAQSYQGHDSAQSYQSQNSAPTYQGQNNAQSY
QGQSNGQSYQGHDNAQSYQSQNNASGYQGQSNAQSYQGHDNAQSYQSQNNASGYQGQYGD
KGHQTQNVAVGPAGPAGPIGPQGPAGPVGPGGPIGFNGPPGPQGPEGPMGFTGPQGPEGP
MGFTGPQGPEGPMGFTGPQGPAGFNGPIGPPGPPGLNGAPGPAGPPGPAGPIGFNGPAGP
PGPPGLNGAPGLNGAPGPVGPPGPAGQNGPPGPIGFNGTNGAAGPPGPPGPVGPAGPAGV
NGASGSAGPAGPAGPAGAAGPAGPAGAVGPAGAAGPAGPAGAVGPAGPAGQNGGPGPVGP
VGPAGPNGGPGPVGPAGPAGPAGQNGGPGPVGPVGPIGPIGPIGPIGLTGAIGPVGPVGP
AGVNGTNGTDGPAGPVGPVGPVGPVGPIGPIGLTGAIGPVGPVGPVGPVGAVGPIGPVGP
VGPIGLTGPAGVNGTDGLVGPVGPVGPVGPVGPVGPIGPIGLTGPAGVNGTDGLIGPIGP
IGPIGPVGPVGPVGPIGPIGLTGPAGVDGTNGTDGAVGPIGPVGPIGPVGPIGPIGLTGP
AGVDGTNGTDGAVGPIGPVGPIGPVGPIGPIGLTGPAGVDGTNGTDGAVGPIGPIGPIGP
IGPIGPIGPTGPTGPAGANGTIAEYDYLGCLTAGGTNGLTGTVTTFVEVTSVSDCASVCA
TGPNPSLFFSLATVAGASTCTCGNALDPTTTDDIHNQCNQLCTFTENGTPVYCGNTAGTL
VSVFGAI
NT seq
3084 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgttatcagcaagctactgcctgtggcagctgtcttgctaggttgcgtgaacaat
gctgccgctctagctgtgcgtgagcctgtagacaggttggacacttactaccgtgttgag
attggccctggtttcacaaagactacctcgtcactcacggacctggctagtaaacatggc
tcggcaggtattgggaagcgagggcaggaagaccacggccccgactgtgattgcaaactt
cacacagtatacatgacgcagcgggactttgacaaggtcaatcgtagcgaaggagctatg
gaccagcctggcaatggaaactccgtcgagagtgataatggacctcgaggaaagactggt
tatcaaggtccacgaggatctcggtttgctaaggctgctccttggccgtcaaaccagaat
agcacccaggtagtccagaattctggttatcaaggccagaacagcgcaccaacttatcag
ggccagcagaatagcgcacaaagttatcaaagccagaacagcgcaccgacttatcaaggc
cagaataacgcaccgacttatcaaggccagcagaacagcgcaccgacttatcaaggccag
cagaacagcgcacaaagttatcaaggccagcagaacagcgcaccgacttaccaaggccag
cagaacagcgcaccgacttatcaaggccagcagaacagcgcaccgacttatcaaggccag
aataacgcacaaagttatcaaagccagaataacgcacaaagttatcaaagccagaacagc
gcaccgacttatcaaggtcagaataacgcacaaagctaccaagggcatgatagcgcacaa
agttatcaaagccagaacagcgcaccgacttatcaaggtcagaataacgcacagagttat
caaggccagagtaacggacaaagctaccaagggcatgataacgcacaaagttatcaaagc
cagaacaacgcatctggttatcaaggccagagtaacgcacaaagctaccaagggcatgat
aacgcacaaagttatcaaagccagaacaacgcatctggttatcaaggccagtatggtgat
aaaggtcatcaaacccaaaatgtcgcagtaggcccagcaggcccggcaggtccaatcggt
ccacaaggcccagcaggcccagtaggccctggaggtccaatcggttttaatggccctcct
ggtccacaaggcccggaaggtccaatgggttttactggtccacaaggcccggaaggtcca
atgggttttactggtccacaaggcccggaaggtccaatgggttttactggtccacaaggc
ccggcaggtttcaatggcccaattggcccaccagggcccccgggtctgaatggagcaccg
ggtccggcaggtccacccggaccggcaggtccaatcggttttaatggccccgctggtcca
ccaggacccccgggtctgaatggagcaccgggtctgaatggcgcaccgggtcctgtaggt
ccaccaggcccggcaggtcagaatggtccaccaggtccaatcggtttcaatggtaccaat
ggtgcagcaggtccaccaggtccaccaggtccggtaggtccagcaggtccagcaggtgtg
aatggcgcatcaggctccgcaggcccggcaggtccagcaggcccggctggtgcagcaggc
ccggcaggtccagcgggtgcagtaggtccggctggtgcagcaggcccggcaggtccagcg
ggtgcagtaggtccggctggtccagcaggtcagaatggcggcccaggcccagtcggtcca
gtcggtccagcaggtccgaacggtggcccaggcccagtcggtccagcaggtccagcaggt
ccagcaggtcagaatggcggcccaggcccagtcggtcccgtcggtcctattggtcctatt
ggtcccattggtcccattggtctcacaggcgcaattggtccagttggtccagtcggtccc
gcaggtgtgaatggtactaatggtacggatggcccagccggtcctgttggcccagttggc
ccagttggtcccgtcggtcccattggtcccattggtctcacaggtgcaattggcccagtt
ggcccagtcggtcctgttggtccagtcggcgcagtcggtccaattggtccagtcggtcca
gttggtcccattggcttaacaggtccagcaggtgtaaatggtactgatggcctagttggt
ccagtcggtccagttggtcctgttggtccagttggtccagttggtcccattggtcccatt
ggcttaacaggtccagctggtgtaaatggtaccgatggcctaattggtccaatcggtcca
atcggtcctattggtccagttggtccagttggtccagtcggtcccattggtcccattggc
ttaacaggtccagccggtgtggatggtacaaatggtaccgatggtgcagtcggtcctatt
ggtccagttggtcccattggtccagttggtcccattggtcccattggcttaacaggtcca
gccggtgtggatggtacaaatggtaccgatggcgcagtaggtcctattggtccagttggt
cccattggtccagttggtcccattggtcccattggcttaacaggtccagccggtgtggat
ggtacaaatggtaccgatggcgcagtaggtcctattggtcctattggtcctatcggtcct
atcggtcctattggtcctattggtccaacaggtccaacaggtccagcaggtgccaatggt
actatcgccgagtatgactaccttggctgccttacggcgggcggaacgaatggccttaca
ggcaccgtaaccacattcgtcgaagtaacatcagtcagtgactgcgccagtgtttgcgcc
acgggtcctaacccttctctattcttttcattggcaacagtggctggtgcatctacttgc
acatgtggaaatgccctcgatcccacgaccaccgacgacatccacaatcagtgcaaccag
ctttgcacattcactgaaaatggcacccctgtctattgcggtaataccgctggcacgttg
gtgtccgtctttggtgcaatctag
DBGET
integrated database retrieval system
