Thermodesulfovibrio autotrophicus: V4D30_06280
Help
Entry
V4D30_06280 CDS
T10573
Name
(GenBank) FecR family protein
Organism
taut Thermodesulfovibrio autotrophicus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FecR
SBP_bac_5
DUF1373
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XCH45941
UniProt:
A0AAU8GXC3
LinkDB
All DBs
Position
complement(1217551..1221294)
Genome browser
AA seq
1247 aa
AA seq
DB search
MREKSLRAKREVFSFFFFSLIMCFLFISIAHAEEVGKITALQGKVDILRAGKSPAVPAKI
NEPVYLNDIIRTKTDSRAEITFRDGTVVKIAPRSRVDISEYFVDGETLKVTLNVPRGKVG
AAVAEKSIEKIKASPKANRFEIKTPIAVAGVRGTNYIVAHYPTYSTVTVITGRVYTYNIQ
RPEIVVEVKAGESTIVREGAPPSPPRATTPKEIEREQRDITVAKEEMSPAGKEETRTASD
EKASSAETMPVAVEATAVLERKPFATQLVGKTVTETLVEATPPITETIPSTTEFLMDVSF
QSIEPISASDPNIKLNYTVSANRNINVKYRVIQGGSYGDWITVNTVAQNPVYFSVPVMGY
GYSSYQVEIEANDESGNTKKWFSSIINPLSKYLTGTIVTNASSSVTGYAAGATGFDKGML
KLTVANPVSFSSTFNAGGGDSSTGCWILKGTASSSYFRLLTPDYLFTGSGPSSITLESGS
IKSLTTAPWIYVKPLNLSAQITGYIHHYDGSKIDELSGLPQSTIFIGRTGQLNLPSNIND
SVPYTTENYTVGYVPSHDIPEPTMLWGSFQQNSGSSLKLQGFAGGSWEQDYAIYGLYIGS
DNSAGIIKGLKGGYNFYDEGLHIFDSEPVITLKKKADGYSAMNTWRNYIEGYYQGFFRGG
SGTPTISRQDINATSYGAIGSASLSLKKGSYIEPWGVFGIELGGSHSATSPTGFTLEFGG
DSWDNRDADPDKPDYWVGSISDATVSGNRMSGTFTGRFMTPNHYGTVEGKLFGDFGSDKW
VGVVLGSYEPVMELSHISNIVSGTDTSKIYKQNFSPTQARINAYLGGDSFWSKGYGSIYS
VGKIVDDSNEIDFSTDKGYLWYAPITWSLGSNQYSGYIGGRFAKKSDTTYNMSAYLAGIY
NDSTNKGIFIGNLSTDGSSNVLTLEKRFFLEGENTVRAVTIDTGSIPSTPSPAVISNLSA
DSNEYGITINIYNQEAKIVMDTNTNEYNFGAGIIGMGGTYSSAPSGLWNITYTGSFEGQP
NTFGALIKGDLWGSENSIQNLIHGKTYAYFADITGTPAVTGIFVGETVGTFDPTSWQAIT
VGVAFETQKFLSMACPGGTCNTSGTGFTEDQEKLRKLGIPVVEVGKASFSGSGNNLTVNM
NDVVFFSTQTGQKPLLWSTANVTGTYSGTPTLNQSVTLNATSGASGSVQFTPTYWSGGAW
AATVANDTAYPVQLSGGSYTGSVNMQGAAAGTYGSGSFSGTASGIVR
NT seq
3744 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagagaaaaatcgctgcgggcaaagcgagaagtcttctcatttttctttttttcatta
attatgtgctttttatttatttccatagctcatgcagaggaagtggggaaaataacagca
cttcagggaaaggttgatatattaagggctggcaagtctccagcagtccctgcaaagata
aatgagcctgtttatttaaatgacataataaggacaaagacagactcaagagcagagata
acattcagagatggaacagttgtaaaaattgcaccccgtagcagagttgatataagcgag
tattttgttgatggtgaaactctcaaggttacactcaatgtgccaagaggcaaggtagga
gctgctgtagcggaaaaaagcattgaaaaaataaaggcttcaccaaaggctaacagattt
gagattaaaacaccaatagcagttgcaggagtaaggggaacaaactacatagttgcccac
tatccaacatattcaaccgtaactgttattacaggaagggtttatacctataatattcag
cgcccagagattgttgttgaagttaaagctggtgagagcacgatagtaagagagggagct
ccaccatcaccaccaagagcaactacaccaaaagagattgaaagagaacaaagagatata
actgttgctaaggaagagatgtctcctgctggtaaagaagagacacggacagcttctgat
gagaaagcctcttctgcagagacaatgcctgtagcagttgaggcaactgcagtattagag
agaaagccttttgcaactcagcttgtgggaaaaacagttacagagaccctggttgaagct
actccacccattacggagacaataccttctactaccgagtttctaatggatgtaagtttt
caaagcattgaaccaatatcagcatctgatcccaatataaagctgaattatacagtctca
gcaaacagaaacataaatgttaaatacagagtcatacaaggaggtagttatggtgactgg
attactgtaaatacagtagctcaaaatcctgtctatttttcagtgcctgttatgggttat
ggttattcctcatatcaagttgagatagaagcaaatgatgaatctggcaatactaagaaa
tggttttcttcaatcattaatcctctttctaagtatctcacaggaacgattgtaactaat
gcaagtagttcagtaaccggatatgctgcaggagcaacagggtttgacaagggaatgctc
aaacttacagttgcaaatcctgtttcctttagttccacatttaatgcaggaggaggagat
agctcaacaggttgctggattttaaaaggaactgcctcctcttcctatttcagacttctt
acgccagattatctttttacaggaagcggtccttcttcaattactcttgaatctggaagt
ataaaatcattaaccactgcaccatggatatatgtaaagccacttaatttgtctgcccaa
attacaggatatattcatcattatgatggcagtaaaatagatgaactctcaggactccct
cagtccaccatatttattggaagaacagggcagttgaatttgccatcaaatatcaatgat
tcagtcccatataccactgaaaattacacagttggatatgttccttctcatgatatacct
gagccaacaatgctatggggttcttttcagcaaaactctggaagcagtctaaagcttcag
ggatttgctggaggctcatgggagcaggattatgctatctatggattatacattggttct
gacaactctgcaggaattattaaaggcttaaagggaggctataacttttatgatgaaggc
cttcacatctttgatagtgaacctgtcattacactaaaaaagaaagcagatggttattcc
gcaatgaatacatggaggaactatattgagggttattatcagggattctttagaggcgga
agtggaactccgacaatatcaaggcaggatataaatgctacatcttatggtgcaattggt
tcagcctctctttctcttaaaaaaggaagctatattgagccatggggagtttttggaata
gagcttggtggaagtcattctgcaacatcaccaacaggatttacacttgaatttgggggt
gactcttgggataacagagatgcagatccagacaaacctgattactgggtcggctctatt
tcagatgcaacagtatcaggtaatagaatgtcaggaacattcactggcagattcatgact
ccaaaccattatggaacagtagaaggtaaactgtttggtgattttggttcagataaatgg
gttggtgttgtgctcggcagttatgaaccagttatggagctttcccatataagtaatatt
gtatcaggtacagacacgagtaagatttacaaacagaatttttcaccaacacaagcaaga
attaatgcatatcttggtggagatagcttctggagtaaaggctacggaagtatttattca
gtgggaaagattgttgatgattctaatgaaatagattttagcactgacaaaggctattta
tggtatgcaccaattacctggtcattaggttcaaatcagtattctggttatataggtgga
agatttgcaaaaaaatcagatacaacatataacatgtctgcctatctggcaggaatatat
aatgattcaacgaacaagggaatttttataggaaatctctcaacagatggatcatcaaat
gtattaacccttgaaaaaagatttttccttgaaggtgaaaacactgtaagggcggtaact
attgatacaggttcaataccttcaactccctctccagcagttatctcaaatctcagtgct
gattctaatgagtatggaataacaataaatatttataatcaggaagccaaaattgtcatg
gatacaaacacaaatgaatacaactttggagcaggcataattggaatgggaggaacatac
agctctgctccctcaggcttatggaatataacatatactggaagctttgaaggacagcca
aatacctttggtgctttaattaaaggagatttatgggggagtgaaaacagtattcagaat
ctaattcacggtaaaacatatgcatattttgcagacataacaggaactcccgccgtaaca
ggaatattcgttggtgaaactgttggaacctttgacccaacaagttggcaggcaatcaca
gtgggagtagcttttgaaacgcagaaattcttaagcatggcatgtccgggaggaacatgt
aatacatcaggaactgggtttacagaagaccaggaaaagcttagaaaacttggcatacct
gttgttgaggttggaaaagcaagttttagtggttcaggaaacaatctaacagtaaacatg
aatgatgttgtattcttttcaactcagacaggacaaaagcctctgctctggtcaacggca
aatgtaactggaacatattctggaacaccaacactaaatcagtctgtcactctcaatgct
acatcgggagcttcaggttctgttcagtttactcccacatattggtcaggtggagcatgg
gcggcaacagtggcaaatgatactgcctatccagtccagctttcaggtggttcatataca
ggttctgtaaacatgcagggtgctgctgcaggaacttacggaagtggtagtttttcagga
acagcatctgggattgtaaggtaa
DBGET
integrated database retrieval system