Tamlana sp. s12: JJL45_02265
Help
Entry
JJL45_02265 CDS
T10518
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16089
outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
Organism
tay Tamlana sp. s12
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tay00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tay02000
]
JJL45_02265
Transporters [BR:
tay02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
JJL45_02265
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
NOMO1-like_2nd
EMC7_beta-sandw
fn3_3
SdrD_B
PEGA
SpaA
DUF2846
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQY82837
LinkDB
All DBs
Position
530760..533003
Genome browser
AA seq
747 aa
AA seq
DB search
MKYLIIFFCLTSTIINAQDITGHVLFDNLPLAYANVYLKGTRQGTTTNEDGNYSLKNIQP
GSYTIIVSYTGFKSESKAINIANEDIVINFNLETSADLEEVVVTGTLKAVSRLDSPVPVE
VYSPTFLKKNPTPNIFESLQNVNGVRPQINCSVCNTGDIHINGLEGPYTLVLIDGMPIVS
GLSTVYGLSGIPNSLIEQVEIVKGPASSLYGSEAVGGLINIITKRPENAPLFFADSFVSG
WGEWNLDMGFKAKIGNKTDLLLGVNYFNYSNPIDNNNDNFTDVTLQDRLSVFQKWNFKRK
ENRVFSLAGRFFYEDRWGGEMQWNPSYRGGDDVYGESIYTTRYELLGTYQLPVAEKMMLQ
FSYTDHDQNSVYGNTPYLAKQRIGFTQLTWDKPLKKHDLLFGVAARYNYYNDNTPATITA
DEIVIPSLFVQDEMVLHKKHRLLLGARYDYDTRHGSIFTPRLAYRFKPSDQAIVRLNAGT
GFRVVNLFTEEHAALTGSRNVVITENLNPEQSVNFNFNYLQKFYSKKGMMFTLDASAWYT
HFSNLIAPDYETNPNQIIYSNLEGKAESKGVSVNLDANLASGIKMLLGATVQDVTTTHNN
VTQRQILTENFTGTWGISYKNYKYQTTVDYTGNIYGPMRLPLLGDLDPRLPESPVWSIQN
IQFTFDGLKNFEIYGGVKNLLNWTPNKGNPFIIARAHDPFDKDVAYDNNGDVLVTPDNPY
GLTFDPTYIYAPNQGRRLFIGLRYALK
NT seq
2244 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatatctaataatatttttttgtttaacttcaacaatcataaatgctcaagatatt
acaggtcatgtgttatttgacaacttaccactagcctatgcaaacgtttatttgaaaggc
acacggcaaggcacaacaacaaatgaagacggcaactatagccttaaaaatattcaacca
ggaagctatactatcattgtttcttataccggatttaaatctgaatcaaaagccataaat
atcgctaatgaagatattgtgataaattttaatctagaaacatctgcagatctggaagaa
gtggttgttactggaactttaaaagccgtttcaagattggatagccctgttcctgttgaa
gtgtacagccctacgtttctaaagaaaaatccaacgcctaatattttcgaatctctacaa
aacgtgaatggtgtacgtccacaaattaattgtagtgtttgtaacaccggggatattcac
atcaacggactcgaaggtccatacaccttagtcctaatagacggcatgcccattgttagt
ggcttgtctaccgtttatggtttgtcgggtataccaaattcacttattgaacaggtagaa
atcgtaaaaggcccagcctcctcactttatggaagtgaagcggtaggtggtttaattaac
attatcactaaacgccccgaaaatgcccccttattttttgcggatagttttgtttcaggc
tggggagaatggaatttagacatggggtttaaagcaaaaattggtaataaaaccgatctg
cttttaggggtgaattactttaactacagcaaccctattgataataacaacgataatttt
accgatgtaacgcttcaagatagattatcggttttccaaaaatggaattttaaacgtaaa
gaaaatagagttttttcgttagcagggcgattcttttatgaagaccgttggggtggagaa
atgcaatggaatccatcttatcgcggtggcgacgatgtttatggcgagagtatttacacg
acgcgttacgaattattaggaacctatcaacttcctgtggccgagaaaatgatgctgcaa
ttttcgtataccgatcatgatcaaaattccgtttatggaaacaccccttatctggcaaaa
caacgaattggatttacacaacttacctgggacaaaccgcttaaaaagcatgatttatta
tttggtgttgcagcccgatataattattataatgacaacacgcctgccactataactgcc
gatgaaatagttattccttcactttttgttcaagatgaaatggtacttcataaaaaacac
cgtttactattgggtgcgcgttatgattacgatacgcgccacgggtccatttttacacca
cgtttggcttatcgatttaaaccttcagaccaggctattgttcgacttaatgctggcaca
ggttttcgcgtggtaaatctgtttaccgaagaacacgcggcgctaacaggctcaaggaat
gttgttattactgaaaatttaaacccagagcaatccgttaatttcaactttaattattta
cagaaattttacagtaaaaaaggcatgatgttcaccttagatgcttctgcttggtacacc
catttttctaatttaattgcccccgattatgagactaaccccaatcaaattatttactct
aatttggaaggcaaagcagaaagtaaaggtgttagcgttaacttagatgccaatttagca
agtggcattaagatgcttttaggggcaacagtacaagatgttaccaccacccataacaac
gtcacacaacgccaaatactaaccgaaaactttacaggaacctggggtatttcatataaa
aattacaaataccaaactacagtagattacacaggaaatatttatggccccatgcgtttg
cctctattaggggatttagatcctaggttacccgaatcacctgtttggagcatccaaaac
attcagtttacatttgacggtttaaaaaactttgaaatttatggtggtgttaaaaacctt
ttgaactggacgcctaacaaaggtaacccctttattatagctcgagctcatgaccctttt
gataaagatgtagcatatgacaataacggagacgttcttgtaacaccagataacccttat
ggtttaactttcgatcccacttacatttacgcaccaaaccaagggaggcgattatttata
ggcctacgttatgctttaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system