Tamlana sp. s12: JJL45_07420
Help
Entry
JJL45_07420 CDS
T10518
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
tay Tamlana sp. s12
Pathway
tay03020
RNA polymerase
Brite
Enzymes [BR:
tay01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
JJL45_07420 (rpoC)
Transcription machinery [BR:
tay03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
JJL45_07420 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
tay03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
JJL45_07420 (rpoC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQY83803
LinkDB
All DBs
Position
1711580..1715881
Genome browser
AA seq
1433 aa
AA seq
DB search
MARKQDKNTVKRFNKISIGLASPESILAESRGEVLKPETINYRTHKPERDGLFCERIFGP
VKDYECACGKYKRIRYKGIVCDRCGVEVTEKKVRRDRVGHINLVVPVAHIWYFRSLPNKI
GYLLGLPSKKLDMIIYYERYVVIQPGNAKNEEGEPLQKMDFLTEEEYLNILETLPQDNQY
LDDSDPNKFLAKMGAECLIELLARIDLESLSYELRHKANTETSKQRKTEALKRLQVVESL
RESNQNRENRPEWMIMKVIPIIPPELRPLVPLDGGRFATSDLNDLYRRVIIRNNRLKRLV
EIKAPEVILRNEKRMLQESVDSLFDNTRKSSAVKTDSNRPLKSLSDSLKGKQGRFRQNLL
GKRVDYSARSVIVVGPELKLFECGLPKNMAAELYKPFVIRKLIERGIVKTVKSAKKIIDK
REPVVWDILENVLKGHPVLLNRAPTLHRLGIQAFQPKLIEGKAIQLHPLVCTAFNADFDG
DQMAVHLPLGPEAILECQMLMLASHNILNPANGSPVTVPSQDMVLGLYYMTKLRKSTPEV
PIKGEGLTFYSPEEVEIAFNEQRVDLNAGIKVRTIDINEEGKLAPVIIETTVGRVLFNQH
VPQAAGYINEVLTKKSLRDIIGNILKATSVPETADFLDAIRTLGFKFAFQGGLSFSLGDI
IIPPEKQGMIDKANGLVDGITGNYNMGLITNNERYNQVIDIWTSTNAELTELSMKRIRED
QQGFNSVFMMLDSGARGSKEQIRQLTGMRGLMAKPKKSNAGGGEIIENPILSNFKEGLSI
LEYFISTHGARKGLADTALKTADAGYLTRRLVDVSQDVIINTEDCGTLRGVEVEPLKKND
EVVETLQERIVGRVSLNDVFNPLTEEKLASAGQLIDDAVAKAIGASPLESIEVRSALTCE
ALQGICAKCYGRNLATGKMVQRGEAVGVVAAQSIGEPGTQLTLRTFHVGGIAGNISEENK
LAVKFNGIAEIEDLKTVKGQDNEGNEIDIVISRTSELKLTDKKTGIVLSTNNIPYGSTIF
VKNGQELAKGDVVCTWDPYNGVIISEFAGKVRYENIEQGVTYQVEIDEQTGFQEKVISES
RNKKLIPTLHIEDASGETMRSYNLPVGAHLMIDDGEKINVGKILVKIPRKSAKAGDITGG
LPRVTELFEARNPSNPAVVSAIDGVVSFGKIKRGNREIIVESKLGDVKKYLVKLSNQILV
QENDYVKAGMPLSDGSITPNDILNIKGPSAVQQYLVNEVQEVYRLQGVKINDKHFEVVVR
QMMRKVRIIDSGDTIFLEDQLAHKADFIKENDDIFGMKVIEDAGDSSTLKAGQIVSPRQL
RDENSILRREDKALVTARDAQPATATPILQGITRASLQTKSFISAASFQETTKVLNEAAV
AGKVDALEGLKENVIVGHRIPAGTGMRRYSDIIVGSKEEFDEMMQVKQELNYN
NT seq
4302 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaagaaaacaagataaaaatacagttaagagatttaataaaatctcaatcggttta
gcttctccagagtctattttagcagagtctagaggcgaagttttaaaaccagaaactatc
aattatcgaactcacaaaccagaacgtgatggtttgttctgtgagcgtatcttcggtcct
gtaaaggattacgagtgtgcttgtggtaaatataaaagaatacgctacaaaggtattgta
tgtgaccgttgtggtgttgaagtaacagaaaagaaagtacgtcgtgatcgtgttgggcac
atcaaccttgtggttcctgtggcacacatctggtacttccgttcgttaccaaataaaatt
ggttatttattaggattaccatctaagaaattagatatgattatttactacgaacgttac
gtagttattcaaccaggtaatgctaaaaatgaagaaggtgaaccattacaaaaaatggac
ttcttaacagaagaagaatacttaaatattcttgaaacccttcctcaagataatcagtat
ttagacgattcagatccaaataagtttttagctaaaatgggtgctgaatgtttaatcgaa
ttattagcaagaattgacttagagtctttatcatacgaattacgtcataaagcaaatacc
gaaacgtctaaacaacgtaaaacggaagctttaaaacgtttacaagttgtagagtcttta
cgtgagtcaaatcaaaatagagaaaatcgtccagaatggatgattatgaaagtaattcca
atcattccgccagaattacgtcctctagtaccactagatggaggtcgttttgcaacgtct
gatttgaatgacttataccgtcgtgttattattcgtaacaaccgtcttaaaagattggtt
gaaattaaagctcctgaagttattttacgtaacgaaaaacgtatgcttcaagagtctgtg
gattcgttattcgataatacacgtaaatcttctgcagtaaaaacagattctaacagaccg
ttaaaatctttatcagattcattaaaaggtaagcaaggtcgtttccgtcaaaacttactt
ggtaagcgtgtggattattcagcacgttctgtaattgttgtaggaccagaattaaaatta
tttgaatgtggattgccaaaaaatatggcagctgaattatacaaaccttttgtaattaga
aaactaattgaaagaggtattgttaaaacagtaaaatcagcaaagaaaattatagataaa
agagagcctgtggtttgggatatcttggaaaacgttcttaaaggacatccagtattacta
aaccgtgcgcctaccttacaccgtttaggtattcaagcttttcaaccaaaattaattgaa
ggaaaagcgattcaattacacccattagtatgtacggcatttaacgccgatttcgatggg
gatcaaatggcggtgcatttaccattagggccagaggctattttagagtgtcaaatgtta
atgttggcatctcacaatatcttaaaccctgctaatggttctccggtaacggtaccttct
caggatatggtacttggtctttactatatgaccaagctacgtaagtctacaccagaagtg
ccaattaaaggagaaggattaaccttctactctccagaagaggtagaaattgctttcaat
gagcaacgcgttgatttgaatgctggtatcaaagtaagaacgattgatattaatgaggaa
ggtaaacttgctccggttatcatcgaaactacagttggtcgtgtattatttaaccaacac
gtgcctcaagcagctggttatattaatgaagtattaactaaaaagtcgttaagagatatt
attggtaatatcttaaaagcaacttcagttcctgaaactgccgatttcttagatgctatt
agaactttaggatttaaattcgccttccaaggtggtttatcattcagtttaggagatatc
atcatcccgccagaaaagcaaggtatgatcgataaagctaacggtttagttgatggtatt
actggtaactataacatgggacttattaccaataacgaacgttacaaccaagttattgat
atctggacctcgacaaatgctgaattgacagagttgtctatgaaacgtattcgtgaagac
caacaagggtttaactcagtgtttatgatgcttgattctggagctcgtggatctaaagaa
cagattcgtcagttaaccggtatgcgtggattaatggcaaaacctaaaaaatctaacgct
ggtggtggtgaaattattgaaaatccaattctttctaactttaaagaaggtctttcaatt
ttagagtactttatctctacccacggtgcacgtaaaggtcttgccgatacggcccttaaa
actgccgatgctggttacttaacaagacgtttagtagacgtttctcaagatgttattatc
aatactgaagattgtggtacattaagaggtgttgaagttgaaccattgaaaaagaatgac
gaagttgttgaaactttacaggaaagaattgtaggccgtgtttcattaaatgatgtattt
aatcctttaactgaagagaaattagcttctgctggtcaattaattgatgatgctgttgct
aaagccattggagcatctcctttagaaagtattgaagtacgttctgctttaacttgtgaa
gcgttacaaggtatttgtgcgaaatgttacggtcgtaacttagctacaggtaaaatggta
caacgtggtgaagctgttggtgttgttgcggcacaatcaattggtgagcctggtacacag
ttaacacttcgtacgttccacgtaggtggtattgcaggtaatatttcagaagaaaacaag
cttgctgttaagtttaacggtattgctgaaatcgaagatttaaaaacagttaaaggtcag
gataacgaaggaaacgaaattgatatcgtaatctctagaacgtctgaacttaaacttaca
gataagaaaactggtattgtattaagtactaataacattccttatggttctactattttt
gttaaaaatggtcaagaattagctaaaggtgatgtcgtatgtacttgggatccatataac
ggtgtaattatttcagaatttgctggtaaagtaagatatgaaaacatcgaacaaggggtg
acttaccaagttgaaattgatgagcaaacaggtttccaagaaaaagtaatttctgaatct
agaaacaaaaagcttattccaacacttcatattgaagatgctagtggtgaaaccatgcgt
tcttacaacttaccagttggcgctcaccttatgattgatgatggagagaaaattaatgta
ggtaagattttagttaagattcctcgtaaatctgcaaaagcaggggatattacaggtggt
cttccacgtgttaccgagttattcgaagcgcgtaatccatctaacccagcagttgtttct
gctattgatggtgtggtttctttcggaaaaattaagagaggtaaccgtgagattatcgta
gaatctaaattaggtgatgttaagaaatacttagtgaagttatctaatcagatcttagta
caagagaatgattacgttaaagctggtatgccattatctgatggttctattacaccaaac
gatatcttgaatatcaaagggccttcagctgttcaacaatacttagtaaatgaagtacaa
gaggtataccgtttacaaggggtgaaaattaatgataaacacttcgaagttgttgttaga
caaatgatgcgtaaagttagaattatagattctggtgatacgattttcttagaagatcaa
ttggctcataaagcagatttcattaaagaaaatgatgatatcttcggaatgaaagtgatt
gaagacgctggagattcttctacgcttaaagcaggtcaaattgtttctccacgacagtta
agagatgaaaattctattttacgtcgtgaagataaagcacttgttacggctagagatgct
caaccagcaactgcgactccaatacttcaaggtattacaagagcttcgcttcaaacgaaa
tcatttatttctgcggcatccttccaagaaacaactaaagtattaaacgaagctgcagta
gcaggtaaagtagatgctttagaaggcttgaaagaaaacgttattgttggacatagaatt
cctgcaggtactggtatgagacgttactctgatatcattgtaggttctaaagaagagttt
gacgaaatgatgcaagtgaaacaagaattaaattacaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
