Thermococcus barossii: A3L01_10245
Help
Entry
A3L01_10245 CDS
T05081
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
tbs
Thermococcus barossii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_3_5
Big_1
PKD_4
PKD
Invasin_D3
Peptidase_S8
MG4
K319L-like_PKD
Big_7
WD40
Y_Y_Y
PQQ_3
InlK_D3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASJ05725
UniProt:
A0A2Z2MLU5
LinkDB
All DBs
Position
1898759..1905397
Genome browser
AA seq
2212 aa
AA seq
DB search
MRKIGILLVVMLVVSIPVVPVIKASDNSNTGKAFVEKAPIPSEYKYLQAEYYSLPDYFFK
IKDYDIMEILLSLSHEDYQHINEIVFLSREVYSPRYHNGELYLKLEIELDGNLSPLVVAD
LFNVTRTGRYVFAHVPVSSLPQLVMDSHIVSITRVPKLSVLDSDGVPIIGADVLHDYNIR
GEGVRVAVIDFSFNMGTHGYFCSEIVRSTAPNADIVEISLSNDYLDTLIAALNQIRDWNN
DDDPSNDIDVVSMSLGTYKVRLDGQSPIDTAVNDVVNSGAIVVVAAGNYGDKHYEATFQD
SDNDGYHEFSSGDEDLMITVDSPVEVTLNYFDFTGDLNLEISPSTGVSCHLGGPSTYESC
SINSSGTYFIKIHEISEGSGKFELFFNTSVSFMEYNTFSSSIVAPASNPNVITVGAVPRN
NPSVVEDFSSRGPTNTGLTKPDVVGPDNVTITVTSNGFTYEYHDLLGTSYATPHIAGAVA
LLESGAPSLTDDQVKELLFRLSNRYSNKDNDFGYGLPDLAQLIDSYEPDNYYTQAKPISL
GASQQRTIFPSTDVDWVKFSVDSYKAVTITASESSPFGSIELTLYNSNLQVISGPVSKDG
TVSISKNLDPGTYYIRVREYGQDGVVYPPYTLTVTGAELQPPVVDFSYSPSSPTIEDTVQ
FFDNSHDPDGGSIVYWHWDFGDGSTSTSQNPQHQYTTPGTYTVTLWVKDDDGQMSSISKT
ITVSDVSNHRPVIQDIIFYPSNPEVNQPVWMEAIVNDPDGDSIDMYYWDFGDGSTESGTS
PVVSHEYLEGGTYTVTLVVRDSAGKYSYPFTKTIYIKTPFLKNNPPVWTLNILHGDDVGD
IEISKNGEYIVAGGYSWAGFAVMDKYGRLLWQTNVVGDVNDVAISPDGHYVVVGTDSYLY
VFSQDLRDQYLWRISLGSRVNSVWAGSQYIIAGTFDNNLYFIDYDGTIIHQLSDFEGRRE
AIFGNEEGSAAIYLGDGTPPYTLYYASVYGSHWNLNVEVSGHEFAASYSLDYVGYTGPDP
NGQNTWDAGYARISDKYGYIIMDEPIPLPQDLDFYPAEGVAIYGGSRLAIVVMWGVVDEP
DYPVLYIYDSNGNLLRQEQFSGLASYITVKYNGVYTTDNVYLVAAGSFSNNEAGLYVYDY
NANPVWKYLGPNDKGVTVTDVAIDYYGDYIVAGGKDGLLMFFRTEPDSGTPPVATFSYTP
TAPEAGVNITFDASGSYDPDGTIKRYVWDFGDGTTGEGVTVTHTYQDYGTYTVTLTVMDN
DVITATYSQEINVIMPTKLIVADITGKQGTTVVLNATLLDILGNPLQGGTVQFYVDDQYV
GESTTNSAGTAFFSLDTSNLAAGVHTIKARFIGNSLYKASEGYGQLLLYQYDTHLVILTT
SAKYNTSTTLEAALRDEFGNPLAGKPVKFYVDGEYVGGTVTNSEGVAAIQYTVNVPAGTH
VITAEFIGGPTYGPSRNTVDLLVYVKDTSLSTTGISAKVNSTTTFCATLLDENGEPVTAV
NVIFKIDAIEIGTALTNGSGVACIQHTINLSPGYYLLTTEFTGTSNYGPSNSSAFLLVYS
TRSQLAVTNTSAKVGSSVALKAVLVDEFGNPLSGKPVKFYVDGQYVGGTVTNSEGVAAIQ
YTVNVPAGTHVITAEFVGGPNYGPSEDTAKFLAYETATSITVYDSNGKVNGNVTLRAVLK
DEFGNPLSGKPVKFYVDGEYVGGTVTNSEGVAAIQYTVNVPAGTHVITAEFIGGPTYGPS
TGKGEFLAYNYSTSIVVYDSNGKVSGNVTLKAVLVDEFGNPLSGKPVKFYVDGQYVGGTV
TNSEGVAAIQYTVNVPAGTHVITAEFVGGPNYGPSEDTAKFLAYETATSITVYDSNGKVS
GNVTLKAVLVDEFGNPLAGKPVKFYVDGQYVGGTVTNSEGVAAIIYTVNVPAGTHVITAE
FVGGPNYGPSEDSGKLLAYTYGTTLTVYNASGKTDENTTLKAVLVDEFGNPLSGKPVKFY
VDGEYVGGTVTNSEGVAAIIYTVNVPAGTHVITAEFVGGPNYGPSEDSGKLLAYTYGTII
VMENVSAKVGNSATLKAVLVDEFGNPLAGKPVKFYVDGQYVGGTVTNSEGVAAIQYTVNI
STGIHVITAEFVGGPNYGPSEDTAKFLAYETATSITVYDSNGKVNGNVTLRAVLKDEFGN
PLSGKPVKFYVDGEYVGGTVTNSEGVAAIQYTVNISTGIHVITAEFVGGPNY
NT seq
6639 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaaattgggatattgctcgtagtgatgctggtcgttagtatacccgtggtgcct
gttattaaggcatctgataattcaaacacaggaaaagcctttgttgaaaaagctccaata
ccttcagaatataagtatttacaggctgagtactactcgcttccagattatttcttcaag
attaaggactatgacattatggaaattttgttatctttgtcccatgaagattaccaacat
atcaatgagattgttttcctcagtagagaggtatactctcccagatatcacaatggggag
ctttatctaaaactagaaattgaattagatggaaatctttcaccccttgtggtggccgat
ttgtttaatgtgactagaaccggtaggtacgtttttgcacatgttcctgtgtcctcttta
ccccagttagtaatggattctcacatcgtttctattactcgcgttcctaaacttagtgtt
cttgatagtgatggagttccgataataggagcagatgtcttacatgattacaatatccgg
ggagaaggggttagggttgcagtaatagatttctcctttaatatgggcactcatggctat
ttttgttcggaaattgtgagatcaacagcaccaaatgcggatattgtggagatttccttg
tcgaatgattacttagacacacttattgctgctcttaaccagattagagactggaataat
gacgatgatccctctaatgacattgatgtagtttcgatgtcattaggtacttataaggtt
agacttgatggtcagtctcctattgacactgctgttaatgatgttgttaatagtggggct
atagttgttgttgctgctgggaattacggagataagcactatgaggcgacatttcaagat
tctgataacgatggatatcatgagttttcatctggtgatgaagatttgatgatcacagtt
gattctccggttgaggttactcttaattatttcgactttactggtgatttgaatttagaa
atctctccttcaactggagtttcatgtcatttaggaggcccttctacttacgaaagttgt
agtatcaactcttccggaacatattttataaaaatacacgaaatctcagaaggtagtgga
aaatttgagttgttttttaacacttcggtgtcattcatggagtataacactttctcaagc
agtatagttgctccagcatccaatccaaatgttataactgtaggggcagttccgcgcaac
aatccttcagttgtagaggacttcagcagtagaggaccaacaaatactggattgacgaag
cctgatgtagtgggtccagacaatgttactatcacagttacatcaaatgggttcacttat
gagtatcatgacctactaggaacgagctatgctactcctcatatagcaggtgcagttgcg
ctgttggaaagtggggctccgtccttaacagacgatcaggttaaagaactcctgtttaga
ctatctaacagatactccaacaaagataacgactttgggtatgggcttcctgatttggca
caattaattgattcatatgagccagataactattacactcaggcaaagccaatatcatta
ggagcatcccagcagagaacaatattcccctcaacggatgttgattgggttaagttcagt
gttgattcgtacaaagcagtcacaataactgctagcgagagttcaccatttggtagcatt
gaactaaccctgtacaattccaaccttcaagtcataagtggaccagtatccaaagacgga
acggtttcgatttcaaaaaacctcgaccctggtacatactatattagggttagggaatat
ggacaagatggggttgtatatcctccatacactctaactgttactggggcagaacttcag
ccacctgttgtagattttagttattctccctcatcgcctacaatagaggacacagtccaa
ttttttgataattctcatgatccagacggcgggagtatagtgtactggcattgggacttt
ggagatggaagtacaagcaccagccaaaacccgcagcatcaatacactactcctggaact
tatacagtaactctgtgggtaaaggatgatgatggccagatgagttctattagcaagact
atcacggtatcagatgtgtcaaatcacaggcccgtaatccaagacatcatcttttatccc
tccaacccagaggtaaaccagccagtatggatggaggccattgttaatgaccctgatggg
gatagtattgacatgtattattgggactttggggatggaagtacagaaagcggaactagt
ccagttgtctctcatgaatacttggaagggggtacctatactgtaaccctagtagtcaga
gattctgctggaaaatatagttacccatttactaaaaccatatacattaagacaccattt
ttgaagaacaatcctccagtgtggacattgaatatactacatggggatgatgtcggagac
attgaaatatccaagaatggagagtatattgtagctgggggctactcatgggcaggattt
gcagtaatggataagtatggaagacttctatggcagactaatgttgtgggtgatgttaac
gatgttgcgatatcaccagatgggcattacgtggtagttgggactgatagctacctgtat
gtcttttcccaggatttgcgggatcaatatctttggaggataagtcttggaagtcgcgtc
aattcagtgtgggcaggaagtcaatatataattgctggaacttttgacaataacttgtac
ttcatagactatgatgggactattattcatcaacttagtgattttgagggtaggagggag
gctatctttgggaatgaggaaggatctgcggcgatatatctgggggatggcacaccaccc
tatactctgtactatgcttcggtttacggaagtcattggaatttaaatgtcgaggtgagt
ggtcacgaattcgcagcctcgtattcattagactatgtcggttatactgggccagatccc
aatggacagaacacttgggatgcaggctatgcgagaatttctgacaaatatggctacata
atcatggatgaaccaattcccctccctcaggatttagatttctatcctgcagagggtgta
gcaatttatggaggcagcagacttgctattgttgttatgtggggtgtagtagatgagcca
gattatccagtgctatatatttatgacagcaatggtaaccttcttagacaggaacagttc
tctggcttggcttcctatataacagtaaaatataatggggtatatacaacggacaatgtt
tatcttgtagcagcaggatcgtttagcaataatgaggcaggcctatacgtctatgactac
aatgcaaatccagtttggaaatacttagggccgaatgataaaggagtgactgttactgat
gttgcgatagattattacggggattacattgttgctggaggaaaagatggtctcctcatg
tttttcagaacagagcccgactctggaacgccccccgtagcaactttcagctatacacca
actgcccctgaagcgggcgtgaacataacctttgatgcaagcggatcctatgatcctgat
ggcactataaagcggtacgtctgggactttggagatggcaccactggggaaggtgttacc
gttacccacacttaccaagattacgggacctacacagtaacgttgactgtcatggacaac
gatgtcataacagcaacgtattctcaggagatcaatgtgataatgccaactaaactaatc
gttgctgatattaccgggaaacaggggactactgttgtcctcaacgcaacacttttggat
atcttgggtaaccccctgcagggaggcactgttcagttttatgttgatgaccaatatgta
ggagagagtaccaccaattctgcaggaacagcctttttctccttagacactagcaacttg
gcagctggagtgcacacaataaaggccagatttatcgggaactctctgtacaaagctagc
gaagggtatgggcagttattgctctatcagtacgatacccatttagttatattgacaact
agtgccaagtataacactagcactactttggaagccgcgctcagggatgagtttggtaat
ccgttggctggtaaaccagtgaagttctacgttgacggggagtacgttggagggacagtg
actaattcagagggggtagcagcaatacagtacactgttaacgttccggcaggtactcac
gtgattactgcagaattcatcggaggaccaacatacggacctagcaggaatactgtagat
ttactggtttatgttaaagatacctctctcagcactactggaatctcagcgaaggtgaat
tctacaaccactttctgtgctacgctgcttgatgagaatggagagcccgtcactgcagtg
aacgttattttcaagattgacgcaattgaaattggaactgctctcacgaatgggtctggt
gtagcctgcattcaacacactataaatctatccccaggatattatttactcactactgag
tttacaggcacatccaattatggaccaagtaacagctccgctttcctcttagtatatagc
acccgctcccagcttgcggtgactaatacttcagcgaaggttgggtcttcggtggctctc
aaggcggtgctcgtggatgagtttggtaatccgctttcgggtaaaccagtgaagttctac
gttgatgggcagtacgttggagggacagtgactaattcagagggggtagcagcaatacag
tacactgttaacgttccggcaggtactcatgttatcactgcagaattcgttggtgggccg
aattacgggccaagtgaggatacagcgaagttcttagcttatgagacagcaacaagcata
acagtgtatgattctaatggtaaggttaacggtaacgtgactctcagggcagtgctcaaa
gacgagtttggtaatccgctttcgggtaaaccagtgaagttctacgttgacggggagtac
gttggagggacagtgactaattcagagggggtagcagcaatacagtacactgttaacgtt
ccggcaggtactcacgtgattactgcagaattcatcggaggaccaacatacgggccaagc
actggtaagggcgagttcttggcgtataactacagcacaagtattgttgtttacgattct
aatggtaaggttagcggtaacgtgactctcaaggcggtgctcgtggatgagtttggtaat
ccgctttcgggtaaaccagtgaagttctacgttgatgggcagtacgttggagggacagtg
actaattcagagggggtagcagcaatacagtacactgttaacgttccggcaggtactcat
gttatcactgcagaattcgttggtgggccgaattacgggccaagtgaggatacagcgaag
ttcttagcttatgagacagcaacaagcataacagtgtatgattctaatggtaaggttagc
ggtaacgtgactctcaaggcggtgctcgtggatgagtttggtaatccgttggctggtaaa
ccagtgaagttctacgttgatgggcagtacgttggagggacagtgactaattcagaggga
gttgcggcgattatttacactgttaatgtcccagcgggtactcatgttatcactgcagaa
ttcgttggtgggccgaattatggtccaagcgaagacagtggaaaactactagcttacact
tatggtaccactctaacagtatataatgctagtggaaaaactgatgaaaatacaactctc
aaggcggtgctcgtggatgagtttggtaatccgctttcgggtaagcccgtgaagttctac
gttgacggggagtacgttggagggacagtgactaattcagagggagttgcggcgattatt
tacactgttaatgtcccagcgggtactcatgttatcactgcagaattcgttggtgggccg
aattatggtccaagcgaagacagtggaaaactactagcttacacttatgggacgatcatt
gtcatggagaatgtttcagctaaagtcggtaacagcgctacattaaaagctgtgctcgtg
gatgagtttggtaatccgttggctggtaaaccagtgaagttctacgttgatgggcagtac
gttggagggacagtgactaattcagagggggtagcagcaatacagtacactgttaacatc
tcaacgggtattcacgtgattactgcggaatttgtcggaggaccaaattatggtccaagt
gaggatacagcgaagttcttagcttatgagacagcaacaagcataacagtgtatgattct
aatggtaaggttaacggtaacgtgactctcagggcagtgctcaaagacgagtttggtaat
ccgctttcgggtaagcccgtgaagttctacgttgacggggagtacgttggagggacagtg
actaattcagagggggtagcagcaatacagtacactgttaacatctcaacgggtattcac
gtgattactgcggaatttgtcggaggaccaaattattaa
DBGET
integrated database retrieval system