Theobroma cacao (cacao): 18602516
Help
Entry
18602516 CDS
T02994
Name
(RefSeq) extensin-2
Organism
tcc
Theobroma cacao (cacao)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_2
Pollen_Ole_e_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18602516
NCBI-ProteinID:
XP_017974938
UniProt:
A0AB32WA35
LinkDB
All DBs
Position
4:24972615..24977344
Genome browser
AA seq
1019 aa
AA seq
DB search
MTGPRADPVRGRFWPQVLVALAIVVVASNVGSVSADAYPYSSPPPPYEYKSPPPPSPSPP
PPYEYKSPPPPPPYEYKSPPPPSPSPPPPYHYHSPPPPKHEEKPPYYYKSPPPPSPSPPP
PYYYESPPPPKHEEKPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPKHEEKPPYYYKSPPPPVK
PPPKPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPRPPYYYKSPPPPPHYVSPPYYYKSPP
PPAKSPPYYYNSPPPPAPYYPAPHPYPHHHPLIVKVVGKVYCYRCYDWGYPVKSHDKKHL
KGAVVEVTCNVGEKKVKAYGKTKINGKFSITVEGFDYAKYGAEACKAKLHAAPTGSPCNI
PTSLHEGNTGAELKVKSKTKYEVVLKAKPFAYAPKTPYKECEKPKPKPKPPTPYYYTSPP
PPTPVYIYKSPPPPPPTYVYKSPPPPSHPYKPPTEPYKPPPYYYKSPPPPSPSYIYKSPP
PPTPTYVYKSPPPPSHPYKPPTEPYKPPPYYYKSPPPPSPTYVYKSPPPPSHPYKPPTEP
YKPPPYYYKSPPPPSPTYVYKSPPPPTPTYVYKSPPPPSHPYKPPTEPHKPPPYYYKSPP
PPSPTYIYKSPPPPSHPYKPPTEPHKPPPYYYKSPPPPSPTYIYKSPPPPPYYYKSPPPP
SPSPPPPYYYESPPPPKHEEKPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPPHYVSPPYYYKS
PPPPSPSPLPPYYYKSPPPPVHSPPPPYYYKSPPPPSPSPLPPYYYKSPPPPSPSPTPPY
YYKSPPPPVHSPPPPYYYKSPPPPIKSPAPVYHYNSPPPPSPSPHPPYYYKSPPPPSPSP
LPPYYYKSPPPPSPSPLPPYYYKSPPPPVHSPPPPYYYKSPPPPSPSPLPPYYYKSPPPP
SPSPPPPYYYKSPPPPVEAPAPTYHYKSPPPPYYYNSPPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYY
YKSPPPPSPSPPHPYYYKSPPPPSPSPLPPYYYHSPPPPVTSPPPPVYIYASPPPPTHY
NT seq
3060 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaggtccgcgggccgacccggtgaggggtcggttttggccccaagtgttagtggcc
ttggccattgttgttgttgcaagcaatgtaggttcagtgtctgcagatgcttatccatac
tcatcacctcctccaccttatgagtacaagtcacctccaccgccatctccttctccacca
ccaccatatgagtataaatctccaccaccaccaccaccttatgagtacaagtccccacct
ccaccatctccatcaccacctcctccataccactaccactctccaccaccaccaaagcat
gaagaaaaacccccgtactactacaaatctccaccacctccatccccatccccacctcct
ccatactattacgagtctccaccaccaccaaaacatgaagaaaaaccaccatactactac
aagtctcctccacctccatctccatcaccacctcctccatactactacaagtctccacca
ccaccaaaacatgaagaaaaacccccatactactacaagtctcctccacctccagtaaag
cctccaccaaaaccatattattataaatctcctccaccaccatctccttcaccacctcca
ccttactactataagtctccaccaccaccttcaccatctcctcgacctccttactactac
aagtctccaccacctcctccacattacgtctcaccaccatactattataaatctccacca
ccaccagctaaatctcctccttactactacaattctcccccaccaccagctccttattac
cctgcccctcacccttatccccaccaccatccactcatagtcaaggtggttggtaaagtt
tactgctacagatgctatgactggggatatccagtgaagtcacacgacaagaaacatctt
aaaggtgctgttgtggaagtaacttgcaatgtcggtgaaaagaaggttaaggcctatgga
aaaaccaagatcaatggaaaattcagcatcacggttgaaggatttgactatgccaaatat
ggagccgaggcatgcaaggccaagctccacgctgcacccactggttcaccatgcaacatt
cccaccagtctacacgagggcaacacgggtgctgagctcaaggtgaagtcaaagaccaag
tacgaggttgtgctcaaggctaagccatttgcctatgctccaaagactccttacaaggag
tgtgaaaagccgaagccaaagccgaagcctccaactccttactactatacttctccacca
ccacctacacccgtttatatctataaatcaccacctcctccaccaccaacatacgtctac
aagtcaccaccacctccatcccacccatacaagccaccaactgagccatacaaaccacca
ccatactactacaaatctccacctccaccatcaccctcctacatctataagtcaccaccc
ccaccaacccccacttacgtttacaaatcaccaccacctccatctcacccatacaagcca
ccaactgaaccatacaaaccaccaccatactactacaagtccccacctccaccatcaccc
acctacgtctacaaatcaccaccacctccatctcacccatacaagccaccaactgagcca
tacaaaccaccaccatactactacaaatctccacctccaccatcacccacctacgtctac
aagtcaccacccccaccaacccctacttacgtctacaaatcaccaccacctccatctcac
ccatacaagccaccaactgagccacacaaaccaccaccatactactacaagtcaccacct
ccaccatcgcctacttacatctacaaatcaccaccacctccatctcacccatacaagcca
ccaactgagccacacaagccaccaccatactactacaagtcaccacctccaccatcgcct
acttacatctacaaatcaccaccacctccaccatactactataaatccccaccacctcca
tctccatccccacctcctccatactattacgagtctccaccaccaccaaaacacgaagaa
aaacctccatactactacaagtctcctccacctccatctccatccccacctcctccatac
tactacaagtctccaccacctcctccacattacgtctcaccaccatactattataaatct
ccaccaccaccatcgccatctcctcttccaccatactactacaaatccccgccaccacca
gtccattctccaccaccaccatactattacaaatctccaccaccaccatcgccatctcct
cttccaccatactactacaaatcacctccacctccttcaccctctcccacacccccatat
tattacaagtctccaccaccaccagtccattcccctccaccaccatactactacaaatca
ccaccacctccaataaagtctccagcaccagtctaccactacaactctcctcctccacca
tcaccatctcctcatcctccatattactacaaatccccaccacctccatctccatcacca
ttacccccatattactacaaatctcctcctccaccgtcgccatctcctcttccaccctat
tactacaaatccccaccaccaccagtccactctccaccaccaccatactactacaagtcc
ccaccaccaccatcgccatctcctcttccaccatactactacaaatcccctccacctcct
tcaccctctcctccaccaccatactattacaaatcaccaccacctccagtagaggctccg
gcaccaacctatcactacaaatccccaccaccaccatactactacaactctcccccacca
cccccatattattacaagtccccacccccaccttccccatcaccaccacctccctactac
tacaagtctccacctccaccttccccgtcaccaccacatccttactattacaaatcccca
cctcctccctcaccctcaccccttcccccatattactaccactcacctcccccaccagtg
acatcacctccacctccggtctacatttacgcttctcctccaccaccaactcactactag
DBGET
integrated database retrieval system