Theobroma cacao (cacao): 18603282
Help
Entry
18603282 CDS
T02994
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
tcc
Theobroma cacao (cacao)
Pathway
tcc03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tcc00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
18603282
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
tcc03019
]
18603282
Messenger RNA biogenesis [BR:
tcc03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
18603282
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18603282
NCBI-ProteinID:
XP_007035224
UniProt:
A0AB32VAE3
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(29538436..29541787)
Genome browser
AA seq
463 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEDKLGEYFGQYGNVLQTVVMRDKVTGRPRGFGFVVFSDPSVL
DTVLQEKHTIDGRTVEAKRALSREEQQTSARSGNLNQGRNSGSGGNIRTKKIFVGGLPPT
LTEDGFRQYFEAYGHVIDVVIMYDQNTQRPRGFGFISFDAEDAVDRVLHKSFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPGGLSRTMSGGAGGGGGYQGYGASGGNASSYDGRMDSNRYMQPQSTGAG
FPPYGSSGYSAPGYGYGPANNGVGYGGYGNYGGAGAGYGGPAGAAYGNPNAGYAGGPPGA
PRSSWGTQTPSGYGTMGYGSAAPWGAPGGGAGSGGPGSAGTGQSPTGATGYGSQGYGYGG
YGGNDGSYGNAGYGAVGGRSSGTPNSNASGPGGGDLQGSGGGYMGSGYSDANGNSGYGNA
SWRSDSSQGSGNYGGTQANGPHGGQASYGGGYSGAQGRQAQQQ
NT seq
1392 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcagggaaagttgtttattggagggatatcatgggaaacaagcgaggac
aagttaggggaatactttggccaatatggaaacgttttgcagaccgtggttatgagagat
aaggttaccggaagaccccgggggtttggattcgttgtcttctcagatccgtccgttctc
gatactgttcttcaagaaaaacacaccatcgatggtagaacggttgaggcaaagagggcg
ttatcaagagaggagcagcaaacatctgctagatctggaaatcttaatcagggtagaaat
tcaggaagtggtggaaatattaggaccaagaagatttttgttggagggttgcctcctacc
ttaactgaagatgggtttcgccaatactttgaggcatatggtcatgtaattgatgtagta
atcatgtatgaccagaatactcagcggcctcgtggatttggttttatctcctttgatgct
gaggatgcagttgatagggttttgcacaagagttttcatgatttgaatggcaagcaagtt
gaagtgaagcgagccctccctaaagatgccaatcctggtgggcttagccgaactatgagt
ggtggtgctggtggtggtggaggttaccagggctatggtgcttctggtgggaacgcgagt
tcttatgatggtcgtatggactccaataggtacatgcagccccagagtactggagctggc
tttccaccttatggctcgtcgggatatagtgcacctggttatggttatggtccggctaat
aatggtgttggttatggtggttatggcaattatggtggtgctggtgctggttatggtggc
cctgcaggcgcagcttatgggaaccccaatgctggttatgcaggtggcccacctggtgcc
cctagaagctcatggggtactcaaactccttctggttatggtactatgggttatgggagt
gctgctccttggggtgccccaggtggtggtgctggtagtggtggtccaggttctgcaggt
accggccaatctcccactggagcaacagggtacgggagtcaaggttatggatatggtggg
tatggtggaaatgatggatcttatgggaatgctgggtatggggctgttggaggtcgttcc
agtggtactccaaatagtaatgcttctggtccaggtggaggagatctacaagggagtggt
ggtggctacatgggaagtggatatagtgatgcaaatggaaattcaggttacggaaatgca
tcatggaggtctgattcatcacaaggttctggaaattatgggggcacgcaggcaaatggg
cctcatggtggacaagccagttatggtggtgggtacagtggtgctcagggccgacaagcc
caacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
