Theobroma cacao (cacao): 18613424
Help
Entry
18613424 CDS
T02994
Name
(RefSeq) piezo-type mechanosensitive ion channel homolog
KO
K22128
piezo-type mechanosensitive ion channel component 1/2
Organism
tcc
Theobroma cacao (cacao)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tcc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
tcc04131
]
18613424
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
tcc04040
]
18613424
Membrane trafficking [BR:
tcc04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Others
Others
18613424
Ion channels [BR:
tcc04040
]
Other channels
Mechanosensitive channel (Piezo)
18613424
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Piezo_RRas_bdg
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18613424
NCBI-ProteinID:
XP_017979538
LinkDB
All DBs
Position
1:30235753..30253040
Genome browser
AA seq
2483 aa
AA seq
DB search
MGSFLAGFVLPLLLLTAALINWSLVSLVDLIAFLLIQYTAPKIGFHFRRKYLLQWPVIIF
SLLVCLSQAVYLVMWAIDGYKQSVGDAWWMKLIGFMIIQSWKSPTVIYFLVVQLLVVFVA
LLDIHGTKFGLVPWRYSCWGHFLTAVEHLGSHLRVASCLLLPPIQLVVGISHPSWVSLPF
FIGSCVGLVDWSLTSNFLGLFRLWKALQLYAGFNIVLLYVYQLPIEFSHLLQRIADFVGL
FKISTASEWPEICSAVSLILFYIMLSYVKCDLEEMDFIMSMRESNLTEQLLPSKHSFFIR
ESRSGVRHTNVLLRRTVFRTFTINFFTYGFPVSLFALSFWSFHFASICAFGLLAYVGYIV
YAFPSLFRLHRLNGLLLVFILLWAVSTYIFNVAFAFLNRNFGKDMEIWEMVGFWHYPIPG
LFLLAQFCLGILVALGNLVNNSVFLYSSDEDALSSNNNSAVEVDGETKVFIVATIAWGLR
KCSRAIMLALIFVIAMKPGFIHAVYVIFFLIYLLSHNISRKIRQFLILLCEAHFALLYLL
QIELISNALEQKGSLSLEIILQLGLLKHDSLWDFLEIALLACFCAIHNHGFEMLFSFSAI
VQHTPSRPVGFSILRAGLNKSVLLSVYASPNTSGCHDNASYERRIAAFLSEIGQTFLSIY
RSCGTYIALLTILLTVYMVTPNYISFGYIFLLLVWITGRQLVERTKKRLWFPLKTYAIMV
FIFVYSLSSFTSFKIWLSSFVDLYFYLGYDPEGSLLDNIWQSLAVLIVMQLYSYERRQSK
YNWTDDPNPLDSGVLGFAKRFLIWHSQKVLFVSLFYASISPISAFGFLYLLGLVICSTLP
KASRIPSKSFLVYTGFLMTTEYLYQMWGKQAGMFPGQKHSDLSLFLGFRVYELGFWGIES
GLRGKVLVIAACIFQYNIFRWLDNMPSGISNKGKWEEPCPLFLSAEDTFTNGFMSNGEEK
PSSSFGAVPIRQDRAVSDSWSSLSPAFSQAPHPVSSKAGGSEVSSFRKFSFGYFWGSTKE
SHKWNKKRILALRKERFETQKALLKIYLKFWMENMFNLYGLEINMIALLLASFALLNAIS
MLYISLLAVCVLLNRRIIRKLWPVLVFLFASILILEYFAIWKNMFPLNQNKPSQAEIHCH
DCWRSSSSYFQYCRSCWLGLIIDDPRMLFSYFVVFLLACFKLRADHLSDFSGSSTYRQMM
SQRKNSFVWRDLSFETKSMWTFLDYLRLYCYCHLLDLVLVLILITGTLEYDILHLGYLAF
ALVFFRMRLEILKKKNKIFKFLRIYNFAVIVLSLAYQSPFVGEFSSGKCKTVNYIYEVIG
FYKYDYGFRITARSAIVEIIIFMLVSLQSYMFSSQESDYVSRYLEAEQIGAIVREQEKKA
AWKTAQLQQIRESEEKKRQRNFQVEKMKSEMLNLQIQLHSMNSVATLSDVSPDDEGLRRR
RSASVTSNRDVVPPDKEEGTLGKQEQLIREEVYPLEAHAYAARIKGESPEVVQSPKHSMV
YAPCEITEIEHDVDSAFCDTEKKKSQAKENPLISAVHLLGDGVSQVQSIGNQAVNNLVNF
LNIAPEDSDMNEHSSVEVEAYDEMESQKMQNMCLNRSSSLQSDKSSDATSLQLGRIFCHI
WSQMRSNNDVVCYCFFVLVFLWNFSLLSMVYLAALFLYALCVNTGPTYIFWVIMLIYTEV
YILLEYLYQILIQHCGLSINSDLLHELGFPAHEIKSSFVVSSLPLFLVYLFTLLQSSISA
KDGEWMPFTDFNLHRRSAHYRTEILVSSSWSERVSKSLQFVINMVKLVIRSFCWYWKSLI
QGAETPPYFVQVSMDVHLWPEDGIQPERVESGINQLLRVVHDERCTEKIPSHCPFASRVQ
VQSIERSQENPNVALIVFEVVYASSLTGCTSADWYKSLTPAADVSIEILRAKRAGFVEEM
GFPYKILSVIGGGKREFDLYAYIFVADLTVFFLVAIFYQSVIKNKSEFLDVYQLEDQFPK
EYVFILMIIFFLIVVDRILYLCSFATGKIIFYLFSLVLFTYSITEYAWQIKSSNQNAGQL
ALRAIFLAKAVSLALQAVQIRHGIPHKCTLYRQFLTSEVSRINYLGYRLYRALPFLYELR
CVLDWSCTTTSLTMYDWLKLEDINASLYLVKCDAVLNRAKHKQGEKQTKMTKCCNGICLF
FILLCVIWAPMLMYSSGNPTNMANPIKDATFQTDISTGGGRLTLYQTTLCEKLQWDKLNS
DVNLDPLNYLDSYNKNDIQLICCQADASILWLVPDVVQRRFIQSLDWDMDMGITSTWLLT
RERPKGKEVVKYEKPVDSKDLPERSDVQKVLNGSTNSFRIYNLYPRYFRVTGSGEVRPFE
QEVSSVSADLVINHAAFEWWSFHDINSSNVRGCRDLTGPMAIIVSEETPPQGILGDTLSK
FSIWGLYITFVLAVGRFIRLQCSDLRMRIPYENLPSCDRLIAICEDIYAARAEGELGVEE
VLYWTLVKIYRSPHMLLEYTKPD
NT seq
7452 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggagttttcttgctgggtttgtcttgcctctgctgcttctaacggctgcattgatt
aattggagtttggtctctcttgttgatttgatagctttccttctcattcagtatactgca
cctaaaataggatttcatttccggaggaaatatttgttacagtggcctgttattatcttt
tccctactcgtttgtctttcacaagctgtgtatcttgttatgtgggccattgatggttat
aaacagagtgtaggagatgcttggtggatgaagctgattggttttatgataatccagtct
tggaaatctcccactgtgatttattttttggttgtacaattgctagtggtatttgttgct
ttacttgatatacatgggaccaaatttggtcttgttccttggcggtattcttgttggggt
catttcttaacagccgttgaacatttaggttcccatcttagagttgcttcctgtttgctt
ctacctcctattcagctggttgtgggaataagccatccgtcatgggtgtctttgccattt
ttcattggtagctgtgttgggctagtggattggtctttgacaagcaattttctaggactg
tttaggttgtggaaggcgctccagctttatgcaggcttcaacattgtcttgctctatgtg
tatcagctccctatagagttctcacatttgttacagaggatagctgattttgttggtcta
tttaaaatttccacagcatctgagtggcctgaaatttgctctgctgtttctcttatactt
ttttatatcatgctatcctatgtcaaatgtgatttggaggaaatggattttatcatgtcc
atgcgagaaagtaacttgacagagcaactacttccctcaaagcattcattcttcattcgt
gaatcaagatctggtgtaagacataccaatgttttactacggcgcacggttttccggact
tttaccatcaactttttcacatatggttttccagtatccttgtttgctctttccttttgg
agttttcattttgcaagtatatgtgcttttgggctacttgcatatgttggctacattgtg
tatgcctttccttccctgtttcgtttgcaccggttaaatgggctgcttcttgtcttcatt
ctcttgtgggctgttagcacctatattttcaatgtggcatttgcattcctgaataggaat
ttcgggaaggatatggaaatttgggagatggttggattttggcattatcccatacctgga
ctttttttgcttgcacaattttgtcttgggattttggttgctttgggtaatcttgtaaac
aattctgttttcctttactcatctgatgaggatgcactatcatcaaacaacaactctgct
gtggaagtggatggagagaccaaggtgttcattgtggctacaattgcatggggactgcga
aaatgttctcgagctatcatgcttgcactgatatttgtcattgctatgaaacctgggttt
atccatgctgtatatgtgatattctttttgatatatcttttgagccacaacatcagcaga
aagatacgccagtttctgattcttctatgtgaagctcactttgcattattgtaccttctt
cagattgagttgatctctaatgctttggagcaaaaaggctccttaagtttggaaatcata
ttgcagttaggtctgcttaaacatgatagcttatgggactttctggaaatagctttactt
gcttgcttctgtgcaattcataaccatgggtttgagatgctattttcattctcagcaatt
gtgcagcacacccctagccgtcctgttgggtttagcatcttgagagctggtctgaacaaa
tctgttctattgtcagtatatgcgtccccaaacacatcgggttgccatgataatgcttct
tatgagagaaggatagcagcatttcttagtgaaattgggcaaacgtttttatcaatatat
cgatcatgtggaacctacattgctttgctgactattcttcttacagtatacatggtgaca
cccaactatatatcttttggatacatcttccttctccttgtttggattactggaagacaa
cttgttgagagaacaaaaaagcgcctatggtttcctttaaaaacatatgcgatcatggtg
ttcatttttgtctatagcttgagcagtttcaccagctttaagatttggttgtccagtttt
gtagatctgtatttttatttgggttatgacccagaaggttcattgttggataatatctgg
caatctctagcagttctaattgtgatgcaactttatagctatgaaaggaggcagagcaag
tacaactggactgatgatcccaatcctttagattctggggtacttgggtttgccaagcgg
tttctgatttggcacagccagaaggtcctgtttgtttcattattctatgcgtctatatct
ccaatttctgcttttggattcttgtatctacttggccttgtcatatgttcaactttacct
aaagcttctcggatcccatccaaatcgttcttagtttatacaggatttctgatgacaaca
gagtatctttatcagatgtggggtaaacaggctggaatgtttccagggcaaaagcattct
gatttgtcactctttctgggtttccgtgtatacgagctgggattttggggtatagaatca
ggcttgaggggaaaggtgctggtaattgctgcatgcatctttcaatacaatatcttccgt
tggttggataatatgccaagtggtatttcgaacaaaggcaagtgggaagagccttgtcct
ttatttttgtcagcagaggacaccttcaccaatggctttatgtctaatggggaagaaaag
ccatcatctagttttggggcggtacctataagacaagacagagcagtaagtgattcatgg
tcatctttgagccctgctttttctcaagcacctcatcctgtgtcctccaaagcaggaggc
tctgaagttagtagctttagaaaattttcatttggatatttctggggaagcaccaaggag
agtcataaatggaacaagaagcggatccttgcattaaggaaagagagatttgaaacacag
aaggctctcttaaaaatatatttgaaattctggatggagaacatgtttaacctttatggc
cttgagattaacatgattgcattgcttcttgcaagttttgcattgttgaatgccatctct
atgctatatatttcattgcttgctgtttgtgttcttttgaatcggcggattattcgtaaa
ctgtggccagtgcttgtcttcttgtttgcttccatcctcatccttgaatattttgccatc
tggaagaatatgtttcctctgaatcaaaataaaccaagccaggctgaaatacattgccat
gactgctggagaagctcatcttcatatttccaatattgcaggagctgttggctgggactg
atcattgatgatccccgaatgcttttcagctattttgtggtctttctactagcatgtttc
aaactccgtgcagatcacttgtccgatttctcagggtcatcaacatatcggcaaatgatg
tctcaacgtaaaaattcatttgtttggcgagatctctcttttgaaaccaaaagcatgtgg
acctttcttgactacctaaggctttattgttattgccatctattggaccttgtccttgta
ttgattttgattactggaactcttgagtatgatattctgcaccttggttatcttgctttc
gctcttgttttcttccggatgaggcttgaaattctcaagaagaagaataaaatattcaag
ttcttgcgtatctacaacttcgcagtcattgttctttctcttgcctatcaatctcctttt
gtaggggagttcagttctgggaagtgtaagactgtgaactatatatatgaggtcattgga
ttttacaagtatgattatgggtttcggattactgctagatctgcaattgttgagattatc
atatttatgttggtatcccttcagtcatatatgttttcctctcaagagtctgattatgtg
tcacgatatctggaagcagagcaaattggtgccattgtacgcgagcaagagaaaaaagct
gcatggaaaactgcacagttacaacagattcgtgaatctgaggagaagaaacgtcagcgt
aactttcaagtagagaaaatgaaatctgagatgctcaacttgcaaatacagcttcatagc
atgaactcagttgcaactctcagtgatgtttctcctgatgatgaaggcctacgaaggagg
aggagtgcttctgttacttcaaatagggatgttgtgcctcctgataaagaggaaggcact
cttgggaagcaagagcaacttattagagaggaggtatacccccttgaagcacatgcatat
gctgctcgtataaaaggagaaagtccagaagtagtgcaatctccaaagcactcaatggta
tatgcaccttgtgagattactgaaattgaacatgatgttgatagtgcattttgtgataca
gagaagaagaaaagccaagcaaaggaaaatcctttgatttctgcagtacacctcctaggt
gatggtgtttcccaggtacagtctattggaaatcaggcagttaataaccttgtgaatttc
ttgaacattgcaccagaagattcagacatgaatgagcactcatctgtcgaggttgaggca
tatgatgagatggagagccaaaagatgcagaatatgtgtttaaaccgttcatcctctctg
caatctgataaaagttctgatgctacaagtttgcagctggggagaatcttctgccatata
tggtcccaaatgcggtctaataatgatgttgtgtgctactgtttctttgttcttgtcttt
ctatggaatttcagtttgctttctatggtgtatcttgcagctcttttcttgtatgctcta
tgtgtgaataccggcccgacttatatcttctgggttattatgctgatttacacggaggtt
tatattttgcttgaatatctgtatcaaattctaatccagcattgtggattgagcattaac
tcagacctactccatgaattaggatttcctgctcatgaaatcaagtcatcgtttgttgtg
agttcgttgcctctatttcttgtctacttatttaccctcttacagagctctataagtgca
aaagatggtgaatggatgccctttaccgactttaacttacataggaggagtgctcattac
agaacagagattcttgtgagctctagctggagtgaaagagtatcaaagtcactccaattt
gtaataaacatggtgaaactggtaattagaagcttctgctggtactggaaatcattgata
cagggagctgaaactcctccttattttgttcaagtgtcaatggatgttcacttgtggcca
gaggatgggattcagccagaaagggttgagtctggaataaaccaactgctaagggtggtt
catgatgagagatgtactgaaaagatccctagtcattgcccatttgctagtagggttcaa
gttcaaagcattgaaagaagtcaagaaaacccaaacgtggctttgattgtttttgaggtg
gtgtatgcatcttctttgacaggatgtacctcagcagattggtacaaatcactaactcca
gcagctgatgtgtcaatagaaattctcagggcaaagcgtgctgggtttgttgaagagatg
ggattcccatacaaaatcctctctgttattggcggtgggaaaagggaattcgatctgtat
gcttacatatttgttgctgatttgactgtgttctttttagttgcgattttctaccaatct
gtcattaagaacaagagcgaatttcttgatgtttatcagctagaagatcaatttcctaaa
gagtatgtatttatcttaatgatcatctttttcttgattgttgttgatcgcatactttat
ctctgttccttcgccacaggaaaaattattttctaccttttcagccttgttctcttcaca
tattcgattacagagtatgcttggcagataaaatcttccaaccagaatgctggacagcta
gcactccgtgctatttttcttgctaaagcagtatctctagcacttcaggctgtacaaatc
cgacatgggattcctcataaatgtaccttgtatcggcagtttttgaccagtgaggtttca
cggattaattacttaggctatagactttatcgggctctaccattcctttatgaattacga
tgtgtactcgactggtcgtgcacaacaacatctttgaccatgtatgactggctcaaactg
gaagacatcaatgcaagtctgtaccttgtcaaatgtgatgctgtgttgaacagagcgaag
cacaaacaaggagaaaagcaaacaaaaatgactaaatgctgcaatggaatatgtctgttc
tttatattactttgtgttatctgggctcctatgctgatgtacagcagtggcaatccaaca
aatatggcaaaccccattaaagatgcaacttttcaaacagacattagtactggtggtgga
aggttgaccttgtatcagacgactctctgtgaaaagctccaatgggataagctcaattct
gatgttaatcttgatcccctaaattatttggactcatacaataagaatgatatacaatta
atatgctgccaagctgatgcaagtattttgtggcttgtccctgatgtggttcagagaaga
tttattcagtcccttgactgggacatggacatgggtatcacttctacttggctgcttact
agggaacgaccaaagggcaaggaagttgtgaaatatgagaaacctgttgattctaaggat
cttcctgaacggtcagatgtccaaaaggttcttaatggttcaacaaacagctttaggata
tataatctttatccaagatacttccgtgtcactggttctggtgaagtccgaccttttgag
caagaggtaagttcagtgagtgcagatcttgttatcaatcatgcagcttttgagtggtgg
tccttccatgatatcaattcatctaatgtaaggggctgcagagatttaacaggacctatg
gccataatagtatctgaggaaacaccaccccagggtattcttggagacacactaagcaag
ttcagcatttggggtctctacataacttttgtgcttgctgttggccggtttatcaggctt
caatgctctgacttaagaatgagaataccatatgagaacctgccttcctgtgataggttg
atagccatctgcgaagatatatatgctgcaagagcagaaggtgagcttggagtcgaagag
gtcctttactggaccctagtgaagatctataggtcaccacacatgctgcttgagtatacc
aaacctgactag
DBGET
integrated database retrieval system
