Tigriopus californicus (tidepool copepod): 131881757
Help
Entry
131881757 CDS
T09700
Name
(RefSeq) fibrillin-2-like
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
tcf
Tigriopus californicus (tidepool copepod)
Pathway
tcf04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tcf00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
131881757
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
tcf00536
]
131881757
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
tcf00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
131881757
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
131881757
NCBI-ProteinID:
XP_059084689
LinkDB
All DBs
Position
6:3564176..3575643
Genome browser
AA seq
2555 aa
AA seq
DB search
MKHNGCSRLSKLDCCCGAGMGVAWGESRADCEPCPIKGTKDFDDMCEAVANILNPADVDE
CALRNDLCPHGRCINTDTGYYCECEIGYQNSPSGSCIDVNECLAGKCKGGRCRNSPGGFD
CNCPPGMHLSQDGSACIDHNECERSGFCANGECINAMGSFKCECKDGFQLSPSGLSCVDI
DECLENPRICLRGRCRNTPGAYICECEGGFMHSSDGAFCMDENECSHDHMCENGQCINMD
GGFKCVCDPGYELSRNGKTCVDIDECRSSPCLNGKCSNTNGGFQCECHSGFSLGPDGRTC
TDSVMGPCYDLFRHGQCLNPSTNMVSKSSCCCNTGVSIQGWGMPCQSCPIPGSYEFKDLC
PHGPGFTNSGNDINECAQNKDICANGACENLIGAYRCICNPGYEIDPLGKQCVDVDECKI
NPLLCAGGQCKNTPGSYQCACPPGTIFNLVSNICDDENECVQLGLEACPNGRCINTKGSY
TCECNPGSVLDSSGRFCLDNRRGSCWTKMNNGNQCENNLPTLTLKSECCCSVGLAWGSPC
EKCDEARDCDCPAGMAKMDGKVCTDINECTLDPNVCQGGICINTDGSFKCRCPPGLTLDT
SGTQCVDERVEPCFLDYRLGVCSKDIGGFYKRDRCCCSIGEAWGHRCSQCPRPGTAAYNE
LCPKGPGFVDLLDVNECLNFPNMCQNGRCKNTIGSYSCRCNQGYALDEDGVRCVNINECD
IMFGVCGNGTCIDVPGGFTCDCDAGFETTPMMQVCMDINECERSPGLCRGGKCINTPGSF
HCECPSGHELSEDGRACKDIDECGLNSEVCSNGVCENMMGAYQCICDEGFRQAGSGTSCI
DIDECADDNGGCDNSCINTPGSYSCTCATGYMLLMDGRSCKDIDECEETKNPCNGGKCMN
TPGSFSCVCSGGLMMGSDGSSCLDLDECAINENVCKNGKCENTLGSFKCLCDDGYSIKEE
LEDGCTDDDECELNLYHCDPRAECQNTNGSYVCSCHEGFSGDGFECQDINECLTNNGGCD
SHAQCINIPGSFKCVCDQGYNGDGIQCEDIDECSDDPTLCDNGVCLNEQGSFSCECQMGY
MHPEQDNTQACIDIDECSLLDNVCLNGECENLHGVYRCVCHPGYTLDNSGGNCTDIDECQ
DQLSCQYGQCSNEDGSYQCECPSDMELLPSGTGCVDRRVGRCYMNFNITFGGYSVCGGSL
GDEVSRSACCCSVGLAWGDRCEKCPEIGTDEYNLVCPGGKGFHPNEKTIILEDINECLEI
QGICKNGRCSNTFGSYMCTCDHGFKLDSGQIECIDVDECLENPIACGEGKCVNIHGGFEC
ICPDGYMLASDGQECIDMRKEMCFMSFNSNNCSQPMSRSQTKVVCCCSMGQGWGPGCESC
PATGTQQYQALCGNGSPGMMIDPLSGTTHEIDECLMMPGMCQHGTCMNTIGSFTCDCELG
FTYDDASHQCIDTNECNFNGAAACFGNSRCVNTQGSYECVCPPGYKLDHSGRDCLDVDEC
SENFNLCRNGQCTNIGGSFQCVCDQGFALTTSKDACMDRDECALNPTICGNGTCLNVQGS
YRCQCHYGFQLSAQGDCEDVDECRIRYDICRNGRCKNTRGSFTCDCPDGYILSADGQNCE
DVDECQDPGICPEPGACQNIMGSFICTCPDGYRLNPSGVECEDINECLEQPGFCENGFCE
NRDGEALCECSPGWALDPSGIKCLDVRTEQCFNQYRGRFCMNPRSINATKQTCCCTKGEA
WGSECERCPREGSRAFDELCPLGSGRGGDGEDFNECEMIDGICEGGSCVNTDGGFRCECP
NGFTLDPEGISCVDENECVTKPLICGNGTCANVNGGFECECSDGYAPGPRGICEDVDECR
EYGHQCAFRCHNVPGSFRCICPFGYTLAPDGLHCMDLNECESEANNCRYECKNLIGSFMC
VCPEGYRKIGYSDDCEDIDECASNSELCGQGRCINIEGGYQCECPLGYEISANGKECTDR
REGLCHQKIFGGRCPRKMPEIGTTLVTKADCCCTMGAAWGDECEICPTRGTLAFEKLCMD
TGFGAYGQDIDECQTLPNLCNNGQCINAMGSYRCICDRGFKPDNTKTACNDVNECLQRPG
PCEHECQNTYGSFICSCPPGYLLNSDRTTCRDVDECSTGQHMCEHECVNTQGSYQCVCPP
GFTQFGDRCLDTDECVEQPGLCPPPGTCKNTRGSFKCVCPRGYRLDGSGTFCIDTNECDE
DPSRCDKAECRNHLGSYKCGCPDGFALHSYLNQCEDQNECSLGNNPCGNARCQNSIGGYA
CTCPSGYQYNQQLLICVQASLGCSQAACSFGCNPVGSNGFSCGCPRGYQGVGNSHCLAIN
DPDSFRDQGDLDYEFLDEGEEQDESVVSNEGCFACKMNGNGSMKRRRMGTGRRQSRSYSR
KRLQRRRNVHNRSIRSSQGHSHAEFPSNQDTINLLFGLVDTRHKRSTEEPTSTTTGRPFQ
SQEILIELKRNQTKHRRRILFLQPSTMDLEHYLTYEIDGLDKELFQIKRRDGIWGLFYRR
RVREAGVHKITILSKEDANQRHGTLHMRLKVVIVD
NT seq
7668 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagcacaatggttgttccaggctctccaaattggattgttgttgtggtgcgggaatg
ggcgtggcctggggagaatccagggccgattgtgagccgtgtccaatcaaagggaccaaa
gactttgacgacatgtgtgaagctgtggcaaacattctgaaccctgcagacgtagatgaa
tgcgcgttaagaaacgacttgtgccctcatgggaggtgcatcaatacagataccggctac
tattgcgaatgcgaaattggataccagaactctcccagtggttcatgcattgatgtgaat
gaatgcttggcaggcaaatgtaaagggggaaggtgccgaaactctccgggagggtttgat
tgcaattgtcctcccggaatgcatctctcccaagacggctccgcgtgcattgatcataat
gagtgcgagcgaagtgggttctgcgctaacggggaatgcatcaatgccatgggatccttt
aagtgtgagtgtaaggatggttttcaactgtcgccctctggactctcttgtgtggacata
gacgagtgcttggaaaacccgcgcatttgcttgagaggccgatgtcgaaacactcctgga
gcctatatttgtgaatgtgagggtgggttcatgcattcctctgatggtgcattctgcatg
gatgagaacgaatgctctcatgatcacatgtgtgagaatggtcaatgcatcaacatggac
gggggtttcaagtgtgtctgcgatcctggctatgaattgtctcggaatggcaagacctgt
gtggacattgatgagtgccgaagcagtccttgcctcaacgggaagtgttccaataccaat
ggcggcttccaatgcgagtgtcacagcggcttttcattgggaccagatggtcgaacctgt
acggactccgtcatgggcccttgctacgacctgtttcgccatggccaatgtctcaaccca
tccaccaatatggtttccaagtcatcatgctgttgcaacaccggggtctccattcaaggt
tggggaatgccttgccagtcttgcccgatccccggatcttatgagttcaaggacctatgc
cctcatggcccgggtttcaccaacagtggcaatgacatcaatgagtgcgctcaaaacaag
gacatctgtgctaatggggcttgcgagaatctaattggagcttacagatgcatttgcaat
ccaggctatgagatcgatcctttggggaagcaatgcgtcgacgtggatgagtgtaagatc
aaccccctcctttgtgctggaggccaatgtaagaacacccctgggagttatcaatgtgcc
tgtccaccaggaaccattttcaatctggtgtcgaacatctgtgacgatgagaatgaatgt
gtacaacttggtctcgaagcttgtcccaatgggcggtgtatcaacaccaagggcagctat
acttgcgagtgcaacccgggatcagttttagattcctctgggcgtttctgcctcgacaat
cgacgtggtagttgttggaccaaaatgaataatggcaaccaatgcgaaaataatttgccc
actctcaccctcaaatccgaatgttgctgctctgtcgggctagcttggggtagtccttgc
gaaaaatgtgatgaggcaagagattgtgattgtccagcggggatggctaaaatggacggc
aaggtttgcaccgacatcaatgagtgtactttggatcccaatgtttgtcagggcgggatt
tgcatcaataccgatggatctttcaaatgccgatgtccaccaggattaacattggataca
tccggaacccaatgtgtggatgagcgagttgagccttgcttcctggattaccgtctcggg
gtttgtagtaaggacattggaggcttttacaagcgcgaccgttgttgttgttccattggc
gaggcttggggtcatcgttgctcacaatgtcccagacctggaactgcagcctacaacgaa
ctctgtcccaaaggtccagggtttgtagatcttctggatgtcaatgagtgcttgaacttt
cccaacatgtgccagaatggtcgctgtaagaacaccattggtagctacagctgccgttgc
aatcaagggtatgccttggacgaggacggagtacggtgtgtaaatatcaatgaatgcgac
atcatgtttggcgtgtgtggaaatggcacttgtatcgatgtccccggggggttcacgtgt
gactgtgatgctggttttgaaactacgccaatgatgcaggtctgtatggacatcaacgag
tgtgaaagaagccctggcctttgtcggggaggcaaatgcatcaacacgcctggtagcttt
cattgcgaatgtcccagtggacatgaactatctgaggatggccgtgcctgcaaggatatt
gatgaatgtggtctgaactccgaggtgtgttccaatggagtttgtgaaaatatgatgggc
gcataccaatgcatttgtgacgagggattccgccaggctggttctggaacatcttgcatt
gatattgatgaatgtgccgatgataatggaggatgtgataatagttgcatcaatacccca
ggttcttactcgtgcacctgtgccactggttatatgctactgatggacggccgaagttgc
aaagacattgatgaatgcgaagagaccaagaatccttgtaacggaggcaagtgcatgaac
acacccgggagtttctcatgcgtatgctctggaggactaatgatgggctcagacggatcc
tcgtgtctcgaccttgatgagtgtgctatcaatgaaaacgtttgcaagaatggaaagtgc
gaaaacactctcggttccttcaaatgcctctgtgacgatggctactcaatcaaagaggaa
ttggaagatggctgcacggatgacgatgaatgcgaactcaacttgtatcactgtgatccc
agggctgaatgccaaaacaccaatggatcctacgtgtgctcttgccatgagggattcagt
ggggatggttttgaatgtcaggacattaatgagtgccttacgaataatggaggctgtgac
tcccatgctcagtgtattaatatcccggggtctttcaaatgcgtatgtgaccaaggttac
aacggcgacgggatccagtgtgaagatattgacgagtgctcggatgatcccactttatgc
gacaatggagtctgtctgaatgagcaaggatcattttcttgcgaatgccaaatggggtat
atgcatcccgagcaagataacactcaggcttgcattgatatagacgagtgttccttactg
gacaacgtttgcttgaacggcgagtgtgagaaccttcatggggtctacagatgcgtgtgc
catcctggatacacgttggataattcgggtggaaactgcacggacattgatgaatgccaa
gatcaattgtcgtgtcagtatggtcaatgctccaatgaggatgggtcctatcaatgcgag
tgcccttcagatatggaactccttccctcgggcactggttgtgtggatcgcagggttggg
agatgttacatgaacttcaacatcactttcggaggatatagcgtgtgtggtggttcattg
ggggatgaagtctcaagatccgcatgctgttgctcagtgggcctagcttggggagatcga
tgcgagaagtgtccagaaatcggtactgacgaatacaacctagtttgtccggggggcaaa
ggtttccatcccaacgagaagacaatcattctcgaggatatcaacgaatgccttgaaatc
caaggaatttgcaaaaatggccgttgctccaacacctttggtagctacatgtgcacttgc
gatcacggattcaagctagattccggtcagattgaatgcattgacgttgacgagtgcttg
gaaaatcccattgcttgtggtgagggcaaatgcgtgaacattcacggaggctttgaatgt
atctgtccagatggatacatgcttgcgtctgacggacaggagtgcatcgatatgcgcaaa
gagatgtgcttcatgagcttcaactccaacaattgctcccaacccatgtcacgatctcaa
accaaggtggtgtgttgctgctctatgggacagggttggggtcccggttgtgagagctgt
ccagccactgggacccaacaatatcaagccttgtgcggcaatgggagtccaggtatgatg
atagatcccttgagtgggaccactcacgagattgacgagtgcctcatgatgcctgggatg
tgccaacatggaacctgcatgaacaccattggcagcttcacttgcgattgtgagctgggg
tttacctacgacgacgcctctcaccaatgcatcgacaccaatgagtgtaacttcaacgga
gcagcagcttgtttcggcaactcaaggtgtgtgaatacccaaggtagctatgaatgtgtt
tgcccaccaggatacaaactggaccattctggtcgcgattgtctggacgtggatgagtgt
tctgagaacttcaacctttgtcgaaacggtcaatgtaccaatattggtgggagctttcaa
tgtgtctgtgatcaaggattcgctcttaccacatccaaagatgcgtgcatggatcgggac
gaatgtgcactgaacccaaccatttgtggaaatggaacgtgcttgaacgttcaaggatcg
taccgttgtcagtgtcattacgggttccaattgagtgcccaaggagattgtgaggatgtg
gatgaatgccgcattagatatgatatttgtcggaatggccgatgtaaaaacacccgtgga
agttttacttgcgattgcccagatggttatattctctcagctgatgggcaaaattgcgag
gacgtggatgagtgtcaagaccccgggatttgtccggaacccggtgcttgtcaaaacatc
atggggtccttcatttgcacctgtcccgatggataccgcttgaatccctctggagtggaa
tgcgaagatatcaacgaatgtttggaacaacccggcttctgcgaaaacgggttctgtgaa
aatcgcgatggggaggccttgtgcgaatgcagtcccggatgggctttggatccatcgggg
attaagtgtctggatgttcggactgagcaatgtttcaatcaatatcgaggacggttctgt
atgaacccacggtcaataaatgccacgaaacagacatgctgctgcaccaaaggcgaagct
tggggctctgagtgtgagcgatgtccaagagaaggatcaagagcctttgatgaattatgt
ccgttgggcagtggacgaggaggagatggagaggacttcaatgaatgcgagatgattgat
ggcatttgcgaaggaggctcctgtgtgaacactgatggtggttttaggtgtgaatgtccg
aatggttttactttggaccccgaagggatcagttgcgtggacgagaacgaatgtgtcacg
aaacctctcatttgtgggaatggaacttgtgccaacgtgaatggcggctttgaatgcgag
tgctcagacggttatgctccagggcccaggggaatatgtgaggacgttgatgaatgccgt
gaatatgggcatcaatgtgcttttagatgccacaatgttccgggctcgtttcgctgcatt
tgtccctttggctacacactagctcctgatggtctgcactgtatggatttgaatgaatgt
gagtccgaggccaacaactgtcgatacgagtgcaaaaacctaatcggatccttcatgtgc
gtgtgcccggagggttatcggaaaatcggttattccgacgactgtgaagatattgatgaa
tgtgcaagtaactctgagctgtgcggccaaggcaggtgtatcaacatcgaagggggctac
caatgcgaatgtccacttggatatgagatctcggcgaatggaaaggaatgcactgatcgg
agggagggactttgtcaccaaaagatcttcgggggtcggtgcccacgaaagatgcccgag
attggaaccacgctcgtgaccaaggcagattgttgctgcacaatgggagccgcttggggt
gacgaatgtgaaatctgccccactcgtggaacactggccttcgagaaactgtgtatggac
acaggctttggggcctatggacaagacattgacgaatgccaaactctgcccaacctttgt
aacaacggccaatgcattaacgccatgggatcctacagatgcatttgcgaccgaggattc
aaaccggataacaccaagaccgcatgcaacgacgtgaatgagtgtctccaaagaccaggg
ccttgcgagcacgaatgtcagaacacatacggttcattcatttgctcttgtccgcctggt
tacctcctcaactccgatcgaactacttgtcgggatgtggatgagtgttccactggtcaa
cacatgtgtgagcatgaatgcgtgaacactcagggctcgtaccagtgtgtttgtccgcct
ggcttcactcaatttggtgacagatgtctggatacagacgagtgtgtggaacaaccgggt
ctctgcccaccaccaggcacttgcaagaacacccgtgggagcttcaaatgtgtctgccct
cgaggttatcgtctggacggaagtgggactttttgcatagataccaatgaatgtgacgag
gatccttctcgatgtgataaagcagaatgtcgcaatcatcttggatcgtacaaatgtgga
tgcccagacggattcgcactccattcttatctcaatcaatgcgaggatcagaatgaatgt
tcccttggaaataacccttgtggcaatgcaagatgtcaaaactccattggaggatatgct
tgcacatgtccgtctggctatcagtacaatcagcaactattgatttgtgtacaagcctcg
ttggggtgctctcaagccgcatgctcatttggatgcaaccccgtcggatccaacgggttc
agctgcggttgtccaagaggttatcagggcgtaggaaactctcattgccttgccattaat
gatccagacagtttccgcgaccaaggggatttggattatgaatttttagatgagggtgaa
gagcaagatgagtcagtagtgagcaacgaaggctgctttgcttgcaaaatgaacgggaat
gggtccatgaaacgccgaagaatgggaacaggacggcgtcaaagccgaagctacagtcga
aaaagattgcaaaggcgccggaatgtccacaatcgaagcattcgctcaagccaaggtcac
agtcacgcagaatttccgtccaatcaagacaccattaacctactctttggtcttgtggac
actcgccacaaaaggtcaacagaggagccaactagcacaactacaggacggccttttcaa
agccaggagatcttaatcgaattgaaacgtaatcaaactaaacacagacggcgcatcctt
ttcctccaaccttcaaccatggatctggaacattatctcacttacgaaatcgacggactg
gataaggaattgttccagatcaaacgaagagacggaatctgggggcttttctaccgtcga
cgggtgcgggaagcaggtgtacacaaaatcactatcctgagcaaagaagacgcaaaccaa
cgacacggcaccttacacatgcgattgaaagtagtaattgtagattga
DBGET
integrated database retrieval system
