Hydrogenovibrio crunogenus: Tcr_1856
Help
Entry
Tcr_1856 CDS
T00296
Name
(GenBank) Resistance-Nodulation-Cell Division (RND) superfamily cation efflux transporter
KO
K15726
heavy metal efflux system protein
Organism
tcx
Hydrogenovibrio crunogenus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tcx00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tcx02000
]
Tcr_1856
Transporters [BR:
tcx02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
Tcr_1856
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABB42448
UniProt:
Q31EH5
LinkDB
All DBs
Position
complement(2031032..2034226)
Genome browser
AA seq
1064 aa
AA seq
DB search
MITRMTDWAVTNRLLVVIALITIISTSIFMIPKLNLDAFPDVTNVQVTVNTEAPGLASEE
VEQLITYPIEAVMYALPDVEEVRSISKTGLSGVTIVFKEGTDIYFARQLVFERLQSAKEL
IPDNVGTPEIGPNTSGLGQVYQYLLVAEPGSGYDAIALRSLNDWVVKLLLMPVDGITDVL
SFGGEVRQYQVNINPSRLLAFKLTQDDVIHAIEQNNDNVGGWYMNRGQEQLIIRGSGWFN
AGKDGLEEIRQVPLKTIDGKVIKVADVAMVEFGGEIRQGATTMTRRTNDGQVETLGEIVS
GIVLKRMGANTQATIEGIDERIDMIQLALPEGVKFEAFYDQTDLIDKAINTVANALVEAF
IFIVIVLVLFLLNVRAVTLVLISIPLSIGVALAIMAHYGLSANLMSLGGLAVAIGMMVDG
AVVMMENIFKHLTKPDSRHNSEHSKNLSPGSETPYELERDHGIALRIKLAASEVAKPIFF
AVSIIMVVFTPLFSLEGVEAKLFQPMAVSIMIAMAVSLVVSLIVVPALASYFFQNGFKER
TSPLMVILEKAYRIVLAKAMNVKAVVLSGAIVLLISALMLVPYLGTEFAPELEEGTINLR
VTMAPSTSLDTALSVSPKLESILMEFPEVTYAVSRIGRAEVGGDPEPVSNIEIFIGLKPV
SEWSTADNRLELQEKMEEKLQQHPGLLFNFSQPIATRIDELLSGVKAQLAIKLIGPDLNV
LSDKGKLIEKAVRNIEGARDVAMEAIEGEAQLVIKPNRRELSRYGLSVGDVMSKVKDGLG
GREAGQVINGNERYDIYVRIADEFRNNVNAISDLRLQSPSGAVVRIGDIATVSIESGPPQ
VRRDDVQRRVVIQANVQGRDMGGVVKDIRDTVAKEIDLPPGYTVAIGGQFENQQRAQNRL
MVVVPISIGLIALLLYFAFNSVGQAMLILVNLPLAMIGGIAALYISGQYLSVPSSIGFIT
LFGVAVLNGVVMVEAINHRIMGGNESISQAIFEGAISRLRPVLMTAIIASLGLIPMIMAT
GIGSEIQRPLATVIVGGLISSTFLTLFVLPVLYEWFSKKKLAES
NT seq
3195 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattactcgaatgactgattgggcagtcacgaaccgtttgttggttgtgattgctttg
ataacaataatttccacctctatttttatgattccgaaattaaatttggatgcttttccc
gatgtcaccaatgtacaagttacagttaacacagaagcaccgggtttagcctccgaagag
gttgagcagcttattacctatccgatcgaagcggttatgtatgcgttaccagatgttgag
gaggtacgttcaatttcgaaaacgggtctctcaggtgtcacgattgtctttaaagaaggg
acggatatctattttgcacgacagttggtgtttgaacgcctgcaatcggcaaaagagtta
atccccgataacgttggtacacctgaaataggtcccaacacttcagggttaggacaagta
tatcaataccttctcgttgctgagccgggttctggttatgatgctattgctcttcgcagt
ttgaatgattgggttgttaaactgttattgatgcctgtagatggtattactgatgttctc
tcatttggtggtgaagttcgccaataccaagtgaatattaacccatctcgcttgctagct
tttaagctgacacaagatgatgttattcatgctattgaacaaaataatgacaatgttggt
ggttggtacatgaaccgtggtcaagaacaactcattattcgtggttcaggttggtttaac
gctggcaaagatggccttgaagaaattcgccaagtaccattaaaaacaattgatggaaaa
gtcattaaagttgctgatgttgcaatggtcgaatttggtggggagattcgtcaaggggca
acaactatgacccgaagaacaaatgatgggcaagtggaaacacttggtgaaattgtttca
ggtatcgtgctaaaacgcatgggggccaatacgcaagcaacaatagaaggaattgacgag
cgaattgatatgattcaactggccttgccagaaggagttaagtttgaagcgttctatgat
caaactgatttaattgataaggcaatcaataccgttgcaaatgctttagtagaggcattt
atttttattgttattgttctggtcttgtttttattgaatgttcgagctgtaacattagta
ctgatatcgattccattatctattggggtcgcactggcaataatggcgcattatggtttg
tcggccaatttaatgtcattgggtggtcttgccgtagctatcgggatgatggtagacggt
gctgtggttatgatggaaaatatctttaagcacttaacaaaacccgactcgaggcataat
tctgaacacagtaaaaatcttagcccaggttctgaaacaccatatgaattagagcgggat
catggtattgctttgcggattaaattggcggcaagtgaggttgccaagcctatatttttt
gccgtatccattattatggtagtttttacgcctctgttttccttagaaggtgttgaggcg
aagttgtttcagcctatggcagtgagcattatgattgcaatggcagtatctttagttgtt
tctttaattgttgtgcctgcgctagcgagttacttttttcaaaatggttttaaggaaaga
acaagccctttgatggttattctggaaaaggcgtaccgaatagtgcttgccaaggcgatg
aatgttaaagcggttgtcttatcaggtgccattgtgctactcatttctgctcttatgtta
gtgccgtacttaggaacagagtttgcgcctgaattagaagagggtacgataaatttacga
gttaccatggcgccctcaacaagcttagatacagctttgtcggtatctcctaaacttgaa
tctatactaatggagtttccagaggtcacttatgcggttagccgtattggacgagcagaa
gttggtggagatccagagcctgtaagtaatattgaaatctttattggtttaaagcctgta
tctgaatggtcaacagcagacaaccgtcttgaactgcaagaaaaaatggaagagaagctt
caacaacatccagggcttttattcaacttttcacaacctattgcaacccgtatagatgag
ttgttatccggtgtaaaagcacaattagctataaagctaatcggaccagacttgaatgtt
ctgtctgataaaggaaagttaattgaaaaagccgtcagaaatattgagggtgcaagagat
gttgcaatggaagctattgaaggagaagcgcaattagtaattaagccaaaccgccgagaa
ctttcacgctacggcctttctgtaggcgatgtaatgtccaaagtgaaagatgggctcgga
ggtcgtgaagctgggcaagtcattaatggtaacgaacgttatgatatttatgtgaggata
gcagatgaatttagaaataacgttaatgcgatttctgacctaagattgcagtctccatca
ggagcggttgttagaatcggtgatattgcaacagtctccattgagtctggtcctccacaa
gtaaggcgtgatgatgtgcagcgtcgcgtcgttatacaagctaacgttcaaggacgtgat
atgggaggagttgttaaagacatcagagatactgttgctaaagaaatagatttaccacct
ggttataccgtagctattggtgggcaatttgaaaaccagcaacgtgcacaaaatcgatta
atggtggtggtgccaatttcaattggtttgattgcattattgctgtactttgcatttaat
tctgttggtcaagcaatgctaattctagttaatttaccattggccatgattggtggaatt
gctgcgctttatatatcagggcagtatttgtccgttcctagctcaattggatttattaca
ttattcggtgttgcggtgttaaatggcgtagttatggttgaagcaatcaatcaccggatc
atgggtggaaatgaatcaatttcgcaagccatttttgagggtgctatttcaaggttaaga
cctgtgttaatgactgcaattattgcgtcactaggactaattccaatgattatggcaaca
gggattgggtctgagattcaacgcccgttagctacagtgattgtagggggattaatctcg
tcaactttcctcactctttttgttttgccagtactgtatgaatggttctcaaaaaagaaa
ttagctgaatcataa
DBGET
integrated database retrieval system
