Trachymyrmex cornetzi: 108766349
Help
Entry
108766349 CDS
T11212
Name
(RefSeq) DENN domain-containing protein 4C isoform X1
KO
K20163
DENN domain-containing protein 4
Organism
tcz Trachymyrmex cornetzi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tcz00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
tcz04131
]
108766349
Membrane trafficking [BR:
tcz04131
]
Protein recycling
Rab GTPases and associated proteins
Other Rab GTPase associated proteins
108766349
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DENN
dDENN
uDENN
DUF2464
PPR_2
PPR_long
PPR
PPR_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108766349
NCBI-ProteinID:
XP_018371092
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1600 aa
AA seq
DB search
MDDRRVADYFVIAGLPGQDDELSEDNETNDKLEAWCQEGTHLKDMHMPPPITDLAVIFPA
LGEHCPEGYTLLEYTVSGFPADLNHGSLRTNECYLCYRRGRDKPPLVDIGVIYDGKERIM
QDAEMVLETPKGHVANVNNSTSKIFVTYRRASRKMPCNSLVVTDICVILTNKGESPPHAF
CVINKNLNKGMLGSDVFLCYKKSMNRANLVSFKPAILYKYPMVDYNSFVFPNSVAMFCLP
MGATIECWPKVACKPKPVFSTFVLTVADAAQKIYGSAITFYEEVQMEPDTSNCKNSQEIM
DTVENNKNSDNMEITKDKPQVKMKMFKRFGILKKLSILELERLQYTDPASQSLNISKSIC
ILSHWPFFDTFEKFLVFLHRMVNDKPQSVPIEKYISYFLCDIPFPSPQRPRILVQLSSQD
RLILTQPEDLALPRSGASFRQLLINLGPDNCLLILLLILTEQKILVHSLRPDVLTSVSEA
IAMILFPFKWQCPYIPLCPLGLAEVLHAPLPFLIGVDSRFFDLYDPPSDVNCVNLDTNNI
AICDDKKYLNVKLLPKKAARQLRNWLELLSSKIISWGKTSCSQKDRGDEDFSVDREFQQK
RKEQALELEIQDAFLRFMATILKGYRSYLLPITKAPTVGTTDPTSLFNIQAFLRSRDKAH
AKFYTMLVRTQMFIRFIEERSFVSDMDMAGLAFFDECTERVEEENVTLLELDESQHSERT
VFIPPPEAGTNQTPIIYKSFKLDPELMRPQKNFCLKNPSLSAFGMVPGSPMARRTKHEIK
VAQRMARKQAAMPDRWGRCLLGTCHSLWFLHLPAMLQVSSQPAAVLHQAYEILVKMQKLR
LDPMEEVCYRAMMQLCGVYGQPVLAVKLLFHMKRSGVQPNALTYGFYNKAVLEATWPSDM
TNSSQLMWNKLRNVIVGAALFKKAGKKSARRRLSSNVDFLTTDKTECMEHALSRSSLDSS
HSQDTEAAHSDSTKGSSVSDLPGFGAFELKAKLLRQNSIVKDQTTLSILQSDELEQTPSN
PRLTRSVESPLKSPIRTPVTENDPLGALINDETPIVSPSEENDSNCSTSTLTVLNNTTEE
RPGGPLLFRSNILPRSATFHQAVDESGMTVGGHLQRSETMPHSVAQQGEQEREKERLEIS
SLWSQNKDSVTSSLSSLGSSLKLSFGRYSTGGLAFAKNKDLISSNQLIESLSLSSYISPS
SLTGKKSNEIILGGLNSLKSAATTVVKKFDEIKEAISATSTPVKNKEREQKIAYGVSHES
LDSLPDSIQDRNETRASGDGNLDLCPLYELAECLYPKGARELEERLAIELVLSSASRCHH
CAAILYDEEIMAGWQPEDSNLNTVCQYCDKATVPLLTATILDYRSEVSEKNSDPLMGALV
ELLDQPKESLEPITVPYLNPLVLRKELESVLSQEGDACLTKHKFIQEHPIVYWNLIWYFE
RINLTSHLPDLWLDNDKNSELQRTVGLVGVRTMWDNERLHMDRLPMYLQWKSNSTEDRTL
MQTVITYVRCNDLAEPILRVALERSKHQTGDHPFSIYRDILFLAFTVLGRTNIDQGVFDR
EYSLSLEKFSENDEKLLHKIDAPPTMMSVYCRYYFKQLNV
NT seq
4803 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgacagaagggtagcagattattttgttattgccggtctacctggtcaggatgac
gagcttagcgaagataatgagactaacgacaagctggaggcttggtgtcaggaaggcact
catctcaaagatatgcacatgccgcctcctatcacagatcttgccgtaatattccctgca
ctgggagaacattgtccggagggatatacactcttagaatatacagtatccggttttcca
gcagatttaaatcatgggagtttacgaacaaacgaatgttatttgtgctatagaagaggg
cgggataaacctcccttggttgacattggtgtaatatatgatggaaaagaacgtataatg
caagatgctgaaatggtattggagacccctaaaggtcatgtggcaaatgtgaataattct
acgtcaaaaatttttgtaacatacagacgagcgagtcggaagatgccttgcaattccctt
gtggttacggatatttgtgttatcttgacaaataaaggagagagtccgccacacgctttc
tgtgttattaataagaatttgaacaaagggatgctgggcagcgatgtatttttgtgctat
aagaaatctatgaatcgcgctaatttagtatcatttaaaccagcgatactctacaaatat
cccatggtagattataacagtttcgtctttcctaattctgtcgccatgttttgtttaccg
atgggcgcgactatagaatgttggcctaaagtagcgtgtaaacctaagccggtattctcg
acgtttgtcttaacagttgccgatgctgctcaaaaaatatatggttcagcaataacattt
tacgaggaagttcaaatggagcctgatacttcaaactgcaaaaatagtcaggagatcatg
gacacagttgaaaataataaaaacagtgataatatggagataactaaagataagccgcaa
gtgaaaatgaagatgtttaagagatttggcatactcaagaagcttagtatattggaactg
gaaaggttgcagtacacagatcctgcgagccaatcgctgaatattagtaaatccatatgt
atactatctcactggccgttttttgacacgttcgagaaatttttggttttcctacaccgc
atggtgaacgataagccgcagagtgtcccaatcgagaaatatatctcgtattttttatgc
gacataccgtttccaagtccgcaacgtccacgaatcttggtacagctcagtagtcaggat
agattaatcttgactcaaccggaggatttagctctgcctagatcaggcgcaagtttcaga
caactactgataaacttgggacctgacaattgtttattaatactattattaatattgacc
gagcagaaaatattggttcactccttacgtccggatgtactaacttccgtcagcgaggcc
attgccatgattttgtttccttttaagtggcaatgtccttatataccattgtgtcctcta
ggattagcagaggtgttacatgcaccattgccatttctgatcggcgtagattcaaggttc
tttgatttatatgatcctccttctgacgttaattgtgtaaatttggatacgaataatatt
gcaatatgtgacgataaaaaatatctaaatgttaaattattgcctaaaaaggcagctaga
cagctcagaaattggttagagcttttgtcctccaagataatttcgtggggaaaaactagc
tgttcccaaaaagatagaggagatgaagacttcagtgtggatagggaatttcaacaaaaa
cgaaaggagcaagctttagaacttgaaatacaggatgctttcttaagattcatggcgacg
attctcaaaggatatcgaagttatctgttaccgattacaaaagcgcctactgtaggaaca
acagatccgacaagtttatttaatatccaagcgtttttgagaagtcgcgataaagcccat
gctaaattttacaccatgcttgtcagaacgcaaatgtttatcaggttcatagaagaaaga
agtttcgtatctgatatggatatggcagggttagcgtttttcgatgaatgcacagaacga
gtcgaggaggaaaatgtaacgcttttggaactggatgaatctcaacatagtgaacgtaca
gtatttatacctccacctgaagcaggaacaaatcaaacaccaataatatacaagtcgttc
aagttggacccggaattaatgaggcctcagaagaatttctgtttaaagaatccctctcta
agtgccttcggtatggtacctggaagtcctatggctcgtagaacaaagcatgaaatcaaa
gttgctcagagaatggctcgaaaacaagctgcaatgcccgacaggtggggtagatgcctg
cttggtacatgtcacagtctttggtttctgcatttaccggccatgttacaagtctccagc
caacctgctgcagttttgcatcaggcctatgaaatattagtcaaaatgcagaagttacgt
cttgatcctatggaagaggtatgctacagagctatgatgcaactttgtggggtatatggg
caaccagttttagctgtaaagttattgttccatatgaaacgcagtggtgttcaacctaac
gctttaacgtacggattttacaacaaggctgttctagaggcaacttggccttccgatatg
acaaactcaagtcagttaatgtggaacaaattacgaaatgttatcgtcggtgcagcttta
tttaaaaaagctgggaaaaagagcgctagaagacgattgagctctaatgtagacttctta
accaccgataagactgaatgcatggaacatgcgctctctcggtctagtctcgacagttcc
cattctcaggataccgaagctgcgcacagtgattccactaaaggcagttctgtgtcagat
ctacccggattcggagcattcgaattaaaagctaagctccttcgacaaaatagcatagtg
aaagatcaaacaacattaagtatcttacaatcggacgaattggaacaaacaccgagtaat
ccaaggctaacgcgcagtgtcgaatcgcctttaaaaagtcccatacgcacaccagttacg
gaaaatgacccattgggtgctctcattaatgacgaaacaccgattgtgtcgccttccgag
gagaatgattcaaattgctcaacaagtactttaaccgttttaaataatacgactgaagag
agaccaggagggccgctcttatttagaagcaacatcctcccacgtagtgcgacgtttcat
caagcggtagatgaaagtggcatgacggtgggtgggcatttgcagaggagtgagacgatg
cctcactccgtggcgcaacaaggggaacaggagagagaaaaggagagactggaaataagc
agtctttggtctcaaaataaggatagtgtaacgtccagcctctctagcttaggatctagt
cttaaacttagtttcggacgatactccacgggtggattggcatttgctaaaaataaggat
ttaatatcatcgaatcaacttattgaatctcttagtctctccagctatatcagcccgtcg
agtttaacaggaaaaaagtcgaacgaaataatacttggtggtttgaatagcttaaagtcc
gctgcaacgactgtggtaaaaaaatttgacgaaataaaagaagccatttcagcgacaagt
acgccagtgaaaaataaggaacgtgaacaaaaaatagcttacggagtatcgcatgaatct
ctagattctctccctgattccatacaagatcgaaacgaaacaagagcatctggtgatgga
aatttagatttgtgtccactgtacgagctcgcagagtgtctgtatccaaaaggcgctaga
gagttagaggaacgtcttgctattgagcttgtgctttccagtgccagtagatgccatcat
tgcgctgccatcctttatgatgaggagataatggctggttggcagccggaagattccaac
ttgaatacagtctgtcaatattgcgacaaagctaccgtgccccttctcacagctacgata
ttagattacagatccgaagtaagcgagaagaacagtgaccctttaatgggagcattggta
gaattattggatcaaccgaaagaatcgttggaaccgataaccgtaccatacttaaatcca
ttagttttgagaaaagaattagaaagtgtattgagtcaagagggggacgcgtgtctcact
aagcacaagttcattcaagagcacccgatagtatattggaatctgatatggtactttgaa
agaattaatttaacgagtcatctacctgatctctggttggataacgataagaactcggaa
cttcaaagaactgtaggattggtgggtgttagaaccatgtgggacaatgaacgactccac
atggaccgtttgcctatgtatcttcaatggaagtcaaattccacagaagacaggacattg
atgcaaacagtgataacatatgtccgttgcaacgacttagcggaacctatattaagagtg
gccttagaaagaagtaaacatcaaacaggcgatcatccgttttctatatacagggatatt
ttgtttctggcatttactgtattaggaagaacgaatattgaccaaggcgtcttcgacagg
gaatacagtttatcgctggagaaattttccgagaacgatgagaagttattacacaaaatt
gatgcaccgccaacgatgatgtcagtgtactgcagatattacttcaagcaattaaacgtg
tga
DBGET
integrated database retrieval system
