Teleopsis dalmanni (Malaysian stalk-eyed fly): 119662753
Help
Entry
119662753 CDS
T09311
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(IV) chain
KO
K06237
collagen type IV alpha
Organism
tda
Teleopsis dalmanni (Malaysian stalk-eyed fly)
Pathway
tda04512
ECM-receptor interaction
tda04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tda00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
119662753
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
119662753
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04147 Exosome [BR:
tda04147
]
119662753
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
tda00536
]
119662753
Exosome [BR:
tda04147
]
Exosomal proteins
Exosomal proteins of other cancer cells
119662753
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
tda00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
119662753
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
C4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119662753
NCBI-ProteinID:
XP_037928428
LinkDB
All DBs
Position
X:complement(32402864..32409680)
Genome browser
AA seq
1780 aa
AA seq
DB search
MEPLWKRLLFAAIIAGVFSVSNAEFWNNMDVNNIYSSGVHYKEEAIAPPRAPIDESYDII
DTATQVRTGQLPRNCTSGTVGCIPKCFAEKGNRGFSGDIGSPGPKGLPGYPGTEGPPGDK
GQKGDPGPLGPRGYKGERGINGIPGMAGVPGIQGVSGNPGTPGIPGKDGCDGQDGLPGLA
GIAGLAGPRGYPGHPGIKGEKGEPAKENGDYAKGEKGEPGFTGRSGIPGPDGPTGAKGDR
GDTGPYGAPGPRGDRGIKGEKGAPCFAPPQPGKKGEKGEKGEPAGREKLTGTKQIAGEKG
DRGEKGNAGQAGEKGAVGYSGEPGRDGMKGEKGLPGGAGDRGRQGNFGPPGPSGQKGDRG
ETGLNGLSGKPGQKGEPGRPGNAGARGLLGPPGPPGGGTGSPGAPGPKGPRGYTGSPGPK
GLDGTDGAPGQPGLPGPKGGPGLAGRNGLEGPQGEKGEKGNDGRTGSMGPIGPIGHTGPP
GPEGQKGEPGYPGIGDVGEKGDHGIPGTDGLKGQKGERGFKGNAGLPGDSKLGRQGVAGR
MGSPGAKGDKGRDGIPGQKGDMGIKGDVGGRCSSCPPGLKGDKGDAGLNGPQGIPGIRGS
PGEPGLRGDRGDDGIAGPNGAPGSKGLDGLPGPPGPEGRAGKDAILDYSLIVPEKGDKGE
RGFIGPAGLKGDRGAAGLSGLQGQKGEIGARGEKGYAGQPGTDGSPGNPGINGLDGLPGI
SVKGEPGPAGQNGLKGDKGTAGYTGQKGEPGSCDAGMLTVPAKGNKGDRGQPGMPGPIGP
IGEKGNMGWEGQKGDQGPQGPVGQVGPRGITGPRGDKGNQGPSGAPGNPGKDGLYGPPGR
TGDRGQKGEQGISITGPPGPKGNQGFIGEKGDRGPTGAVGPIGVEGAPGYPGEKGDAGLP
GATGMTGLVGSKGDPGPIGPQGAPGPPGKPGVDGVQGRDGAKGEPGNPGIVGMPGLKGDI
GAPGIDGPKGYHGINGLPGKRGALGPTGLPGQKGDKGDRGITGADGVTGPRGPPGPPGFT
GAKGDMGPMGATGADGIPGRDGAKGDQGVQGLDGPPGLPGDASEKGQKGEPGAPGLRGQT
GIPGLNGLPGDKGADGIAVRGQDGPPGQKGDQGRNGIDGNDGLPGQKGDQGYSGSPGIKG
DKGATGLSGAPGSPGLDGLPGAIGAPGPQGYVGMKGAKGERGLSGINGIKGDKGATGFVG
FAGAPGLKGDQGFPGAPGLNAQAITIKGDKGEMGAFGLIGQPGIKGIKGNQGAPGFEGQK
GDRGLTGPQGMAGLNGAPGMKGDRGLTGDTGAPGIAVKGEKGLPGRPGKQGRDGIYGRVG
EKGEKGLPGLNGMPGLVGLPGPIGPVGPRGEPGPMGQPGRNGNDGLPGAVGLKGDMGFPG
PKGERGESGFEGQKGEKGETGISGIRGAPGFPGEKGDPGIPGADGLNGPMGPQGEKGFMG
PKGRDGINGKAGDRGQKGEPGLVPPPGPKGEPGHPGYEGQKGERGPPGLQGLTGLKGDQG
ERGEIGLIGLAGQMGRPGPKGEQGLPGLIGRDGFQGPPGPKGDQGLACSAAQDYLTGILL
VKHSQSEEIPRCESGHIELWTGYSLLYVDGNDFAHNQDLGSPGSCVRRFSTLPMLTCGQN
NVCNYASRNDKTFWLSTSASLPMMPVENYEISKYISRCVVCEAPANVIAVHSQSLSIPNC
PNGWEGLWIGYSFLMHTAVGNGGGGQALSSPGSCLEDFRATPFIECNGGKGHCHFYETMT
SFWLVTVEGEPFSRPQQDTLKAGSLLQRVSRCQVCIKNST
NT seq
5343 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagcccctgtggaagcggttactttttgccgcaataattgctggagtgttcagcgta
tcaaatgctgaattttggaataatatggatgtgaataatatatacagttctggagtacat
tacaaagaagaagcaattgctcctcctagagccccaatagatgaaagttatgatataata
gatacagcaactcaggtgcgtactggacaattaccaagaaactgcacatctggtactgtg
ggttgtataccaaaatgttttgctgaaaaaggaaatcgcggtttttctggtgacataggt
tcaccaggcccaaaaggtttgccaggttatcctggtactgaaggtccacctggtgataag
gggcaaaaaggtgatcccggtccactgggtccacgcggctataagggtgaacgcggcata
aatggtattcctggtatggcaggtgttccaggtatacaaggagtaagtggcaatccaggt
actcctggtatacctggcaaagatggttgtgatggtcaagatggtttgcctggcttagct
ggtattgctggcttagctggtccacgtggttatcctggtcatcccggaattaaaggtgag
aaaggtgaacccgctaaagaaaatggggattacgcaaaaggcgagaaaggtgagcctggt
tttactggtcgctcaggaattcctggtcctgacggtcctacaggcgcaaaaggtgatcgc
ggtgatactggaccctatggtgcacctggacctcgcggtgatcgtggtataaaaggagaa
aagggtgctccatgctttgctccaccccaaccaggtaaaaaaggtgaaaagggtgaaaaa
ggcgaacctgctggtcgtgaaaagttgacgggtacaaaacaaattgctggagaaaaaggt
gaccgcggtgaaaagggtaatgctggtcaagctggcgaaaaaggtgctgtaggttattcc
ggagagcctggtcgtgatggtatgaagggtgaaaaaggcttacctggtggtgctggtgac
agaggaagacaaggtaattttggaccccctggaccatctgggcaaaaaggtgatcgcggc
gaaactggtttaaacggtttatctggtaaaccaggtcaaaaaggtgaaccaggtcgtccc
ggaaatgcaggtgcgcgaggtttacttggtcccccaggaccgccaggtggcggtacagga
tcacctggagcaccaggtccaaagggtccacgaggttatactggttctccaggacctaag
ggtctggatggaactgatggcgcacctggacagccaggtctacctggtccaaaaggtgga
ccaggtctagctggccgtaatggtcttgaaggtccccaaggtgaaaaaggcgagaaaggt
aatgacggacgtactggttctatgggtcctattggaccaattggtcatactggtccccca
ggtcctgaggggcaaaaaggtgagccaggctaccctggtattggtgatgttggagagaaa
ggtgatcacggtattcctggaactgatggattaaaaggacaaaagggtgaacgtggtttt
aaaggtaatgctggtttaccaggtgattctaaattgggtagacagggtgtagcaggtcga
atgggtagtcccggtgctaaaggtgataaaggtcgagatggtattccgggtcaaaagggt
gatatgggtattaaaggtgacgttggcggtagatgttctagttgtccaccaggccttaaa
ggtgataaaggtgatgccgggttaaatggtccacagggaattccaggtattcgtggttca
ccaggtgaacctggtctacgtggtgatcgtggtgatgatggaattgctggtccaaatggt
gctcctggtagcaaaggtttggatggccttcccggtccaccaggacctgaaggtcgagct
ggtaaagatgcaattttggattatagtctgatagtgccagaaaaaggcgataagggtgaa
cgcggttttattggacctgcagggcttaaaggagatcgtggtgcagctggattgtcaggt
ttgcaagggcaaaaaggtgaaatcggcgccaggggtgaaaaagggtatgcgggacaacct
ggaactgatggttcgcctggcaatcccggaattaatggcttagatggactaccaggtata
agtgttaagggtgaaccaggtcctgctggtcaaaatgggttaaaaggtgataaaggaact
gctgggtatacaggtcaaaaaggtgaacctggttcatgtgacgccggaatgttgacagtt
cctgcaaagggtaataagggcgatcgcggacaaccaggaatgcctggccctattggtcca
attggagaaaaaggtaacatgggttgggaaggtcaaaagggtgaccaaggtccacaaggt
cccgttggtcaggttggacctagaggtataactggccctcgtggtgataaaggaaatcaa
ggaccatcaggtgcacctggtaatcctggtaaagatggtttgtatggtccacccggaaga
actggtgaccgaggtcaaaaaggtgaacaaggcatatccattactggcccaccaggacct
aaaggaaaccaaggttttattggcgagaaaggtgatcgaggtccaactggtgcagttggt
ccaataggagttgaaggtgctcctggctatcctggtgaaaaaggtgacgctggtttacct
ggtgctactggtatgacaggtcttgttggttctaagggtgaccctggtcctataggtcct
cagggtgcgcctggtcctcccggtaaacctggtgttgatggcgtacaaggacgtgatggc
gcaaaaggtgagccaggtaatcctggtatagttggcatgcctggcttaaaaggtgatatc
ggtgctcctggtattgatggaccaaagggttatcatggaataaatggccttccaggcaag
cgtggtgctctcggtcctactggtttaccaggtcagaaaggcgataaaggtgacaggggt
ataactggagctgatggagttacgggaccacgtggaccgccaggtccaccaggctttaca
ggtgctaaaggtgatatgggtccaatgggagcaacaggagctgatggtatacctggtagg
gatggtgcaaaaggtgaccaaggcgtgcaaggacttgatgggccacctggtcttccagga
gatgcttccgaaaaaggacagaaaggagagccgggtgcacctggtttaagaggtcaaaca
ggcattcctggcttaaatggcttacctggtgacaaaggtgccgatggaattgcagtacgt
gggcaagatggtcctcctggacaaaaaggtgatcagggacgaaacggtattgacggtaat
gatggtttacctgggcaaaaaggtgatcaaggatattcgggctcaccaggaattaagggt
gataagggtgcaactggattgtctggtgctccgggatcacctggattagacggacttcct
ggtgctatcggtgccccaggacctcaaggttatgtcggcatgaaaggagctaaaggtgaa
cgcggtttatctggaattaacggtattaaaggcgacaaaggtgcaactggttttgtcggc
tttgctggagctccgggtttaaaaggagaccaaggcttccctggtgctcctggactcaat
gcacaggcaataactattaaaggtgacaaaggtgaaatgggtgcattcggacttataggt
caacccggtattaagggtatcaaaggtaatcaaggcgctcccggattcgaaggtcaaaaa
ggtgaccgtggtttaactggccctcaaggtatggctggattaaacggagcccctggcatg
aaaggggacagaggtttgaccggagatactggggcaccaggtattgctgttaaaggagaa
aaaggtctgcctggtagacctggtaaacaaggtcgtgatggaatatatggacgagtgggt
gaaaaaggagaaaaaggtctgcctggtttgaatggtatgccaggtttagttggcttacct
ggtccaatcggtcctgttggtccaagaggagaaccaggtccaatgggccaacccggtcgt
aacggtaatgatggtcttcccggtgctgttggacttaaaggtgacatgggattccctggt
cctaaaggtgaacgaggtgagtcaggatttgaaggacaaaagggcgaaaagggtgaaaca
ggaatttctggcatccgtggtgctcctggttttcctggcgaaaaaggcgatcctggtata
cctggtgcagatgggcttaacggtcctatgggtccacaaggagaaaaaggcttcatgggt
ccaaaaggtcgagatggaatcaatggtaaagctggtgatagaggtcaaaagggtgaacct
ggtttagtaccgcctccgggtccaaagggtgaacctggtcatccaggatatgagggtcaa
aaaggtgaacgtggtcctcctgggttacaaggattaactggtttaaagggtgaccaaggt
gaaaggggtgagatcggcttaattggacttgcaggacaaatgggtcgtcctggtccaaaa
ggagaacaaggcttgccaggtttaataggccgtgatggtttccagggaccacctggtcca
aaaggcgatcaaggcttagcatgttccgctgcacaagattatttaactggtatactgtta
gtaaaacacagtcaatctgaagaaataccacgttgtgaaagtggacatatagaattatgg
actggctattccttactttatgttgatggtaatgattttgcacataatcaagacttaggt
tcaccaggctcatgtgttcgtcgcttttctacactgcctatgcttacatgcggacaaaat
aatgtctgtaattatgcttcaagaaatgataaaactttctggctttcaacgtccgcttca
ctgccaatgatgccagtggaaaattatgaaatcagcaaatatatttcacgttgtgtggtg
tgcgaagcacccgctaacgttattgctgtacacagtcaatctttaagtataccaaattgt
ccaaatggttgggaaggactttggatcggttacagtttcctaatgcacactgcagttgga
aatggaggtggtggtcaagcattatcttcacctggttcatgtctagaagacttccgtgca
acgccattcattgagtgcaatggcggaaaaggacactgccatttctatgaaacaatgacc
agcttctggcttgtcactgttgaaggtgaaccattctcacgtcctcaacaggacacactc
aaagccggtagtctgctgcagcgagtatctagatgccaagtctgtataaagaactcgaca
taa
DBGET
integrated database retrieval system
