Teleopsis dalmanni (Malaysian stalk-eyed fly): 119662753
Help
Entry
119662753 CDS
T09311
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(IV) chain
KO
K06237
collagen type IV alpha
Organism
tda
Teleopsis dalmanni (Malaysian stalk-eyed fly)
Pathway
tda04382
Cornified envelope formation
tda04512
ECM-receptor interaction
tda04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tda00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
119662753
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
119662753
09150 Organismal Systems
09158 Development and regeneration
04382 Cornified envelope formation
119662753
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04147 Exosome [BR:
tda04147
]
119662753
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
tda00536
]
119662753
Exosome [BR:
tda04147
]
Exosomal proteins
Exosomal proteins of other cancer cells
119662753
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
tda00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
119662753
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
C4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119662753
NCBI-ProteinID:
XP_037928428
LinkDB
All DBs
Position
X:complement(32402864..32409680)
Genome browser
AA seq
1780 aa
AA seq
DB search
MEPLWKRLLFAAIIAGVFSVSNAEFWNNMDVNNIYSSGVHYKEEAIAPPRAPIDESYDII
DTATQVRTGQLPRNCTSGTVGCIPKCFAEKGNRGFSGDIGSPGPKGLPGYPGTEGPPGDK
GQKGDPGPLGPRGYKGERGINGIPGMAGVPGIQGVSGNPGTPGIPGKDGCDGQDGLPGLA
GIAGLAGPRGYPGHPGIKGEKGEPAKENGDYAKGEKGEPGFTGRSGIPGPDGPTGAKGDR
GDTGPYGAPGPRGDRGIKGEKGAPCFAPPQPGKKGEKGEKGEPAGREKLTGTKQIAGEKG
DRGEKGNAGQAGEKGAVGYSGEPGRDGMKGEKGLPGGAGDRGRQGNFGPPGPSGQKGDRG
ETGLNGLSGKPGQKGEPGRPGNAGARGLLGPPGPPGGGTGSPGAPGPKGPRGYTGSPGPK
GLDGTDGAPGQPGLPGPKGGPGLAGRNGLEGPQGEKGEKGNDGRTGSMGPIGPIGHTGPP
GPEGQKGEPGYPGIGDVGEKGDHGIPGTDGLKGQKGERGFKGNAGLPGDSKLGRQGVAGR
MGSPGAKGDKGRDGIPGQKGDMGIKGDVGGRCSSCPPGLKGDKGDAGLNGPQGIPGIRGS
PGEPGLRGDRGDDGIAGPNGAPGSKGLDGLPGPPGPEGRAGKDAILDYSLIVPEKGDKGE
RGFIGPAGLKGDRGAAGLSGLQGQKGEIGARGEKGYAGQPGTDGSPGNPGINGLDGLPGI
SVKGEPGPAGQNGLKGDKGTAGYTGQKGEPGSCDAGMLTVPAKGNKGDRGQPGMPGPIGP
IGEKGNMGWEGQKGDQGPQGPVGQVGPRGITGPRGDKGNQGPSGAPGNPGKDGLYGPPGR
TGDRGQKGEQGISITGPPGPKGNQGFIGEKGDRGPTGAVGPIGVEGAPGYPGEKGDAGLP
GATGMTGLVGSKGDPGPIGPQGAPGPPGKPGVDGVQGRDGAKGEPGNPGIVGMPGLKGDI
GAPGIDGPKGYHGINGLPGKRGALGPTGLPGQKGDKGDRGITGADGVTGPRGPPGPPGFT
GAKGDMGPMGATGADGIPGRDGAKGDQGVQGLDGPPGLPGDASEKGQKGEPGAPGLRGQT
GIPGLNGLPGDKGADGIAVRGQDGPPGQKGDQGRNGIDGNDGLPGQKGDQGYSGSPGIKG
DKGATGLSGAPGSPGLDGLPGAIGAPGPQGYVGMKGAKGERGLSGINGIKGDKGATGFVG
FAGAPGLKGDQGFPGAPGLNAQAITIKGDKGEMGAFGLIGQPGIKGIKGNQGAPGFEGQK
GDRGLTGPQGMAGLNGAPGMKGDRGLTGDTGAPGIAVKGEKGLPGRPGKQGRDGIYGRVG
EKGEKGLPGLNGMPGLVGLPGPIGPVGPRGEPGPMGQPGRNGNDGLPGAVGLKGDMGFPG
PKGERGESGFEGQKGEKGETGISGIRGAPGFPGEKGDPGIPGADGLNGPMGPQGEKGFMG
PKGRDGINGKAGDRGQKGEPGLVPPPGPKGEPGHPGYEGQKGERGPPGLQGLTGLKGDQG
ERGEIGLIGLAGQMGRPGPKGEQGLPGLIGRDGFQGPPGPKGDQGLACSAAQDYLTGILL
VKHSQSEEIPRCESGHIELWTGYSLLYVDGNDFAHNQDLGSPGSCVRRFSTLPMLTCGQN
NVCNYASRNDKTFWLSTSASLPMMPVENYEISKYISRCVVCEAPANVIAVHSQSLSIPNC
PNGWEGLWIGYSFLMHTAVGNGGGGQALSSPGSCLEDFRATPFIECNGGKGHCHFYETMT
SFWLVTVEGEPFSRPQQDTLKAGSLLQRVSRCQVCIKNST
NT seq
5343 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagcccctgtggaagcggttactttttgccgcaataattgctggagtgttcagcgta
tcaaatgctgaattttggaataatatggatgtgaataatatatacagttctggagtacat
tacaaagaagaagcaattgctcctcctagagccccaatagatgaaagttatgatataata
gatacagcaactcaggtgcgtactggacaattaccaagaaactgcacatctggtactgtg
ggttgtataccaaaatgttttgctgaaaaaggaaatcgcggtttttctggtgacataggt
tcaccaggcccaaaaggtttgccaggttatcctggtactgaaggtccacctggtgataag
gggcaaaaaggtgatcccggtccactgggtccacgcggctataagggtgaacgcggcata
aatggtattcctggtatggcaggtgttccaggtatacaaggagtaagtggcaatccaggt
actcctggtatacctggcaaagatggttgtgatggtcaagatggtttgcctggcttagct
ggtattgctggcttagctggtccacgtggttatcctggtcatcccggaattaaaggtgag
aaaggtgaacccgctaaagaaaatggggattacgcaaaaggcgagaaaggtgagcctggt
tttactggtcgctcaggaattcctggtcctgacggtcctacaggcgcaaaaggtgatcgc
ggtgatactggaccctatggtgcacctggacctcgcggtgatcgtggtataaaaggagaa
aagggtgctccatgctttgctccaccccaaccaggtaaaaaaggtgaaaagggtgaaaaa
ggcgaacctgctggtcgtgaaaagttgacgggtacaaaacaaattgctggagaaaaaggt
gaccgcggtgaaaagggtaatgctggtcaagctggcgaaaaaggtgctgtaggttattcc
ggagagcctggtcgtgatggtatgaagggtgaaaaaggcttacctggtggtgctggtgac
agaggaagacaaggtaattttggaccccctggaccatctgggcaaaaaggtgatcgcggc
gaaactggtttaaacggtttatctggtaaaccaggtcaaaaaggtgaaccaggtcgtccc
ggaaatgcaggtgcgcgaggtttacttggtcccccaggaccgccaggtggcggtacagga
tcacctggagcaccaggtccaaagggtccacgaggttatactggttctccaggacctaag
ggtctggatggaactgatggcgcacctggacagccaggtctacctggtccaaaaggtgga
ccaggtctagctggccgtaatggtcttgaaggtccccaaggtgaaaaaggcgagaaaggt
aatgacggacgtactggttctatgggtcctattggaccaattggtcatactggtccccca
ggtcctgaggggcaaaaaggtgagccaggctaccctggtattggtgatgttggagagaaa
ggtgatcacggtattcctggaactgatggattaaaaggacaaaagggtgaacgtggtttt
aaaggtaatgctggtttaccaggtgattctaaattgggtagacagggtgtagcaggtcga
atgggtagtcccggtgctaaaggtgataaaggtcgagatggtattccgggtcaaaagggt
gatatgggtattaaaggtgacgttggcggtagatgttctagttgtccaccaggccttaaa
ggtgataaaggtgatgccgggttaaatggtccacagggaattccaggtattcgtggttca
ccaggtgaacctggtctacgtggtgatcgtggtgatgatggaattgctggtccaaatggt
gctcctggtagcaaaggtttggatggccttcccggtccaccaggacctgaaggtcgagct
ggtaaagatgcaattttggattatagtctgatagtgccagaaaaaggcgataagggtgaa
cgcggttttattggacctgcagggcttaaaggagatcgtggtgcagctggattgtcaggt
ttgcaagggcaaaaaggtgaaatcggcgccaggggtgaaaaagggtatgcgggacaacct
ggaactgatggttcgcctggcaatcccggaattaatggcttagatggactaccaggtata
agtgttaagggtgaaccaggtcctgctggtcaaaatgggttaaaaggtgataaaggaact
gctgggtatacaggtcaaaaaggtgaacctggttcatgtgacgccggaatgttgacagtt
cctgcaaagggtaataagggcgatcgcggacaaccaggaatgcctggccctattggtcca
attggagaaaaaggtaacatgggttgggaaggtcaaaagggtgaccaaggtccacaaggt
cccgttggtcaggttggacctagaggtataactggccctcgtggtgataaaggaaatcaa
ggaccatcaggtgcacctggtaatcctggtaaagatggtttgtatggtccacccggaaga
actggtgaccgaggtcaaaaaggtgaacaaggcatatccattactggcccaccaggacct
aaaggaaaccaaggttttattggcgagaaaggtgatcgaggtccaactggtgcagttggt
ccaataggagttgaaggtgctcctggctatcctggtgaaaaaggtgacgctggtttacct
ggtgctactggtatgacaggtcttgttggttctaagggtgaccctggtcctataggtcct
cagggtgcgcctggtcctcccggtaaacctggtgttgatggcgtacaaggacgtgatggc
gcaaaaggtgagccaggtaatcctggtatagttggcatgcctggcttaaaaggtgatatc
ggtgctcctggtattgatggaccaaagggttatcatggaataaatggccttccaggcaag
cgtggtgctctcggtcctactggtttaccaggtcagaaaggcgataaaggtgacaggggt
ataactggagctgatggagttacgggaccacgtggaccgccaggtccaccaggctttaca
ggtgctaaaggtgatatgggtccaatgggagcaacaggagctgatggtatacctggtagg
gatggtgcaaaaggtgaccaaggcgtgcaaggacttgatgggccacctggtcttccagga
gatgcttccgaaaaaggacagaaaggagagccgggtgcacctggtttaagaggtcaaaca
ggcattcctggcttaaatggcttacctggtgacaaaggtgccgatggaattgcagtacgt
gggcaagatggtcctcctggacaaaaaggtgatcagggacgaaacggtattgacggtaat
gatggtttacctgggcaaaaaggtgatcaaggatattcgggctcaccaggaattaagggt
gataagggtgcaactggattgtctggtgctccgggatcacctggattagacggacttcct
ggtgctatcggtgccccaggacctcaaggttatgtcggcatgaaaggagctaaaggtgaa
cgcggtttatctggaattaacggtattaaaggcgacaaaggtgcaactggttttgtcggc
tttgctggagctccgggtttaaaaggagaccaaggcttccctggtgctcctggactcaat
gcacaggcaataactattaaaggtgacaaaggtgaaatgggtgcattcggacttataggt
caacccggtattaagggtatcaaaggtaatcaaggcgctcccggattcgaaggtcaaaaa
ggtgaccgtggtttaactggccctcaaggtatggctggattaaacggagcccctggcatg
aaaggggacagaggtttgaccggagatactggggcaccaggtattgctgttaaaggagaa
aaaggtctgcctggtagacctggtaaacaaggtcgtgatggaatatatggacgagtgggt
gaaaaaggagaaaaaggtctgcctggtttgaatggtatgccaggtttagttggcttacct
ggtccaatcggtcctgttggtccaagaggagaaccaggtccaatgggccaacccggtcgt
aacggtaatgatggtcttcccggtgctgttggacttaaaggtgacatgggattccctggt
cctaaaggtgaacgaggtgagtcaggatttgaaggacaaaagggcgaaaagggtgaaaca
ggaatttctggcatccgtggtgctcctggttttcctggcgaaaaaggcgatcctggtata
cctggtgcagatgggcttaacggtcctatgggtccacaaggagaaaaaggcttcatgggt
ccaaaaggtcgagatggaatcaatggtaaagctggtgatagaggtcaaaagggtgaacct
ggtttagtaccgcctccgggtccaaagggtgaacctggtcatccaggatatgagggtcaa
aaaggtgaacgtggtcctcctgggttacaaggattaactggtttaaagggtgaccaaggt
gaaaggggtgagatcggcttaattggacttgcaggacaaatgggtcgtcctggtccaaaa
ggagaacaaggcttgccaggtttaataggccgtgatggtttccagggaccacctggtcca
aaaggcgatcaaggcttagcatgttccgctgcacaagattatttaactggtatactgtta
gtaaaacacagtcaatctgaagaaataccacgttgtgaaagtggacatatagaattatgg
actggctattccttactttatgttgatggtaatgattttgcacataatcaagacttaggt
tcaccaggctcatgtgttcgtcgcttttctacactgcctatgcttacatgcggacaaaat
aatgtctgtaattatgcttcaagaaatgataaaactttctggctttcaacgtccgcttca
ctgccaatgatgccagtggaaaattatgaaatcagcaaatatatttcacgttgtgtggtg
tgcgaagcacccgctaacgttattgctgtacacagtcaatctttaagtataccaaattgt
ccaaatggttgggaaggactttggatcggttacagtttcctaatgcacactgcagttgga
aatggaggtggtggtcaagcattatcttcacctggttcatgtctagaagacttccgtgca
acgccattcattgagtgcaatggcggaaaaggacactgccatttctatgaaacaatgacc
agcttctggcttgtcactgttgaaggtgaaccattctcacgtcctcaacaggacacactc
aaagccggtagtctgctgcagcgagtatctagatgccaagtctgtataaagaactcgaca
taa
DBGET
integrated database retrieval system
