Teleopsis dalmanni (Malaysian stalk-eyed fly): 119670220
Help
Entry
119670220 CDS
T09311
Name
(RefSeq) mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like
KO
K15162
mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12
Organism
tda
Teleopsis dalmanni (Malaysian stalk-eyed fly)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tda00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
tda03021
]
119670220
Transcription machinery [BR:
tda03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Mediator complex
CDK-module
119670220
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Med12-LCEWAV
Med12
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119670220
NCBI-ProteinID:
XP_037936320
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(49944713..49953044)
Genome browser
AA seq
2399 aa
AA seq
DB search
MLSVLQEKRPLKKARLGPPDVYPQDAKQREDELTPANVKHGFSTTSPLSDEFGTAHNSNV
NANKMGAFFSAILVKKEELMTLQDTGKKKQQLNCKDHFWPVSPRNKVAMDAWFKDLAGNK
PLLSLAKKVPSFNKKEDIFITLCDNQVNMQRATWFIKLSAVYATCLTESKNKKRTIYDPV
SDCTSYFIKFMKELLPKLQEYYQQSISDKASHCNSTGLATQNSSTHSNSTIPVPSMASPV
SMHSPASSQQNSNNHGVLSGGTPVNASSTQGSVNLGLTGSSISGIGSNFEDCRNALKYWN
YCTQLSKYMHEESLLDRQEFLYWILELLDKMRTQASFNEALKKLVLTFALQYMHDFVQSE
RLCRKLAYIVAKKLSNLLNATVEQQNNSKSLQSNCVVNMEVDDDEKKRNTIDPYETALND
YMNCPHHRDIILYLSTILQIITIECPTAMVWCGIGDNRAPSALCGSPLDNLPLAPSVLPM
PSKCELTTNIEIRRQLRAVESEIRERSKHAENRWFAEKWLKSSNNPCNHVLSILDHLDTH
CFERMDQSNSIESLYANIFKPFVTVKREVGSNGEVKEIRQEYDAKEDAKTVKILCEWAVS
NQRWGEHRAIVVAILLDKRQIDVTTPNIENEQFNNNGNISNTNEDKDSVASGVGLIGGLP
VFQSVLMDFLDQDAPVLDENGSLQNRTQFTNLVHLFSALIRHDVFSHNAYMYTLISRGDL
LTDGTSSTTAKPISGTSGTGPVSNKPSPPTHNFDDDFMTGIEYDDSNVDDDLGKLVQTIK
EKIPDHTSAGGSEPPISRHFVYTKHFPIPQDDPTSPYSSESNQRYILLFGVGKERDEKKH
AVKKMSKEICKLFSKKFSIDVAEGGKVKKHSRNEFNFEATTSKCQNMAYFDQHVVTSQCA
ATVLEQLNSFALGNNNYLPVQEHVAFLFDLMEMALNIYSLIELCDQILKELPEVENQLVV
KKSNLIRSYTTLLGLYIVGILRRYHSCLLLSIEQTVSIFEGLCKIIKHVGSPSECSSAER
CILAYLSDLHDSCVILKSKEQQPEYFQQLNVIKKFKEIFVAPEQINIVPPTYNPQFLQEL
FSSPKRGGKIDQLWVRQLHESPTNVYSFVSNAFIAVCRESDNDRLNDIAISCSELTASCN
ALSTEWIAALQCICNSTKKPRYPHLFGQIDIHNTRIHNSLAVFMCILVARHCFPLSDFVV
KFALPTLVTACAETTGDAEAGARLTCHLLLKLFKTIEIPQPGLYSVSTSPNPINVVSNTT
NIKLSCDRHLLVGAHKNIPVEAVLAVLKAILYVVDTAALKTPTSVTGAVAYCSGKRSGFN
TPVHPGSTPKSNERPVDLSQILGTSDLNSLGNDDQEMAQQNSLSANSNQGEQISLLEFAH
HVLKQICAQEHVLERCLKHAEKLCDFIIDDMLTTKQVQRVLHMICYPEAEYNIISEMDQR
SMIVRILENLGQWTLRISWLDLQLMYRQLMNNPAELNMWLDTVARAAIDVFQMEEINLPN
SNRSEYRAKPSTWLVAPLISKLTPAVQGRILRVAGQVLESMNYFSKVSKMDSNSSGSGDE
REKSNSCGSIISSYSGSNSGSRGRKPPLNYQPFLELILTCLKGQDEFKEGLLASLYSQLS
QCLQSFSMLDTIGGVDNPQAREEILDALQLRFSLLGGMFDSIQKNGTSTTDWAMLLAQLV
CQGVIDLSSNRELFTTVVDMLATLVHSTLVSDTQSDRDENKKSYLNLMKKLKKEIGEQTN
SSIKVIRQLLPLYKQTTEVISCEPAGVDTKGNKICDMDKKQLRISDKQRISVWDILEGQK
NPAPLSWVWFGAVKLERKPLAYEEAHRNLKYHTHSLVKPSSYFYEPLPLPPEDIEPVPEK
ICIKDEMKADTPSSVDQSPSAVVSGRGRGKGTTRKRKTKNPKTPPVNTQVQPQMTAQQQQ
QQQQQTSSATQQQTTQQLNPNQMGQMQMNMQVNMQQFAPNPMMQQNSGQIMQSQQMQNVP
SNLQQQLNSGNAQQQNTQLGFMAAGPQNMPQTGHTQQPQWNNQNQYHSMQQQQQQQQFYQ
QQGIQMNRFERPQLNDPKLALSNMLRARQPNYNQNNNTTFNAMQQQQRQGQGMQPQQQAG
LNNVQQQQQQQLQQQQFVRGAIRGAIRGIAPNQMGGTAPNQIAPNMNAVNIGQNITPNPL
MQQQQQMAQNNPQAMAMAQNTGMIGSVSNNNSNLMSGQSSNNLVNAGNIMQQNVGGVSNN
AVNQNMINQGPGQFQNFNQYQQGINATGPNQQNNIMGGFNQMNQRNNPNDFMTQQQQRGP
AGIVNNRGQYMNQAPNVTMNTMVGQGTVPPYSRQQNSGGKPGVVSSQHQFQQQQQQRLHQ
IMQLQGMNQQNNSGSVIGQQQTQSMGQQQTPNLVAQLQRQMPNQQNMMGQQFQHQPPPY
NT seq
7200 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgtccgttttgcaagagaaaaggccattaaaaaaggcacgtttaggaccaccagac
gtttatccacaagatgcaaaacaaagagaagatgagcttacacccgcaaatgtaaaacat
gggttttcgactacatcaccactttcggatgaatttggtacagcgcataattccaatgtc
aatgcaaacaaaatgggtgcattttttagtgcaatactcgtcaagaaagaagaactcatg
acgttgcaagatacagggaaaaagaaacaacaactcaattgcaaagatcatttttggcca
gtgtcgcctcgcaataaagttgctatggatgcttggttcaaggatttagctggaaataaa
ccactgttaagtttagcaaaaaaagttccatcttttaataagaaggaggatattttcatt
acactttgtgacaaccaagtcaatatgcagcgtgcaacctggtttataaaattaagtgct
gtttatgctacatgccttacggaatcgaaaaataaaaagcgcactatatatgatccagta
agtgactgcactagttattttataaaatttatgaaggaattattaccgaaattacaagag
tactatcaacaaagtataagcgacaaagcgtctcattgcaatagcacgggtctagcaaca
caaaattcaagcacacattcgaatagtactataccagttccttctatggccagtccagtt
tctatgcatagtccagcaagtagtcagcaaaattctaacaaccatggtgtactaagtggg
ggaacacctgtgaacgcttcaagcactcaaggatctgttaatcttggcttaacaggctct
tcaatttcaggaataggcagtaattttgaagattgtcgaaatgctttaaaatactggaat
tattgcactcagctcagtaaatacatgcatgaagaatcactgttggatagacaggaattt
ctttattggatacttgaattattagataaaatgcgtacgcaagcttcatttaacgaagca
ttgaaaaagttggtacttacttttgctttgcaatacatgcatgattttgttcagtctgag
cggctttgtcgtaagctagcctatattgttgctaaaaagctttctaatctgttaaacgca
actgtggaacagcaaaataacagtaaatcattacaatcaaattgtgtagtaaacatggag
gtggatgacgatgaaaaaaaacggaatacgatagatccctatgaaactgcgttaaatgat
tatatgaactgcccgcatcaccgtgatataatcttatatctgagtacaatattacagatt
atcacaattgaatgtccaacagctatggtttggtgtggtatcggggacaatcgtgcacca
tcagctttgtgtggtagtcctttggataatttacccttagctccatcagttcttcctatg
ccgtctaaatgtgaattgactacaaacattgaaatacggcgacaactacgtgcagtagaa
tccgaaattagagaacgttctaaacatgctgaaaatcgttggtttgccgagaaatggtta
aaatctagtaataatccgtgcaaccatgtactttcaattctagatcatttagatacccat
tgttttgaacggatggatcaaagtaattcaattgaatctctttatgcaaatatttttaaa
ccttttgtgactgtgaaacgtgaagttggttcaaatggagaggtaaaagaaatacgtcaa
gaatacgatgctaaggaagatgctaaaacagttaaaatactctgtgaatgggcagtatct
aatcagagatggggtgaacatcgggcaattgtagtagcaatattgttggataaaagacaa
atagatgtcactacacctaatattgaaaatgaacaatttaataataatggaaatataagt
aatacaaatgaagataaagattctgttgcttcgggagttggtttaataggtggattaccc
gtttttcagtcagtattaatggattttttggatcaagacgccccagtattagatgaaaat
ggttccctgcaaaatcgtacacagttcaccaatcttgttcatttatttagcgctttgata
cgccatgatgtcttttcccacaatgcttatatgtacacactaatctcacgtggagactta
ttaactgatggtacttcaagtacaacagcaaagccaataagcggcacaagtggcactggt
ccagtatcaaataaaccatcaccgccgactcacaattttgatgatgatttcatgactgga
attgagtatgatgattctaatgtggacgatgatcttggaaaactagtgcaaaccattaaa
gaaaaaattcctgatcatacaagtgctggtggcagtgagcctccaatatcacgtcatttt
gtgtacacgaaacattttcctatacctcaagatgatccaacatctccgtacagtagtgaa
tcaaaccagagatatatactgctttttggagttggcaaagaacgtgatgagaagaaacat
gctgttaagaaaatgtctaaggaaatttgtaagcttttctcaaaaaaatttagtattgat
gtggcagaaggagggaaagtaaagaaacattcacgaaatgagtttaattttgaagctaca
actagtaaatgtcaaaacatggcatactttgatcagcatgtagtaacgtcgcaatgtgct
gcaacagtacttgaacaacttaacagttttgcacttggaaacaacaattacttgccagtt
caagagcacgtggcttttttatttgatttaatggaaatggctcttaacatttatagcttg
atagagctttgtgaccagattttaaaagaattaccagaagtagaaaatcagttggttgtc
aaaaagtctaatttaattagaagttacacaacattattgggtttatatattgtaggcata
cttcggcgatatcatagttgcttgctattatctatagaacaaactgtttcaatctttgag
ggactatgcaaaattatcaaacatgttggcagtcctagtgaatgtagctctgccgagcgt
tgcattcttgcatatctaagtgacctgcatgattcatgtgttatattaaagagcaaagag
cagcaaccagaatattttcagcagttaaacgttattaaaaagtttaaagaaatatttgtt
gctccagaacaaattaacattgttccaccaacatataatccacaattccttcaagaactt
ttttcttctccgaaacgtggaggtaaaatagatcaattatgggtgcgacaactccatgaa
tccccaacaaacgtgtatagttttgtttcgaatgcatttattgcagtatgccgtgaatca
gacaatgatcgtttaaatgatatagcaatttcatgttcagaactgactgctagttgtaat
gcattatctacggaatggatagcagcattgcagtgcatatgtaattcaacaaagaaacca
cgctatccacatttatttgggcaaattgacatacacaacaccagaatacataattcgttg
gcagtatttatgtgcatcttagtcgcgcgtcattgttttccactgtcggatttcgttgtc
aaattcgctctgccgactcttgttacagcatgtgcagagaccactggagatgccgaagct
ggagctcgtttgacttgccatttattattaaagctgtttaaaactatcgaaataccacaa
cctggtttatactctgttagtacatcaccaaatccaataaatgtagtcagcaatacaact
aacataaagttaagttgtgatcggcatttgcttgttggtgcacataaaaatattccagtg
gaggcagtcttagctgtgttaaaagcaatattatatgttgttgacacagcagctcttaag
acccctacttcagttactggtgccgttgcttattgcagtggcaaacgtagtggtttcaat
actcctgtccatccgggaagtacaccgaagagtaatgaacgacccgttgatttaagtcaa
atattaggcacgagtgatcttaatagtttgggtaatgatgatcaagaaatggcacaacaa
aattcattatcagctaattctaatcagggggaacaaatatctttgctagagtttgcacat
catgtacttaagcaaatctgtgctcaggaacacgttttggaaagatgtttaaagcatgct
gaaaaattgtgtgatttcattattgatgatatgcttacaacgaagcaggtacaacgtgtt
ttacatatgatctgctatcctgaagcagaatataatattatatcagaaatggatcaacgt
tctatgattgtgcgcatacttgaaaatcttggacaatggacattacgtatatcttggctc
gatttacagcttatgtatcgacaactgatgaataatccagcagaacttaatatgtggctg
gatactgtggcacgtgctgctatagatgtttttcagatggaagaaataaatttacctaat
agtaatagaagcgaatatagggcaaagccgtcaacatggctggtggcaccacttatatca
aaactaacacctgctgtgcagggacgcatattacgtgtggccggtcaagtgcttgaaagt
atgaattacttttctaaagtatcaaaaatggatagcaacagttcaggtagcggtgatgaa
agggaaaaaagtaatagttgcggtagcataattagtagttatagtggttctaatagtggt
tcacgtggacgaaaaccaccacttaactatcaaccattcttggagcttattttaacgtgc
ctcaaaggccaagacgaatttaaggaaggattattggcttcattgtattctcaattatct
caatgtttgcaatcattttcaatgttggatacaattggaggtgttgataatccgcaagct
cgtgaagaaattttagatgctttacaactgcgtttctcacttcttggtggtatgtttgac
tcgatacaaaaaaatggtacttctacaacggattgggcaatgttattagcacaattggtt
tgccaaggagtaatcgatttgagttcgaatagggaattattcactactgttgtggatatg
ttagcgacacttgttcattcaacgttggtatcagatactcaatcggatagagatgaaaat
aaaaaatcgtatcttaatttaatgaaaaaattaaaaaaagaaataggcgaacaaacgaat
tcttctataaaagtaataagacaattgcttccactatacaaacaaacaacggaggttatt
tcatgtgaaccagctggggttgatacaaaaggtaataaaatttgcgatatggataaaaag
caattacgcatatcagataaacaacggataagtgtatgggatatattagagggacaaaaa
aatcctgcaccactttcttgggtatggtttggagcagtaaaattagaacgcaaaccatta
gcttatgaagaggcgcatcgaaatctaaaatatcacacacacagccttgttaagcctagt
agttacttttatgaacccttaccactgccacctgaagatattgaacctgttccagaaaag
atttgtattaaggacgaaatgaaagctgacacaccttcttcagttgaccaatctccaagt
gcagttgtgtctggtcggggtaggggtaaaggtacaacacgtaaacgtaaaactaaaaat
ccaaaaactcctccagtaaatactcaagtacaaccgcaaatgactgctcagcagcagcag
caacaacaacagcaaacatctagtgcaacacaacaacaaacaacacagcaattaaatcca
aatcaaatgggtcaaatgcaaatgaatatgcaggtaaatatgcagcagttcgcaccaaat
ccaatgatgcaacagaactctggacagataatgcaatcacagcagatgcaaaatgtacca
agtaatttacaacaacaacttaatagtgggaatgctcaacaacaaaatacgcaattaggt
tttatggcagctggacctcaaaacatgcctcaaacaggtcacacccagcaaccacaatgg
aataatcagaatcaatatcattccatgcaacaacaacagcaacagcaacaattttatcaa
cagcaaggaatacaaatgaaccgctttgaacgtcctcagctgaatgaccctaaattagcc
ctgtctaatatgttacgagcacgccaacccaattataatcaaaataataatactacattc
aatgctatgcaacaacagcaacgtcaaggtcagggtatgcaaccacagcaacaagccgga
ttaaataatgtacaacagcagcaacaacaacaattgcaacagcaacaatttgtacgtggc
gctatacgcggagccattcggggtattgcaccaaatcaaatgggtggtactgctcctaac
caaattgcaccaaacatgaatgctgttaatatagggcaaaatataactccaaaccctttg
atgcaacagcaacaacaaatggcgcaaaataatccccaggctatggcaatggcacaaaat
acaggaatgataggttctgtttctaataataattcaaatttaatgagtggccaatctagc
aataacttagttaacgctggtaatataatgcagcaaaatgtaggaggagttagtaataat
gctgttaaccagaacatgataaatcaaggacccggccagtttcaaaattttaatcaatat
caacagggcataaatgcaacgggtccaaatcagcaaaataatattatgggtggcttcaat
caaatgaatcagcggaacaatcctaatgatttcatgacacaacagcagcaacgtggtcct
gctggcattgttaacaatcgtggccagtatatgaatcaagcaccaaatgttacaatgaac
accatggtgggtcaaggtacagtacctccatattcgcgtcagcaaaatagtggcggtaaa
cctggagttgtatcgtcacagcaccaatttcaacagcaacaacaacaacgtcttcatcaa
ataatgcaactgcaaggcatgaaccaacaaaataatagtggaagtgttattgggcaacaa
caaactcaaagtatgggacagcaacaaactccaaacttggttgcacaattacagagacaa
atgcctaatcaacaaaatatgatgggacagcaattccaacatcagcctccaccatattaa
DBGET
integrated database retrieval system