Teleopsis dalmanni (Malaysian stalk-eyed fly): 119680579
Help
Entry
119680579 CDS
T09311
Name
(RefSeq) vacuolar protein sorting-associated protein 13
KO
K19525
vacuolar protein sorting-associated protein 13A/C
Organism
tda
Teleopsis dalmanni (Malaysian stalk-eyed fly)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tda00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
tda04131
]
119680579
Membrane trafficking [BR:
tda04131
]
Endosome - Golgi transport
Rab GTPases and associated proteins
Rab associated proteins
119680579
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
VPS13_N
VPS13_M
VPS13_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119680579
NCBI-ProteinID:
XP_037949404
LinkDB
All DBs
Position
2:81394351..81410508
Genome browser
AA seq
3176 aa
AA seq
DB search
MANENNQANSTMIERMIAVVINNIQVKISNIHIRYEDCITTGRPFSFGVTLKDLETYTTD
LNWERGFAGSDVRCVFKVAELNSLSLYMNCNAILYTQTKIDDMPNLFRNHIAQKNSAPLH
YTFILNPISSMAKLKLNMNPENGHPPYQSPKIDLFLEMDGIGIALTNKQFQYVLKLGDYI
NRLQLGAPYRKYRPFNKPYKNNYKEWWKFAITAVLEVQIKKRNRYWTWEHIHEHRQLCAN
YSKSYKQKSLTSRPSSELVETCSVLEKKLDLFNIILIRKRIQIDTEKQKKEEEETKVVAK
SGWFGGWFGGGNKDDDDKEPKNFVKSLEDAMSSEEKNQLYETIGYTDNFVPLEIPKYYEA
VKLNFRLTAFELGLYKELNSSKEDLSGSILETLMLLHVSMATCNVRQRPASGGLSVTAGV
KELNIIGLKRDDFIPTLITSKVTEELNLLDVLFEIAPIDELCDQRVNVLARPLQIVYDAE
TILKLLKEFKPPKSVNLSELEGAASVRMADFKERSATGMQYMLDQHKIMELDIKFLPNII
IIPETGTYIPNSKSLIVISMGDVHITSQPRRSSKYDVHALSQSGADQDKIMEVVLAHSYD
NYKVLLQSMQILVVKEEEDWESVLEMAASSDMHVLLPTSIVVKASVCLFHDDPRLPKTKV
EILLPGINIDVSEDRVFEALGIFKSLPMPDEDIEAKPLLKAVSTASLQSVSSFLNAESRK
KKPIRVNAPQVKDDLVQSTDLVVNFALKEFRVVLYKSNTSSIASRSESTHFGTPPEEPST
DDMEVFADAYTIQSVSRLQKILALEILQLECDMTQLTYEMTVNAKLGAIKLTQFSNENYK
LIEYPVIDTPQFSEELTYLLTVSFTSVNKKSPEFSTKHNSTEAKVTVNFSTLKVLLHLEC
LLKLMEINNSLQKRLEAYDDGKPKDRIATAGEPAPIPNKLDTIAEDSEEVGTKIVTERTK
KSRSRKVVDSIKMHIVANLHQVVVMLSSRTRGLATLKVENFTAGVVMKSSYTEVKVGLKD
IHVEDLNPHTIHTSILSIVGKNALKCQLVLFNLDETSAYNSDDMKVNVEIGGMRIVFLNW
FVTSVLNFIHNFQAAEQAIANVSAAAAEQAKNNALDAYEKATRIKLNIKIKAPIIVVPVN
SKSTDAIVLDLGYLLLSNTTSELEVNNDERSPAVLDDIKLEMRSMKVYKASVVDEYGKAS
IISIFPTHDDVDATYGVKTGINILDPVSFTLDVKRNLSFSWYKELPEINLAGRLKSITLN
LFKDDYTLVMSILNQNMTEGQNEIVDNDDDIEPSVTTVEVHKPNESPSHKSTAPTDNAKR
VLDIPKIYAQLMFNFQFDGVQAALHFDNGDSLAEFGIYFLSVKGKKLIDGTLSTSIVLCN
IQLDDKRKNTKSKITRYLGRKNWKHEDPHVFPSECDENNRSYMVDVTAIIREADSVAEVR
VSSFDLILCIDFLLKLSHFFELPEESKNVQPIAEVKPGVVAKQTAVPVKENDIYKENKVS
LMIHIDQPDIILIESLENINTSAIIFNMEANLNYRAIGEKQIINGEIQSLKMYLCSFKPE
RREATKHYIIHPCVITLQGSTPEHEGLHISLKLSEIIINISPATIELINKALKTLQTDNA
EKNALKIEKPDYTDIWEQKPFKKKNYWFFKPDTAVEALEITENEIRIPKTEKCVVEVPCI
TIVLEMGIGYYTTPLISLDMRLQAVVSDWSSALRVNGSLCLNMDYYNQSFGAWEPIIELN
EHIKPDGELEYLPWDLSFSMKIENKSNESEESIEDAKIITVQSEQNLELTVTKTLLNLIP
SLNEAFAQAMDVTGLTKPDIIAPYVVENDTGFNITINFRRGIFTLHECHTPRATKPNISA
VLYQTESIDNNFSLNEIKDCTISPNGRVYLQTKDLSTLTTEEDEEYNLYVKIGGIEKEIL
LPVIKSDTRYFALYKDVHQDPWGLISEVKSEYGTTKINIHGVVSVFNHFSIPLQVHRTKP
NSVDKSFIGEIQPHDVFHIPLHGIYSETKELFFCLQGYKCSVQGIKWNDCPTDLNYSRQI
QCDPLNTFEPFYMNAVREKTEVFYENTNKYKLLSAYYTIHLRPPLYMHNSLPINIKVSVL
GCNVANSSRSSQASPIIENYKEKSIMKQDLLDYGEKEVKPGDVLHLPTLKFSGKKRDNSS
FLIVKLMDYLEKDWSCTTSISDQNIKDIAIWKFTAFDSPSKMEIDLCVRYETLHDSLVAT
IFSPFWLVNKSGLMLSYNLNTETVDVLFHPPEYKGPILFSPAKSLFDKKAISVRVDSGDW
SDKIPLDIAGSNGTVTCTCPDEKYQIGVHNSLTTNSLTKQITFIPFYNAVNNCDFEIELQ
ELNRPADNWNKVAPGSCSAIWPKSGSDFLMVAKVNGITTVPFNYAEAQCCLLQLYKDKVG
GINVDVQATEGGVYIIFTQYNPGDAPALFINHTNDNVAFYEKTLQNKIITVSPLSLLLFT
WANPAGEKNIVMGKNEVVSDLRRDDCGEIKLHNNTTTYWVSFLDGLQRVILFTKNKSIVS
RSETSAQLQTITQSIMLRLQGIGLSVINNEKGVDIMYMGIKSSGIIWESKKDKKRFKQMN
IDETAQVEGQYQKYLLEKSVNQESQYFLDIKQEIDFENMVLKTTPPRIIQRTFYPGIWVN
MNTSPFQTQLHVKLNKIQMDNQLRDCIFPVVLTAVPPPKSVAKTITLKPFIECSIVERII
PNSTVKQYKYAIILIQEFHLKVDLVFLAAIAELFTTDLNDEQRAKLFNADVDAISKPLWE
LVQTRSLEQQKHFYDNLHLGPLKIHLSFSMAGSDTIPLPGVLATLVQGIGVTLTDVNDVV
FRLAFFEREFQFFTQQQLTSEITTHYAGQGLKQLYVLVLGLDVLGNPYGLVVGLKKGVGD
LFYEPFQGAIQGPGEFAEGLVLGVKSLFGHTVGGAAGAVSKITGALGKGIASLTFDEDYQ
KKRQRNINKKPENFQQGIARSGKGLVMGFVDGVTGVVTKPVAGAKEEGVEGFFKGLGKGA
IGLVTRPTAGVVDFASDSFGAVKRAAESKEDDKRLRAPRFIRLDAVLRPYCRAEAKGNQI
FREIEKGKYATTDTYVHREVIIRKKENLIISNHRVIYITKNDLFGHWVVNWQHLWPEIEK
ITASDRGVELVMKRDNKKVMGIFGRSDKQNRLLIKIPPNRREKLVEIMESQRLEDI
NT seq
9531 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaacgaaaacaatcaggctaattccacaatgattgagcgaatgatagctgttgtt
ataaacaatatccaagtgaaaatatcgaatattcatatacgatatgaagactgtatcaca
actggtaggccattttcatttggtgtaacattaaaggacttagagacatatactactgat
ttaaactgggagagaggctttgctggatccgatgttagatgtgtttttaaagtggcagaa
ttaaattctttgtcactgtatatgaattgcaatgctatactctacacacaaaccaagata
gatgatatgcctaatttgtttcgaaatcatattgcacaaaagaattcagccccactgcat
tatacattcattttgaatcctatcagttcaatggcaaaacttaaactaaacatgaatcca
gaaaatggtcatccaccatatcaatctccaaaaatcgacttattcttagagatggatggt
attggcattgcgttaacaaacaaacaatttcagtacgtacttaaattgggtgattatata
aatcgcttacaattaggcgcaccttacagaaaatatagacctttcaataaaccttacaaa
aataactacaaggaatggtggaaatttgctattaccgctgtattagaagtacaaataaag
aaacggaatagatattggacgtgggaacatattcacgaacacagacagttatgtgcaaat
tattctaagtcatataaacaaaaatctcttacttcgcgaccttcttctgaacttgttgaa
acttgcagtgtcttggaaaaaaaattggatttatttaatattatattaatccgcaaacgt
attcaaatagatacggaaaaacaaaagaaggaagaggaagaaaccaaagttgtcgcgaaa
tcaggctggtttggcggttggtttggaggtggtaataaagatgatgacgataaggagcct
aagaacttcgttaaatcattagaagatgccatgagtagtgaagaaaaaaaccaattatat
gaaacaattggttatactgataattttgtaccattggaaattccaaaatattatgaggca
gtaaaattaaatttccgattaacagcatttgaattaggtctttataaagaactaaatagt
agtaaagaagatttaagtggtagtatacttgaaacattaatgttactccatgtatcaatg
gcaacttgcaatgtaagacaacgtccagcatcaggaggtttgagcgtaacagcgggcgtt
aaggagttaaatataattggtttaaaaagggatgattttattccaactttaattacctca
aaggtaacagaagaacttaatttattagatgtgctgtttgaaattgctccaatagatgag
ttatgtgatcaacgtgtaaatgttttggcacgaccattacaaattgtttatgatgctgaa
acaattttaaagcttttaaaggaatttaaaccaccaaaatcagtgaatctatcagaatta
gaaggtgctgctagtgttagaatggccgattttaaagaacgctcagccactggaatgcag
tatatgcttgatcagcataaaattatggagttagatataaagtttctgccaaatatcatc
ataattccagaaaccggtacttatattccaaatagtaaatctcttattgtcattagcatg
ggtgacgtacatataacatcacaaccgcgaagatcttccaagtatgatgtacacgccttg
tctcaatctggcgcagaccaagacaaaattatggaagttgtcctagcgcactcatacgat
aattataaggttttacttcaaagcatgcagattttagttgtaaaagaagaggaagactgg
gaaagtgttcttgaaatggctgcgagctcagatatgcatgtactgttacctacgtcaatt
gttgttaaagctagtgtgtgtttatttcatgatgatccacgtttaccgaaaaccaaagtt
gaaattttgttgcccggtataaatattgatgtaagtgaagatcgggtttttgaagcatta
ggtatttttaaaagtttgccaatgccggatgaagacattgaagccaagccgttacttaaa
gcagtaagcactgcctctctacaatctgtatcgagtttccttaacgcagaatcccgtaaa
aagaagccaataagagttaatgcgccgcaagtgaaggatgatctagtacaaagtaccgat
ttagttgttaattttgcattaaaggaatttcgcgttgtattgtataagtctaatacatcg
tctattgcttcaagatcagaatcaactcattttggaactccgcctgaagaacctagtacc
gatgacatggaggtattcgcagatgcatatactatacaatccgtttcacgattacaaaaa
atacttgcacttgaaatcttacaattagagtgcgatatgacccagcttacttacgaaatg
actgtgaatgcaaaacttggggctataaaattaacacaatttagcaatgaaaattataaa
ttaatagaatatcctgtaattgatacacctcaattcagcgaagaactcacatatttgcta
acggtgtcatttacctcagttaataaaaagtcaccggaattcagtactaagcataattcc
actgaagctaaggtcacagttaacttttcaactctaaaagttttacttcatttagaatgt
ttacttaaattaatggaaataaataactcgctacaaaaaagattagaagcatacgatgat
ggaaaaccgaaagatcgtattgcaacagctggagaaccagctcctattcctaataaactt
gatactattgctgaggactcggaagaagtaggaactaaaatagttactgaacgtacaaaa
aaaagtcgatcaagaaaagttgtggatagtattaaaatgcatattgtagccaatttacat
caagtagtcgtaatgttaagctctcgtacacgtggtttagcaacattaaaagttgaaaac
tttaccgctggtgttgtgatgaaatcttcgtataccgaggtaaaagtgggactaaaagat
atacatgttgaagatctaaatccgcatactattcataccagcatactttcaattgttggg
aaaaatgcgctaaaatgtcaactagttttgtttaacttggacgaaacaagcgcttacaat
tctgatgacatgaaagtaaatgtggaaattggtgggatgcgtattgtctttttaaattgg
ttcgtgacatctgttttgaatttcatacataattttcaagctgccgagcaggctatagcc
aacgttagtgcggctgcagctgagcaggcaaaaaacaatgctctagatgcttatgagaag
gccactcgtataaaactaaatattaaaataaaagcacccattattgtagtccctgtaaat
tcgaaaagtacagatgcaattgtattggatttgggttatttattgctttcgaatacaaca
agcgaacttgaagtaaataatgacgaacgtagtccagcagttttggatgatattaaactt
gaaatgcgaagtatgaaggtttacaaagcatcagtagttgatgaatacggtaaagcatcc
ataattagcatatttcctacacatgatgatgttgatgcgacttatggtgtaaagactggt
ataaatattttggacccagtaagctttacacttgatgttaaacggaatttatcatttagt
tggtataaagaactaccagaaataaatttagctggcagattaaaatctattacattaaat
ctatttaaagatgactataccctagttatgtctatattaaatcaaaatatgacggagggg
cagaacgaaatagttgataatgatgatgatatcgaaccatcagtaactactgtagaggtt
cataaaccaaatgagtcacctagtcataaatccaccgccccaaccgataatgctaaacgt
gtgctcgacataccaaaaatatatgcgcagttgatgttcaatttccagttcgatggcgtg
caagcagcattacattttgacaatggtgacagtttagccgaatttggaatttattttttg
tcagtaaaaggcaaaaaattaatagacggcacattgagtacatcaatagtattgtgcaac
attcaacttgatgataaacgtaaaaatacaaaaagtaaaatcacaagatatctgggccgt
aaaaattggaaacacgaagaccctcatgtctttccaagtgagtgtgatgaaaacaaccgt
tcttacatggttgatgttaccgctataataagagaagctgattccgttgctgaagtacga
gtttcctcttttgatttaatcttatgcattgattttctattaaaattatcacatttcttt
gaattgcccgaagaaagtaaaaatgttcaaccaatcgctgaagttaagccgggagttgtg
gcaaagcaaactgctgtgcctgtaaaagaaaacgacatttataaagagaacaaagttagt
ttaatgattcatattgatcaacctgacattatactaattgaaagcttggagaatataaat
accagtgccattatatttaatatggaagctaatttaaattaccgcgcaattggtgaaaaa
caaattattaatggggaaatacagtcattaaaaatgtacctgtgctccttcaaacccgaa
agacgtgaagcaactaaacattatattatacatccatgtgtgataactttacaaggctct
acacctgaacatgaagggctgcacataagtttaaaattaagtgaaataattattaatatt
tcacctgcaacaattgaacttataaataaagctttaaaaactctgcaaactgataatgct
gaaaagaatgctttgaaaatcgaaaaacctgactacaccgatatttgggaacagaaacca
tttaagaagaaaaactattggttctttaaacctgacaccgctgtggaggcattagaaata
acggaaaatgaaatacgtatcccaaaaactgagaaatgtgttgttgaggtgccttgtatt
accattgttttagaaatgggtattggatattatactacaccacttatatcgcttgatatg
cggctacaagcagtcgttagtgattggagttcagctttaagagttaatgggtcactttgt
ttaaatatggattattataatcaatcgtttggtgcttgggagccgattattgaattaaat
gaacatattaaacctgatggagaacttgaatacttgccttgggatttgagcttttcaatg
aaaattgaaaataaatctaatgaaagtgaagaatcaatagaagatgctaaaataataaca
gttcaatctgaacaaaatttagaattgactgtaactaaaactttactaaatctaatacct
agccttaacgaagcatttgctcaggcaatggatgtgactggtttaactaaacctgatatt
attgcaccatatgtagttgaaaatgatacaggctttaatataacaattaattttagacgc
ggaatattcacactacatgaatgtcacactccaagagctacaaaaccgaacatttctgca
gtgttatatcagaccgagagcatagataataatttttcgctcaatgaaataaaagattgt
accatatctcccaatggacgtgtgtatttacaaactaaagacctgtctacacttactaca
gaggaagatgaagaatataatttatatgttaagattggtggcattgaaaaggaaattttg
cttccagttataaaatccgatacgcgttactttgctttgtataaagacgtacatcaagat
ccatggggcttaatttctgaagtaaaatcggagtatggcacaacaaaaattaatatacac
ggcgttgtcagcgtttttaatcacttctcgattccgttgcaagttcatcgtactaaacct
aattcggttgacaaaagtttcataggagaaatacagccccatgatgtttttcatatacca
ttacatggaatttattctgaaacaaaggaattatttttctgtttacagggttataaatgc
tccgttcagggcatcaaatggaatgattgtccaacagatttgaattactctcgtcagata
caatgtgatcctcttaatactttcgaaccattttatatgaatgcggttcgagagaaaact
gaagtgttctatgaaaacacaaataaatataaattattaagtgcttattatacaatacac
ttacgcccaccgttgtatatgcataattctttacctattaatataaaagtatcagttttg
ggttgtaatgttgccaattcatctagatctagccaggcttcacccattattgagaattat
aaagaaaaaagcattatgaaacaagatttgctagactatggtgagaaagaagttaaacca
ggcgatgttttgcatttacctacacttaagttttctggtaaaaaacgagataattccagt
tttttgattgtaaaattaatggattatttggaaaaagactggtcttgtacaacatccatt
tcagatcagaatataaaggatatagctatatggaaatttaccgctttcgattccccaagt
aaaatggaaattgacttgtgtgttcgttatgaaactttacacgatagtttggttgctacc
atatttagcccattttggttagtaaataaaagtggcctaatgcttagttataacttgaat
acagaaactgtggatgtcctattccatcctccagagtataaaggaccaatacttttttcg
cctgccaaatccctatttgataagaaggctatctcagtgcgagttgatagtggagattgg
agtgataaaataccattagatatagcaggttcaaatggtactgtaacttgtacttgtcca
gatgaaaaatatcagattggcgtgcataatagcttaacaacaaattctcttactaaacaa
atcacatttataccattctataatgcggttaataattgcgattttgaaattgaactacaa
gaactcaatcgtcctgcagataattggaataaggttgcacccggttcatgttctgcaatt
tggccaaaatctggttctgactttttgatggtagctaaggtcaatggaataacaactgta
ccttttaattatgctgaagcacaatgttgtctgctgcagttatacaaagataaggtcggt
ggaataaatgttgatgttcaagcaactgagggaggtgtttatataatatttacccaatat
aatccgggagatgcaccagcacttttcattaaccacacaaatgataatgttgccttttac
gaaaaaactcttcaaaataaaataataaccgtatctccactaagtttacttctatttact
tgggctaatccagccggtgagaaaaatatagtaatgggaaaaaatgaggttgtatcagat
ttgagacgtgacgactgtggagaaataaagttacataataatacaactacatattgggtt
tcatttttggatggtctacaacgtgttatacttttcacaaaaaataaatctattgtttct
cgatctgaaacaagtgcacaactacaaactattacacagtccattatgttgcgtctgcaa
ggtatcggcttatctgttataaataatgaaaaaggtgtagatattatgtacatgggcata
aaaagttcaggtattatatgggagtctaaaaaagataaaaaacgttttaaacagatgaac
atagatgaaactgctcaagttgaaggccaatatcagaagtatttgctggaaaaaagtgtt
aaccaagaatctcaatactttttggatatcaagcaagagattgattttgagaatatggta
ttaaaaacaacgcctccaagaataatacaacgtactttttatcccggcatatgggtgaac
atgaatacatcaccattccaaacacaattacatgttaaattaaataaaatacaaatggat
aatcagttacgagattgtattttccccgttgtattaacagctgtgccaccaccaaagagt
gttgccaaaactattacactgaagccttttattgaatgcagcattgttgaaagaattata
ccaaattcaacagtgaagcaatataaatacgcgattatacttattcaagaatttcattta
aaagtggacttagtattccttgctgcaattgctgagttatttactacagatcttaatgat
gagcaaagggcaaaactgtttaatgctgatgtggacgcaatatcaaaaccactatgggaa
ctagttcaaacacgctccttagaacaacaaaaacatttctatgataatttgcatttgggt
ccattaaaaatacatttaagtttttcaatggctggttcagatactataccattacctgga
gtattggcaacattggtacagggtattggtgtgactttgacggacgtaaatgatgtcgtc
ttccgtctagcattcttcgaacgcgaattccaattctttacacaacaacagttaacttct
gagattacaacgcactacgctggtcaaggtctaaagcaactttatgtgctcgttttagga
ctggatgtgctgggtaatccatatggtctggttgtcggtttgaaaaaaggagttggtgat
ttgttctatgaaccatttcagggtgctattcaaggtccaggcgaatttgctgagggtctg
gttttaggtgtgaaatctttgtttggacataccgtaggaggtgcagctggagcagtttcg
aaaataactggcgctttgggcaaaggaatagcaagtcttactttcgatgaagattatcag
aaaaagcgacaacgtaatattaacaaaaaacctgaaaacttccagcaaggcattgcgcga
agtggcaaaggccttgttatgggatttgttgatggtgttactggtgtagttaccaaacct
gttgctggcgccaaagaagaaggagttgaaggattctttaaaggtctgggaaaaggtgct
ataggcttagtcactcgacctacagcaggtgttgtagatttcgctagtgatagctttggc
gcagtaaaacgtgccgctgaatcaaaagaggatgacaaacgtttacgtgcaccacgcttc
attcgtcttgatgcggttttgcgaccctattgtcgtgcggaagcaaaaggcaaccaaata
ttcagggaaatcgagaaaggtaaatatgcgacgacggatacctatgtacatcgtgaagtt
atcataaggaaaaaagagaatttgataatttccaatcatcgagttatttacattaccaaa
aatgacttgtttgggcactgggtggttaactggcagcatttatggcccgaaattgaaaaa
atcacagcctcagatcgaggggtagaattagtaatgaagagagataacaaaaaagtaatg
ggcatctttgggaggagtgataaacaaaacagacttcttataaagatcccaccaaatcga
cgagagaaattggttgaaattatggaatctcagcgcttagaagatatttag
DBGET
integrated database retrieval system