KEGG   Tenacibaculum dicentrarchi: AUW17_05210
Entry
AUW17_05210       CDS       T04208                                 
Name
(GenBank) restriction endonuclease subunit R
  KO
K01153  type I restriction enzyme, R subunit [EC:3.1.21.3]
Organism
tdi  Tenacibaculum dicentrarchi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tdi00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:tdi02048]
    AUW17_05210
Enzymes [BR:tdi01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.21  Endodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.21.3  type I site-specific deoxyribonuclease
     AUW17_05210
Prokaryotic defense system [BR:tdi02048]
 Restriction and modification system (R-M system)
  Type I R-M system
   AUW17_05210
SSDB
Motif
Pfam: SWI2_SNF2 ResIII HSDR_N T1R_D3-like Helicase_C NPHP3_N
Other DBs
NCBI-ProteinID: ALU74703
LinkDB
Position
complement(1161696..1164761)
AA seq 1021 aa
MKFNEDSRVKIPSILHLIQLGYTYLSLKDNHWDIDTNIFTDIFYTQLKKINTNLSQKEAE
KFYNEVSLTLENEDLGRAFYKKLTNKSGIKLIDFENFENNSFHVVTELPYEKDEDNFRPD
IILLINGMPLVFIEVKKPNNKDGILAEHKRMQRRFKNKKFRKFINLTQLMVFSNNMKYND
NDTQMLAGAFYSTTNYKKPIFNYFREEENFDLAKILAPISDEQENYVLKDTNLISIKNAK
EFISNKNPTSPTNSISTSLFQKKRLQFILQYAFAYVEEENGLEKHVMRYPQIFATKAIEN
KLENGVKKGIIWHTQGSGKTALAYFNVKHLTDYYQQKNIIPKFYFIVDRIDLLNQAAKEF
SSRGLVVHKVNSREEFTKDIKSTKVIHNNSGKAEITVVNIQKFKDDPDVIKNNDYNLNVQ
RVFFLDEVHRSYNPKGSFLANLELADKNAIKIGLTGTPLLGKEYNSKTLFGDYIHKYYYN
LSIKDGYTLRLIREEIETKYKLTLQETLEKIKVLEGNADKKTLYSHYKFVAPMLHYIVQD
LETARISMNDNSIGAMVVCDSSEQAEMMQEIFDEKYAIKPASYFLQAAEDPEQYGDKKNT
NSKVNKAAVILHDVGTKQERKDWVSDFKAGKIDVLFVYNMLLTGFDAKRLKKLYIGRNIK
SHNLLQTLTRVNRTYKNHKYGFVVDFADIQKEFDKTNQAYFNELQSELGDEMEHYSNLFK
SSEEIEIEIEEIKDVIFKFDTNNAEIFSEQISEINERTEIREIAKVLNNAKELYNLIRLS
GNFELLEKLDFKKLAILSRLTNDRLALINTKIALENNVETNNILNTALEDVIFAFTKVKQ
EEMILADELKDVLGKTRGKLGDNFDHKDPKFVSLREELERLFKKKNLSEVSKQEMEANIK
ALNEIYNVAKKLERENQLLKAKYDYDEKYARIHKRLMEKDPLTDNERKLFDALKGLKTQV
DNEILQNSKLLENESYVEKMMMRLVINEFKNKQNIHINATDVKRINNILVKEYINEYNSV
A
NT seq 3066 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaatttaatgaagactctagggttaagattccctcaattttacatttaatacagtta
ggatatacctatttatctttaaaagataatcattgggatattgacaccaatatttttacc
gatattttttatactcaactaaaaaaaattaatacaaacctttctcaaaaagaagctgaa
aaattttataatgaagtttcacttactttagaaaatgaagatttaggaagggctttttat
aagaagttaacaaataaatctggaattaaattaattgattttgaaaattttgaaaataat
tcctttcatgtagttacagaattaccttacgaaaaagatgaagataattttagacccgat
attatcttattaataaacggaatgcctttggtttttattgaagttaaaaaacctaataat
aaagatggaattttagcagaacataaacgaatgcaaaggcgttttaaaaataagaagttt
agaaaattcatcaacttaacacagttaatggttttttctaataacatgaagtataacgat
aatgatacgcaaatgttagcaggtgctttttatagtaccacaaattacaaaaaaccaata
ttcaattattttagagaagaagaaaacttcgatttagctaaaatattagcgcctatttct
gatgaacaagaaaattatgtattaaaagatacaaatcttatcagtattaaaaatgctaaa
gaatttatttcaaataaaaatcctacttcaccaacaaattcaataagtacttccttattt
cagaaaaaacgtttacaatttatattacaatatgcttttgcttatgtagaagaagaaaat
ggtttggaaaaacatgtaatgcgctatcctcaaatttttgcaacaaaagctattgaaaac
aagttagaaaatggtgttaaaaaaggaattatttggcacacacaaggttctggtaaaact
gcattagcgtattttaatgtaaagcatttaacagattattatcagcaaaagaatattatt
cctaaattttattttattgtagatagaattgatttattaaatcaagctgcaaaagaattt
agttctcgtggtttagtagtacataaagtaaatagtagagaagaatttacaaaagatatt
aaatcaactaaagtaattcataataattcaggaaaagcagaaattacagtagttaatatt
cagaaatttaaagatgaccctgatgttataaaaaacaacgattataatttaaatgtacaa
cgtgttttctttttagatgaggttcatagaagttataatccgaaaggaagttttttagca
aatttagaattagcagataaaaatgctatcaaaattggattaacaggaacgccactttta
ggaaaagaatacaattctaaaacgttgtttggtgattatattcataaatattattataat
ttatctataaaagacggatatacattgcgtttaattcgtgaagaaatagaaactaaatat
aaattaacacttcaagaaacattagaaaaaattaaagttttagaagggaatgctgataag
aaaacactctattcacattataaatttgtagcgccgatgctacattatattgttcaagat
ttagaaaccgccagaatttctatgaatgataatagcattggcgcaatggtggtttgtgat
tcatctgaacaggctgaaatgatgcaagaaatttttgatgaaaaatatgctattaaacca
gcaagctatttcttgcaagctgcagaagaccccgaacaatatggggataaaaaaaataca
aatagcaaagtaaataaagctgctgtaattttacacgatgtaggcacaaagcaagaacgt
aaagattgggtttctgattttaaagcaggtaaaatagatgtactttttgtctataatatg
ttattaactggtttcgatgctaaaagattaaaaaaattatacattgggcgtaacataaaa
tcacataatttattacaaacattgaccagagtaaatagaacctataaaaatcataaatac
ggttttgtagttgattttgctgatattcaaaaagaatttgataaaacaaatcaagcgtat
tttaacgaattgcaaagtgagttaggcgatgaaatggaacattactcgaatctgtttaaa
tcatccgaagaaattgaaatagaaattgaagaaataaaagatgttatttttaaatttgat
accaataatgccgaaatatttagtgagcaaatatcagaaataaacgaacgtacagaaatt
agagaaattgcaaaggttttaaacaatgctaaagaactgtataacttaattagattatcg
ggtaattttgaattattagaaaaattagactttaaaaaattagctattttatcaagatta
acaaacgaccgtttagcacttatcaataccaaaatagccttagaaaataatgttgaaacg
aataatattttaaataccgctttagaagatgtcatttttgcttttacaaaagtaaaacaa
gaagaaatgatattggctgatgaattaaaagatgttttaggaaaaactcgtggaaaatta
ggtgataactttgatcataaagacccaaaatttgtttctttacgtgaagaattagaacgt
ttatttaaaaagaaaaatttaagtgaagtttctaagcaagaaatggaagccaatataaaa
gccttaaatgaaatttataatgtggctaaaaaattggaaagagaaaatcagttattaaaa
gctaagtatgattatgatgaaaaatacgctcgtattcataaacgcttaatggaaaaagac
ccgttaacagataacgaacgcaaactttttgatgctttaaaaggattgaaaactcaagta
gataatgaaatattacaaaattcaaagcttttagaaaatgaaagttatgtagaaaaaatg
atgatgcgtttggttatcaatgaatttaaaaacaaacaaaacatccatataaatgcaacc
gatgtaaaacgcattaacaacattttagtaaaagaatatattaacgaatacaatagcgta
gcctaa

DBGET integrated database retrieval system