KEGG   Tenacibaculum dicentrarchi: AUW17_10610
Entry
AUW17_10610       CDS       T04208                                 
Name
(GenBank) preprotein translocase subunit SecD
  KO
K12257  SecD/SecF fusion protein
Organism
tdi  Tenacibaculum dicentrarchi
Pathway
tdi02024  Quorum sensing
tdi03060  Protein export
tdi03070  Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tdi00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03060 Protein export
    AUW17_10610
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   03070 Bacterial secretion system
    AUW17_10610
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    AUW17_10610
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:tdi02044]
    AUW17_10610
Secretion system [BR:tdi02044]
 Sec (secretion) system
  Prokaryotic Sec-SRP core components
   AUW17_10610
SSDB
Motif
Pfam: SecD_SecF_C SecDF_P1_head SecD_1st Sec_GG MMPL bPH_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: ALU75675
LinkDB
Position
2465214..2468231
AA seq 1005 aa
MQNKGLIKLFAVLFGLVSLYQLSFTFFANKVEDSAKVYAKENAKGNSGRELAKFERKYLD
SVANDQVVNLGIGKYSYNDIKEREMNLGLDLKGGINAILQVSVKDILIALANNSENTVFR
SALAKANEAQKDSQENYLDLFLTQFETLSNGSIKLSDPAIFGTKSLREKIDFNKTNAQVK
EVLQQEINSSINTSFEVLRSRIDKFGVTQPNIQRIGNSGRIQIELPGAKDIERVTKLITS
TAELQFWEVYTNAEVQNFFFSANAKVAELLKDDSITATTQVKDSAKADDIDDLLGTSTDA
AVKANTQKNLFTYLYPNVAQNQQQMSSLVAQAKVQDTAQVNSLLAHKSVQALLPANLKYV
KFLWDYKAQKSADGTAEIIGLYAIKSNRNDKATIDGDVISDANQDFDQLSKPVVSMTMNA
SGTKKWAKMTGDNVGKFVAVVLDNYVYTAPVVNGAITGGSTQISGGTMTVEEAQDISTVL
KAGKLPAPARIIQAEVVGPSLGQESINASIWSFGLAILLILVWMFLYYGKAGIYANIALL
VNILFIFGWLASYNAVLTLPGIAGIILTIGMSVDANVIIFERIKEALRGGQTLETAVDEG
FSFKGALSAIIDANITTFLTGVILFIFGTGPIKGFAYTLMLGIATSLFTAIFITRLFIDK
SIEKGTGLPFNTSISKNWFQNINIEFLKKRKLAYIVSGFFILAGLVSIFTLGLKQGVDFK
GGRSYVVRFDQPMNATQVATSLKDAFKSAPEVKTYGSDHQLKITTAFKIDEDGSEVDEIV
QKSLFTGLKAYLGTTSYEDFKPGFEKAGSGIMSYMKVEPTIADDIKKSALWAVIGSLIVV
FLYILLRFRKIAFSIGAVVAVFHDVLVVLGVFSICYKFMPFDMEIGQSFIAAILTVVGYS
LNDTVVIFDRIREFTQEKTTISASLVNKALNSTLGRTINTSLTTLLVMLAIFFFGGDSIK
GFMFALIVGVVVGTYSSLFVATPIMFDASKKAEAVKEQEENQEIA
NT seq 3018 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaaaacaaaggtcttattaaattatttgctgtccttttcggactagtaagcttgtac
caattgtcgtttacattttttgctaataaagtagaagatagcgctaaggtatatgcaaag
gagaacgctaagggtaacagcggtagagagttagctaaatttgaaagaaaatatttagat
agcgttgcaaacgatcaggttgtaaacttaggtattggtaaatatagctataacgacatc
aaggagcgtgaaatgaaccttggtttagacttaaaaggtggtattaatgctattttacaa
gtatctgtaaaagatattttaattgctttagcaaacaattctgaaaacactgtttttaga
tcagcgttagcaaaagcgaatgaagctcaaaaagacagtcaagaaaactacttagactta
tttttaacacaattcgaaaccttaagtaacggaagtattaaattaagtgatcctgcaatt
tttggtacaaaatctttacgtgaaaagattgattttaataaaaccaatgcgcaagtaaaa
gaagttttacaacaagaaattaatagttctattaatacttcttttgaagtattacgtagc
cgtattgataaatttggtgtaactcaaccaaatattcagcgtatcggaaactctggaaga
attcaaattgaattaccaggtgctaaagatattgagcgtgttacaaaattaattacaagt
actgccgaattacaattttgggaagtatatacaaatgctgaagttcaaaactttttcttt
agtgcaaatgctaaagttgctgaattattaaaagatgattcaataactgcaaccacgcaa
gttaaagattctgcaaaagcagatgatattgatgatttattaggaacatcgaccgatgca
gctgtaaaagcaaatactcaaaagaacttatttacttatttatatcctaatgtagctcaa
aatcaacaacaaatgagctctttagtggcacaggctaaagttcaagatacggcacaggta
aatagcttacttgctcataaaagtgtacaagctttattacctgcaaatttaaaatatgtt
aaatttttatgggattataaagcacagaaaagtgcagatggtactgctgaaattattggt
ttatatgccataaaatcaaacagaaatgacaaagcgactattgatggtgatgtaatttca
gatgctaatcaagattttgatcagttaagcaagccagttgtatcaatgacaatgaatgct
agtggaactaaaaaatgggcaaaaatgactggcgataatgttggtaaattcgttgccgtt
gttttagataactacgtatatacagcgcctgtggtaaacggagcaattacaggaggaagt
actcaaatttcaggaggaaccatgactgttgaagaagctcaagatatttcaacagtatta
aaagcgggtaaattacctgctcctgctagaattattcaggcagaagttgttggaccatca
ttagggcaagaatctattaacgcaagtatttggtcattcggattagcgattttattaatt
ttagtttggatgtttttatactacggtaaagcgggtatttacgccaacattgctttatta
gtaaacattttatttatcttcggatggttagcctcatataatgcagttttaaccttacct
ggaattgcaggtattattttaacaatcggtatgtcggttgatgcgaatgttattattttc
gaaagaattaaagaagccttaagaggtggacaaactttagaaactgccgttgatgaagga
tttagttttaaaggagctttatcggcaattattgatgcaaatattactacattcttaacg
ggtgttattttatttatcttcggaacaggacctattaaaggttttgcttatacattaatg
ctaggtattgcaacttcattatttacagcaatttttatcactcgtttatttattgataaa
tctattgaaaaaggaactggattacctttcaatacaagtatttctaaaaactggtttcaa
aatatcaatatcgaatttttaaagaaacgtaagttagcttatattgtttctggattcttt
attttagctggattggtatcaatctttaccttaggattaaaacaaggtgttgattttaaa
ggaggtcgttcttacgttgtacgttttgatcagccaatgaatgcaacacaagttgcaacg
agcttaaaagatgctttcaaatcggctcctgaagtaaaaacttacggatctgatcatcaa
ttaaaaataactactgcttttaaaattgatgaagatggtagcgaagttgatgaaatagtt
caaaaatcattatttacaggattaaaagcgtatttaggaactacttcttacgaagacttt
aaaccaggattcgaaaaagcaggtagcggaattatgagctacatgaaagtagaaccaacc
attgctgatgatattaaaaaatcagcattatgggcagtaatcggttcattaattgtagtt
ttcttatatattttattacgttttagaaaaatagccttctctatcggtgcagttgttgcc
gtattccacgatgtattagtggtattaggtgtattttctatctgctacaaattcatgcct
tttgacatggaaattgggcaatcatttattgctgctattttaacagtagttggatattca
ttaaatgataccgtagtaatttttgatagaattagagaatttactcaagaaaaaacaacc
atatcggcaagtttagtaaacaaagctttaaacagtaccttaggtagaaccataaatact
tctttaacaacattattagtaatgttagcaattttcttctttggaggagatagtattaaa
ggatttatgtttgccttaattgtaggagttgttgtaggtacgtattcatcattattcgta
gcaacaccaattatgttcgatgcttctaaaaaagcagaagctgtaaaagagcaagaagaa
aaccaagaaatagcataa

DBGET integrated database retrieval system