Tenacibaculum dicentrarchi: AUW17_11105
Help
Entry
AUW17_11105 CDS
T04208
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
tdi
Tenacibaculum dicentrarchi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tdi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tdi02000
]
AUW17_11105
Transporters [BR:
tdi02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AUW17_11105
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
SdrD_B
MetallophosN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALU75762
LinkDB
All DBs
Position
complement(2572979..2575369)
Genome browser
AA seq
796 aa
AA seq
DB search
MKIYKILLITLFSVFSAYSQNVLTGTITDTHGEGIVGAAIFIKKIEKGTTTNIEGKYELK
NLEKATYLITFQSLGYKTEVKNIIINKNTTILNITLEEDSSKLDEIVVSAGRTSEKISEI
PASITIVGTRELEKLGTTTTNINDILEFSVPGLASSTGTYSNWGQTLRGRQLLVMVDGIP
QSTPLRNAKVGLKSLNPNDISRVEVIKGATAIYGNGGDGGIINYITKKPNKYKKLSGKTN
LWQTANLKRVKDALGWGAYQSLSGNMNDFSYYASGSYEQTGNKYDANGEVLLPTYGLDNT
KIFSGLLKLGYQLNDNQKLSLMANHYQTRQNTPFVATLGSITVLNKEGGYKITPGKGILP
TSTNPILGSETGVTTTNAQLKYQLSDIFNGTTNLDTDVFYQKSKNIFFYSPRFVGGGQSV
VNSEKIGFRPNFHTVLNIDSPVNTSFTYGVDILKDKTNQGLLDGRLWVPNLNLFSYAPYL
QAKFKYNQDWVFKAGVRYDAMNLKIENFTTLPYSSKSDNNFTDPVNVIGGDLDFKNTAIN
LGLRYIKNDEFIPYASYSQGFSLPDLGRTLRTAMADNVNHLDINAIKTNNYEFGFLSKFK
HVRFEAVGFYSTSNFGLGLIFNDDINRFEQSKNPQKIYGAEVSTDFTFLNDKLQFGGSYS
FVEGLKHTPGNPNDLSYIGGDVVSPPKTTAYINIQPIKNLTSSVRLIYTGNRNRFNPKEK
EGIYSYNYREVPVKGYTMLNFSSTYTVKNNIKLSVAVNNLLNEFFLPARAQWAAPLRSQT
SAGEGINAKLGVVYEF
NT seq
2391 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaatatataaaattttattaataacattattctcggtatttagtgcgtattcacaa
aatgtactaacaggaactattactgatacgcatggagagggaattgtaggggctgctatt
tttataaaaaaaatagaaaaaggaacaacaacaaatattgaaggaaaatacgaacttaaa
aatttagaaaaagcaacgtatttaataacgtttcaatctttaggatacaaaacagaagtt
aaaaatatcattatcaataaaaatactacaatcctaaacataaccttagaagaagattct
agtaaattagatgaaattgttgtttctgcaggaagaacttcagaaaaaatttcagaaata
cctgcttctattacaattgtaggaacaagggagttggaaaaattaggtacaacgactacg
aatattaatgatattttagagttttctgtccctggtttagcttctagtacaggaacttat
tctaattgggggcaaacacttcgtggtagacaactgctagtaatggtagatggaataccg
caatctacacctcttagaaatgctaaagtgggtttaaaatctttaaatccaaatgatatt
tccagagttgaagttataaaaggagctactgctatttatggtaatggtggagatggtggt
attataaactatattacaaaaaagccaaataaatataaaaaattaagcggtaaaacgaat
ttgtggcaaacagcaaacttaaaaagagttaaggatgctttaggttggggagcataccaa
tctttatcaggaaatatgaatgacttttcatattatgcctctggaagttacgagcaaact
ggtaataaatatgatgccaatggcgaagtattactacctacttatggcttagataacaca
aaaatatttagtggtttattaaaattaggctatcaacttaatgacaatcaaaaattaagt
ttaatggcgaatcattatcaaactcgtcaaaacactccttttgttgctacattaggttca
ataacggtattaaataaagaaggaggttacaaaataactccaggaaaaggaatattacca
acatcaacaaatccgatactaggtagtgaaacaggagttaccactacaaatgcacaatta
aagtatcaattatctgatatttttaacggtacaacaaatttagatactgatgtattttat
caaaaaagtaaaaatatatttttctattctcctaggtttgttggtggtggacagtctgtt
gtaaattcagaaaaaataggttttagacctaattttcatactgttttaaacatcgattct
cccgtaaatacgtcttttacttatggtgttgatattttaaaagataaaacaaaccaaggg
ttattagatggacgcttatgggttcctaatttaaatttatttagctacgcaccatatttg
caagctaaatttaaatataatcaagattgggtttttaaagcaggtgtacgttacgatgcg
atgaatcttaaaattgaaaattttactacattaccttactcatctaagtcagataataat
tttacagatcctgttaatgttattggtggtgatttagattttaaaaataccgcgataaac
ttagggcttagatatattaaaaatgatgaatttataccttatgcaagttattctcaaggg
ttttctctacctgatttaggtagaacattaagaactgcaatggctgataatgtaaatcat
ttagatattaacgcgatcaaaacaaacaattacgaatttggatttttatcaaaatttaag
cacgtacgtttcgaagctgtaggtttttatagtacttcaaacttcgggttggggcttatt
tttaacgatgatattaatcggtttgaacaatctaaaaatcctcaaaaaatatatggagcc
gaagtttctactgattttactttcttaaatgataaattacaatttggtggttcgtattct
tttgttgaaggattaaaacatactccaggaaatccaaatgacttaagctacattggtggt
gatgttgtttctcctcctaaaacgactgcatatattaatattcaaccaataaaaaactta
acatcatcagtgcgtttaatttatacgggtaatcgtaatcgatttaatccgaaggaaaaa
gaaggtatatattcttataattatagagaagtacctgtaaaaggatacacaatgcttaat
ttttcaagtacatatactgtaaaaaataatataaaattatcggttgcggtaaataactta
ttaaatgagttctttttacctgcaagagcacaatgggcagccccattaagaagtcaaact
agcgcaggtgaaggaataaatgctaaactaggagtggtttatgaattttag
DBGET
integrated database retrieval system