Tepidibacter aestuarii: T8CH_1026
Help
Entry
T8CH_1026 CDS
T08095
Name
(GenBank) AraC family transcriptional regulator, transcriptional activator of pobA
Organism
teb
Tepidibacter aestuarii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Fer2_BFD
HTH_18
Cupin_2
AraC_binding
HTH_AraC
Cupin_1
ExsA_N
DMSP_lyase
ARD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAH2212824
LinkDB
All DBs
Position
T8CH:1059429..1060883
Genome browser
AA seq
484 aa
AA seq
DB search
MNKVEKIEFKNNKKNKGFEIISLKSFFESANTSFIRKYFRTNFYTLIFVTEGKCIHEVDF
LEYTIKAGEILIISKDRIHRYNEFNNVQGYLIMFTEGFLCEFLSNNTSEVKDLFKQSYMN
PYINFMDLYTSTLIKLLDVIHDMYTNEYGIIDYNVIASAFRTFALLILNNILGEDTSKQS
KNEIFVKFTELVEEHINKEKTVEGYANMMHVSKKTVNLMTRKAIDMSAKQYIIQQLILKI
KLKLSFEQKSISEIANEVGFTESSNLTRFFKKYTGVNPREFRSMNREGSNNVIRSESMDL
NAIKEAIETKVYHIDSDTKVPLHEHATQDEVFYCIKGSGFGVLADKEVELQVGDVFIAPA
GTMHSLRSDGNLYVTASLIPVNRIICHCKQVSYGDIRKAMVGGARTIEEIEEITGAGTGC
GNCIEDIKKILSLACGCNNISIEAVVDAVKGGADTVEKIGELTGAGTNCGKCKALIQNII
DTNK
NT seq
1455 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaggtagaaaagattgaatttaaaaataacaaaaaaaataaaggttttgaaatt
atatccttaaaaagtttttttgaatctgctaatacctctttcataagaaagtattttcgt
actaatttttacactttgatttttgttactgaaggtaagtgtattcatgaagttgatttt
ttagaatacaccattaaagcaggcgaaatattaattatttcaaaggatcgtattcataga
tataatgagtttaataatgtacaggggtatttaatcatgtttacagagggttttttatgt
gaatttttaagtaataatacttctgaagtcaaagatttgtttaagcaaagctacatgaac
ccatatattaattttatggatttatatacttcaacgttaataaaacttttagatgtaata
catgatatgtacacaaatgaatatggtattatagattacaatgtaatcgcttcagctttt
agaaccttcgcactattaatattaaacaatatcttaggagaagatacatcaaaacagagc
aaaaatgaaatttttgtaaagtttactgaattagttgaagaacatattaataaagagaaa
actgtagaaggctatgctaatatgatgcatgtttccaaaaagacagttaatttaatgaca
cgaaaagcgattgatatgtcagcaaagcaatatattattcaacaacttattttaaaaata
aaacttaagctctcctttgaacaaaagagtataagtgaaattgccaatgaagtcggtttt
acagaatcatctaatctgacaagattttttaaaaaatatacaggcgttaatcctagagaa
tttagaagtatgaatagggaaggcagtaataacgtgataaggagtgaaagtatggattta
aatgctataaaggaagctattgaaacaaaggtatatcacatcgattctgatacaaaagtt
cctctccatgaacatgcaactcaagatgaagtattttattgtataaaaggttcaggattt
ggagtattagcagataaggaagttgagttacaggtaggggatgtatttattgctcccgcg
ggaacaatgcattctcttagaagtgatggaaatctttatgtaacagcttctcttatacct
gtaaatagaattatttgtcattgtaaacaagttagttatggtgatattaggaaagcaatg
gttggtggtgctcgtactatagaggaaatagaagaaattacaggagcaggaacgggttgc
ggcaattgtattgaagatataaaaaaaatattatcattagcctgtggatgcaataatatt
tctattgaagctgtagttgatgcagttaaaggtggagcagatacagttgaaaaaattgga
gaattaacaggagcgggtactaattgtggaaagtgtaaagctttaatacaaaatataatt
gatacaaacaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
