Terrisporobacter hibernicus: JW646_11575
Help
Entry
JW646_11575 CDS
T07658
Name
(GenBank) glycoside hydrolase family 13 protein
Organism
tem
Terrisporobacter hibernicus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
hDGE_amylase
Malt_amylase_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UEL46291
UniProt:
A0AAX2ZBH5
LinkDB
All DBs
Position
2343693..2345585
Genome browser
AA seq
630 aa
AA seq
DB search
MCKIISFNSWDEHFKAPFGALDVNQGADIKVSASKEVYSICLVITKEDENLNSKEIRRIL
LNKKEEHIYQCKIDPLLIPAVYYYYFEVEAEQDGHNKKIFYGKMNQNGEVCEYDFDNLNK
YQLTVYEESKAPTWFKEGILYHIFVDRFNNGNRTGKPNNPKKNSFIYANWEDDPMYIKDE
NGDIIRWDFYGGNLKGIINKLGYLKKLGVSIIYLSPVFESSSNHKYNTGDYKKIDPMFGD
EEIFKELIKKANEKGMSIILDGVFSHTGADSIYFNKFNNYSSKGAYNDEDSPYRSWYTFD
DSKVGYKCWWGIKDLPNVDELEPSYMDYIIKDEESVLNKWTKIGVKGWRLDVVDELPDEF
VTEFKKELKKSKTDSVLIGEVWEDASNKVSYGQRRNYLLGKQLDSAMGYPFRKGILSFLK
GEIASYELTDLYMEMKENYPPEAFKSNLNLLGTHDVKRVKTELNNDKDMIKLAVLAQMTF
EGVPYIYYGDEAGLEGDKDPDNRRTYPWKNEDNEMMDFYRNSIQTRYRVKSLLNGETNFI
YTRDNDVFAYERSLNEKDEDNCLIIINRSEDYKCIDFDFGCDLLDEIGIKYTPGDYGATL
EKENGKFVVDIRPKSFIIFKMKNIQNELFE
NT seq
1893 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgcaaaataatatcatttaactcctgggatgaacactttaaggctccttttggagcc
ttagatgttaaccagggagctgatattaaagttagtgctagcaaagaggtatacagtatt
tgtttagtaataacaaaagaagatgaaaatttaaatagtaaagaaataagacgaatttta
ttgaataaaaaagaagaacacatataccaatgtaaaatagatccattactaattccggca
gtatactattattattttgaagttgaagctgaacaggatggacataataaaaaaattttt
tatgggaaaatgaatcaaaatggtgaagtatgtgaatatgattttgacaacctaaataaa
tatcaattaacagtatatgaagaaagtaaggctccaacttggtttaaagaaggtatttta
tatcatatatttgtagatagatttaataatggtaatagaactggaaaaccaaacaatcca
aagaaaaatagttttatatatgcaaattgggaagacgatccaatgtatataaaagatgaa
aatggagatatcataagatgggatttttatggaggtaatcttaaagggattattaacaag
ttaggatatcttaaaaagcttggagttagtattatatatttaagtccagtttttgaatca
tctagcaaccataaatacaatacaggagattacaaaaagattgaccctatgtttggtgac
gaagaaatatttaaagagttaattaaaaaagctaatgaaaagggaatgtctataatactt
gatggtgtatttagtcatacaggtgctgatagtatttatttcaataagtttaacaactac
tctagcaaaggagcttataatgatgaggactctccttacagaagttggtatacttttgat
gattcaaaggttgggtacaaatgctggtggggaattaaagatttaccaaatgtagatgaa
ttagaaccttcatatatggattatataattaaagatgaagagagtgttttaaataaatgg
actaaaattggagttaaaggatggagattagatgtagtagatgaattaccagatgaattt
gtaactgaatttaaaaaagagttaaaaaaatctaaaacagattcagttttaattggagaa
gtttgggaagatgcttctaataaagttagttatggacaacgtagaaactatcttttagga
aaacagcttgattcagccatgggttatccatttagaaaaggaatactatctttcttaaag
ggagaaatagcttcatatgaacttactgatttgtatatggaaatgaaagaaaactatcca
ccagaggcatttaaatcaaatttgaatttattagggactcatgatgttaaaagagttaaa
acagaacttaataatgataaagatatgattaaacttgcagtattagcacaaatgactttt
gaaggggtaccgtatatttattatggcgatgaagcaggtcttgaaggagacaaagatcca
gataacagaagaacttatccatggaaaaatgaagataatgagatgatggatttttataga
aattctattcaaactagatatagagtgaaatcattattaaatggtgaaactaattttatt
tatactagggataatgatgtttttgcttatgaaagatcacttaatgaaaaagatgaagat
aattgtttaataattataaatagaagtgaagattacaaatgtatagattttgattttggg
tgtgatttattagatgaaataggaataaaatatactcctggtgattatggcgctactttg
gaaaaagaaaatggtaaattcgtagtagacattagaccaaaatcttttattatatttaaa
atgaaaaatattcaaaatgaattatttgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system