Terrisporobacter hibernicus: JW646_18895
Help
Entry
JW646_18895 CDS
T07658
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
tem
Terrisporobacter hibernicus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2_assoc
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
ERCC3_RAD25_C
AAA_11
SWIM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UEL47660
UniProt:
A0AAX2ZGU5
LinkDB
All DBs
Position
complement(3866298..3869462)
Genome browser
AA seq
1054 aa
AA seq
DB search
MDFKIVNDILIDNTDKLRLSRGQEYYKDGYVQEIKYNNQNKILNIDGKVASANYNILYYP
EITIDLKNKEIVNTICTCEDYRKRSSSNNNVICKHIVASSLYVINLLKSDVISNLKQTTI
VLKNDNKIKRNKNFINKELLDYFKSNEREKVKLDVRVEYVGDNSVSCDFKIGIDKMYVMK
DLKEFAYSRLESKDLIFGIDFLYNPVNNYFEYEDEKIVQIIEEYGMDLSYNSPQKNFKYL
TVKGSNIRRLFEALSYRTFDFKFRNMYYSPSVIKSNIPVDISFELNNNEAILKCEDKLPF
PLSLKGDVVFYKGNIYLLNSENGIYYKKLYSVLNEFKEVSFPLENVSQVLSDMIPKIEKI
CDKVIVDEKIKDNISKDLKIKYFFDLENSNVTCKIVFSYDEDNNKFIIRDFEKENEGVYR
LYSNFFEKENDKYIFKGNDNQLYDFLNRDINSLKNIGEVYYSDKLKERKIHNSSAFRVGL
GEEINHYLDFNFEIEGVDPKEYKNIIKAFKNQKKFYKLGDGDFINLEDSETKEMFKLMES
LGFTDNIKNMKIHSSKAMFINHLLTEKKLPYISGMENTNNIIEKFRSIQKQEINIPKDLH
ATLRDYQVDSLNWFETLDYLGFGGILADEMGLGKTIQTIAFLLNKKDKKTLIVTPTSLIH
NWKSEFKKFAPSLSVGISHGLKKDRLGIIKNINDFNVILTTYGSLRNDIEEYEKLEFDYC
IIDEAQNIKNPLASSTDAVKAIKASNKFALTGTPIENNLMELWSIFDFIMPGYLYSLTKF
NAIFIKDVSQVENLKRMIKPFILRRTKEQVIKELPPKIEKEFYVEMGKTQRNTYGIYVEE
IKRKLEEKKDVKNKITIFSYLTKLRQLCLDPSIIVEGYKGKSAKTDTCLEIIKDYIEKDN
KILVFSQFTSVLKNIGKKLNKNKINFYYLDGSTPAKNRITLVDSFNNNEEIKVFLISLKA
GGTGLNLTSANTVIHFDPWWNPSVQNQASDRAHRIGQKQVVEVIKLISKGTIEEKIMELQ
QKKSELIHDMLDGNLNNTNILSSLSEEELIDLIK
NT seq
3165 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggactttaaaatagtaaatgatatattgattgataatactgacaaactaaggttgagt
agaggacaagagtattataaagatggatatgtacaagaaattaaatataataatcaaaat
aaaatcttaaatattgatggaaaagtagcttccgctaactataacatcttatattatcca
gaaattactatagacttaaaaaataaagaaatagtaaatacaatttgtacttgcgaagac
tatagaaaaagaagttcaagtaacaataatgttatatgcaaacatattgtagcttcatct
ttatatgtaattaatttattaaaatcagatgtaattagcaatttaaaacaaacaactatt
gtattaaaaaatgataataaaataaaaagaaataaaaattttattaataaggaattatta
gattactttaaaagtaatgaaagagaaaaagttaaattggatgttagagtagagtatgtt
ggggacaatagtgtatcttgtgactttaagataggtatagataagatgtacgttatgaag
gatttaaaggaatttgcttactctagacttgaatcaaaggatttaatatttggcatagat
ttcctatacaatccagtaaataattattttgaatatgaagatgaaaagatagttcaaatt
attgaagagtatggaatggatttgtcatataactcaccacagaaaaatttcaaatattta
acggttaagggttccaatattagaagactattcgaagctctttcttatagaacatttgat
tttaaatttagaaatatgtattacagcccaagtgttattaaaagtaatattccagtagat
ataagttttgaattaaataacaatgaagccatactaaaatgtgaagataagcttcctttt
cccctatcattaaaaggtgatgtggtattttacaaaggaaatatatacttgttaaatagt
gaaaatggtatatattataaaaaactttactctgtattaaatgagtttaaagaagtaagc
ttcccacttgaaaatgtaagtcaagtattaagtgacatgatacctaaaatagaaaaaatc
tgtgataaagtaattgtagatgaaaaaataaaagacaatatttctaaagacttaaaaata
aaatacttctttgatttggaaaatagcaatgtaacttgcaaaatagttttctcctatgat
gaagacaataataaatttattataagggactttgaaaaagagaatgaaggagtttataga
ttatattcaaacttttttgaaaaagagaatgataaatatatatttaaaggaaacgataat
caactatatgactttttaaacagagatattaatagtcttaaaaatattggtgaggtatat
tattctgataaacttaaagaaagaaaaattcacaattcttcagcttttagagttggtctt
ggtgaagaaattaatcattacctagattttaattttgaaattgagggagtagatccaaaa
gaatataaaaatattataaaagcatttaaaaatcaaaaaaaattttacaaattaggtgat
ggagactttataaacttagaagatagtgaaactaaagaaatgtttaaattgatggagagt
ttaggttttactgataatataaaaaacatgaaaatacactcaagtaaagcaatgtttatt
aatcatctccttacggagaaaaagctaccatatatttctggaatggaaaatacaaataat
attattgagaaatttagaagtattcaaaaacaagaaatcaatattccaaaagaccttcat
gcaaccctacgggattaccaggttgattctcttaactggtttgaaactttagattatcta
ggttttggtggaattttagctgatgaaatggggctaggtaaaacaatacaaacaattgca
tttttactaaataaaaaagataaaaaaactttaatagttactcctacatcattaatacac
aactggaaaagtgaatttaaaaaatttgcaccttctttatcagtgggaattagtcatggt
ttgaaaaaagacagattaggcataattaaaaacataaatgattttaatgttatattaaca
acttacggttcccttagaaatgatatagaagagtacgaaaagcttgaatttgattattgt
attatagacgaagctcaaaatataaaaaatcctttagcttcttctactgatgctgtaaaa
gccataaaagcaagtaataaatttgctttaactggtacacctatagaaaataacttgatg
gaactttggtctatatttgattttattatgcctgggtatttatatagtttaactaaattt
aatgccatatttataaaagatgtgagtcaagtagaaaatctaaaaagaatgataaaacca
tttatacttcgtagaacaaaagaacaagttattaaagagcttccgcctaaaatagaaaaa
gagttttatgtggaaatgggcaaaacacaaagaaatacctacggtatttatgtggaagaa
ataaaaagaaaattagaagaaaaaaaagatgtaaaaaataaaatcaccatattttcttac
cttacaaaacttagacaactatgcttagatccaagcataattgtggaaggatacaagggt
aaaagtgcaaaaactgatacttgtttagaaataataaaagattatattgaaaaagacaac
aaaattttagttttctctcaatttacatctgttttaaaaaacataggcaaaaaactaaat
aaaaataaaatcaacttttattatttggatggaagtactcctgctaagaatagaataact
ttagtagatagctttaataataatgaagaaataaaagtatttttaatatcacttaaagct
ggaggaaccggtttaaatttaacctctgccaatactgtaattcactttgatccatggtgg
aatccatctgtgcaaaatcaagcaagtgatagggctcatagaatcggtcaaaaacaagta
gtagaagttataaaattaatttccaaaggaacaatagaagaaaaaataatggaattacaa
caaaaaaaatcagaattaattcatgatatgcttgatggaaacctaaacaatactaatata
ctaagtagtttgtcagaagaagaattaattgatttaataaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
