Trichodesmium erythraeum: Tery_0342
Help
Entry
Tery_0342 CDS
T00387
Name
(GenBank) protein of unknown function DUF490
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
ter
Trichodesmium erythraeum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ter00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ter02000
]
Tery_0342
Transporters [BR:
ter02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Tery_0342
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABG49815
UniProt:
Q119K9
LinkDB
All DBs
Position
525128..532096
Genome browser
AA seq
2322 aa
AA seq
DB search
MTNAPKKLNDQTNVSTSRKWIRIIIISGIGLGTVSVAGGIVGTWFVQKQLAPMVSKSLSK
LMQRPVKVGELKKFGLGYIEFGPSSLPPNSKDSISAYTEVVKVKFPLRSILFKTLKLDIT
FGESQAYVQQEIDGSFAIPKLAGDLPDPPLDIEIKKVNFPKINVSIQPSEKGKSSTPILL
DLSKTEVRSLDKQQRWLVSLNGRVIDGGNFKVNADANIKTWEIEANMVAQKLQLPIFATL
ASALENIPTLNIESGELDANLRAQVKITDNIADIVQDVRGRVSLQRLKANTDILSNQVNL
NTVANISWPKVNVENLDGNYGNIGLKLRGAVETTRDLNLENIKLDFQGTVLPVSFETLFN
TATREINLLSNNTTSAETKQQLQQINGQIQSIKPLLAGRVKTDIKFSGSLLEPLVSGKIE
TTEVTRVDRLRFKNIATKFTVSSQLNQDFRPVNMAASFSGLQINPMLGGKITGKGAVLEV
DLPIATPKASSKKLEVGTQAVERFQEVSLKSQESETKFNPTVDLDLRVQNLPVEAIAQQY
NITSPLPIGEFSTEVKISGPLETLKGQVQWRLPKAVYPLSGAVDIINSQANIKNTIVKIG
GGTVNINGNANLENWQLNATVNQVNLDKKSLQPLGLPSGLEGIFNGKANFSGLTSKFSIN
SINGNGNGIVNIAGGQINLNGKLNNGNWQGKGIGSQINLSALERIAINSDILRTPNSIFS
SKNDGIINGEVTLSGNLNNLSLAGVKANINGNLNLANGIINANGKVNNGGFKVLVNTAEL
PINPLLDLGWSAVNSGIINDQEKLNLIKKNIPRLKSINGKLSGKVSLLGNLTNLSPEFLQ
ENITGDFTGNLKIKTGTINAVGNLKRGNFQTIFQTNQIALSAVEDLLKETRIVSPKSNIV
QKNTDGQVKGRATVSGNINNLTPEGVTIDGYGKVLIAGGIINAQGRLSQGNFQASVNSSK
LRVNPLLDLGKSVLVSGLIPVETYKIKTLIRQVNTINSLNSQVNIKANFSGNLTNFTSER
ISAMAKSQLFIDDNYIDFDGKLNGGNFLVNVETARISLRPLEKIIRKTDLVSLPPSATLP
PGIEGEILGKFSVFANINNVNLQDIAVDGSGKLIIGNNTINATGKLEQGNFEAVAIADPI
PLSFVKKIAKETEVVSSENLRYLETINGNVFANAKLAGNLDNLNPEAIAASAEGKLIFAD
GGAINITGELVGKEWQAAVVGNQIPLEQFSAALEKHEQAKSAVAAIRKAQKLLGQAENLP
VIGGLFNSKIDLSGSLANLNPEAIQAQAKLTLSELPVIDKSFNGLFSWNQKRIEITKAAI
PPEVNVNGLVDVDFTAQKSPTISGINIDVSLSDFNLASLPIKKLMESLPVEKKGELLTGR
VSFDGKVIGKSIADLNLVGDVVLRNLSVNKVDFDSELSGKLNAGITQGINFKIAGKNDSL
ELVLDETYFPTAFLVKRDQAKLAGVTEGENFLITLAKFPLELLGIAPAKQFDIGAVSGEA
SAKIAVSNLRTFDIKSIKADGNLEVTKPGIGYIDAESFRADINYAQGKASINDGILLLGN
SRYVLQGMVDLNSQGATFDPYFAANLKIEKAEVQDILTALQWFELKDIARGVATPNYAKA
ADLQTSAVGFYEKTPVMMQLRRLAEIKVLLKQQEESQEPKTPIQIPPLADLDVTLSGEIM
AEGSLQSGVDGKFDIKGSGWSWGVYKIDNFLVQGKYENEVLTVKPLEVQVGEASLAFNGD
LNTKNQSGKLQLKNIDLAEVQKFAQSYVLQNSNINITGKLNLETELNGNFQDPRAKGKIK
IVDGTLNERPIEKAQTDFSYKAGRLGFNGDLSIVGDPILYEGDVPINLPFAKVSTDNNLI
NARVNVKNDAFKIVNILTDQVVLDSGEGDISLEVKGTLKQPRVEGTAKFTDISIAATAFP
EALTDLEGTVSFNGDSIEVEKIQGNISDGVVEVTGVLPIRESLGREDSDINNPLTITLKK
LNVDFKKVFKGGIDGEVIITGTALEPVVGGNVEVSKGKIFLNQAVGLAEGAVGEKQTDGV
SSGLGEFEVGLNDFQLMLSDRLEMSFLGIANFQVAGGLLINGTLKNIRPSGKINLEGGTI
NLFSTELRLDRSYKNIAEFNPNNRFDPMLDIQLLASAFETSGSSLSRSNSAFSAETIDAP
SLGTLSSSQRIKIRAKAKGLLSELKDNLELTSSPQRTETQIVSLLGGNIVNTLSAGRSLA
LANVASTALFTNIEQDIIEGTGLSEFRIFPANIPNSGSERANSLGWGLEVGIDLTDKVGA
SVTILEATELSLDYQINNKIRLRGNSNFDENAVLSIQYETRF
NT seq
6969 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaacgccccaaaaaaacttaatgaccaaaccaacgtttccacctccagaaaatgg
atacgaataattattattagtggtataggattaggtactgtctcggtagcaggaggaata
gtaggaacctggtttgtacagaaacaactagctccaatggtcagtaagagtctaagcaaa
ctaatgcaaagaccagttaaagtgggggaactgaaaaagtttggtctcggttatatagag
tttggtccttcgtccttacctccaaactcaaaggactcaattagtgcctacacagaagta
gtcaaagtcaaatttcctcttagatcaattttattcaaaaccttaaaactggatattaca
tttggagaatctcaagcttatgtacaacaagaaattgatggttcatttgctataccaaaa
ttggcaggggacttacctgatccaccattagatattgagattaaaaaggtaaatttccca
aaaataaatgtttctattcagccgtcggaaaaaggaaaatcttctaccccaattctatta
gatttaagtaaaaccgaagttcgctctttagataaacaacaacgttggttagtgagtctt
aatggtagggttatagatggtggtaactttaaggttaacgctgatgctaatatcaaaacc
tgggaaattgaagctaatatggtagcacaaaagctgcagctgccaatatttgcaacctta
gcatctgcactagaaaatattccgactctaaatatagaaagtggggagttagatgcaaac
ctccgcgctcaggttaaaataactgataatattgcagatattgtacaagatgtgagagga
agggttagcttacagaggttgaaggcaaacactgatatcctcagcaaccaagttaacttg
aatacggttgctaatatttcttggccaaaagttaatgtggaaaatttggatgggaactac
gggaatattggcttaaaactaagaggtgcagtagaaacaacaagagatttaaatttagag
aatattaaacttgatttccaggggactgttttgcctgtttcttttgagactttgtttaat
actgcgacaagagagattaatttactctcaaataatactacatcagcggaaactaaacaa
cagttacagcagatcaatggtcaaattcaaagtatcaagcctttgttagcagggagagta
aaaactgatatcaagttttctggaagtttactcgaaccattggtatcaggaaaaattgag
actactgaagttactagggttgataggttaaggtttaagaatattgctactaagtttact
gttagttctcagttaaaccaagattttcgacctgttaatatggctgctagtttctccggt
ttgcaaattaaccctatgttgggaggtaaaataactggtaaaggggctgttttagaagta
gacctccccattgctacccccaaggcgagcagtaaaaaactagaagttggcactcaggct
gtagaaaggttccaagaagtatctctaaagagtcaagagtcagaaacgaagtttaaccca
acagttgacttagacttgcgggtacaaaatttacctgtggaagcgatcgctcaacaatat
aacattacttcacctcttcctattggtgaattttccacggaggttaaaatttctggtcct
cttgaaactcttaaagggcaagttcaatggcggctacctaaagcagtttatcctttaagt
ggtgctgttgatattattaatagtcaggcaaatattaaaaatactattgttaaaattggt
ggcggaaccgttaatattaatggcaatgctaacttggaaaactggcaactaaatgccact
gttaaccaagttaatttagataagaagtctttacaacctttaggtttaccatcaggatta
gaaggtatttttaatggtaaagctaatttttctggtctgacaagtaaattttcaattaat
agtattaatggcaatggaaatggtattgttaatattgctggtggtcaaattaatctgaat
ggtaaacttaataatggtaattggcaaggaaaaggaatagggagtcaaatcaatttaagt
gctttagaaagaattgctataaattcagatattctaagaactcctaattcaatattttct
agtaaaaacgacgggataattaatggtgaagtaactttatccgggaatttaaataattta
agtttagcaggagtaaaggctaatattaatggcaatcttaatcttgctaatggcataatt
aatgctaatggtaaagttaataatggtggatttaaagtgttagttaatactgcagagtta
ccaattaatcctttactagatttaggctggtctgcagttaattcaggaattattaatgac
caagaaaaattaaatctgattaagaaaaatattccccgattaaaatctatcaatggtaag
ttaagtggtaaggttagtttattgggaaatttgactaacctttctccagaatttttacaa
gaaaatatcactggagatttcacaggaaatctcaagattaaaacaggaacaattaacgct
gtaggtaatttaaaaagaggtaatttccaaactatatttcaaacaaatcaaatagctcta
agtgctgtagaagatttattgaaagaaaccagaatagtttctcctaaaagcaatattgta
caaaaaaatactgacggacaagttaaaggtagagctacagtatctggaaatataaataat
ttgactccagaaggagtgactattgatggatatggcaaggttttgattgcaggaggaata
attaacgctcaaggaagattaagtcaaggaaattttcaagcctcagttaatagcagtaaa
ttaagagtaaatccacttttagatttgggaaagtcagttttagtatctggattaatacca
gtcgaaacttataaaattaaaactttaattcgtcaagttaatactattaattcgttaaat
agtcaagtcaatataaaggctaatttttctggaaatttgacaaattttacttcagaaaga
ataagcgcaatggctaaaagtcagctatttattgatgataattatattgattttgatgga
aaacttaacgggggcaactttttagtaaatgtagaaacagcaagaattagtttacgccct
ttagaaaaaataatcagaaaaactgatttagtttctcttcctcctagcgcaactttaccc
ccaggaattgaaggagaaatattgggaaaatttagcgtttttgccaatattaataatgtt
aatcttcaagatatagctgttgatggaagtggaaaattaataattggaaataatacaatt
aatgctacaggtaaattagagcaaggaaattttgaagcagtagcgatcgctgatcctatt
cctctaagttttgtcaaaaaaatagccaaggaaacagaggtagtttcctcagaaaattta
cgttatttagaaacaataaatgggaatgtttttgcgaatgctaaattagcaggaaattta
gataatttaaacccagaagctatcgctgcttctgcagaaggaaaactaatttttgctgat
ggtggagccataaatattactggggaattagtaggtaaagaatggcaagctgccgtagta
ggaaaccaaattcctttagagcaattttcagctgctttagaaaaacatgaacaggcaaaa
tctgctgttgctgccattagaaaagctcaaaaattattagggcaagctgaaaatttacct
gtaattggagggttatttaatagcaaaattgatttgtcaggaagtctagcaaacttaaat
ccagaagcgattcaagctcaagcaaaattaacactttcagagttaccagtgattgataaa
tccttcaatggtttgtttagctggaaccagaaaagaatagaaataacaaaagctgctatt
cccccagaagttaatgttaatggattagtagatgtagattttacagcacaaaaatctcct
actatttctggaattaatattgatgtcagtttgtcagattttaacttagcatctttgcca
ataaaaaagttgatggaaagtttacctgtagaaaaaaaaggtgaattattaacaggtaga
gttagctttgatgggaaagttattggaaaatctattgcagatttaaacttagttggtgat
gtagttttgagaaatttatcagtaaataaggtagattttgattctgagttatcaggaaag
ttaaatgcaggaattactcaagggataaactttaaaattgctggtaagaatgattctttg
gagttggtgttagatgaaacttattttcccactgcttttttagtgaaacgagaccaggca
aaactcgctggtgttactgaaggagaaaactttctaataacattagcaaaatttcctttg
gagttgttaggtatagcaccagcaaagcagtttgatattggcgcagtttctggagaagca
tcggcaaaaatagctgtatctaatttgagaacgtttgatattaagtctatcaaagcagat
ggaaatttagaggtgacaaaacctggtattggttatatagatgctgaaagttttagagca
gatataaattatgctcaagggaaagcaagtattaatgatggcatattgttattaggaaac
agtcgatatgtcttacagggaatggttgatcttaattcacagggtgctacttttgacccc
tattttgcagctaacctcaaaatagaaaaagcagaagtgcaagatattttgactgctctc
caatggtttgagttaaaagatattgcacggggagtggcaactccaaattatgctaaggcg
gcagacttacaaacatcagcagtgggtttttatgaaaagacaccagtaatgatgcagttg
cgtcggcttgctgaaattaaggttttgctcaaacaacaggaagaaagtcaagaaccaaaa
actcccatacagataccacctcttgctgatcttgatgttactttgtctggagaaataatg
gcagaaggatctttgcagtctggtgttgatgggaagtttgatatcaaaggtagcggttgg
agttggggagtttacaaaatagataattttcttgtacagggtaagtatgaaaatgaagtc
ctgactgtcaaacccctagaagtgcaagtaggagaagcgtccttggcttttaatggagat
ttgaatacaaaaaatcaaagtgggaagttacagttaaaaaatatagatttggcagaagta
cagaagtttgctcagagttatgtactgcaaaatagtaatattaatattacgggaaagttg
aatttagaaacagaattaaatggaaattttcaagaccccagagctaaaggtaaaattaag
atagtagatggaactctaaatgaacgacctattgaaaaagcacaaactgattttagttat
aaagctgggcgactgggttttaatggggatctttctatagttggagatcctattttatat
gaaggtgatgtacctattaatttacctttcgctaaagtttctacagataacaatttaatt
aatgccagggtcaatgttaaaaatgatgctttcaaaatagtaaatattttgactgaccag
gtggttttagactcgggtgaaggagacatatcattggaggttaaaggaacattaaaacaa
ccacgagtagagggtactgctaaatttacagatattagtatagctgcaacagcatttcct
gaagctttaacagatttagaaggtacagtttcatttaatggcgatagcatagaagttgaa
aaaattcaaggaaatattagtgatggtgtggttgaagttactggtgtcttacctattcgc
gaatcattgggcagggaagactctgatatcaataaccctcttaccattaccttgaaaaaa
cttaatgtagattttaaaaaggtctttaaaggtggtattgatggtgaggtaataattacg
ggtacagctttggaacctgttgttggtggtaatgtagaagtatccaaaggtaagatattt
ttgaatcaagcagtaggtttagcagaaggagcagtaggagaaaagcaaacagatggggta
agctctggtttgggagaatttgaggttggtttgaatgattttcagttgatgttgagcgat
cgcctagagatgtcttttctaggaatagctaattttcaagtggcaggtggtttactgata
aatggtactctcaagaatattcgtcccagtggtaaaattaatttagaaggaggtacaatt
aatttatttagtacagagttacgtttagaccgcagctataaaaatatagctgaatttaat
cccaataatagatttgaccctatgctagatatacaattgttagcatcagcctttgaaact
agtggctcatcattatcaagatcgaattcagcattttccgctgaaaccatagatgctcca
tctctaggtacattgagtagtagtcagagaataaaaattagagctaaagcgaaaggactg
ctatcagagttaaaagataacttagagctgacaagttctccacagcgaacagagacacaa
atagttagtttattaggtggtaatattgttaatactcttagtgcgggcagaagtttagca
ttagcaaatgtggcgagtactgctctatttactaacatagaacaggatattattgaagga
acaggattaagtgaatttcggatatttcctgccaatattcctaacagtggctcggaacgt
gctaatagtttgggttggggtctagaagttggtattgatctgactgataaagtgggagca
tctgttactatacttgaagcaacagagttgtctttagattatcaaattaataataaaata
cgtctccggggtaatagtaatttcgatgagaatgctgtgttgtctattcagtatgaaact
agattttga
DBGET
integrated database retrieval system
