Trichodesmium erythraeum: Tery_1259
Help
Entry
Tery_1259 CDS
T00387
Name
(GenBank) GTP-binding protein YchF
KO
K06942
ribosome-binding ATPase
Organism
ter
Trichodesmium erythraeum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ter00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ter03009
]
Tery_1259
Ribosome biogenesis [BR:
ter03009
]
Prokaryotic type
Other maturation factors
Tery_1259
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
YchF-GTPase_C
MMR_HSR1
FeoB_N
ABC_tran_Xtn
MeaB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABG50601
UniProt:
Q116H3
LinkDB
All DBs
Position
complement(1944894..1945985)
Genome browser
AA seq
363 aa
AA seq
DB search
MLRAGIVGLPNVGKSTLFNALVANAKAEAANFPFCTIEPNVGVVAVPDNRLNVLAQISNS
AQTVPTRIEFVDIAGLVKGASKGEGLGNQFLSNIREVDAIVQVVRCFDSEDIIHVSGSVD
PVRDIEVINLELALSDLAQVERRIERTKKQARTSKEAQTELEVLEKLEVVLNEGNSVKMA
GLNKDESLIIKPLNLLTSKPIIYAANVSEDDLANGNDWVEKVRNIAAVENAQVVVISAQV
ESELIELPEEEITDYLKSLGVEEGGLKSLIKATYELLGLHTYFTTGEKETKAWTIKAGTL
APQAAGVIHTDFERGFIRAETIAYKDLVTSGSMTTAKEKGLVRSEGKDYLVKEGDIMLFR
FNV
NT seq
1092 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctcagagctggaattgtcggactacccaacgtaggaaaatctaccttatttaatgct
ttagttgctaatgctaaggcggaagctgctaacttcccattttgcacaattgaacccaat
gttggtgtagtagctgtgccagataatcggttaaatgtgctggctcaaatttctaattct
gcccaaactgttcctactagaattgagtttgttgatattgctggtttagtaaaaggtgca
agcaaaggagaaggtttaggtaatcaatttttatctaatattcgagaggttgatgctatt
gttcaagtagttcgttgttttgatagtgaagatattattcatgtctctggttctgtggat
ccagtgcgagatattgaggtaattaatttagaattagctttatccgatctagctcaggta
gaacgacgaattgaacggactaaaaaacaagctcgtaccagtaaagaagctcagacagaa
ttagaagttttagaaaaattagaggttgttttaaatgaaggtaattcggtaaaaatggct
ggtttaaataaagatgaatctttgataattaagcctttaaatttattaacttctaagccc
ataatttatgcagctaatgtctcagaagatgatttggctaatgggaatgactgggttgaa
aaagttcgcaatattgctgctgtagaaaatgctcaagttgtggtaatttcagctcaagta
gaatcagaattaattgagttacctgaggaagaaataactgattatttgaaatctttagga
gtagaagaaggtggtttaaaatctttgattaaagcgacttatgaattgttgggattgcat
acttattttactactggagagaaagaaactaaagcttggacaattaaggctggaacttta
gctcctcaagctgctggtgtaattcatactgattttgaacgaggttttattcgagcagaa
acaattgcttataaggatctagtaaccagtggttcaatgactactgctaaggagaaaggt
ttagtaaggagtgaaggcaaggattatcttgttaaggaaggtgatattatgctcttccga
tttaatgtttag
DBGET
integrated database retrieval system
