Trichodesmium erythraeum: Tery_2556
Help
Entry
Tery_2556 CDS
T00387
Name
(GenBank) ATP-binding region, ATPase-like
Organism
ter
Trichodesmium erythraeum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_16
Pkinase
HATPase_c
PK_Tyr_Ser-Thr
GAF
HisKA
GAF_2
Pkinase_fungal
DUF8739
AAA_22
DYF4_C
nSTAND6
BLOC1S3
Choline_kinase
UL97
HATPase_c_3
ABC1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABG51757
LinkDB
All DBs
Position
complement(3947029..3952464)
Genome browser
AA seq
1811 aa
AA seq
DB search
MITLTGYHITEIIYQGTRTEVYRGTRNSDNKPVIIKVLANVNPKFNELVQFHNQYMLSRH
LQHPNILQPLALERYGNGYALVMPDNGAIALSSYWHGGLKSVDTELEQNLGEFLRIAIQL
TESLHYLNQKRIIHKDIKPANILIYPKTQQIQLIDFNIASLLPKAQQEVTHPNVLQGTLA
YISPEQTGRMNRGIDYRVDFYSLGVTFFELLTGELPFTTDDPMELVHCHIAKLPIFENKE
LRNGVCIPQIPQMVINIVMKLMGKNPEDRYQSALGLKYDLENCLQQWEARGEIAKFQLGR
LDFSTHFLIPEKLYGREREVKQLLAAFERVSEGEGDRAPRSEIMLLAGFSGIGKTAVINE
VHKPITAQHGYFIQGKFDQFNQNVPLSAFLQALRNLMEQVLFEPDARFVAWKTKILEAVG
QNGQVLIDVIPELELVIGKQPAVPELSGNAVENRFNFLFQKFIEVFTDKRHPLVIFLDDL
HWADTASLKLIKLLMEDNSYLLLLGAYRDHEVSSVHPLILALEELKQLGTTVNTITLQSL
AFRDMNQLVADTLHCSTDISQPLTELINRKTQGNPFFTTQFLKGLYQDRYITFNREQGYW
ECDIIQINDLSLTDDVVEFMSQKLLKLPKETQQVLKLAACIGNKFDLDTLAIVAKQLKSD
VMTALWSALEAELILLQSQVYKFYTSNDETEVDYEYIENVGYRFLHDRVQQAAYSLIPDD
QKEANHYHIGQLLLEQISPETRERYIFEIVNQLNYGVNLITEQVARDELAELNLVACRKA
KGGSAYKAAREYGVIGIDLLGRKAWQRKYVTMLQLHELVAEASVIYGDFQGMNQQIDAVI
EHGKTLLDQVDSHIIRIQALTTQNNLLEAIAYGKSILEEFGVKFPETITSVELEHEIEET
QALIGDRSIEDLLHLPVMVNPEKLAILKISTRMITCCYLAGSPLYALLGSLQTKLSIQYG
NGIFSPTGYVVYGIFMLNFKKDIYTSNQLGELAYRLASNAKDKNIPAITFIPLGLCLYHH
QNHLQETLSIFEAGYQAALEIGKVEYLGRYSYGFCLNSFWCGKPLKELVVQIQAYIEVTV
KFKLSHFERYCLIFWEATVLLLGNPENIHLEIEDSNDRRPWMTEMLKSHDLAQIFHYYLH
RGILKFILGDILSAKADTIAAKKYLSGGLGTVGEAGFYFYDSLITLATLQESASDIGSSL
QQVQENQNNLHLWSEYAPMNYLHKWQLVEAEKYRVLGKKYQAGDFYDRAIAGAKENEYFQ
EEALANELAAKFYLVWGKEKIAAGYMQEAYYGYAYWGSKAKTEQLEQTYPQLLNPILQQV
KPISSTTSISLENSLQLLDLKSAIKAFHALSEEVELEVLLSKLMYVLIENAGADKGVLVV
DNFGTWEISVICDQNKCRFLKASPNLSNVLPVNIINKVKRTRQRILINYFDQENVYISDP
YFTQQKPKSLCCTPMLNQGKLIGIIYLENYLCTQVFTSSSIEIINLLSAKAAISIQNALL
YRRLENYSRNLEAEVEIRTQKLQENNQQLQATLEQLQRTQAQLIQAEKISSLGEMVAGIA
HEINNPITFISGNIFHAQEYFGDLVELIDLYQENFPQSSPAIQDKLVEVELDFLCEDLKR
LFQSMQNGSDRIRQIVLGLRNFSRLGESECKEIDIHEGLENTLMILQHRCQDQKGRPDIT
LIKNYGKLPLINCYPSQLNQVFWHIITNAIYALTRADSPAVPEIRITTEVHNDKTVQISI
ADNGIGMSEKVREKVFDPFFTTKPVGQGTGLGLLISHQIITEQHNGELYCISQLGKGSEF
IIKIPVLLDYR
NT seq
5436 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattactctaactggttaccatataactgaaattatctaccaaggaacaagaacagaa
gtttatagaggtacacgcaatagtgacaacaaacctgtaattatcaaagtcttagccaat
gttaaccccaaatttaatgagctggtacaatttcacaaccaatatatgctaagtcgccat
ctgcaacaccccaatattttacaacctcttgctctggaacgttacggtaatggttatgct
ttagtgatgccagataatggagcgatcgccctttcatcttattggcatgggggtttgaaa
agtgttgatactgaattagaacaaaaccttggggaatttttgagaattgctattcaacta
actgaatctctacattatctgaaccaaaagcgcatcatccacaaagatattaaacccgcc
aatatcttgatttatcccaaaactcaacaaattcaactgattgattttaatattgctagt
ttgttgcccaaagcacaacaggaagttacccaccccaatgtgctacaaggaactctggcc
tacatctctccggaacaaactgggcggatgaaccggggtattgattatcgcgtggacttt
tattctttgggtgttacgttctttgaactacttacaggtgagttaccttttaccacggat
gatccaatggagttagtacattgccatattgctaaattaccaatctttgagaacaaggaa
ttaagaaatggggtttgtattccacaaatacctcagatggtaattaacattgtcatgaaa
ttgatggggaaaaatcctgaagatcgttatcaaagtgcattgggtttgaagtatgatcta
gaaaattgtttgcaacaatgggaagctagaggagaaatagctaagtttcaattaggaagg
ctagattttagcactcacttcctcattcctgaaaaactctacggacgggaaagggaagtt
aagcagttgttagctgcttttgagcgggtatctgaaggagaaggggatagggctccaaga
tctgaaataatgctgctggcagggttttcgggtattggtaaaactgctgtgatcaatgaa
gttcataaaccaattactgctcaacatggttactttattcaaggtaaatttgaccaattt
aatcaaaatgttcccttgtcagcatttttacaagcactgcgaaatttaatggaacaagtg
ttgtttgagcctgatgctcggtttgttgcatggaaaacgaaaatcttggaggcagttggg
cagaacggacaagtattaattgatgtgattccagaactagagttagtaattggtaaacaa
cctgctgtaccagaactatcaggcaatgcagtggagaatcgttttaatttcttgttccaa
aagtttattgaagttttcacagataaaagacatcccctggtaattttcttggatgatcta
cattgggcggatacagcttctctgaaattgattaaactgttgatggaggataatagttat
ctactattgttgggagcttatcgagatcatgaagtttcatcagtacacccattgattttg
gcgctagaggagttgaaacaactgggtacaactgttaatactattactcttcaatctctt
gctttccgcgatatgaatcaattagtagctgatactttacattgttcaactgatatctcg
caaccactcacggaattaattaatcggaaaactcaaggaaatcctttttttacaactcag
ttcctcaaaggattatatcaggatagatacattacttttaatcgcgaacagggctattgg
gaatgtgatataatccaaattaatgatctttctctcactgatgatgtggtggagtttatg
tcacaaaagttgctgaagttacccaaggaaactcagcaggtacttaaattagcagcttgt
attggcaacaaattcgacttagatacattagcaattgtggccaagcaattgaaatcagat
gtgatgacagctttgtggtcagctttagaggcagagttaattttgctacaaagtcaagta
tataaattttataccagcaatgatgaaacagaggtagattatgaatatattgaaaatgtg
gggtatcgctttttgcatgatcgcgtccaacaagctgcctattctctaattcctgatgat
caaaaggaagctaaccattatcacattgggcaattactcctagagcagatatctccagaa
accagagaacgatacatttttgaaattgttaatcaactcaattatggagttaatttaatt
actgaacaagttgcacgggatgaactagcggaacttaatcttgttgcttgtcgtaaagct
aaaggaggatctgcctacaaagcggcaagggagtatggagtaattggcattgacttactt
ggtaggaaagcttggcaacgaaaatatgtaaccatgttacaattacatgaattggtagca
gaagcatctgtaatttatggggattttcagggaatgaatcaacagatagatgcagttatt
gagcatggaaaaactttattagatcaagtagacagtcatataattagaatccaagcttta
actacccaaaataatttgctagaagcgatcgcctatggtaagtcaattttagaagagttt
ggagttaagtttcccgagactattacctctgttgaattggagcatgaaattgaagaaact
caagctttgataggcgatcgatctatagaggatttattacacctgccagttatggtaaat
cctgaaaaattagcgattttgaaaatatctaccagaatgattacgtgctgttatctagca
ggttctcctctgtatgctttgttgggtagtttacaaactaaattatcaattcagtatggt
aatggtatcttttcaccgactggatatgtggtttatggaatatttatgctgaactttaag
aaagatatttatacaagcaatcaattgggcgaattagcttatcgtttagcttctaacgcc
aaggataaaaatattcccgctataaccttcatccctcttggattatgtttgtatcatcac
caaaatcacctccaggaaacattgtcaatttttgaagcaggttatcaggctgctcttgaa
ataggcaaagttgaatatctcggtcgttatagttacggattttgtctcaattctttctgg
tgtggtaaaccattgaaagagttagtagttcaaatccaagcatatattgaggtaacagtt
aaattcaagctgtcacactttgaaagatattgtttgattttttgggaagcaacagtattg
ctcttaggaaatccagaaaatattcatctggaaattgaggacagtaatgatagaaggcct
tggatgactgaaatgttaaaatcccatgatctagctcaaatttttcattattatctccat
cggggaattttaaagtttattttaggggatatcctttcagcaaaagctgatactattgca
gctaaaaagtatttgtctggaggactgggaacggttggtgaagcgggcttttatttttat
gattctttaattactttagctactcttcaagagtctgcctcagatattgggagttcactg
caacaagtacaagaaaatcagaataatttacacctttggtcagaatatgcgccgatgaat
tatttgcataaatggcaattagtggaagctgaaaagtatcgagttttaggtaaaaagtat
caagcaggagatttttacgaccgcgctattgctggagcaaaagaaaatgaatatttccag
gaagaagctctggctaacgaactggcagcaaaattttatcttgtatggggcaaagagaaa
attgctgctggttatatgcaagaggcttattatggatatgcttattggggtagcaaagct
aaaactgagcaactagaacaaacctatcctcaactccttaaccccatccttcaacaggtc
aaacctattagctccactactagcatctccctagaaaattctcttcaattactagatcta
aagtctgccattaaagccttccatgctctttctgaggaagttgaacttgaggttttgctc
tctaaattaatgtacgttcttatcgaaaatgctggagcagataaaggtgttctagttgta
gataactttggtacttgggaaatttctgtcatctgtgatcagaacaagtgtcgtttcttg
aaggcctccccaaatctaagtaatgttctaccagttaatattattaataaggtaaaacga
actcgacaaaggatattgattaattatttcgaccaagagaatgtatacattagcgatcca
tattttactcaacagaagccgaaaagcctttgttgcaccccaatgcttaaccaaggaaaa
cttatcggtattatctatctggaaaactatctatgtactcaagtttttacctcatcttcc
atagaaattatcaatcttttgagtgcaaaagcagccatttctatccaaaatgctctgctc
tatcgtcgtttagaaaactatagtcgtaacctggaggctgaagtggaaatcagaacccag
aaactacaagaaaataaccaacaattacaggctaccctagaacaattgcagcgtactcaa
gctcaattaattcaggctgaaaaaatttcttctctaggggaaatggtagcgggaattgct
cacgaaattaacaaccccattacttttatctctgggaatatttttcatgctcaagaatat
tttggagatttagtggaattaatagacctttatcaagagaactttccccagtctagtcca
gcaatacaagataaattagtagaggttgagctagactttttgtgtgaggatttaaaacgc
ttgttccagtcaatgcaaaatggaagcgatcgcattcgccagattgtcctcggtttgcgc
aatttctctcgtcttggtgaatcagaatgtaaggagatagatatccatgaaggtttagaa
aacacgttaatgatcttgcaacatcgctgtcaagatcaaaagggtcgtcctgatattact
ctgattaaaaactacggaaaactgcctctcatcaactgctaccctagtcaactaaatcaa
gtcttttggcatattattaccaatgcgatctatgctttaacaagggcagacagtcccgct
gttcctgaaattaggataactactgaggtacacaacgacaaaactgtccaaatctctatt
gctgataatgggataggaatgagcgaaaaagtgcgggaaaaagtgtttgacccctttttt
actactaaaccagttggtcaaggaactggattaggattattaataagtcatcaaattatt
accgagcaacataatggagaattgtattgtatttctcaactaggaaaaggtagcgagttc
ataatcaaaatcccggttttgttggattatagataa
DBGET
integrated database retrieval system