Tetrahymena thermophila: TTHERM_00003780
Help
Entry
TTHERM_00003780 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
7832616
NCBI-ProteinID:
XP_001008060
TGD:
TTHERM_00003780
UniProt:
Q22SF7
LinkDB
All DBs
AA seq
3294 aa
AA seq
DB search
MKSLVRGVGSTPQSFTIQQQDFKDAVIVGYFKFNTLDPNKQYSMMRYQVSQEYTFLNYYT
INYSPYILIQMDNDNQLELNQQGPGITTGYWYQFGFGFKQSLNIYYSVWQGYPQGAIVYP
TYQYNNFQLRSDITQLTLCIICPPLENKFTQFVGQYSSIKMITGFYPQDIYKLLINENNM
NDQLLRSAFFINDNVINYIKTQYYPLTTDLSTNCTNSTKFYFDGICIDPSQCQNIVYFQT
TQFGSINSVFYNSIKLKCDVCQDYCLNCDNKSICLQCKSGYVLDTTNNICKRCPVNSFYN
PLNSLCLSNCPNGYQKDYINQLCVQNFNPFYILLNPLLYPRNFIQNDGFTLMDTNLQIQP
DQYTQCWLENQSFGPYTILGGQNNLNSNKINKKILNLPKNFQKIITFQGLIYNNGQQGDF
ILEVNNNLVTLSSFTKIFTNYQLCDDNQSVNFYQLTYIINDSTTNLDINISSNKNGWGIR
NFAMNVTKCHSTCNDCTNDGNPWSCTTCQMQQTSIQINKNCACNKGQYTQFQNCYSSPCY
TCSNCPPNCLSCEDQTGKCTSCATGYSIQNGLCIINSSCSNQYSQDPGSSYCIRAKDQGM
SFFVKDRIQLDLQFWYYTGLSEQFRQCYNRKYAPLIYGTQSVSLIMQLPQYQNYHYQVEF
QFTAMNVDYFAPSDYVSYYIDNNLVKKVNYKSNTTTSLCEDINYGETQVPESVFQLKKDA
NLNFTIGAYLVSSKWFTLNDLTIYYQRCHASCTNCLNGSSCTSCIQNSQPNAALGNFCYC
NDGFYFAYDWNTSSGLCLPCNSFCKTCNGPSITDCIICQESYKVVNNICVNACQVNQFWD
FNLHQCVNCSDCCSSCNGTSNSQCLSCQDPIMTLNSNVCKFNSDNNTCNSCNTNVSNSLC
GGTQINHDFCITKGWLSYNSNTCVNCFTADSNGNCGGSSIYNQLCNKYGYYYSSTSSQCL
SCSQAFGVNCGDPSIANVCKQNRWIYQSLSTCISYLQWLKFQQLLKLFWFYGSFQQXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXFNNSCLDKCPNGYSYNSSQNNCQNCPVFIG
VPECNNCASDCQTCSAATISQCKTCYGSRQLNAATNRCDCKDQEDQRTFFYECSMNNQAV
LNIQLSNQGPQMTIDFGKILADIPNYPTQTNSTTICKLLFSQAELQKIGFNSACQIQFNL
VNIALDNTATIIQGDTLNFLPNILKFKINSSTYIDTFLNNIVYQQPPQDTGVVFNFKKIE
NSCNDYKITLDKVQNDSGRGFQSITWTLLNPTTNQDDVQIQNILSQASTQNLLNITIPKG
VITLNTQKSIQASYKLKNTYSASQQFVFQVQTFKSVASVLNSNMIIPYFRYLEFNLNLSY
SIQYCDSQGNSLNTNDPIDITISSPQSNQIQKQIKSNTQNQIVQIIQAYSFPPNSNNQIN
VQLQLSSDQSVTNMQQVSFSTVPPKLIVKINGGNQRIDYKSNLNLNASLRDLDVQDPSAD
QGITLVWSCTDPSDPTKQCNDQNAKPFNFNQINPSIPPSTFSPYTVIRVQAQANKDTRSS
LDFIIVLFTEFDLPLLDISLNLLDPQGLTVNLNEEIFATLNYNTTVNTDILSFSSTLVYL
NEPVGAIKFDYTQLKFQLWDHYSGFNRSNPSVSIRFSVFNPYFYMPSVSIMSFQINFPPD
QCSFTINPLPTSLNIVYSLSTIFNLQMSNCVDDNLPIKYQFFMYKSVNDLNQEKLDSKQI
TRRQLNDLQQDTNLSTILPSGNLIIMATATDSKLAVFNTTININVTSSNMNEANYIQAID
SVINNNKLTNQQIISELSLITEDLSLRTDLISSDQINQKKIQILEKLKQLILLLPSSSTF
SSLSNKAIASLMPTIKLTPDQQNSQLTSLQSALSEDWSQVPYYNLSVAEKSVKNQQIYDY
FKIIDSMANNSQSSNSTSQNLQIDISNKLGEKMNYNSLPNEDPKIFQGNSIKIQSQQVTE
KNLCNYLFCSNFQPSETQTKSIIYNVAYKTYQQNPYLDDPSFKNLTQQIQQSIGNQTIAS
FPVINPSILSSQQNPSQNSIINQSNAVYNFQGNQLQKEGLTCYTKNKNQWTQSGCKLVFN
SKSNQYTCFCESLAPTTIVNDLQALIQNKNLQTAFSGQGFENISHFSDFYEYIAFWLIVC
KTVGFILLYIKGNRLDKKYVKHQDKQIASNINQRKVMPLPLNLKSIKESDQNIIQYQKQQ
NGNNSPFSVDQQMRNQSQRKTNKKFFNTQNQIKNELQVEKQEIQQIEQQELQKQCQSEVE
EINLEQKGSSNQNQEDSNTPRIIEEQTTKVENKSIFSKLQTINLIQENGDQVKNESKQED
QKQCIQYMSQVSSSNSQQQQQQQTTKIDQNQSKVSNDGYVKCVLCLKKNTLFVTPNQKKL
FNSNNIGKCCFSDLIYQQNILSDSTVQWGKDSVSSINWCSNDYKQDFSIIDPKKEFDDSY
EQCVEMSNTIYKDHLEMKLIEKEIFEDEIYSRKYMNKSFGEFLNTVQNDLSPDKVKQDQL
ILLKSFISYMLSSKKSPEDKIYLRGHGMLALFLLCFCSIKRSFYIMKEIYHFFYVDIIHP
DQIKKEVNYCSIVKHVVFTYLENFQKKKDPTPQQIERIVAFTRKYLYFQYNFFFLNQLNL
SSAFQIIELLLLNRTHDIMTRAMACIIHLNIKSIIEGDGDKFSLRDTIYNKVQPDNLHPL
LFQQWEPLKKEAIQKILLDLNRTIEMEKYKLYDCGAEMLDKAVKNCIKQQKNRFKIMEEH
YLKEIKDLKSSLKLAMNELNQNAQKMQQQEVEKNNIIIQYQALKKKYEINEIEYEDIQSK
LQFLNERANKRQMHYNKEYEEQVANLQQQVKNQKLDFRELDMLYRNQQGQFKQQLEEKDN
VIKRLKQGIQLLQRQRNEIVRDKASEQSLQEVNEICNESQEQINNNQEQQEDESINYRMF
HSHVQTQQFRQLNQNQNLQKSFERNNHVLQHVPQLKQSISEVSTVSDQSALRIQQKKSVD
EQICDQIEDERQFFAVSGKSNGDINQKTTQKVKNQESSPCNQDATNTTNKIEKYESTNDQ
LSRSVLQMYKQFDDPKALQQAINEQQISPAHSYTKNIQFESTDEKQYISSLEHPYFENHK
EETDYYYNSNSSQQIKSSQNSPKSYPQVQAFSPSQQQQQLQEQQKQQSPSQFTEAKINQK
QSSKSASPHSHIQQENSPQNELNHNHFSPVDDKFNAYNNLFGIRSAQSNSNNKQKVDDQN
KSKAVQNQRAMTQSLIQQTNEKEEQLNGEILQKFPHNKRTLSNQIPQQNEIKQN
NT seq
9885 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagcttagtaagaggggttggctctactcctcagagctttactatttagtaataa
gacttcaaagacgctgttattgtagggtattttaaatttaacaccttagatccaaataaa
tagtattctatgatgaggtactaggtaagtcaagaatatacattcttgaactattatact
attaattattctccatacatactgatatagatggataatgataatcaacttgaacttaac
taacaaggcccaggaattacaacaggctattggtattaatttggtttcggattcaaataa
tcacttaatatttactattctgtatggcaaggatatccttaaggagcaatagtttatcct
acttactagtataataatttttaattaagatcagatattacatagcttactttatgtatt
atttgtcctcctcttgaaaataaatttacataatttgttggacagtattcatcaataaaa
atgatcacaggtttctaccctcaagatatatataaattgctaataaacgaaaacaacatg
aatgatcagttattgagatcagcattttttataaatgataatgtaattaactacattaaa
acataatactacccattaactacagatttaagtactaattgcactaattctaccaaattt
tactttgatggaatttgtattgatccatcttaatgctagaacatagtctatttttagaca
acctaattcggatctataaatagtgttttctataattcaataaaattaaaatgtgatgtt
tgctaagattattgtctaaattgcgataataaatctatttgtttataatgtaaaagtggc
tatgtgcttgatactacaaataatatttgtaaaagatgtccagtaaatagcttctataat
ccattaaattctctatgtttatctaattgtcctaatggatattaaaaggattatattaac
taactatgtgttcaaaattttaatcccttttatatcttactaaaccctttgctatatcca
agaaattttatttaaaatgatggatttactttgatggatactaatttgtagatttaacct
gattaatatacctaatgttggctagaaaatcaaagctttgggccttatactattttggga
ggacaaaataatctcaattctaacaaaattaataaaaaaattcttaatttacccaaaaac
ttttaaaaaattattactttttaaggtttaatttataataacggttaataaggtgatttt
attttagaagttaataataatttagtaaccttatcatcctttactaaaatattcactaat
tattaactttgtgacgataattaatctgttaacttctaccaattaacttatattattaat
gactccacaactaatctagatattaatatttcatctaataaaaatggatggggaatcaga
aactttgcaatgaacgtcactaaatgtcattccacttgcaatgattgcacaaatgatggc
aatccttggtcttgcactacttgctaaatgcaataaacttctatacagataaataagaat
tgtgcatgcaacaagggatagtatacttaattttaaaattgctattcttctccttgctat
acctgctctaactgtccaccaaattgcttgtcttgtgaagatcaaactggtaaatgtact
tcttgcgctactggatattctatccagaatggattatgcattattaacagttcttgctct
aattaatactctcaagatcctggttctagctactgtataagagctaaagattaagggatg
tcttttttcgtcaaagatagaatttagctagatttataattttggtactatactggttta
tctgaatagtttagataatgttataatagaaaatatgcacctttaatttatggtacataa
agtgttagcttaatcatgtagttaccttagtattaaaattatcattatcaagtagagttt
taatttacagctatgaatgtagattattttgcaccatcagattatgtgagttattatata
gataataatttagtgaaaaaagtaaattacaaatcaaatactactaccagtttatgcgaa
gatattaattatggagaaacataggttccagaatcagtattttaactcaaaaaagatgca
aatttaaatttcacaatcggagcttatttggttagctctaaatggttcacattaaatgac
cttacaatatactattaaagatgtcatgcaagctgtactaattgtttaaatggatcttct
tgtacttcttgtatttaaaattcataacctaatgcagccttaggtaatttttgttattgt
aatgatggattctattttgcttatgactggaatacaagctctggactctgtctaccttgc
aatagcttttgtaaaacatgtaatggacctagcataactgattgtattatttgctaagaa
agctataaggttgtcaataatatttgtgtaaatgcttgttaggttaattaattttgggat
tttaacttacattaatgtgttaactgttcagattgctgctctagttgcaatgggacgtct
aacagttaatgtttgtcgtgttaagatccaataatgaccttaaattctaatgtttgtaaa
tttaattcagataataatacttgcaattcatgtaatacaaatgtttctaattctctttgt
ggtggaacttaaataaatcatgatttttgcataactaagggttggttgagttacaatagt
aacacatgtgttaattgttttactgctgactctaatggaaattgtgggggtagtagtatt
tacaattagctgtgtaataaatatggatattactattcttcaacatcatcttaatgcctt
tcatgctcataagcttttggagtaaattgcggtgatccttcaatcgccaatgtttgtaaa
taaaataggtggatttattaatctctatctacttgtattagctacttgtaatggctcaag
ttctaataattgcttaagctgttttggttctatggttcttttcaataatnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttcaataattcttgtttagataaatgtcct
aatggatatagctataattcttcttaaaataactgttaaaattgtccagtttttataggt
gtaccagagtgcaataattgtgcttcagattgttaaacttgctctgcagcaactataagt
taatgcaaaacttgttatggctcgaggtaattaaatgcagcaacaaatagatgtgactgt
aaagattaggaagattaaaggacgtttttttatgaatgtagtatgaataactaagctgtt
ttaaatatacaactatcaaatcaaggaccataaatgacaatcgattttgggaaaatatta
gcagatatccctaattatccaacttaaacaaactctaccactatatgcaagttattattc
agctaagcagagctatagaagataggctttaattctgcttgttaaatttagtttaacttg
gttaatattgctcttgataacacagctacaataatttaaggagataccttaaacttttta
ccaaacattttaaagtttaaaataaattctagtacttatatagacacatttttgaataat
attgtatatcaatagccaccataagatactggtgttgttttcaattttaaaaagatagaa
aactcttgcaatgattataaaattacattagataaagtttaaaacgactcagggagaggt
ttctaaagtataacttggacacttttaaatccgacaactaattaagacgatgtttagata
taaaatattttaagccaagcttctacttaaaatttattaaacatcacaataccaaaaggt
gttattactttaaacacataaaagagtatttaagcttcttataaattgaaaaatacttat
tctgcatctcagtagtttgtattttaagtataaacatttaaaagtgttgcttctgttctc
aattcaaatatgatcatcccttattttaggtatttagagtttaatctgaatttgagttat
tcaatttagtactgtgacagctaaggaaattcacttaatactaatgatccaattgacata
actatttcaagtcctcagtctaattaaatctagaaacaaattaaaagtaacacatagaac
caaattgtttaaataatataagcatactcatttcctccgaattcaaataattaaattaat
gtttagctctaattatcaagtgattaatctgtaacaaatatgtaataagtttcatttagt
acagtaccaccaaaattaattgttaaaattaatggtggaaattaaaggatagattacaaa
tctaatttaaatttaaatgcaagtttaagagatttagatgttcaagatcctagtgctgat
taaggaattactttagtatggagttgcacagatccttctgatcctactaaataatgcaat
gattaaaatgcaaaaccatttaattttaattaaataaatccttctattccaccttcaact
tttagtccttatacagttatcagagtttaagcacaagcaaataaagatacaagatcttct
ttagattttattattgttttatttactgaatttgatttgcctctcctagatatttcccta
aatcttcttgatccttagggtcttactgttaacttgaatgaagaaatttttgcaactctt
aattataatacaacagttaataccgatattctttcattttctagtactttagtttactta
aatgaaccagttggagcaattaaatttgattatacctaactaaagttttagctatgggac
cactattctggatttaatcgttcaaatccaagtgtgagcatcagattttcagttttcaat
ccttacttttacatgccaagtgtatcaatcatgagtttttaaataaactttccacccgat
caatgtagcttcactataaacccacttccaacttctttaaatattgtatatagtttatca
actatatttaatctctaaatgtctaactgtgtggatgataatttaccaattaagtattaa
ttttttatgtataaatctgtaaatgatctaaatcaagaaaagcttgattcaaagtaaata
acaagaaggtaactaaacgatttataataagatactaatttatcaacaatacttccttca
ggaaatcttattatcatggcaactgctacagattctaagttagcagtttttaatacaaca
attaatataaacgtaacaagctcaaatatgaatgaagctaattatatttaagcaatagat
tctgtcataaataataacaagctaactaattaacaaattatttcagagctttcacttatt
actgaagatctcagtttaagaactgatttaatctcaagtgatcaaataaattaaaaaaag
atttaaattttagaaaaattaaagtaattgattttactacttccttcatcatcaaccttc
tcatcattatccaataaagcaatagcaagcttgatgcctacaatcaagcttactcctgat
tagtagaatagctaattaacaagtttgcaatctgcattatctgaagattggagttaggta
ccatattataatttatcagttgctgaaaagtcagttaaaaattaataaatatatgactat
tttaaaataatagatagcatggctaataattcttaaagctcaaattctacctcttaaaat
ctctaaatagatatttcaaataaattaggagaaaaaatgaattataactctttaccaaat
gaagatccaaaaatattttagggaaatagtataaaaatacaaagctaataagtaactgaa
aaaaatctttgtaattacttgttttgtagtaatttctagccatcagaaacataaactaaa
tctattatttacaatgttgcatataaaacttactaataaaatccctatttagatgatcca
agctttaaaaatctgacttaataaatttaataaagcatcggaaactaaacaatagcctca
tttccagtaataaacccatctatattatcatcataataaaatccttcataaaattcaatt
atcaattaaagtaatgctgtgtataatttttaaggaaattaattgtaaaaagagggattg
acctgctacacaaaaaataaaaattaatggacttaaagtggctgtaaattagtctttaat
tcaaaaagcaattaatatacatgcttttgtgagtctttagcgcctacaactattgttaat
gatttataagctttaatttaaaataaaaacctttaaacagcttttagcggataaggtttt
gaaaatatttctcacttttctgatttttacgagtacattgccttttggttgatagtttgt
aaaacggttggttttatattgctctatattaaaggaaatcgtttggataaaaaatatgta
aaacattaagataaacaaattgcaagcaatattaatcaaaggaaagttatgccattacca
ttaaatttaaaatctataaaagagagtgactaaaatataatttaatatcaaaaataataa
aatgggaataactctcctttttctgtagactaataaatgagaaattaatcataacgtaaa
acaaacaaaaaattctttaacacttaaaatcaaattaaaaatgaattataggtcgaaaag
taggaaatttaataaattgaataacaagaattataaaaatagtgctaaagcgaagttgaa
gaaattaatcttgaataaaagggaagctctaatcagaattaagaagattcaaacacgcca
agaataatagaagaatagactactaaagtagaaaataaaagcatattttctaaactttaa
acaataaatttaatttaagaaaatggagatcaagtgaaaaatgaatctaaataagaagac
taaaaatagtgtatttaatatatgagttaagtatcaagtagtaatagttaataatagcag
tagtagtaaactactaaaatagattaaaaccaatctaaagtttctaacgatggatatgtt
aaatgtgttctttgtttaaaaaagaatacattatttgttactccaaaccagaagaagctt
tttaactcaaacaacataggcaaatgctgctttagcgatttgatttaccaataaaatata
ttaagtgatagtacagtttaatggggcaaagatagtgtttcttctattaattggtgttca
aatgattataagtaggatttctcaataatagatcctaaaaaagagtttgatgatagctat
gagcaatgcgtggagatgtctaatactatttataaggatcatttggaaatgaaattaatt
gaaaaagaaatatttgaagatgagatatatagcagaaaatatatgaataagtcatttgga
gagtttttgaatacagtttaaaatgatttatcgcctgataaggttaaataagaccagcta
atattgctaaaatcttttatttcttatatgttgagctctaaaaaatcaccagaagacaaa
atatatttaagaggacatggtatgctagccctctttcttctttgtttttgttcaataaaa
agatctttctatatcatgaaagaaatatatcacttcttttatgttgatattattcatcca
gattaaataaaaaaagaagtgaactactgctccatagtcaaacatgttgttttcacttat
cttgaaaacttccaaaagaagaaagatccgactcctcaataaatagaaaggatagttgcc
ttcacaagaaaatatctctacttttaatataatttctttttcttaaattagctaaattta
tcaagtgcctttcaaatcatagaacttcttctactaaacaggactcatgatatcatgact
agagcgatggcttgtataattcatttgaatattaaatctattatagaaggtgatggagat
aaatttagtttaagagatacaatctataataaagtttaacctgataatcttcatccatta
ttgttttaatagtgggagcctttgaaaaaggaagcaatttaaaagatattattagactta
aacaggacaatagaaatggaaaaatataaattatacgattgtggagcagaaatgttagat
aaagcagttaagaattgtataaaataatagaaaaatagattcaagattatggaagaacac
tatcttaaagaaataaaggatttaaagagttcattaaaattagccatgaatgaattaaat
taaaatgcataaaagatgcaatagcaggaagttgaaaaaaacaatataataattcagtat
taggctttaaaaaagaagtatgaaataaatgaaatagaatatgaagatatttaaagcaaa
ctctaatttttaaatgaaagagcaaacaaaagataaatgcattacaataaggaatatgaa
gagtaagtagcaaatttgtaataacaagtaaagaatcagaaacttgattttagagagcta
gacatgctttatagaaattaataagggtaatttaaataatagctagaagaaaaagacaat
gttatcaagagattaaaatagggtattcagcttttatagagacaaagaaatgagatagtt
agagataaagctagcgaataatctctttaagaagttaacgaaatatgtaatgaatcttaa
gaataaattaacaataaccaagagtagtaagaagacgaatctataaattatagaatgttc
catagccatgttcaaacatagcaatttagacaactaaactagaattaaaatttataaaaa
tcatttgaaagaaataaccatgttctttagcatgtaccttaattaaagtaatctatatca
gaggtatccactgttagtgattaatcagccctacgtatttagtaaaaaaaatcagttgat
gaacaaatttgcgattaaattgaagatgaaaggtagttctttgctgtctctggtaaatca
aatggagatataaactaaaaaactactcaaaaagtaaaaaattaagaaagctccccttgt
aattaagacgctacaaatactactaataaaatagaaaaatatgaatcaactaatgattaa
ttaagtagaagtgttctttaaatgtacaaacaatttgatgatcccaaagccctctaataa
gcaattaacgaataataaatttctcctgcacattcatatacaaaaaatatttaatttgaa
tcaacagatgagaaataatatatttcatctctggagcatccttattttgaaaaccacaaa
gaagaaacagattattattataattctaattctagttagcaaataaaaagtagttaaaat
tcaccaaaatcctatccttaagtttaggcattttctccttcttaacaatagcaacagctt
taggaataataaaaataataatctccctctcagtttactgaagctaaaataaattaaaaa
caaagctcaaaatcagcttctcctcattctcatatttaataagaaaactctccttaaaat
gaattaaatcataatcatttcagcccagtagatgacaaatttaatgcatataataatcta
tttggaattagatctgcttaatcaaattcaaataataaataaaaagttgatgatcaaaat
aaaagcaaagctgtataaaatcaaagggcaatgacttaaagtctaatataataaacaaat
gaaaaagaagaataattaaatggagaaattttataaaaatttcctcataataaaagaacg
ctatctaatcaaatcccataataaaatgagataaaataaaattga
DBGET
integrated database retrieval system