Tetrahymena thermophila: TTHERM_000155258
Help
Entry
TTHERM_000155258 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LVIVD
DUF7234
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24437585
NCBI-ProteinID:
XP_012651515
TGD:
TTHERM_000155258
UniProt:
W7XEA0
LinkDB
All DBs
AA seq
2896 aa
AA seq
DB search
MDENNQHLNIFTYKFDEDVLGSTLVSRDSKYFIFNVSNKLTIFTFDIHQKQLAQIYQDNS
SQQQINVVTLNQKQSKVYVIKDSIDLYIISLKDFAIQKGQLDQQQVVISFFVSSDDSWIC
LSQDAVGIMFYQIISLGQNQIFLRLACTNTLINSYNYLLIKNDSILITIDYWIGISIFDI
TELAKSIDSGQSNIQMKALLLNWWIDSTYAPYSNALEINLEETFLFVAFRSVGFYIFDIQ
NPSQPQIVQLIQIQKDIIQIIQSYKNPYVYIQTKKRILVYKKVKANFQNNYPNLFNKHAS
ILSTLIDTSQTKQIKLLPDNSHMIVCCSSNGLNILKLKLNSILQPLEIVSQINYSSKLDS
FLIFSNGQLLILSVQDPNSFYFDIYDLGNLISPQRVQRIILDYKDINSITLSKDETLFVF
QSGNNLVFYEVSSIQFKYLNTFNINSSPIVQQSSIVILNEFPYILVLIQEQSITAIQISN
LNEPQISSVQESLGAVYGIQGTYQSHFCFIADGQQGISIIDLRELPNIVIMTKISLNGYQ
VNLILLQNDNYIISSQQSGGQIELINIFNINEPYIMSQTQFENESSVATEISQDLNYLFI
LSSKGIRILPIKTSFLINFEFSLLQDTNSGQQQQTMQGTENLILEVGQNLIVTLTSIYPQ
KNAAITNAYFVQQYKLQTLPSWLSFDNHLNQLQINVTKESLTGLIQNNNTNIQINFNNVV
FVTKVQLTETSFIYQDNNTGSYIITDVQSKQIFQYFKNYNILNGQNQISDQFCQNESFDL
PSLSKMTISNEGYIVIRNILQSSVVYSPLKLLLQNSLIVNFKNPFQIISSVSKIASMSIQ
IDKISGKFVLKNYPGVITLFSKDQDMLQLEGEIIYLNQILTQQILVYFYSNTYTKSNVEV
ILDDKINYQYDQFFLYQDIQNIFQIKKNIQIQSTQSFQAQVNRIFSDSIIYIDTLNTIQF
SFNTYEYTDFKDLTFQAFEIKGGNLKSLSAQIDEISFFPQQLMFIIKPQISDYSSSFCFI
VNATNSYSWVQDQFCVKAKGLLKYWYLLFNLIFAKKNKYKEVQLSSGQEFTQKIILVNDS
YIICKKLFNKFKQQLKTQKKQQDYIQNSQKDNILCQSQLNRETDYSKDKEFLSFQNINSK
KLSNLIINVNKKLDKCIKSKYKGSYEEFDQYINHQNCIDKQKFFADFEKSNLQISYNKKK
LSPQQFKKDLEDEDSIIYNCIYGESQLLKQSSFKEKQTSKNTWIQIQQNKNSLKNSNFLN
QNNQNIIQKLYNLKQTTDQKALRIKAIIDNQLKEKNLKNNCNQHQQLLILMVQKSLKTVL
ILALALFVLIKTTVSLAIKEIYVSTIFKNFESTSNQQYFKQIAVAKKAGLIYFKQGQSTI
NIYDENNNFNQLCSYQPQGQLKDNFLVSDDGKFLIVVLENFLKILEFNLKTKILSILFTD
VQQSQFNILSLNQQQNKIYLIRDQVNFQIISLVDFSIAKGILNNQWQVLDMHISNDEKWL
SVSANTQGLFFYQINKSDNSTIQFSQVSSNSNVNFYQFILFKNDKYIIGLDYWQGISIFD
LTTFAQELNQGNTNIQLNTPVINWWMVQGGFPYSSTIEINQEQSLIYVGARSSGIYAVDI
TNILNPVVFQLIQIQEDIFQLILSYNLSYLYLSTKKSVVVYQKDQVNLQMSYPNLYNKHQ
STLSSILNTPYGWRSLLLKDEKTLIVTCSKYGVVIAQFNQTSIQIPLQVLSTISYPFLTY
SDNIMLFREETFLLVPVQDPSGYIIDVYDISNKTSPKVVQRIPSQTSAYIYSMSKKQDET
LFGCQNLNQLAFYIVSGNISFNLISSFSIPQSLSTVQTNDMVILNGFPYVILLFRALTIA
ALDISDVQKPFIASNIDSLGAEQIIQGTYQRNYCFIADGLQGISVIDLTQLPKIVIISNV
QISGYTNFLNLIVKEQFIITSQLSGGELSLVSMSAIKSPQFISQLQYKNEFAAASSLTSD
SSCQRQHRYFKSNKIKASRLNSFNPLYPISGSQITNAYFVRDGILYDLPSWMVFDIYKST
LTLSITKDSLNVIKANNLDNNDITKQTVVFVTKLPLTQNSFAFTNELTGNVAISQNMSQQ
IFIAYKNMGIINHLNQVSDSFAEDETFTPPMITGLNLTDDAILKIKKVLQMSLTYSPVDL
LLQKSLIIDFMQDNNYIQSCSPSVSILFTVNQKDGKFVNRLYSSVVTSLTEKQDQLQLQG
NIKSLNQLLQQQIQIYLYDKNSTNVNIQIQVSDGINNDFVDTYTFDQLSKILQIKKDLSI
SLENKLQNQINNQYPGSHIQIGSQVDIEFSLNTFNDANFNDLQFQAFQFYNDQYIPLTNQ
QNEIQFIPQQFKFNIKTSISDFGRKYCLAVNVTDSYSWVIDSFCATASVISFIVFLNIFL
QVFGPLLFFLGILKYWNLLFNMFFNKENLFKKQIEENKQFVLKFIIVNDSYLIGQKLFNE
YVKNIPQSRISQKSIQVYQSPHNSSLLKNYILKLNLKNDEILQKNSNIDQQELQINDFEF
TKEQKDKAKQILRRATRILNSKRFNIKTFITDLYNSNKPINYGGKVIYPRQLQNELNDSG
SVLYNCLSGLLIKSLLKLNKRTFVVYQLIKQIAQICYQKSQKQWTEFLTESFPILMQKNM
KKSALQNSNELNAVNIKQLLGIDLGLIIDNIITDAIGIVNPTNSSLYPNSGESIHLLEHK
IKKVQAFMKSKNSKTFCLKKLLNMEYQPLFSHKNQQLPSWLKIKIENQLITLYGIVPQMQ
NYGKLKICIFDCNECIIREVILEMKNNNSKQKSQLNITNDISIIESEQASPLNIYGYSEV
RDKLSHKKLKLFETMQQPILQNNNIKVFTFEQLCSDNQLNVKTQNKIQKSNVQQLNRTII
KSINPLLIDNNVGILE
NT seq
8691 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgaaaataattagcatcttaatattttcacttacaaatttgatgaggatgtactg
ggttcaaccttggtttcaagagattcaaaatattttattttcaatgtctctaataaatta
accattttcacatttgatattcatcaaaaataattagcctaaatttactaggataacagt
tcttaataataaataaatgtagttactttaaattaaaaataaagcaaagtctatgttata
aaagattcaattgatctatatattatttcccttaaagattttgctatttaaaaaggttaa
ctagattaacaataagttgttatttccttttttgtttcttctgatgactcttggatttgt
ttaagctaagatgcagtcggtataatgttttactaaattatctctttaggctagaattaa
atttttttgagacttgcttgcacaaatacattgattaattcatacaactatttgctaatt
aaaaatgattcaatactaattactatagactattggattggtatttcaattttcgacata
actgaattagctaaatcaattgattcaggataaagtaacattcaaatgaaggctctactt
ttaaattggtggattgattctacttatgctccttattctaatgctcttgaaataaattta
gaagaaacattcctttttgtagctttcagatcagttggattttatatatttgacatataa
aatccttcatagccttagatagtttagctcatttagatataaaaagatataatttaaatt
atacaatcttataaaaatccctatgtttatatttaaactaaaaaaaggattctagtctat
aaaaaagtaaaagctaattttcaaaacaactacccaaatttgtttaacaaacatgcatct
attttatcaactttgattgacacatctcaaaccaaacaaataaaattacttccagataat
tcacatatgatagtttgttgctcaagtaatggtttgaatatattaaagttaaagttaaat
tctatactttaacctttagaaattgtaagttagattaattattctagtaaattggacagt
tttttgatattttcgaatggttaattattaattttatctgttcaagatccaaatagtttt
tattttgatatctacgatctaggtaatttaatttctcctcaaagagtgcaaagaattatt
ttggactataaggacataaattcaataactttaagtaaagatgaaacactatttgtattt
taaagtggtaataacttagtgttctatgaagtatctagcatataatttaaatatctgaat
acattcaatattaattcttctcctattgtacaatagagttcaattgttattttgaatgaa
ttcccttacattttagttttaatttaagagtagtcaataacagccatacaaattagtaat
ttgaatgaaccttaaattagtagtgtataagagtcacttggcgctgtctatggtatataa
ggaacatattaaagccatttctgttttatagctgatggttaataaggtatttcaatcatt
gatcttcgcgaattaccaaatattgtaattatgacaaagatatctttaaacggatattag
gttaatttaatccttttataaaatgataactatattatttctagctaacaaagtggaggt
taaatagaattgattaatatatttaatataaatgagccttatattatgagctaaacttaa
tttgaaaatgaatcatctgtagctactgaaatcagctaagatttaaattatttatttata
ttgagttccaaaggaattaggatattacctattaaaactagctttcttataaattttgaa
ttttctttattacaagatacaaactctggttaataataataaacaatgcaaggtacggaa
aatcttatcttagaagtaggctaaaatttaatagttaccttaacttctatctatcctcaa
aaaaatgcagcaattacaaacgcatattttgtccaataatataaattgcaaactcttcct
tcttggctttcttttgataaccatttaaattagctacagataaatgtaactaaagaaagt
ttaactgggttaattcaaaataataatacaaatatatagataaactttaataatgttgtt
tttgttactaaagtatagcttacagaaacatcatttatatattaagataataatactggc
tcttacataattactgatgtataaagtaaataaattttttagtatttcaaaaattacaac
atactaaatggctaaaattaaatttcagattaattttgctaaaatgaatcatttgattta
ccatccctcagtaagatgaccatttctaatgaaggatatattgttataagaaatatttta
cagagtagtgttgtttattcccctctaaagttattgctttagaattcattgattgtaaac
tttaaaaatcctttttaaattattagttctgtatcaaaaatagcaagcatgtcaatttaa
atcgacaaaataagtggaaaatttgttttaaaaaattatcctggagtaatcaccttattt
tcgaaagattaagatatgctacaattagaaggtgaaattatttatttaaatcagattcta
actcaatagattttggtttatttttatagcaatacatacactaaaagcaatgtagaagta
attttagatgataaaataaactattaatatgactaattttttttgtattaagatatacaa
aatatattctagataaaaaaaaacatttagatttaaagcacttaatctttttaagcttaa
gtaaatagaattttctctgattctatcatctacattgatactttaaatacaatctaattt
tctttcaacacatatgaatatacagattttaaagacctcactttttaagcctttgaaatt
aaaggaggtaatttaaaatctctaagtgcttaaatagatgaaataagtttctttccttaa
taattaatgtttataattaagcctcaaatatctgactatagtagttcattttgctttatt
gtgaatgctacaaattcatactcttgggttcaagatcaattttgtgttaaagcaaaagga
ttattaaaatactggtatcttctttttaatttaatatttgcaaagaaaaataagtacaaa
gaagtttagctatcttcaggttaagaatttacttaaaaaataatcttagtaaatgatagt
tatataatttgcaaaaagcttttcaataaattcaaacaatagcttaaaacctaaaaaaaa
tagtaagactatatttaaaattcttaaaaagataatattttatgttaatcatagctaaat
agagaaacagattattcaaaagataaagaatttttatcattttaaaatattaactcaaaa
aagttatcaaatttaatcataaatgtaaataagaagttagataaatgtataaaaagcaaa
tacaaaggaagctatgaagaatttgattagtatattaatcatcaaaactgtattgataag
taaaagttttttgctgattttgagaaatcaaacttacaaatatcctacaacaaaaaaaag
ttatctccataataatttaaaaaagatttagaagatgaagatagcattatatataattgc
atatatggtgagagtcaattattaaaataatctagtttcaaagaaaagcaaacatctaaa
aatacatggatttaaatataataaaataaaaatagtttaaagaactctaatttcctaaac
taaaacaattaaaacataattcaaaaactttataatttaaagcaaacaacagattaaaaa
gcattaagaataaaggcaataatagataattagctaaaagaaaaaaatttaaaaaataat
tgtaattaacattaatagttattaattcttatggttcagaaatctttaaaaacagtactg
attcttgcattagccttatttgtgttgataaaaacaacagtttcattggctataaaagaa
atttatgtgtcaactatatttaagaatttcgaatcaacatctaattaacaatattttaag
tagattgcggtcgctaaaaaagcagggttaatttattttaaataaggctaaagtacgatt
aacatttatgatgagaataataactttaattagctgtgctcttattaacctcaaggctaa
ttaaaagacaatttcttagtatctgatgatggtaaattcttaattgttgttcttgagaat
ttcttaaaaatattagaatttaatcttaaaacaaaaatcctctcaattttgtttacagat
gtttaataatctcaatttaacattctatctctcaactagtagcaaaataaaatttactta
attagagattaagttaatttttagattatttcgctagtagactttagcatagctaaagga
attcttaataactaatggtaagttttggatatgcatatttctaatgatgagaaatggctg
agtgtaagcgctaatacataaggtctatttttttattagattaataaatctgataactct
acaatttaattttcataagtatcttcaaattcaaatgtcaacttttaccagttcatccta
ttcaaaaacgacaaatacataataggtttagattattggtagggaataagtattttcgat
ctaacaacttttgcttaggagcttaactagggaaacacaaacatttagctaaatacccca
gttataaactggtggatggtatagggtgggtttccttattcatctactattgaaattaac
caagaatagtctttgatatatgttggagcgagatcatcaggcatttacgctgtagacatt
actaatattttaaatccagtagtattctaacttattcaaatttaagaagatatattttaa
ttaatcctatcctacaacctctcttacctatacttatcaacaaaaaagagtgttgtagta
tattaaaaggatcaagttaatctttagatgagttatcctaatttgtataataagcattaa
tccactctttcttctatcttaaatactccatatggttggagaagtcttttgctaaaagat
gaaaaaacgctaatagtaacatgctctaaatatggagttgtcattgcttaattcaactaa
actagtatataaataccattataggtactcagtaccatttcttacccttttttaacatat
tctgacaacattatgttgttcagagaagaaacattcctcttagttcctgtataagatcct
agtggatacatcatagatgtctatgatatttctaacaaaacatctccaaaagttgtgcaa
cgtataccttcttagacatctgcttacatttattcgatgtcaaaaaaataagatgaaaca
ctttttggttgccaaaacctaaattaattggctttttatattgtctctggtaacatctca
tttaacttgatctcttcatttagtattccataatctctttcaacagtttaaaccaatgat
atggttattttgaatggctttccatatgtaattttactatttagagcattaacaatagca
gctttagatatttcagatgtctaaaaaccttttattgcaagtaatattgattctctagga
gctgaacaaataatttaaggtacatattaaagaaattattgttttattgcagatggtttg
taagggatttctgttattgacttaacttaacttcctaaaatagtaattatttcaaatgtt
taaattagtgggtataccaattttttgaatcttattgtgaaagaataatttataattaca
agtcagctaagtggaggagaattgtcgttagtaagtatgagcgctataaaatctcctcaa
tttattagctaactttaatacaaaaatgaatttgcagctgcttcatccttaacaagcgat
tcaagttgttaaagatagcacaggtattttaaatctaataagattaaagcaagtagacta
aattctttcaatccactatatcccatatctggatcacaaataacaaatgcttattttgtc
agagatggtattttatatgatttaccttcttggatggtatttgatatctataaaagcaca
ctgactttgagtattaccaaggattcgcttaatgtaattaaggcaaataacttagacaat
aatgatattacaaagcaaactgttgtatttgtaactaaattgcctcttacataaaattcg
tttgcttttacaaatgaacttacagggaatgtagcaattagccaaaatatgagttaacaa
atttttattgcctataagaatatgggcataataaatcatttgaactaagtttcagattca
tttgctgaagatgaaacttttactcctccaatgattactggattaaatctaacagatgat
gcaatcttgaaaataaaaaaagtattatagatgagtttaacatattctccagttgatcta
cttttgcaaaaatcattaataatcgattttatgtaagacaataattatatttaatcatgt
tctccatctgtgagtattttatttactgttaattaaaaagatggtaaatttgttaatagg
ctatattctagtgtggtaacttcattaactgagaagtaggattaactttaattgtaagga
aatattaaaagcttaaattaactcctttagtaataaatttaaatatacctctatgataaa
aacagtacaaatgttaacattcaaatttaagtgagcgatggaataaataatgactttgta
gatacctacacatttgattaactctctaaaatattataaataaaaaaagatctttctatt
agtctagaaaacaaattataaaactaaattaataattaatatcctggatctcatatttaa
ataggtagctaagttgatatagaattttctttgaatacattcaatgatgcgaattttaat
gatctgtaattttaagccttttaattttataatgatcaatacatacctttgactaattag
caaaatgaaatttaattcattccttaatagtttaaatttaatattaaaacatcaatttca
gactttggaagaaaatattgcttagctgttaatgtaacagattcttattcttgggttata
gactcgttttgcgcaacagcatctgtcatttcatttattgtgtttttgaatatattttta
caagtattcggacctttattgtttttcttaggtatcctaaagtattggaatttacttttt
aatatgttctttaataaagaaaatttattcaaaaagtaaattgaagaaaacaaataattt
gtgctaaaatttataatagttaacgattcttatttgataggttaaaaacttttcaatgaa
tatgtaaaaaatataccataaagtagaatatctcaaaaatcaatttaggtatattaatct
cctcacaatagctcattattaaagaattacattctaaaattaaatttaaaaaatgatgaa
attttataaaaaaactcaaatattgattaataagaattgtaaattaatgattttgaattt
acaaaggaataaaaggataaagctaaatagattcttcgaagagctacaagaattttaaat
agcaaacgtttcaacataaaaacatttatcactgatttatataattcaaataaaccaatt
aattatggaggaaaggtaatttatcctaggtaactataaaatgagcttaatgactctgga
agtgttctctacaattgtttgtctggacttcttattaaatcattattaaaattaaataaa
cgcacatttgttgtttattaactaataaaataaattgcttaaatatgctatcaaaaatct
taaaaataatggactgaattcctcactgagtcttttccaatattaatgtagaagaatatg
aaaaaaagtgctctataaaactctaatgaactaaatgcagtaaatataaaataactattg
ggaatagacttaggattaataattgacaacatcattacagatgcaattggtatagtaaat
ccaacaaacagttcactatatcctaatagcggagaaagtatacacctcctagaacacaaa
attaaaaaagtgtaagcatttatgaaatctaagaactctaaaacattttgtttaaagaag
ttattaaatatggagtattagcctttattttctcacaaaaattaacaattaccgagctgg
ctaaaaattaaaatagaaaattaactaattactctttatggaattgttccttagatgcaa
aactatggtaaattaaagatttgtattttcgactgcaatgaatgcataattagagaagtc
atattagaaatgaaaaacaataatagtaaataaaaatcttagctaaacataacaaatgat
atttctattattgaatcagaataagcatcacctcttaatatatatggttatagtgaagta
agagataaattatcacacaaaaagttaaaactatttgaaactatgtaataaccaatttta
taaaataataacattaaagtttttacatttgaacaactttgctcagataactaattaaat
gttaaaacccaaaacaagatataaaaaagtaatgtctaatagctaaatagaactatcata
aaatcaataaatccgttattaattgacaacaatgttggtattttagaatga
DBGET
integrated database retrieval system