KEGG   Tetrahymena thermophila: TTHERM_00030090
Entry
TTHERM_00030090   CDS       T01020                                 
Name
(RefSeq) helicase carboxy-terminal domain protein
Organism
tet  Tetrahymena thermophila
SSDB
Motif
Pfam: Helicase_C_2 DEAD_2 DEAD AAA_22
Other DBs
NCBI-GeneID: 7833584
NCBI-ProteinID: XP_976906
TGD: TTHERM_00030090
UniProt: Q22MW4
LinkDB
AA seq 1257 aa
MNYRKKIIQYEEDTKSIQDRQMSRILQIFPYDNPYDQQIESMKIILDILSNKQNLLFQSP
TGTGKSLMVMCAAAAFAEYHSSQFQILFLTRTNGQINGLVKELNKIRNIDDFISKYSILA
GRNNLCIKKDQFRQYMIDNKIDPNGKNLHKKYDLFCTDCKKCLIKTSAKKDLDNENILKV
SESIVIGDQTKETRNNQQQQQQDQSRVVQVMSAIETDLTENQNNEKYITQKNLACLHFGL
NEMLKEQEYKFTGYSKVRFMNQTDSNENSNKQNQDFDLKNHLNLLELIEKQEEEFDEDYE
FERDSQKYQQFKTNNITIKNEDINPDYEERLPDIEDMVKIFKEKQAQCPFYFNRYIAKQA
NIVFMNYNYLLNPDILKYVSANIIDRQKKQIIIFDEAHNIEQQAESQFQTKLKLKNLQKS
HELITNILITLRLAKQLRILDVLKQKGLELIDKVKESSKSKKNEKKGQDQQDKCNQNGFD
VQIKSEYLEDEESEEEFQPQSLTQRQVQNENEEQNIQNKDQEIKQLQSEKNQIQQSTSIL
KEKDLNIMQQNINIQTIELKSKRTRKHNYQINDEEIEQNILDDDKIKQEIKYQINQQNEN
EVEIKEEQQSFCNADYKSNNFKEGSSFLDNQSILDELEIENEQNFKEKIQKESQQKEIIK
IEDEELNEIAIDFNEKQQEGTNEGDSQSDDKYENQKKILEEFIQNYELKLPKILGYLNKL
INYCLTRQSKLQKAESNLLSEYHFIKQYYQLFGLVSHDNDSDKENILKEENEQKTILQEA
NEVLRQKININSDYQQNMDVLSQFSEFSYIFQQITRYIKVKYSRECQQKAIEDILASAVY
YEGNLHQLKVTLRYFANNLQPLNHLTKIKKIVLFLSNLKDFHQLSMIQQQYKKKQSFHYL
RSSQKQYKNLQNDQYINEDFNLESPDLQKLQDFYFSAQKNELKEDVIFTLGCLSGKYAFR
EIFSKLNVHSLILSSGTLEPFDILIKNLDVKFEIYSGKHVIDPQQQVFTQFIKECSNNGK
PLNFSFEKIYMDDLEIREQKRQNILSTLQIIQNIVKTIQDQSIKGGVLVFFKSYELMYSF
YQAFLGSNAQRELKDIPIFFEKPTNVQFQTDFAHFKKQVLTFKKTSLFFAACRGKLAEGI
DLSDSLARCVLLVGVPLWNISDPYFICKKKYVELVLKMDPNEWSRKQVIKCVNQAAGRSI
RHRYDWGSVFFICELFDQVLHPKNFKKYISKWILMGENKQQNYIEAYKQFLAKNSNY
NT seq 3774 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaattataggaaaaagataatataatatgaagaagatactaaatcgatataagataga
taaatgagtagaattttatagatcttcccttatgacaacccttatgattaataaatagaa
tcaatgaaaattattctcgatattctatcaaataaataaaatctattattttagtcacct
actggaacaggaaagtctttgatggtaatgtgtgcagcagcagcatttgcggaatatcat
agttcttagttttaaattttatttttaaccagaacaaatggatagataaatggattagtt
aaagaattaaacaaaattagaaatattgatgatttcattagtaaatattctattttggct
ggtagaaataatttatgcattaagaaagatcagtttaggcagtatatgattgataataaa
atcgatccaaatggaaagaatttacacaagaagtatgatctcttctgcacagactgtaaa
aaatgcttaattaaaacaagcgctaaaaaagatttagataatgagaacatcttaaaggtt
tctgaaagcatagtaattggtgaccaaacaaaagaaactagaaataattaacaatagtaa
taataagactagagtagagttgtataagtaatgtcagctattgaaactgatttaacagag
aactaaaacaatgaaaaatatattacttagaagaatttggcatgcctacactttgggtta
aatgaaatgctaaaagagtaggaatataaattcacaggatacagcaaagttagatttatg
aattagactgactctaatgaaaatagtaataaataaaattaagattttgatttaaaaaat
cacttaaatttgcttgaattgatagaaaagcaagaagaagaatttgatgaagactatgaa
tttgaaagagatagttaaaaatattaataattcaagacaaataatataacaattaagaat
gaagacatcaatcctgattatgaagaaagattacctgacatagaggatatggttaaaata
tttaaagaaaaataggcttaatgtccattttatttcaacagatacatagctaaataggct
aatatagtttttatgaattataattatcttcttaatcctgatatactaaaatatgtgagt
gcaaatatcattgatagacagaagaaataaatcatcattttcgatgaagcccataacata
gagcaacaagcagagtcttaattttaaaccaaactcaagctcaaaaacctttaaaaatct
catgaattaattactaatattttaattaccttaagattggcaaaatagctaagaatatta
gatgtgctcaaacaaaaaggtttagagttaatagataaagttaaggaatcctccaaatct
aaaaaaaatgaaaagaaaggataagactagcaggataagtgcaactaaaatggttttgat
gtatagataaagtctgagtatttagaagatgaagaaagtgaagaagaattttaaccatag
tctctaacataaagataagtttaaaatgaaaatgaagaacaaaatatttaaaataaagat
taagagatcaagtagctttaatcagaaaaaaatcaaatttaataatcaactagtattttg
aaagagaaagatcttaatattatgcaacaaaatataaatatttaaactattgaattaaaa
tcaaaacgaactaggaagcacaattattaaattaatgatgaagaaattgaataaaatatt
ctagatgatgataaaattaaataagaaataaaatattagataaattaataaaatgagaat
gaagttgaaatcaaagaagaataataatctttttgcaatgcagattataagagcaataat
tttaaagaaggaagctcatttttagataactaaagtattttggatgagctagaaattgaa
aatgaacaaaattttaaagaaaaaatttagaaagaaagctaatagaaagagataataaaa
atagaggatgaagaattaaatgagatagccatagattttaatgaaaaacaataagaaggt
accaatgaaggagattcctagtcagatgacaaatatgaaaaccaaaagaaaatcttggaa
gaatttatttaaaattatgagttaaagctacctaaaatattaggctacctaaataaatta
ataaattactgtctaactaggtagtcaaagctttaaaaagctgagagtaatttattaagt
gaataccattttatcaaatagtattatcagctatttgggttagtatcacatgacaatgat
tcagataaagaaaacattttaaaagaagaaaatgaataaaaaactatcctttaggaagca
aatgaggttctcagataaaaaattaacataaactctgattattagcaaaatatggatgta
ctaagtcaatttagtgaatttagttatatattttagtaaattacaagatacatcaaagta
aaatattccagagagtgctagcaaaaggctattgaggatattttagcatctgcagtatat
tatgaaggtaaccttcattaattaaaagttacattaagatactttgctaataatctttaa
ccacttaaccatctaactaagattaaaaaaatcgtgcttttcttgtctaatttaaaagat
tttcatcaacttagtatgatttaatagcaatataaaaaaaaataatcattccattatcta
agaagttcttaaaaataatacaaaaatctataaaatgactaatacattaatgaggatttt
aatttggaaagccctgatctacaaaaattgtaagacttttacttttcagcacaaaaaaat
gaattaaaagaagatgttatctttacattaggttgtctaagtggaaagtatgctttcaga
gaaatattttctaagttgaatgttcattcgcttattttaagtagtggtacccttgagcca
ttcgatattcttatcaaaaatctcgatgttaaatttgaaatttactcaggaaagcatgta
attgatccttaataataagtattcacttaatttattaaagagtgcagcaacaatggaaag
cctttgaacttttcatttgagaaaatttacatggatgacttagaaataagagaacaaaag
agataaaatatattaagcaccttataaataatctaaaatatagtcaaaactatttaagat
caaagtattaaaggaggagttttagtgttctttaaaagttatgagttaatgtatagcttt
tattaagcttttctaggctcaaacgcttaaagagagttgaaagatattccaattttcttt
gaaaaaccaacaaatgtgtaattttaaacagattttgctcactttaagaaacaagtgtta
acttttaaaaagacttccctattttttgcagcatgcagaggaaaattggcagaaggtatt
gacctaagtgactctttagcaaggtgtgtcctacttgttggagtgcctctttggaatatc
tctgatccttactttatttgcaagaaaaagtatgtcgagttagtgctaaagatggatcct
aatgaatggtcaagaaaacaagtaataaaatgtgttaaccaagcagctggtagatctata
aggcatagatatgactggggcagcgtgttttttatctgcgaattatttgatcaagtactt
catcccaaaaactttaaaaaatatatatcaaagtggattcttatgggtgaaaataaataa
taaaattacatagaggcctataaacagtttttagccaaaaattcaaattattga

DBGET integrated database retrieval system