Tetrahymena thermophila: TTHERM_000309879
Help
Entry
TTHERM_000309879 CDS
T01020
Name
(RefSeq) PiggyBac-like protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DDE_Tnp_1_7
Ku
Ku_PK_bind
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24438322
NCBI-ProteinID:
XP_012654321
TGD:
TTHERM_000309879
UniProt:
W7XIA7
LinkDB
All DBs
AA seq
1199 aa
AA seq
DB search
MKNLREDSVTDWKDNQNIEFLIKLKNQISKKNIQFLTSEEALQISLRIKPKQILQRPKYN
GTFQIRNELTADVVVFTKTLEKHLLNLKTYSNITEWNPSTQRQMVEQQIQYYQVDDILLE
NPVQDISKYYKYGNQLVKMSELFLNQINLFTLKEIKLIGSVQKSSIPRQSFMSGCDILFA
KQDSKRSRYIIASLIKACFEEQRYLVARFVLRQNSIPKLVVLIPHLKKNCEYFYIIELPT
VESIRDYSFNSLIRSTPEQQKLMSQLIDELDLDQDEKNQNQFKIGSQPNETIAKINDLIL
MRGMNVNEEEINKKLFTKEYQQTFKSASQKLLSNINEQFNLKIINQQLYHDSFNQKIYWK
NLISQKDDKLFNDLKDIFGSIEKQNYKDLTKKAYQQIDFSMPQSKIISILSQPLFDIREF
QEYIQIVQNLIYKTMDTFIKGYTSNIIIELILLIRNKSIQFEQYEAFNQFLLKFYEKFQN
DQFISEIVSSEINLISTENHQNSVILTQIEEEFLRQNLLQKEMSSLRVSSKNQENICQNQ
TSKMKKILVNSLKNNQNNDEEIYYSDESETNQARRQKENDNSLPQDNHENQQNFNTQQQK
KQNKQLVSFTQLSSYNSIYSESETSQHEDQIIQNNQDLNSSIEESGEEEQKQDLKRNKGN
FSKKLNLNDVNFKLCSDNKLLKETLINIDLTYRKPQVKNIPLESTPVQIFQKLWSDEIWK
LITDETNKYSKQSFDLNQYNLDSQSLKKQKICFFSQDQIKRFIICEILMGIQRLPSFSDY
FSSDPLLSGGLNRILGRENYQLLTRYLHISDNQSRMVHVDDHTKFKQFQSILNRNYQQFY
VPSNYLAIDEGIIPFKGKTKFKVYCPQKPVKFGIKEYLFCDYSGYTLNLIIHSPHEKQNI
RDIYQPQTLQTQDIVNELIKDYQPLSGSILIMDNYYNSLNLIHDLNQQNIGVLGTVRPDR
MNFTEEQKKMMKIQNFNKGETKSLTKDNIHIFLWRDKDKLVKMITNFLDNRKIVKSMKKT
GQIKTIPLMVDIYNKYAHSVDKRNQICQNYRIHKRSQKWWKCVFYRLLDTTLCNAYIIYK
ILNEGKKSLLTHKDFRIKIVEELIQSLNESTAQLTKSLSHNRGIIYSLIDINKVRKQGVQ
QEIIAHFLERQNQVGLCSLCKQATFFTCESCNYGNKKIALCPVNCHKEHMKKVYNLIDK
NT seq
3600 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatttaagagaagattcagtaacagattggaaggataattaaaatatagaattt
cttattaaattgaagaaccaaatttcgaaaaaaaatattcaatttctaacatcagaagaa
gctttatagatatcactcaggataaaacctaagcagattctctagagacctaaatataat
ggcacattttaaatcagaaatgaattaactgctgatgtagtagtttttactaaaacattg
gaaaagcatttattaaatttgaagacctattccaatataacagaatggaatccaagtact
taaagataaatggttgaataataaatataatattattaggtagatgatatattacttgaa
aatcctgtgtaggacatatctaaatactataaatatggaaattaacttgttaaaatgagt
gaattatttttgaattaaataaatctctttacactaaaggaaattaagttaattggatca
gtttaaaagtcgtcgataccaagataatcatttatgtctggctgtgatattttatttgct
aagcaagattcaaaacgatctagatatataattgcaagtttaataaaagcatgctttgaa
gaataaaggtatcttgtagctagatttgttctaaggtagaacagcattccaaagctagta
gttttgattccacatcttaaaaaaaactgtgagtatttttatatcatagaattgccaact
gtagaatctattagagattattcctttaacagtctaataagatctactccagaacaataa
aaacttatgagctaattgatagacgaattagatttagattaggatgaaaaaaactaaaat
taatttaagatcggatcacaaccaaatgagaccattgctaaaattaatgatctaatattg
atgagaggaatgaatgtgaatgaagaagaaattaataaaaagttatttacaaaagaatat
taacaaacatttaaatcagctagttaaaaacttctgagtaatattaatgaataatttaat
ttaaaaatcattaattagtaattgtatcatgatagttttaactaaaagatttattggaaa
aatttaataagttaaaaagatgataaattatttaatgatttaaaagatatatttggctca
atcgaaaaatagaattataaagatttaacaaaaaaagcatattaataaattgattttagt
atgccatagtcaaaaattatttcaattctatcttaacctctatttgatattagagaattt
taagaatatattcaaattgtgtaaaatttaatatacaaaactatggatacatttataaaa
ggatatactagtaatattattattgaactaattcttttaatcagaaataaatctatctag
tttgaataatatgaggcatttaattagtttttactcaaattttatgagaagtttcaaaat
gattaatttatttcagagattgttagtagtgagataaacttaatttcaacagaaaaccat
taaaattcagtcatattgacttaaatcgaagaggaatttttaagataaaatctcttataa
aaggaaatgtcatcactcagagtatcaagtaaaaattaagagaatatatgccaaaattaa
acttctaagatgaaaaaaattttagtgaatagcttaaaaaataatcaaaataatgatgaa
gagatatattattctgatgaatcagaaacaaatcaagcaagaaggcaaaaagaaaatgat
aattctcttccataggataatcatgaaaattaataaaattttaatacttaataataaaag
aaataaaataaataattagtttcattcacttaattaagcagctataattcaatttattca
gaatctgagacttcttagcatgaagattaaatcatttaaaataattaagatctaaattct
tctattgaagaatcaggagaagaagaataaaaataagacttaaaaagaaacaaaggaaat
ttttccaaaaagcttaatttaaatgatgttaattttaaactatgctcagataataaactt
ttaaaagaaactctcataaatatcgacctcacatatagaaaaccttaagtaaaaaatata
cctttagagtcaactccagtttaaatttttcaaaaattgtggtctgatgaaatttggaaa
ttaattacagatgagacaaataaatattctaaacaaagctttgatttaaattaatacaat
ttagacagttaaagtctaaaaaaataaaaaatttgcttttttagttaagactaaataaaa
agatttataatttgtgagattctaatgggaatataaagacttcccagctttagtgactat
tttagttcagacccattattgtctggaggtttgaacaggattttaggaagagaaaattat
taactgctgactagatatttgcatatttctgataattaaagtagaatggttcatgtagat
gatcatacaaaatttaaatagttttaatcgattttaaatcgaaactattaataattttat
gttccttcaaactatcttgcaatagatgagggcattataccatttaaaggaaaaacaaaa
tttaaagtgtattgtccctaaaagcctgttaaatttggaattaaagagtatttattttgt
gattacagtggttacactctcaacttaataattcattcacctcatgaaaaataaaatatc
agagacatttatcaaccctaaactctttaaactcaagacattgtaaatgagttgatcaaa
gactattagccactttctggaagtattttaatcatggataattattataattcattaaat
ttaatacatgatcttaactaacaaaatatcggagtcctaggaactgttaggccggataga
atgaattttactgaagaataaaaaaaaatgatgaaaatttaaaattttaacaaaggagag
acaaaatctttaactaaggataacattcatatattcctttggagagataaagataagctt
gttaaaatgattactaactttttagataatagaaaaattgtgaaaagtatgaaaaaaaca
ggctaaattaagactattcctttaatggttgatatttacaataaatatgcccactcggta
gacaagagaaactaaatatgctaaaattatagaatacacaaaagatcctaaaagtggtgg
aaatgtgttttttatcgtttattagatacaacactttgcaatgcttacataatttataag
atattaaatgaaggaaaaaagagcctcttaacacataaagactttagaattaaaatagta
gaagagttaattcaaagtttaaatgaatcaacagctcaactcactaaatctttatcccat
aatagaggtattatctactctctaatcgatataaataaagttagaaagtaaggtgtacaa
caagaaattatagctcattttctagaaaggtaaaactaagtcggattatgctcactttgc
aaacaagctactttttttacctgtgaatcatgtaattacggtaataaaaagattgcctta
tgccctgtgaattgtcataaagaacatatgaaaaaagtttataatcttatagataagtga
DBGET
integrated database retrieval system
