Tetrahymena thermophila: TTHERM_00052090
Help
Entry
TTHERM_00052090 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ERGIC_N
ACDH-11_C
Sigma_reg_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7827098
NCBI-ProteinID:
XP_001014905
TGD:
TTHERM_00052090
UniProt:
Q23CY1
LinkDB
All DBs
AA seq
828 aa
AA seq
DB search
MSSLIHKTIKQFDIFSKPFTFFVGNKKSKSTIVGGFLSLSVIAVAVIYFYYLMNLYFTNQ
VEPKITQSFQIQSSLSTIHIQDSFFIIEMLINGQPLKQYEKQVNQVYLNYTVLYEIYYPN
GTYITKVLQLSECTDSQFIGYQCIDQSAFEQSIDIFNNPIEQFSSDISIQINFCDPKITS
NCASPNDISNLIFQQQNYFQVFTKIKQYSQKLKNYQSSYKTEYFYFDPNLITYTRLDLIL
ATTTITEGLLLQKSSSDVNIYDYQRIDTFFSQINIQQRMGISGLGYLVYELNQMHNSIEI
QNAMITEILAQFMSILNTMLLVGFLARYLAESYIVEDINNILLQEYYKKTALKLVQKKEI
RNAFEKFGNGDAAAQSQFPSSYNILNRLYYTKDLSAEKQQSKILCEIQKRINETNFSEQQ
KQYFEMSFWERFKNFFQKILGFNQKLEIHKDPNSDPILYDNLLKQSMKRINIFEVYKDLI
KLKMAIKLILTKDQYAAIQYCGSELCPVQTQIQQQLKEIQSQRLINQIKSNDNKEMPAAL
AVNKLPNSNDINPQVQQQKAKISNIFLKQNILPIIQDRDISQQQQNQVTQKACQGIYKNQ
IIEIFPQTFQEQIKQSQVNDDQYQFKSSMISEIQQSIDVYKEEQQNIFETNDNLIRKQRD
QTTPTSILSSNQHHKIIIDKKDKIQCLRINGDQNELNQSDLSIEIPIQAQEDIDDLHLEN
KNLQTFLGLGCHLIEMDKIEENEEERENYLKQFFVKMNSSNDNQKNYIDQQIYQSLIINE
KQVKAINDYFDQQVVINRRISLHRKAQITNLIEELSNKNKQSNNLKMQ
NT seq
2487 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttccttgatacataaaacgataaaataatttgatatattttcaaaaccttttaca
ttctttgtaggaaataaaaaatctaaaagtactattgttggaggattcctttctttatct
gtaatagctgttgctgttatttatttctattatctgatgaatctttactttactaaccaa
gttgagccaaaaataacttaaagttttcaaattcaaagcagtttaagcacaatccatatt
taagatagtttcttcattatagaaatgcttatcaatggataacctttgaaataatatgaa
aaataagtgaattaagtttatttaaactatacagtactttacgaaatttattatcctaat
ggaacatatattactaaagtactttagctttcagaatgtactgattcatagtttataggg
tattaatgtattgattaaagcgcttttgaatagagcattgatatctttaacaaccctatt
gaacaattctcttctgatatttcaatttaaattaacttttgtgaccctaaaatcacaagt
aattgtgcttcacctaacgatataagcaatctaattttttagcaataaaattatttctaa
gtattcacaaaaataaagtaatatagctagaaattaaaaaactactaatcttcttacaaa
actgaatatttttactttgatccaaatttgataacttataccagattagacttaatatta
gctacaacaaccataaccgaaggattattgctttaaaaatcatcttctgatgttaacatt
tatgattattaaaggatagatacatttttttcatagataaatatataacaaagaatggga
attagtggattaggctatttagtttacgagctaaatcaaatgcataactctatagaaatt
taaaatgctatgataactgaaatcttagcttaatttatgagtatattgaatacaatgctt
ttagtaggttttttggcaagatatcttgctgagtcatacattgtagaagacataaataat
atcttgctttaagaatattataaaaaaactgctctaaaattagtttaaaaaaaggaaatt
agaaatgcctttgaaaagtttggtaatggcgatgcagcagcataatcgtaatttccctca
agctataatatattaaataggttgtattatactaaagatttatcagcagaaaagtagtag
tcaaaaattctttgtgaaatttagaagagaattaatgagaccaatttttctgagtagtaa
aagtagtattttgaaatgagtttttgggaaagatttaagaattttttttaaaaaatattg
ggttttaattagaagttagaaattcataaagatcctaattctgatcctattttgtatgat
aatctactaaaataatcaatgaaaagaatcaatatttttgaagtttacaaagatttgatt
aaattaaagatggcaattaaacttattctaaccaaagatcaatacgctgctatacaatac
tgtggatcagaattatgccctgtatagactcaaatttaatagtaattaaaagaaatataa
tcataaagattgataaattaaataaaatctaatgataataaagaaatgcctgcagcttta
gcagtaaataaattgcctaatagcaatgatatcaatccttaggtttagtaataaaaagca
aaaatatctaatatttttttaaaacaaaacatattaccaattatctaagatagagatatt
agttaataatagtaaaactaagttacttaaaaagcatgctaaggaatttataaaaattaa
ataatagaaatttttcctcaaacgttttaagaataaattaaataaagtcaagtcaatgat
gattaatattaattcaaaagtagcatgatttcagagatccagtaaagtatagatgtatat
aaagaggaatagtaaaatatctttgaaacaaatgataatttaataagaaaacaacgagat
taaacaactcctacctcaatattatcaagtaaccaacaccataaaattattattgataaa
aaggataaaatttaatgtctcaggataaatggggattagaatgagttaaattaatcagat
ctttccatagagatacctatttaagctcaagaagatatagatgatctacatttagaaaat
aaaaatttataaacattcctagggttaggttgtcatcttattgaaatggataaaattgaa
gaaaatgaagaggaaagggaaaattatctaaaataattctttgtaaaaatgaatagttct
aatgataattaaaaaaattatatagattaatagatttattagagtctaattattaatgaa
aagcaagtaaaagcaattaatgattattttgattagcaagttgttataaacaggagaatc
tctttacatagaaaagcttaaataactaatttgattgaagagctaagtaataagaataaa
taaagtaataatttaaaaatgtaatga
DBGET
integrated database retrieval system