Tetrahymena thermophila: TTHERM_000595489
Help
Entry
TTHERM_000595489 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF1983
Chlam_PMP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24439767
NCBI-ProteinID:
XP_012651883
UniProt:
W7XFH9
LinkDB
All DBs
AA seq
3065 aa
AA seq
DB search
MKLKDLLITHLILNRIFLSFGQQVDVSKCYQACQDCSNDKNFECLGCKYPFYFDQNSYKC
VQSCPSGTYENQKMECVSCASQFCLSCSPTECYQCQSGYSVNPQDKQGCISNCQDGQYLF
DGECVYECSIQSNSYSLDPSSNTCIYLQICPQLSYIPASQMVGKIQFFSTSISGDNSTLL
QIDEYGKFIVKSIPQLIPQAYYKIPQLAFITKCVKLVEESTQNNILSCMNTNTQVFTFYI
SSGLLLSQNVTFNQQIANAYYLDGMKITFLTQTGQIVQYNFQSQQFLVVDNSSDNLNQIL
SVQNYQQKNDQYILAINSKNTIYYYDQSFNKNILLQYSSKSTLQMINLNTQDMWAFYQNN
KIDFYSVIFGYAPSLIKSITSQTAIFSMLRSNQTLILIGGQNLTATQVFQISSNKQVTEI
TNTLPASLFNSDCFWNTKDFYFSQKQDLLYIFNFTSTNFALSFTLQLSQPLVCSLTSFDV
LKYNDKVYLLTVIKQDLQIQELTQSQLTSVNSSQIYFSSEQHANQYTQRLSNSIINNLFN
TATNNQILELNGNGIANQYDLESRQIAKQFYFWDDLYYQDQIAIKSYNFYCFLVVEEEEK
LILTGIRNGILTIRELNLYTFEILLENQFSNVDIQPSQINFFRQPFYIQSTKTLIVYINN
QEISELYAELRQLHVFHYSQINNQYDYKFSIRQIVNDVQFSLKTGDVICFLVLDVYLSQI
VIYNIYKDINIFSEYNSVLSYYLSPNLSYQIFSLSPYNTVQIVSTADNKILQVITIGAYL
PQYIRYDNKVFICSNTYTLSYYDGDTNTLILYQNQYYGQNIYAFLHKQNQIIFINTNIYL
TISLDDPNLQLQLVASNTRYYPFKFNDIQIPITLNNHQVQQIVDVKQIFCYQYQSADYLN
NLFFLHIVNLYELDIQLNIYTNLIRVIKQQKWVTDIVIDLLQPHQLVVENYKYYLQYDKK
GFYFLNQNYMVIIIGYHIAFVSSSNFKILFHYVSQLPQLNLAYDVELGYMAFIENLQDCI
IDLNDISKNCISNNYPFSIGNFYGTIIQRQKQLIIFYSQYSLRVYSLKEQIYKFVKYSRD
FLPYSIYYNDLCSTIIIGDKQTQRFKIFNLDTLKLLDTSFPPFSTQTFENLYQFYFFSDQ
IQVILFSSYSNSIVIYNINTYESLKTIQLQYQFNQQSQVVVDENLDLIIFIDNQNQIEII
SYDTNQVVKIFQLDKQQNDSNAYQKMLVWDHYKRKLFASSNNIFYIFDYDTNIFICKYQF
QLPIFDIYISFNKNYIFVTDYLNLKVFDYSILEFNFNSLLPQNLTPNILKIDENQYILFE
NSQSTLKNIVNGEVKDVKYFNQLNPSYFYFNFYNKNNSQIYVIIFNQLLIYKVTSTRIRP
IFSQLLDSQIITFISDSDFQVLFLTQKQSLYYLQKNQTNPQLLILTYISTGVGQFFMIDD
SFLIYSSTKNTSQWNKIMFQNSSSLSTQIKLDQFQFKIQQNDIVKKIVRIDNTQNIIILT
NQCIQIIDIQTGNILQISQLDHQDMQSQICFDPLYQRIYYVDRIEGLKVYDVNMNTIKQN
LPSSGIKLKIEGSFIFMLSFNSVSIYLRKDLKFFQVIRNFNSTQSLIDIEYTGFNNIFVL
YFDNSISFFNANPFTQPKQIDFLQVQNYKVLQSQVQSQNSQYLIIDMMIITIENTIKYTA
QLNIGSISNNICSAQLQIQTEQNDIITKNQQSDYLNLLSLKQLLIQSIIYNMYINNGEQT
DLKYPFVSSSSVTTQYSLNIQAINNNSIYLKTQNSTDQNIVDLQLQNLKISFKNLNNTQF
KFGNQTFQKLERLFLNYIELSDFGNNQLTFEGINHLFIQNLVINGEQIQQIKTQIILFQN
IDIIIIQNITFINCQFNNIINLLTFVKINKLTINNFNIILNSLNSNFQQSSMINISYIKL
LTINNTNLLQNIFQNVQLFKITNVTSISFSNMISNQNKIITNQNVALQGIIFQFEAIPQI
DFQKIKFTTLKLTSLSSISLLKLSNINETLLFNDFQFENFKLENNYNSSISSQQLFILEC
EGIINSNFSNIQIINSDMIGFINLQDLNNKNGIIIQNQISTYSNYYHSLSKTNQLMLLNA
QQLTISNSNFSSISSINSNSNFIEIQVSQNVLLDTIQIQSAELKQNSFIYIFQTTSVVIQ
NVDSNNIETNSIASVFYLYQISRLIMKNNTFISNKSYLDGGAIYLNLITEIILSDNTFKQ
NQSKTGNGGAIYCFSSIFSQFEGNTFFKNSCPQGSGGALLLNNCDIQDMTQNTFQQNSAL
IGGAFRYQGIQPYVLQKTNVSRRILTLNLNSFIKNFAQLYGKNIGSYPIYLDVKNQIKND
SNTQNFKLENLQSGSTSSPILMRLIDEEMREVSFFKNTTQINQEILIEFGSYLLEFQSQE
VGLDGNLRQNYNFDQFGFLFNVSYSYQPNANSSIIVKTISPIFILNTTTFKFDYQELSIP
ISVNFRKCQQGEIQQTFQKYKICYTCQQGNYCLQDPSQFENLQCLKCPIGSKNCHSNVIQ
LQNGYWSKDENSDQVYQCINPENCIPEDPSNKFGCSLGHVGAICESCDSQGVIWGSKYGK
SNGGIQCQECVKQNTIDSILFLILLLIIFCGYLIFQIQRQLILIQIKMSWFYLRKLKLIL
LNNQNISSSSSYIKILINYLQFIALINNFGIQTQQFLSVVEIGGGDPVQHTVYNLDCIFN
NNDFQIPLYAIRVLFINFQIIVIYLLIQLVKLLTNIFKIDDRSFQISSFILIYLFFSSSI
IKVLIQSSSCREIAGNLYIISEMQYECYTQQHTQILLYLIGPLLLIWFIIIPTSFSIYLY
SKRQKLQSLFYLNKYGLLYQEYKEKSYYWDLARNQIRTSLVIFLNLIRTSPILKAMLLQF
LMQIYHRILIIVSPYQRQQLNNIDQLSCKLVIMSIFIIQMILVTDNTSFILLQQSILIII
NVSFIGILLLIIVQRPVPYSIIDQNMLQKFQIFLSKLIPNSIYKLAYQKQINLLRINSLW
KTVKRNLREVIAIEANFKNQKWAQQQKLHQKDSLFKIRNSTISKLQKSIFQQQAQENSNL
EKDQQ
NT seq
9198 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagttgaaagatttgttaattacccatttaatactaaatagaattttcctttctttt
ggccagtaagttgatgttagtaaatgttactaagcatgctaagattgctctaacgataaa
aattttgagtgccttggatgtaaatacccattttattttgatcagaatagttataagtgt
gtctaatcttgcccaagtggaacatatgaaaactaaaaaatggaatgtgtttcctgcgct
tcttaattttgcttaagctgctcacctactgaatgctattaatgctaatctggatactct
gttaatccataagataaataaggatgcatttcgaattgctaagatggataatatttgttt
gatggagagtgtgtatatgaatgcagcatttaatctaatagttattccttagatccatct
tctaatacatgcatttatctataaatctgcccttagttatcttatattcctgcatcttaa
atggttggtaaaatataattctttagcacttctatcagtggagataatagcactctgctt
tagattgatgaatatggcaaatttattgtcaagtcaattccttagctcatacctcaagct
tattataaaattccataattagcatttatcacaaaatgtgttaagctagtagaagaatca
acacaaaacaatatattatcttgcatgaatactaatacctaagtttttactttctatatc
tcatctggtctactcttatcataaaatgttacatttaattaataaatagcaaatgcgtat
tatttagatggaatgaaaataacttttttgacttaaacaggataaatagtctaatacaac
ttccaatcttagtaatttttggttgttgataactcgtcagataatctaaattaaatactt
agcgtttaaaattatcagcaaaaaaatgatcaatatattcttgctatcaactccaaaaat
acaatttactattatgattaatcatttaataaaaatatacttttatagtattcgtctaag
agcactctttaaatgataaatttaaatactcaagatatgtgggcgttctactaaaataat
aaaatagatttttattcagtaatatttggttatgctccttcattaatcaaatcaattact
tcataaactgccatcttttcaatgttgagatctaactaaactttgattctaattggtggt
caaaatttaacagctacttaagtattctaaattagctcaaataagtaagtcactgaaata
acgaacacattaccagctagtctctttaattctgactgcttttggaatacaaaagatttc
tatttctcttaaaaacaagatctactttacattttcaactttacgtcaactaattttgct
ctttcttttactttacaattgtcttaacctttagtttgctcactaacttcctttgatgtt
ttgaaatataatgataaagtttatttgttaactgtaataaaataagatttgtaaatttaa
gagctcacttaaagccaattaacctctgtaaattctagttaaatatatttctcatctgaa
tagcatgccaattaatatacttaaagattatcaaattcgataataaataatttgtttaat
actgctacaaataattagattttagaattaaatggaaatggcattgctaattaatatgat
ttagagtcaagatagattgctaaataattctatttttgggatgatttatattatcaagat
taaatcgccattaaaagttataatttttactgtttcttagttgtagaagaagaagaaaag
ctaatacttactggaataagaaatgggattttaactataagagaattgaatttatatact
tttgaaatacttttagaaaactaatttagtaatgtagacatctaaccaagttaaataaat
ttttttagacaaccattctatatccaaagtacaaaaaccttgatagtttatattaataat
taagaaattagtgaactttatgcagaattaagacagcttcatgtttttcattacagctaa
ataaataactaatacgactacaaattctcaataagataaatagtaaacgatgtttaattt
tcattgaaaacaggtgatgtgatttgtttcctagttttggatgtttacctcagttaaata
gtgatctataatatttacaaagatatcaatatatttagtgaatataatagcgttttatct
tattatttatctccaaatttaagctattagatatttagcttaagtccttataatacagtt
taaattgtatctactgcagataataaaatactctaagtaataactattggtgcatacctt
ccatagtatattagatatgacaacaaagtattcatttgtagtaatacttacactttatct
tactatgacggagatacaaacacgcttatactataccaaaactaatattatggataaaat
atttatgcctttttacataaataaaattagataatattcataaataccaacatctatctc
acaattagtttagatgatccaaatctttaattatagttggtagcatcaaatactagatat
tatccatttaaatttaacgatatttaaatcccaataactcttaataatcattaggtacaa
taaatagttgatgttaaataaatattttgctattaatattaaagtgcagattatttaaat
aatttatttttcttacatattgttaatttatatgagttagacatatagcttaatatatat
acaaatttgataagagtgataaaatagcaaaagtgggttacagatattgttattgattta
ctacaaccacattagctagtagttgaaaattacaaatactatctatagtatgataaaaaa
ggattttattttctcaattaaaactatatggtaataattattggatatcatattgctttc
gttagctcatctaactttaaaattctttttcattacgtatcttaattaccataattgaat
cttgcttatgatgtagaattaggatatatggcctttatagaaaacttataagattgcata
atcgatttaaacgatatttctaaaaattgcatatctaataattatccatttagcattggt
aatttttatggaactattatttaaagacaaaaatagttgatcatcttttatagttaatat
agtttaagagtgtactctttaaaagaataaatttataagtttgtaaaatattcaagagac
tttttaccttattctatatattataacgatttatgtagcactatcattattggagataaa
taaacataaagatttaagatatttaatttagatacacttaaattattggatacatcgttc
ccaccatttagtacttaaacttttgaaaatttgtatcagttttattttttctctgatcaa
atacaagtgatactattttcttcatacagtaattctatagtaatctataacataaatact
tatgagagcctgaaaacaatctaattatagtactaatttaattaacaaagtcaagtagtt
gttgatgaaaatcttgatttgattatattcattgataattaaaattaaattgagattatt
tcttacgataccaactaagttgttaaaatattttaattagataagtaatagaatgactca
aatgcttactagaaaatgttggtttgggatcattataagagaaagctttttgcaagctca
aataacatattttatatctttgattatgatactaacatttttatttgcaaatactaattt
tagcttccaatttttgatatttatattagctttaataaaaattatatatttgttacagac
tatttgaatttaaaagtttttgattactctatcctagagtttaattttaattcattgttg
ccttaaaatttaactccaaatatattaaagatagatgaaaaccaatatattttatttgaa
aactctcaatcaactcttaaaaatatagttaatggtgaagtaaaggatgttaaatacttt
aatcaactaaatccttcatacttttacttcaatttttacaataaaaataactcctaaatt
tatgtaataatatttaattagctcttaatctataaagtaacttcaaccagaataagaccg
atattttcttaattgcttgattcttaaataataactttcatcagtgattcagatttccaa
gttctttttcttactcaaaaatagtctttatattatctttaaaagaatcaaactaatcca
tagctcttgattctaacctatatctcaacaggagtaggccaattttttatgattgatgat
tcgtttttaatatactcctcaaccaaaaatacaagctaatggaataagataatgttttaa
aactcctcatctctttctacttaaataaaactagattaattttaatttaaaatataataa
aatgatattgtaaaaaaaattgttagaatagacaatacttagaatatcataatattgacc
aatcaatgtatacaaataatagatatttagacaggaaatattttataaatctctcaatta
gatcactaagacatgcaatcttaaatctgctttgatcctctttattaaaggatttactat
gtagatagaattgaaggattaaaagtatatgatgtaaacatgaacactattaagtagaat
ttaccatcatcaggtataaaattaaaaattgaaggctctttcatattcatgctttcattt
aactctgtaagtatatatttaagaaaagacctcaaatttttttaagtaattagaaatttt
aacagcacttaatcactaatagatattgagtacactggatttaacaatatattcgtttta
tattttgacaattcaattagtttctttaatgctaaccccttcacttagcctaagcaaatt
gatttcttataagtataaaattataaggttttataatcataagtataatcacagaattct
tagtatttaatcattgatatgatgattataactatagaaaatactatcaaatacactgct
tagctaaatattggctctatttcaaataatatttgttctgcctaattataaatacaaaca
gaataaaatgatataataacaaaaaatcaataaagtgattatttgaatttattatcacta
aaataactcttaatttagagcattatttataatatgtacataaataatggcgaataaact
gatctaaagtatccttttgttagctctagctctgtgacaacctaatactcgctgaatatt
taagcaataaacaataatagtatttatctaaaaactcaaaacagcacagattaaaatatt
gtagacctccaactctaaaatttaaaaatttcatttaaaaacttaaataatactcaattc
aagtttggaaatcaaacattttaaaaattagaaagactatttttaaattacatagaatta
tcagactttggaaataatcaactaacatttgaaggtatcaatcatctttttatctaaaat
ttagtgattaatggagaataaattcaacaaattaaaacgtagattattcttttctaaaat
attgatataattataatacagaacataacttttatcaattgttaatttaataatatcatt
aatctacttacatttgttaagataaacaaattaaccattaataacttcaacatcatactt
aatagtttaaattcaaacttttagcaaagctctatgataaatatttcatatatcaaatta
ctcacaataaataatactaatcttttacagaatatattttagaatgtttaactattcaaa
ataactaatgttacttcaattagctttagcaacatgatatcaaattaaaataaaataata
acaaattaaaatgtagctctacaaggaattattttctaatttgaagcaattccgtaaata
gatttccaaaaaatcaaatttactacacttaaacttacctcactctcatccatttcttta
ctaaaattatctaatataaatgaaactttactatttaatgatttttaattcgaaaacttt
aaattagaaaacaattataatagctcaattagtagctaataactttttattttagaatgc
gagggaataattaattctaatttctcaaatatccagataataaattcagatatgatagga
tttattaatttacaggacttaaataataaaaacggaattattatttaaaattaaatatca
acctactccaactattatcattctctttcaaaaacaaatcaactaatgttacttaatgct
taataattaactatatcaaattctaatttttcatctatctctagcattaattccaattct
aactttattgaaatttaagtaagctaaaatgttcttttagatacaatttaaatttaaagt
gctgaacttaagtaaaatagttttatttatattttctaaaccacttcagtagttatctag
aatgttgattcaaataatatagaaacaaatagcatagcaagtgttttttatttgtattaa
atttctaggttaataatgaaaaataacacttttatctcaaataaatcttaccttgatgga
ggagctatatatttaaacttaataacagaaataatcttatcagataacacttttaagtaa
aaccaatcaaaaacaggaaatgggggagctatttactgctttagtagcatattttcttag
tttgagggcaatactttctttaaaaattcttgtccataaggctctggtggagcattattg
ttgaacaattgtgatatttaagacatgacataaaatactttctaataaaactctgctctg
ataggaggtgcatttagatattaaggcatatagccttatgttttataaaaaacaaatgtc
agtagaaggatacttaccttaaatttaaactcttttattaaaaattttgcataattatat
ggaaaaaatataggttcctatcctatttatttggatgttaaaaattaaataaaaaatgac
tcaaatacctaaaattttaaattagaaaacctataaagtggtagcacatcttcaccaata
ttaatgagattaattgatgaagaaatgagggaagtaagtttttttaaaaatacaacttag
ataaattaagagattctgattgaatttggtagctatttacttgaattctagagttaagaa
gttgggcttgatggtaatctcagatagaattacaattttgattaatttggtttccttttt
aatgtgtcctattcttattaacctaacgctaactcttctattatagttaaaacaattagc
cctatctttattttaaataccacaacttttaaattcgactatcaagagctaagtattcct
attagtgttaactttaggaagtgttagtaaggagaaatttaacaaactttttagaaatat
aaaatatgttatacttgctaataaggaaattattgcttacaagatccaagttagtttgaa
aatttataatgtctcaaatgtcctataggttctaaaaattgccattcaaatgtcatacag
ttataaaatggatactggagtaaggacgaaaattcagactaagtatattaatgtattaat
ccagaaaattgtatccctgaagatccttcaaataaatttggatgctcactggggcatgta
ggagctatttgtgaatcttgtgattcttaaggagttatttggggttcaaaatatggaaaa
agtaatggtggaatttagtgctaagaatgcgttaagcaaaatacaattgactctatttta
tttctaattttattattaattatattttgcggatatttaatattttaaatttaaagatag
ttgatattaatataaattaaaatgagttggttttatttgagaaagcttaaattaatttta
ctaaataatcaaaacattagtagttcttcttcctacattaaaattcttattaactattta
tagtttattgcgttaataaataactttggtatttagacttaataatttctctctgttgtt
gaaattggaggtggtgatccagtatagcatacagtttataatttagattgtatatttaat
aataatgatttctaaattccattgtatgctattagagtattatttatcaatttttaaata
attgttatatatttgctgatccaactagtaaagctcctcacaaacatctttaagatagat
gaccgctcattttagatttcttctttcatactaatatacttattctttagttcttcaata
attaaagtattgatatagtcttcatcttgtagagaaatagcaggaaatctatatattatt
tctgaaatgcagtatgaatgctatacttaataacacacttaaatcctactatatttaata
ggaccattacttttaatatggttcataataatcccaacatcattttctatttatttgtac
agtaaaagataaaaattacaaagcttgttttatctgaataaatacggtcttttgtactaa
gaatataaagaaaagtcttattattgggatttagctagaaatcaaataagaacatctcta
gttatatttctaaatttaattaggacttcaccgatactaaaagctatgcttttataattt
ttgatgtaaatttaccatagaattttgatcatagtaagtccttattaaagatagtaatta
aataatattgattaactatcttgcaaattagttataatgagtattttcataatataaatg
atattagttacagataatacttcatttatactactataataaagcattttaataattatc
aatgtaagtttcataggaatattgctcttaataatagtataaaggcctgttccttacagt
ataattgaccaaaatatgctttaaaaattctaaatttttctatccaaattaattcctaat
tctatttacaaacttgcatattaaaaatagataaatttattaagaataaattctctatgg
aaaacagtcaaaaggaatttaagagaggtgattgcaatagaagcaaattttaagaactaa
aaatgggcttagcaataaaaactgcattagaaagatagtttatttaaaattagaaattca
acaattagcaaactgcaaaaaagtattttctaatagtaagcgcaagaaaattctaattta
gagaaagaccaataatga
DBGET
integrated database retrieval system