Tetrahymena thermophila: TTHERM_000654079
Help
Entry
TTHERM_000654079 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
24440048
NCBI-ProteinID:
XP_012652643
TGD:
TTHERM_000654079
UniProt:
W7XBV8
LinkDB
All DBs
AA seq
3075 aa
AA seq
DB search
MSQIQSITCLSLDLFESSSCFQIQNLGGNQVSITSIVYIDGTTLISVSDSQGYSYFYDIF
NGGIYLTTTTANAPILGQIFYPNFIRATLTQKKLSIVDLIQKQEILGIQNKGQNTMFLSL
ISADLSRTKQEQLQRGSQSSSSLIIINNKITQTIQIKPSSLDNNFYPPSDNYDYLIQVQG
LSAQQQGIFGALSQNSINQYQIIEDYQVNPNQNFSQIIHGGRASLIIALNSGFYSSIYSY
LINLSILNQQKPLDYVSPIVLPASVNAFQLMNSTNYLLISYGAATNFQQVQVQLQAFAQT
LKQGQGQGQGQKGGGVGGGSIVTQVSSPLPLYQNSLCVYDFGKVTNLAGSSYGVDTLSVL
STPIVCKDMGTNNILSIQNIYMDNKNYVIFSLESQSIIIFENNDLINSKFSISIANMINV
SQQNNGSILIMLLIPNTSVLIIGTSQGLVASYDIQDPNLISQSTQQQSQNKQISPLFSKI
GIGLNGQTIGDLLFDNVSQTLIGISKQGQQGQQNNQTYFFQYNLTSQQRVLNLTQNYGQQ
NQTTVEQTVVFSTPPSFLTLTSVTNQYYLNPTIGQNCPSQIPTPAPNITSVKILSLNTQT
KTFNLDVQKDNLNPLLIPGMLSYTSELNNQYAVILLVTQPFKFSQYCISNQKLSRLLLIE
NEQQYFTPSVHSHKQNRILQSTIQISLNLYIIDSKGVSVFKTNSNFYQLSSIINAPLQFV
KDSVQNMFVVFQSSIMIIKPALNTPSSIQNTTITLQQISALTQVADIVQIQKVTIINPLN
QMFIQLSMSDGSLITFLISYSQIWFQNKNLDLQLALLFTVNSSSNPTVKSLLTYNNIYYM
QSQNILVVQYNNNIDYLQYNMNSQSLNQFLTLYNISDSNSRFISTSSDNSLYQIMSDGQV
IKIYAPQCYNQSCFNTTCSIKTMLNTLPANNLQDILQNTTSNVLIRQEQIYNQVLYYSNI
INYISNIEIKRYFYFGSGSVYNIKYIHYEQIASQQYLIQNNITLRLNIHTFNISLQSNTS
GSYQNLPPTTIYGDSPNLFDNYFQVSFKNILWKVNFDNYQDPTKPLFQIANNICVFERFS
VLTYSTLNTKNINDNFIQFLILQGSAAYFRNITIQNKNYNGANYYIQVPSTAFSLTLENI
TVQNCKFESTVFVSASNQLSLNATNIQFQNNQITLSQNNPQLSTFISAQSITLQGFQFQQ
NAIQSVMLFGKTDQSQFFVANISNSSITQNAFFIYEYSINTLILQVEFLQTILSSTYVNL
TQITIQQNQVFQNNYDQSTFNQYLQVVNNNQGQGQKPPFNQINDTNTFISTAVQQQYFFF
QTKYIQQVFIQNANISDNINIGFYQSSFLNLFQADTLSYKNTWLNQSQPNSACIKITEYN
NLQFSLTKSTLENLYIQNDYLIYLKTSQLLSSNQQQVSQFTIDGLSIKNIKVATLIEYNQ
ASIIFFNSLQNTQISLNNLNVANILLKTPLNVFNDMASTLSLLAPFSQASLTNSQFLNFY
TQSKKEVLYMNVQNLKMDTNHFENNQFQTNAPLLGTNGGFMLIQSQNLNMTNNSFYRGTS
YNGAAISLIPSTSNSNFTFKSCSFSNMISQQYGGAVYINNPPANTTFSFIQCQFTSLLAS
EGGSIYSYYFIDKGLNNNSSQIPNIIIYSLTINQTFASNQGSFFSFYNMNVSLSDVLLDI
NNPQKQINIQQLSLFQQLSQFQSIGSLFSVINSIFTLTNSQLNQILTKSNQQQSSIINLQ
QQSQGYMKNVNITQGSFSNGGALLVDTQSQIEIDFVNISQLSYQQSNSLRQIQQTNTSSV
QLTYSQYQQQTLSTFIIRGSSQFKIYQLTMNQNQCSNLFCVGGALSLIQSTGQMDQSNFI
DNISTNNGGAVSIINEISQINITSSLFQNNTSKQEGGGLFVYQNVDLIQTNQKILIYKSR
FLNNNATLGGGIYLNSFSLSNNIQATNWIQISNSVIMNNSASFLGGGIQYTGFDPQISSS
TRISSNTAGQKYGSNLFSRPFKLRFNQNLTQQSNKNNIKYQIKYDQNLGIERLQIKQQVS
GGQLPDLIFELIDENNQIIDGSYQQIINSQIYALVQPYGNINNQNAFQISSSYQKIIFSD
YFNLTDLTITGVPNSYISIQLSSPFINNPNYPENNYYYIIDIHLRECIKGEVYKKGQVIY
HDQIFQIYQCSVCPKGQYSLIHPDMKEPIFECQKCVQNSDCLGGDVINVNEGFWRENNQT
DQILDCINKQSNCLGGTQNFTCNVGHIGPLCESCDIQNGYSRQGDFQCSKCGDIVNNTFK
VLGLVVLYIICAKLSVDGVLQRIMFIIKRKDQIQQETGTNQLFIKKTIKREEANASILLK
LIINYFQVIMVITTFQINVPNVFNSSINVIANPTIQVLYSFECFFHQISVKTGINIIYIQ
FAASTCLPICCALVFIITGLIKYRKNLFLKRFYISTSLIYCLMYFQPSLYKDAISILSCR
QIGNNRYIQYNVLYTCYTDEHIQWSLSLILPILLIITLIIPGFMMYKVYKSKDSILQRKN
YMFIIGEYEMNDKRKVWYWEFIKMYMKLIIMSILIIYEYSIPNKILFTLLVVALYGFFLV
KVHPYSEQLYNKIDIYSTFVLTASIYLAFITYENKDNYYWSLCSIIIIGIINTAFLIWCF
KKLAYAYIPIVQKTYFQFKFLCFKLSPFQCFYTKKTARIYKFQRVVTLVLNELKKRNIIN
AWTGKIKVPLENIIDLIVQGREQMKNGSKLNINSSIKIRSQNYVVSNNEINLFSKNQINN
EDQIQKHEKVDKQIKFPKIQESVNLEFPSENIIAFQNQNYSTSQMAAQQIPQSFFQNESA
KAYINRLKSTSIIQDFGTNRNLLLELAPLSSRFEDNFGTYKNQQSPLMSTISNINDNLTN
LKLLSHKEILSPKDQTNIDSMQIQKDEILEPNKNQIILETPKESENDTTDSQIPIEHLNK
ANENNNLHLQKLSRSLIFQEIQSDIQKKSNVINQNIIQSQINEDIKYHTENDDNLKSNNN
YLRIQNYNKKVQHLKQSRNIVNEDSKIKEQNNNQVQNQKLEDSKNYLNFYQENLIVSNKS
NYYCKSQKEKQQLNS
NT seq
9228 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcctaaatttaaagcattacatgcttgagtttagatttattcgagtcgtcttcttgc
ttctaaatataaaatttaggaggaaattaagtttctataacaagcattgtatacatagat
ggtaccactttaattagtgttagtgattctcaagggtatagttacttttacgatattttt
aatggaggtatttatctgaccacaacaactgctaatgcgcctatccttggataaattttt
tatccaaattttatcagagcaaccttaacttaaaaaaagctttctattgtagatttaatt
tagaaataagagattttaggaatacagaataaaggataaaatacaatgtttctgtcatta
attagtgctgatttaagtagaactaaataagaataattataaagaggatcataaagttct
tcttcattaattattataaataataaaattacatagacaatacaaataaaaccttcttct
ctagataataatttctatcctccttcagataattatgactatttaatttaagtacaaggt
ctttcagcataataacaaggaatttttggagcactttcttagaattctattaattaatat
taaattattgaagattattaagtcaatcccaattaaaatttctctcagatcatacatgga
ggaagggcatcattaattatagctcttaattctggtttttactctagcatatattcttat
ctaatcaatttatccatattgaattaacaaaagcccttagattatgtatccccaatagtt
ttacctgcatctgtaaacgcattttaattaatgaattccactaactatcttttaatttca
tatggagcagctactaatttttagtaggtttaagtataattataagcatttgcataaaca
ttaaaataaggttaaggttaaggataaggttaaaaaggaggaggagtaggtggcggtagt
atagtaacttaagttagttctccattacctttgtattaaaatagtttatgtgtttatgat
tttggaaaagtcacaaatttggcaggatcgagctatggagttgatacattatctgtttta
agtactccaatagtttgtaaagatatgggtacaaacaatatactgagcatataaaatatc
tatatggataataaaaattatgtgattttctctttagaatcctaatctataattattttt
gaaaataatgatttgattaattcaaaattttcaatttcaattgctaatatgattaatgtt
tcttaataaaataatggtagtatcttgattatgctattaattcctaatacatctgtttta
ataattggcacatcataaggattagttgcatcttatgatatttaagatcctaacttgatt
tcccaatctacttaacagcaatcttaaaataaataaatctcacctctttttagtaaaatt
ggaatagggctgaatggataaactataggagatttgttgtttgataatgtttcgtaaact
ttaataggtatatccaaacaaggctagtaaggataataaaataaccaaacatattttttt
tagtataatttaactagttaataaagagttttaaatttaactcaaaattatggttaataa
aattaaacgactgtagaataaacagttgtgttttctacacctcctagttttttaacttta
accagtgttacaaattaatattatctaaacccaaccatcggataaaactgtccttcacaa
atccctactcctgctccaaatattacatctgtcaaaatcttatctttaaatactcaaacc
aaaacatttaatttagatgtacaaaaagataatttaaaccctttacttattcctggaatg
ctttcttatacttctgaattgaataattaatatgcagtaatacttcttgtgacgcaacca
tttaaatttagctaatactgtatttcaaattaaaaattaagcagactactattaatagaa
aatgagtaataatattttactccttcagttcatagtcataaataaaatagaattctttaa
tctactatataaataagcttaaatttatacataatagactctaaaggagtatccgtgttt
aaaacaaatagcaatttttactagctctcttctattattaacgcacctctataatttgta
aaagattcagtataaaatatgtttgttgtattttagagctcaattatgataataaaacct
gctctcaatactccctctagcattcaaaatacgactataactttacaataaatttctgct
ttaacttaggtagcagatatagtttaaatataaaaagttacaataataaatccattaaat
caaatgtttatttaactaagtatgagcgatggttcattaataacatttttaatttcatat
agttagatttggttttaaaacaaaaatttagatctttaactagcattattattcactgta
aatagctcctcaaaccctacagttaaatctcttttgacatacaataatatttactatatg
caatcacaaaatatattagtagtataatataataataatatagattacttataatacaat
atgaattctcaatctttaaattagttccttactttatacaatatttctgatagtaattct
agatttatttcaacttcttcagataattcactttactaaataatgtcagatggttaagtt
ataaagatatatgctccttaatgctacaattaaagctgttttaatacaacctgctcaata
aaaactatgcttaacaccttacctgcaaataatttgtaagatattttgcaaaataccaca
tcaaatgtattaattagacaagaataaatatacaactaagtgctttactactcaaatatt
attaattatatatcaaacatagaaataaaaagatatttttattttggaagtggcagtgtt
tacaatattaaatatattcattatgaataaatagcctcctaataatacttaatataaaac
aacataacattaagactcaatattcacacttttaacatatctttacaatctaacacttca
ggatcttactaaaatttacctcctactactatttatggtgattctccaaatttatttgat
aattattttcaagtttcttttaaaaatattttatggaaggtaaattttgataattattaa
gatcctactaaaccactattctaaatagcaaataatatatgtgtttttgaaagatttagc
gttttgacatactccacattaaatacaaaaaatattaatgacaatttcatttaattcttg
attttataaggttctgcagcctattttagaaatataactatctaaaataagaattacaat
ggagctaattattatatacaggtcccttcaactgcttttagtctcacacttgaaaacata
actgtttaaaattgcaaatttgaatcaactgtttttgtttctgcctcaaattaattaagt
ttaaatgctacaaatatttaattttaaaataattagatcactttatctcaaaataatcca
taattgagtactttcatcagtgcataaagtattactctttaaggattttaattttaataa
aatgcaatttaatcagtaatgctttttggtaaaactgactagtcttagttttttgttgca
aacataagcaatagctcaattacataaaacgcattttttatttatgagtatagtattaat
accttgatattataggttgagtttttgcaaaccattctgagttctacttatgttaatctt
acataaattacaattcaataaaatcaagtattttaaaataattatgattaatctactttt
aattaatatctttaagtcgtgaataataatcaaggtcaaggttaaaaaccacctttcaat
tagattaatgatacgaatacttttattagcactgctgtacagcaacaatactttttcttt
taaactaaatacatctaataagtattcattcaaaatgcaaatatctcagataatatcaat
atagggttttattagagttctttcctaaacttgttttaagctgacactttaagctataaa
aatacctggttaaattaatcataacctaattctgcatgcataaaaattacagaatacaat
aatttatagttttcattaactaaatctacattagaaaatttatatatttaaaatgattat
ctaatttatctaaagacttcttaacttctatcatcaaattaataataagtttctcagttt
acaattgatggactgagtataaagaacattaaagtagcaactcttatagagtataattag
gcttcaattatattttttaatagtttgtaaaatactcagatatctctgaataatttaaat
gtagcaaacatcttgttaaaaacacctttaaatgtttttaatgatatggcttctactttg
agcttgctggctcctttttcataagcatcattaactaattcataatttctgaatttctat
acttagagtaaaaaggaagtactatatatgaatgtttaaaatttaaaaatggacacgaat
cactttgaaaataattaattttaaacaaatgctcctttactaggaactaatggaggcttt
atgttaatttagtcttaaaatttaaatatgaccaataattctttttatagaggcacaagc
tacaatggagcagcgatatctctcattccatcaacatcaaactctaattttacttttaaa
agttgttcattttctaatatgataagttaataatatggtggagcagtttacataaataat
cctcctgcaaatacaactttttctttcatctaatgctaattcacatcattattagctagt
gaaggaggatcaatttactcttattattttatagataaaggattaaataataatagctca
taaatccctaatatcattatatattccctgactattaattaaacatttgctagcaattaa
ggtagttttttttcattctacaatatgaatgttagcttaagtgacgttttattagatata
aataacccttaaaagcaaattaatatttaatagttaagtttattctaacagttaagttaa
ttttaaagtattggaagcttattttcagttataaattcaatctttactttaactaattct
taattgaattaaatattaactaaatcaaaccaataataatcctctatcattaatttataa
taacaatcctaaggatatatgaaaaacgttaacattacgtaaggaagcttttctaatgga
ggagctttattagttgatacatagagctaaatcgaaatagattttgttaatataagctaa
ttgagctactaacaatcaaattcacttagataaatttagcagactaacacatctagtgtt
taacttacttatagttaatatcaataataaaccctaagtacttttataatacgaggatct
tcttagtttaaaatttattaattaactatgaactaaaactaatgtagtaacttattttgt
gttggaggtgctctatctctaatttaatctactggttaaatggattaatcaaattttata
gacaacatttctacgaacaacggaggagcagtatctataataaatgaaattagttaaatc
aatattactagctcactattttaaaacaatacatccaaataagaaggaggaggtcttttt
gtttatcagaatgttgatctaatttaaactaactagaaaattctaatatataaatcgcga
tttttaaataataatgccacgctaggtggtggcatatacttaaactcattttcgctaagc
aataatatataagcaactaactggatttaaatttcaaactcagtaatcatgaataattct
gctagttttctaggtggaggtatataatatacaggatttgatccacaaatatcttcctca
acaagaatatcttcgaacacagcaggttaaaaatatggtagcaacctgttttctagacct
tttaagctacgctttaattagaatttaacatagtaaagcaataaaaataatataaaatat
taaataaagtatgactagaatttaggaatagaaaggttataaatcaaatagtaggtgagt
ggtggttaacttcctgacttaattttcgaattaattgatgaaaataactagataattgat
ggttcatactaataaattataaattcttaaatttatgctttagttcagccttatggtaat
atcaataattaaaatgcattctaaatatctagcagttattaaaaaattattttttctgat
tacttcaatctgactgatttaactattacaggagttcctaattcatatataagcatttag
ttatcatcgccatttataaataatccaaattatccagaaaataattactattacataatt
gatattcatttaagagaatgcattaaaggagaagtgtataaaaaaggctaagtcatttat
catgatcagatattttaaatatatcaatgctcagtatgccctaaaggatagtattctcta
attcacccagatatgaaagaacccatatttgagtgtcaaaaatgtgtttaaaatagtgat
tgcttaggaggagatgtaataaacgttaatgaagggttttggagagagaataattaaaca
gattaaatattagattgtataaataagtaaagcaattgcttaggaggtacttaaaatttt
acatgtaatgttggtcatataggtcctctctgtgaatcttgtgatatataaaatggatac
tctcgttagggtgatttctaatgctcaaagtgtggagatattgtcaacaatacatttaaa
gtgttaggtttggttgttttatatattatatgcgctaagctaagtgttgatggagtacta
caaaggattatgtttatcatcaaaaggaaagattaaatataataagaaactggaactaat
caattgtttataaaaaaaactattaagagagaagaagcaaatgcatccattttgctcaaa
ctcattatcaattacttttaagttatcatggttataacaactttttagattaatgttcca
aatgtttttaatagttcaataaatgtgatagcaaatccaactattcaagttttatattct
tttgagtgttttttccactaaatttcagttaaaactggaataaatattatatatatacaa
tttgctgcttcaacgtgcttacctatttgctgtgcattagtttttattatcactggtttg
ataaaatacagaaaaaatttatttttaaaaagattttacatttctacttcattgatttac
tgcttgatgtatttctagccaagtctttataaagatgctattagtattttaagctgtcgc
cagataggaaacaataggtatatataatataatgtgttgtacacatgctatacggatgag
catatttaatggtcattatctttgatattgccaatattactgatcatcactctcataata
ccaggatttatgatgtataaagtttacaaatcaaaagactccatactttaaaggaaaaat
tatatgtttataattggagaatatgaaatgaatgataaaagaaaagtttggtactgggaa
tttataaaaatgtatatgaaacttataattatgtctattcttatcatatatgaatactct
atcccaaacaaaatcttatttactcttctagtagttgctctgtatggatttttcttggtt
aaagtccatccttattcagaatagctatataataagattgatatttattcaacttttgtg
ttaactgcttctatttacttagctttcattacttatgaaaataaagataattattattgg
tcactttgttcaataattattataggaataataaatacggcctttttaatttggtgtttt
aaaaagctagcttatgcttatattcctatagtttaaaagacatacttctaatttaagttc
ctttgtttcaaattatctccattttaatgtttttatactaaaaaaacagctagaatttat
aaatttcaaagggtagtaacgttagttttaaacgaactcaaaaaaagaaatataataaat
gcatggacaggaaaaattaaagttcctttagagaatatcatagatttgattgtttagggt
agagagtaaatgaaaaatggttcaaaattaaatataaatagttctataaaaattagaagc
taaaattatgttgtttctaataatgaaattaatttatttagtaaaaattaaataaataat
gaagattaaatataaaaacatgaaaaagtagataaataaataaaattccctaaaatacag
gaatctgttaaccttgaatttcctagcgaaaatattatagctttttaaaattaaaattat
tcaacaagctaaatggctgcttaataaattccttaaagctttttttaaaatgaaagtgct
aaagcatatataaataggttaaaaagcacttcaatcatttaagattttggcacaaataga
aatcttcttctcgaattagcacctctttcaagtcgttttgaagataattttggaacttat
aaaaattaataatcaccacttatgtctacaatatctaacataaatgataatttaacaaac
ttaaaattgttaagtcataaagaaattctatcccctaaagattaaaccaatattgatagt
atgtagatatagaaggatgaaattttggaacctaataaaaatcagattatattagaaact
ccgaaagagtctgaaaatgatacaacagatagctaaataccaatagaacatttaaataaa
gcaaatgaaaataataatttacacttataaaaactgagtagaagtttgatattccaagaa
atatagagtgatatttagaagaaaagtaatgttattaattagaatattatatagagctag
attaatgaagatataaaatatcatactgaaaatgatgataatttaaaatctaacaataat
tatttgagaatttaaaattataataaaaaagtataacacttaaagcagagtaggaatatt
gtaaatgaagatagtaaaatcaaagaataaaataataatcaagtttaaaactaaaaattg
gaagacagtaaaaattatctaaatttctattaagaaaatttgatcgtttctaataaaagt
aactattattgtaagtcataaaaagaaaagtaataattgaatagttga
DBGET
integrated database retrieval system