Tetrahymena thermophila: TTHERM_00075820
Help
Entry
TTHERM_00075820 CDS
T01020
Name
(RefSeq) endo-1,4-beta-xylanase xylA, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
7845822
NCBI-ProteinID:
XP_001015622
TGD:
TTHERM_00075820
UniProt:
Q23G83
LinkDB
All DBs
AA seq
1386 aa
AA seq
DB search
MNQQFDKIKNYEQKLQFTINKLEPQHRLPTENSINNASYMGGILKQSQNNNQNYIQFLES
ITPQSNKSNQFNRSFLVERQNTDQEQTRDNILPQINNPRSKSENKNGAQNNSSQQYLDQQ
KQTFYNNRQSSSKNQKRSHNYNFYAQPKNAVEVIITQNEFESTNSSNLWNELQMRKPNYR
YPNTTKYSQSNKITLQQSNGRQLQSRDLIRSLTIDNNNCNSSNSKSRNYLDDLQIYNNAV
NRLDTSSSQNFSQPLSKHMINIKNIVKNQSLTPISQSFNNNRFQELQINTNDNNGNYSNL
RLSNQCFSTPHKGYYKDMNSKMFLNKSYDYDLKIKPPLLHKTKTNEKNIQTELKEIEEQN
DQLSENIIKNENIQISLNRNHLKNISSSSNRYNKHNYNLSSPQMMLQQHSKQQQANIQQQ
YYERIVTDSEIQSNRSNQNNLSFHHTSFSKNQYLIDERKVVNIQVQNAEMDQYIRQIQKY
VFKKQHDIDNNSSLSFKRPNVIHPSDLAEHVFNNQMKINSSNQQLLNNLQQTDSNQDLRQ
TLIENDIHLEQPLIMQQHTFQQQNQDIKQLQVVDQNLYQMNPKQDIDFNQQDKNSLEQTE
TKNQNNLQLQKNYQDMKNKDQIQNIDQQNKNDEKLNNNQMNETLSRQYSFSACYNQNKSI
LPLSRNSEQVDQTPKLNSQEQLQIPSQKSSLDENSSQQNQQINQEDIDFFDKKRSAEFGI
NYNSNKGSKKQIKNSSHQQINSKNTQLELLQENTQQQINQSPKNNQNNNSSKGLLKNHQY
LTQTAQLSSQKSSNQTSYNSPQSYKIVNQQSSQSSYYQSSQISNQPNSQNSPNEQSYKSS
KELSQRNSEQYSPQDLSSQSQQDSNRLLSQGSNQFPSQNSNNFSPYNCSKTKLLENNQRL
DSQRVQQQQQHQESSHQSQNAFMKFNPDKRNQIIIAQEGNSKQISKRNSNSSSKSKQIQI
ETNSARNNQEELLQQKSNDKINLPIQMNQNQIQNGSIQINLDHNQISLQGASALESHQTA
SQQTSKKNSVSQQFYQGIFMNTLRKDPSFQNSDSNPNQYNQEETPYSSNQNTNRDQINEE
LHQQNIENAQFIQKRENNIDKIEQMSQINNQKQDMLLNQSQNGFQNHQFYEKERRKLKAQ
IQQQQKYKKQDKKSEAEEKTNQTETSNKYPNDSRYIQKQIFHKESLETQNARGQNRHIEF
LTTEAAHEDEQSQRKKRFNTVENEGRYLRTDSQDSSQWLRENIIVKNESPNINQANSTQK
SFKSKSKDSTLQSFYQSNMFNIINIGGSVEDPIKIVKKCNQFKKQGYIKLSYKETQFVNS
QKKSNQLTPKKKSINKVSISPTRNQDSNVTSIKTSPQSKIQSKTKLINSSEISFQSPNKF
HVSKQL
NT seq
4161 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattagcaattcgacaagataaagaattatgaacagaagctttaatttacgatcaat
aaattagagccgtagcatcgactgccaactgaaaattcaattaataatgccagctatatg
ggaggaatccttaagcagagttagaataacaaccaaaattatatttaatttttagaatcc
attacaccttaatcaaataaatctaattaattcaatagaagctttttggttgagagacaa
aacactgattaagaataaacgagagacaatattttaccttaaatcaataatccaaggtcg
aaaagcgaaaataaaaatggtgctcaaaataatagcagctaataatatttggactaataa
aaataaactttttacaacaatagatagtcatcttctaaaaattaaaagagaagtcacaat
tacaatttttatgcttaaccaaagaatgctgttgaagtcataattacgcagaatgaattt
gaatcaacaaactcttctaatttatggaatgaactacaaatgagaaagcctaattataga
tatccaaatacaactaaatactcataatctaacaaaattactctttagcaaagtaatggt
agataattacaaagcagagatctcattagatcattaactatagataacaataattgcaac
tcttcaaatagtaaatcaagaaattatttagatgatctttaaatctacaataacgcagtt
aatagattagatacatcttcatcataaaattttagccaacctctatcaaaacatatgata
aatataaaaaatatagtcaaaaatcaaagtttaacacctatttcacaatcattcaacaac
aatagattttaggaactttaaattaatacaaacgataataatggcaattactctaatcta
agattatctaactaatgtttttcaactcctcacaagggttactataaagatatgaattct
aaaatgtttttgaataaaagctatgactatgatttaaagataaaacctcctttgcttcat
aagactaaaactaatgaaaaaaacatttaaaccgagttaaaagaaatagaagaataaaat
gattaattaagtgaaaatattatcaaaaatgaaaatatttaaatttctctaaacagaaat
catttgaaaaacatatcaagctcatctaataggtataataagcataattacaatttatct
tcaccttaaatgatgctttaatagcatagtaaataacaataagcaaatatttagtaataa
tattatgagaggatagtaactgatagtgaaatttaatctaataggagcaattaaaataac
ttaagttttcatcacacttcattttctaaaaactaatacttgatagacgaaagaaaggtg
gtcaacatttaagtttaaaatgcagaaatggatcaatacatcagatagatataaaagtat
gtttttaagaagtagcacgatattgataacaacagcagcttgagttttaaaagaccaaac
gtaatacatccctctgatctagctgagcacgttttcaataattaaatgaaaatcaattca
tcgaactaataattgctgaataatttataataaactgactcaaactaagatttgagataa
actctcatagaaaatgacattcacttagaatagcctcttataatgtagcaacatacattt
taataataaaattaagatattaagtagcttcaagtggtagattagaatttatattaaatg
aatcctaaacaagatattgattttaattaataggataagaactctttagaacaaacagaa
acgaaaaaccaaaataatttataattataaaaaaattatcaagacatgaagaacaaagat
taaatataaaatattgattaataaaataaaaatgatgaaaaactgaataataattaaatg
aatgaaactctttcaagacaatatagtttttcagcttgttataattagaacaaaagtatt
cttcctttatcgagaaatagcgagtaggtagattaaactccaaaacttaattcataagaa
caattataaatcccatctcaaaaatcttctttggatgaaaacagcagtcaacaaaattaa
taaataaattaagaagatatagatttttttgacaaaaagcggtctgctgaatttggaata
aattataattcaaataaaggcagcaagaaataaataaagaacagttctcatcaataaata
aatagtaaaaacactcaactagaactactacaagaaaatactcaataataaataaattaa
agtcctaaaaacaattaaaataataattcatctaaaggattacttaaaaatcattaatat
ttaacatagacagcataactttcttcataaaaatcaagcaattaaacctcctataattcg
ccataatcttataaaatagtaaatcaataatcctcacaaagctcttattattaatcctct
taaatttctaattaacctaattcttaaaattcacctaatgaataatcttataaaagctca
aaagaactatcatagagaaactctgaataatattctccttaagacttaagtagttaatca
caataggattcgaatagattattatcttaaggatctaactaatttccttcttaaaattca
aataatttttctccttataattgttcaaagacaaaattgcttgaaaacaactaaagatta
gattcataaagggtttaatagcaatagtaacattaagagtcaagtcatcagagttaaaat
gcatttatgaagtttaatcctgataagagaaattaaattataatagcataagaaggaaat
tcaaagcaaataagcaaaagaaatagcaattcatcaagtaaatcaaaatagatttaaatt
gaaacaaactcagctaggaataattaagaggagcttttatagtaaaaaagtaatgataaa
attaatctacctattcaaatgaattagaatcaaatttaaaatggaagcatataaattaat
ttagaccataattaaatatctttacaaggtgcttcagctctcgagtctcattaaacagca
tcctaacaaacatcaaaaaagaatagtgtttcttaataattttatcaaggaatatttatg
aatactcttagaaaagacccgagtttttaaaacagtgatagtaatcctaattaatacaat
taagaagaaactccatactcgagcaattaaaatactaatagagattaaattaatgaagaa
ttgcattaataaaacatagaaaatgcctaatttattcaaaagagagagaacaacattgac
aaaattgagcaaatgtcctaaataaacaaccaaaagtaagatatgctattgaattaatca
taaaatggttttcaaaatcactaattttatgaaaaagaaagaagaaaattaaaagcctaa
atttaataacaacaaaaatataaaaaataagacaagaagagtgaggcagaagaaaaaacc
aatcagacagagacgagtaacaaatatcctaatgacagtcgttatatttaaaagtaaatt
tttcacaaagagtctctagaaacttaaaatgcgagaggctaaaacagacatatagaattt
ttaacaacagaagcagctcatgaagatgaataaagttagagaaaaaaaagattcaacaca
gttgagaatgaaggaagatatttgaggacagatagctaagacagcagctagtggttgaga
gagaatataattgtgaaaaatgagagtccaaatataaaccaagctaatagcacataaaaa
tcatttaaatctaaatcaaaagactcgacactttaatccttctaccaatcaaatatgttc
aacataattaatattggaggaagtgtggaagatccaataaaaatagttaaaaaatgcaac
taatttaaaaagtaaggttacattaaattaagctacaaagaaacttagtttgtaaattct
caaaagaagtcaaatcaactaacaccaaaaaagaaatctataaataaagtgagtatttct
cccacaagaaattaggattcaaatgttacttcaattaaaacaagtcctcaatcaaaaata
caaagcaaaacaaagctgattaattcaagcgaaatttcatttcaaagtccaaacaaattt
catgtttcaaaataactttga
DBGET
integrated database retrieval system
