Tetrahymena thermophila: TTHERM_000759019
Help
Entry
TTHERM_000759019 CDS
T01020
Name
(RefSeq) cation channel family protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
cNMP_binding
Ion_trans_2
Ion_trans
zf-CCHC
Cas9_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24440545
NCBI-ProteinID:
XP_012653301
TGD:
TTHERM_000759019
UniProt:
W7XHY0
LinkDB
All DBs
AA seq
1891 aa
AA seq
DB search
MDQKLETSNRFKKQVPTLFYQQMCSDENKYQELEIKDIYVDRLCQRQLFELQINQPQKIH
DGDKEISYKSFQADVNESLQKSLKDINNNQSLIKSQQALTSFNMNQIPQDEQIDYQPKSN
KHKHHYEESKTTSKQNSKKKLFQYEENNRESSSKNESEKESSNFSELNQRISSNSKNFEG
QKENQNQLSNMDINNSQKSQSQIAIQDEMIYEKDLKVLGTKINTAVKIQYFNKQETMVIM
RIRQNVKTFIYNLKIRHSNRKLDDLSEKEYQNINDLSHFYRQKDQIHKSFKIFLVFSKIL
KKTQKLAIFMPTDTSRVIWDLVQVVFTYTFFYLYSIIIFFDQNDFDTNFIQQISFYAFVF
FLLDILVNLNTAFFDKDIIITRRKLIAKQYILSSIFITDLISMFILGSKVIYSNSFISNN
TNQNLFLFGLNLLIFLKGNGISSSVITVAHIAAIGWYFVGISESNNNQNNWLDKLSISSY
TYYQKYIYSIYWSITTMTTVGYGDISASNSAEALYITITMILFSCVFAYSINNIGFILQE
IEKSSKQLNDDITTIQRYLIRKDVNIQLKSRVRHYLSFLAQEQKDRDKQQEDKILSVLSN
KLRDEITQEINSKILNNYLIFSSNFSQSTLNKLIFIMQEILVNPNEVIITEGQSDDSSIY
FIQNGIIEIYQQQIQKQNMITVVKTLTKGQIFGEISFFSGLQRQSSARSVNLSTLYKINR
EEFIEILKENTEDFERFKMMQDQIIFQKDITITHSECYSCKNSGHLANQCPRTHKYFDKQ
FTILKQNFSMFQERLFKERVTIKSKFNAKILWKKNQGIVLRLKQSIQKEDDEMYQMFTNE
ENFNTDYSQSQFDNEDNQDDEEEDSQSQTTIQFDDKENEINIKKIQQQLEKAEKQVKTMN
QFNSNLTNCEDAEQLASLENQIQNLNSNFIYENQDFARAKSNTLNSQGISKSFEASGSID
TINQDFQSSQQKSIRAIYKKDTKIEIQPSLLSQDDYDDGQNSNKSKKFDKQKQMTINAQF
TDYLKSQMKYGPYYSNLNKHIQKQVSNQSVDDNSQYQQTTDIPILPINKIDNNQRKSKTN
HFNSPKKNSYKKSLIQNQSQKELRSSVEQMLLQNIVQMGLTSDKRNSGSQNKSNESNFNY
DKNGKIQNSSRSIRDNNQQKSNQYLSPKNNNQNQGINQDQNKQLQQQLNEKMNNPNQNEN
QQLFEKVSKLLQNMQLPLLLQLTNGKSLLQDSQFIQSNSIDYFDKIQQFKKFYPENNFDK
VLHKLKAVQQEQKKQKKMKLASKERRQNIGFGNTIRVSIFQGNANIIRFQPLDYDINLYK
PTYLSYGTKMQKGVNYPLNMLSKNTENAYFDYLFLKLYQITKNYNLLLLINFIQHIYKID
NIHFPINSDNSIRDYFGFHIGYVLLNLNQILKLEVNLRSNLIHSQGVIELSKGLKKCQII
HTLLLKLSNNPIDDFGIINLCSSINSYGNLNYLLLDLISTQITSKTAKYLINDHSNWDNL
DTLILCLSFNKIGDQGVSELGSALKNLKKVSSLELYLRDTGINTKGINTFGQYLGQCISI
QNLTLNLVQNNICSKGKSNLGFALSNCINLSSLNIYLQENYFELSNSDKVINQFKSYLNI
QIKQGDPLISSLEKCTNLQKLDIELGSNKINDQTVKSIGISLKSLNNLSYLKIELRDNKI
SSEGFSGLCSGLESSKNLQVLRLFLGNNKIDDGAFINFKLKQLEKLADLSLDFYENKISF
NGVCILSFEIANLKNLQSIYLDFNKTLIDDQSLNLLGFNLGRLASLKEIKLFLSDNLIRS
LPLITLIQPLSQVKNLKVLQIYLRNKYTQISFQKDLAIAFQKLLNLLYLSLIIKDYNNIG
NSLNLIGGGIDLIQNIKKMKRLVQKNIKIEL
NT seq
5676 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattaaaagttagaaacatcaaatagatttaagaaataagttccaactctattctac
taataaatgtgcagtgatgaaaataaatattaagaattagaaataaaagacatttatgta
gataggctttgctaaagacagttgtttgaattataaataaattaaccataaaaaatccat
gatggagataaagagatatcatataaaagtttttaagcagatgtaaatgaatccttacag
aaatctttaaaggatattaataacaattaatctttaattaagagtcaataagcacttaca
tcattcaacatgaattagatcccttaggatgaataaatagattattagcctaagtcaaat
aaacataagcatcattatgaagaaagtaaaacaacttcaaagtaaaatagtaagaagaag
ttgttttaatatgaagaaaataatagagaaagttcaagcaaaaatgaatcagaaaaagaa
agtagtaatttttcagaacttaattagcgaatttcttcaaattcaaaaaattttgaaggc
caaaaagaaaattaaaattaattatctaatatggatattaataacagctaaaagagctaa
agtcaaatagctatataagatgaaatgatttatgaaaaagatctcaaagtgcttggaaca
aaaataaatacagctgtgaaaatttaatattttaataaataagaaacaatggtgatcatg
agaatcagataaaatgtcaaaacctttatttataacctaaaaataaggcattcaaataga
aagttagatgacttaagcgaaaaagaatactaaaatattaatgatttatctcatttttat
cgccaaaaagattagattcacaaaagctttaagatattcctagtatttagtaaaatttta
aagaaaacttaaaaattagcaattttcatgccgactgacacctcaagagtcatctgggat
ttagtttaagttgtttttacctatacatttttttatttatattcaatcattatttttttt
gattaaaatgattttgataccaatttcattcaacaaataagcttttatgcatttgttttt
ttcttgcttgatatattagtcaatttgaatacagccttttttgacaaagacatcatcatt
actaggcgtaagctaattgcaaagtagtatattttatcatcaatatttatcactgatttg
ataagtatgtttatacttggttctaaagtcatctactcaaactcctttattagcaacaat
acaaatcagaacctctttttatttggcttaaatttacttattttcctaaaaggaaacgga
atatcctccagtgttataacagttgctcatatagctgctataggatggtattttgttggc
atttcagaatcaaataataatcaaaataattggcttgataagcttagtatttcatcctat
acatactattaaaaatacatatattctatttactggtcgattacaactatgacaacagtt
ggatacggagatatttcagcttcaaattccgcagaggcactttatataacaattacaatg
atcttgtttagttgtgtttttgcatattctattaataatataggttttatattacaagaa
atagaaaagtcttcaaaatagctaaatgatgacattactacaatacaaaggtatcttata
agaaaggatgtgaatatttaactcaaaagtagggtcagacactacttatcttttttagcg
taggagcaaaaagatagggataaataataagaagataaaatactctctgtcctctcaaat
aagcttagagatgaaatcacccaagaaataaactctaaaattttaaataactacctcatt
tttagttctaatttttcttagtctactttaaataaactaatatttatcatgtaagagatt
ttagtaaatccaaatgaggtaataataactgaaggctagtctgatgactcttcaatatat
ttcattcaaaacggaataattgagatttatcagtaataaatttaaaaataaaatatgata
acagttgtaaaaacattgacaaaagggtaaatttttggtgaaatttcttttttttctggt
ctttagagacaatcatcagcaagaagtgtgaatttatcgactctttataaaatcaacaga
gaagagtttatagaaatattaaaagaaaacacagaagatttcgagaggtttaaaatgatg
caggattaaatcatatttcaaaaagatataactattactcattctgaatgctatagctgt
aaaaacagtggtcacttagctaattaatgtcctagaactcataaatattttgataaataa
tttactattttgaaacaaaacttttctatgttttaagaaagactttttaaagaaagagta
accataaaatctaaatttaatgctaagatattatggaaaaaaaattaaggaatagtttta
aggttaaagcaaagtattcaaaaagaagatgatgagatgtattaaatgtttactaatgaa
gaaaattttaatactgactattcataatcttaatttgataatgaggataattaagatgat
gaagaagaagactcataaagttaaaccacaatccagtttgatgataaagaaaatgaaatt
aacattaaaaaaatataataataattggagaaagcggaaaagtaggtaaaaaccatgaac
taatttaattctaatttgacaaattgcgaagatgctgagtaattagcgagtctagaaaac
taaatataaaatttgaattcaaattttatctacgaaaatcaagattttgctagagctaaa
tctaatacgttgaattcataaggaatatcaaagtcatttgaagcatctggtagtatcgat
acaattaactaagatttttaaagcagttaacagaaatcaattagagcaatttacaaaaag
gatacaaaaattgaaatataaccatcacttctaagctaagatgactacgatgatgggcaa
aattccaataaatcgaaaaaatttgataaatagaaataaatgacaataaatgctcaattc
acagattatttaaaaagttagatgaaatatggtccttactatagtaatttaaataagcac
atttagaaataggtatcaaatcaatcagttgatgataactcataataccagtaaacaaca
gatattccgatattgcctatcaataaaattgataataattagagaaaatctaaaactaat
cattttaactcacctaaaaagaactcttacaagaaaagtttaatttaaaattaaagttaa
aaagaattgaggtcttctgttgaataaatgttgctacagaatattgtttaaatgggtcta
acgtcagataaaaggaattctggatctcagaataagagtaatgaaagcaattttaattat
gataaaaatggaaaaatttaaaactcaagtaggtcaataagggataacaactaataaaaa
tcaaatcagtatttgtccccaaaaaataataattaaaattaaggtataaattaagactag
aataaataattacaataacaacttaatgaaaaaatgaataacccaaattaaaatgaaaat
caatagctttttgaaaaggttagtaaattactttaaaatatgtagttacctcttttgctt
tagctaacaaatggtaaaagcttattacaagactcttagtttatatagtcaaattcaatt
gattattttgataagattcaacaatttaaaaaattttatcctgagaataattttgataaa
gtgcttcacaagttaaaagctgtgtagcaagaataaaagaaataaaaaaagatgaaatta
gcttcaaaagagcgtcgctaaaatataggatttggtaatacaataagagtctctatattc
taaggaaacgcaaatattattaggttctaacctttagattatgatatcaatctatataaa
ccaacttatctatcttatggaaccaaaatgcagaaaggtgtcaactaccctttaaatatg
ctttctaaaaatacggagaatgcctatttcgattacttatttttaaaactttattaaatt
acaaagaattataatctcttattattaataaatttcatttaacatatttataaaattgac
aatattcactttcctataaacagtgataatagtattagagattactttgggttccatatt
ggatatgttctacttaatctgaatcagatcttaaagcttgaagttaatttaagatctaac
ttaatccattcctaaggagttatagaattgagtaaaggtttaaaaaagtgttagattatt
cataccttactgttaaagttaagcaataatcctatagatgattttggaattattaattta
tgttcctcaataaatagttatggtaacttaaattacttgcttcttgatttaattagcacc
taaattacttcaaaaactgcaaaatatttaatcaacgatcattctaattgggataattta
gatactttaatactttgcctaagtttcaacaaaattggtgattaaggagtttctgaatta
gggtctgctttgaaaaacttaaaaaaagtatcatctttagaactttatttaagagatact
ggaattaatacaaaagggattaatacatttggttaatacttaggttaatgcatatctatt
taaaatctaactctgaacttagtacaaaataatatttgctcaaaaggaaagtctaattta
ggttttgctttatcaaactgtataaatttatctagcctaaacatatatcttcaagaaaac
tattttgagttatccaattctgacaaagttattaattaatttaagtcatacttgaacatt
tagatcaaataaggagatcctttaatttcttctttagaaaagtgtactaatctttaaaag
ttagatattgagttaggatcaaataaaataaatgattaaactgtgaaaagcattggaata
tctttaaagagcttaaataatttatcttatctcaaaattgagttaagggataataagatt
tcttcagaaggtttttctggtctatgtagtggcttagagtcttctaaaaatctttaagtc
ttacgtcttttcttgggaaataacaaaattgatgatggagcatttataaactttaagcta
aaataattagaaaaattagctgatttatcgttagatttttatgaaaataaaattagtttt
aatggtgtttgtattttaagctttgaaattgcaaatttgaaaaatttataatctatttac
ttagatttcaataaaaccttaattgatgattagagcctaaatcttttagggtttaattta
ggaagattagcaagtctaaaagaaataaaacttttcctgagtgataatttaattagatca
ttaccattaataacgctaattcagccattatcataagttaaaaatctcaaagttttgcaa
atttatttaaggaataaatacacataaattagtttctaaaaggatttagcaattgcattt
taaaagttactcaacctattatatttatcacttattattaaagactataataacatagga
aatagcttaaatttgattggtggaggtatcgatttaatttagaatattaaaaaaatgaaa
agacttgtttagaaaaacataaaaatagaattatga
DBGET
integrated database retrieval system
