Tetrahymena thermophila: TTHERM_00085330
Help
Entry
TTHERM_00085330 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
CCDC28
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7824258
NCBI-ProteinID:
XP_001012680
TGD:
TTHERM_00085330
UniProt:
Q236R5
LinkDB
All DBs
AA seq
1982 aa
AA seq
DB search
MFQWQIPASKQDIIVNSKSFNKKIIKSQIYKNFQNLWLIQSSKSFQMYIYLNLLLLQLFK
LVFYFLLTTKQLFLLSAVIDTYFKLRLHYFSSQYTFLTQQCNQLRYKPIRLKLIEKSNFL
HLRLNNICEQLYYKNQINQNIKKVQALLKFMNKIKNIVFFILLGVILCSFAKQEQNLIKE
RIEEQDQVFIKKERLLQSCSPSCLQCSNNFCLQCMDNTVLPFCYCADGFYQDSFQSCKKC
GQNCKNCYQQQCQICNEHYQVDNGLCVCNGNCDNTVLYYTTRVGSGLQSIVITFNQIIGI
QKTTSQDINSAFSLSYDNCSILIKDTQQIYGVFDASDLKYGGCYIRQSQQNQFIIMLTQK
LDQTNILKAPIIDSTQILVFNGIPLYKSLQQGSVATTTETFIGSQLGYISKICYFEQSKV
FASLSESNLKIQINTINNLSSIFQASSGNIKCEIVNSSVPQITFDPCSSQNGLQMTTQQF
IDKSVLQVSVECSFLGYNTKDIVEIVFTSQNSQNIRIEYNDLFFTSNFKDSFETNVSFLS
DTVLKQIQFSYIIYPATTFSVSSQLLQDRYNSKLQIIGSSVMTEQIIFIQLIASAQNTVS
TLQLAVQYLSSFSLDVDQKVISNFFPNKGLTIKANLVDNDVTILDISQFQLQWYCISEDT
QTECKDRNQNIIVLGSSLTLQVNPKTFNLNGKFTIFILAKRNTNPNAQQIAVTKLDTGQT
QLTIVTDMNSLQQINYQDIIFIELKYETNLYITNQSQTYKAIILNSLTQKKKTIESISNK
LSFIIQDLFPNLDMTVQNNFQIQFQVYDQTLDQIFSSNTYVMQIRQPPQGCKLALSPQAA
FQIITISVNSCNLNGQDTQYQFFYYSSKEQQDQEIQTSGIIVNRRMLSLISQNTQITAYL
PPGNIIVMVITIGPNNLRSNFTQTATIQDNNWSQAEYEKYLQNQYIQTQQQSTKSIQVFG
YQYITNAVEYYESQNLNYIPSDSINQLKNQIIQQLIDSSWQNEDDQVYLLSTQINIRIKQ
SKIKITLSSSLASVNAIEKQVQNILQKINQSQLDNQQRQYYQEILSSIIQNYMKDMNNLN
NWTPDNCQNAIEQSNNIMQGIAETMIVNQQPIQVITEGDSLLVDRVNYITLLSKYYDDSK
IEPDQSQYSQSYYVLIQTWPTTHPLYRDELQQINEQYYSKSTPQQLSLLQKTYPIIIPKI
LEDDKRRRQLSTADANLPGPFQLQFPTQDEKLQCIQRNLNGQWVSNSCKTSIKIINQQRI
VNCSCKTPDPTSIITDITDLFNNQNVQDIFNGEGFWRIFHLSNWYEYAPIWTIIGLNIFF
IALLIIGYKYDKLDERKDLKKAFLFYDYKKGESQTIGQESLFMQIKNLRTQQNKLSNNVL
SLINSQKTQEHFEDQEVNNNNNNNNNNNINKVSLEFNKKSIFAKGDKVYFNNQIVQNTPI
INYNSEHLTSLNIIQQNIREEVQNGNSEYHIDYQTKVLSEKLNLNDQIIQQNVSQNQESN
KNISQQIQEQNQNDKEKKFGEKSQQDNKIVTQNTIKQGTKLKTQQEMIRIDLNESNGQLE
EKKSLRDLQEINSSQISTDFQKIDEKENYQKNDIQNFVFNTKKQFKQDYSIQSSNLDKKY
QNHQQISQQQLQITPENQVNMENITPTIENNKTLSINQNNNSSNHENNNNNNTPQIEGKT
SQQIDVNKLFTQEDYDNFQQTPQSNYIVDHNFLLKTDQIQLDQFTNQEENILKTQTQNFN
NWQLKQEIPIINNNQTDEEAMKIQHKNEIQDQKACDLNQNDQKKIDQKRQKEIELTLFLK
AKEKLQLYLQKETIIRAALAYHIFFQTFIIYNNKVSRVLRFTIYYNRLIWLLAINSVFGV
KLSVVQVLVLSIVSTVIIQIVTTILMLLYFRQKLKIFGVIITSLFLIFCYYSILVVISGQ
QSYDANIWILSYFSTLFLSDYVFGLAISFAMLYLTKKYIDQIQDPLYLNILGSALLIQSF
QY
NT seq
5949 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttaatggtaaatcccagctagtaaataggatattatagttaactcaaaatccttt
aacaagaagattataaaaagtcaaatatacaagaacttttaaaatttatggctgatccaa
agctctaaaagcttttaaatgtatatttatttaaatttgctacttttataactatttaaa
ttagttttttattttcttttaacaacaaaatagttgttccttctgagtgctgttatagat
acttattttaaactgagattacactactttagtagctaatatacttttttaacttaataa
tgtaattaactaagatacaagcctattagattgaaattaattgaaaaatcaaattttttg
caccttagattaaataatatttgcgaatagctatattacaaaaattaaattaattaaaat
atcaaaaaagtataagctttacttaaatttatgaacaaaattaaaaacatagtttttttc
atacttctaggagttattctttgttcttttgccaaataagaataaaatttaatcaaagag
agaattgaagaacaggatcaagtatttataaagaaagagagactactataatcatgctct
ccttcgtgtttatagtgcagtaataacttttgtttataatgtatggataatacagttcta
ccattctgttattgtgcagatggtttttatcaagattccttttaaagctgtaaaaaatgt
ggttaaaactgtaagaactgttatcaataacaatgccaaatttgtaatgaacactattag
gtagataatggtttatgcgtttgcaatggaaattgtgataatactgtcctctattataca
actcgcgttggatcaggtttatagagcatagtcataacctttaatcaaataattggtatt
taaaaaacaacttctcaagatattaacagtgcatttagtttatcttatgacaactgctct
attcttattaaagatacttaataaatttatggagtttttgatgcaagtgatttaaaatat
ggtggctgctacattcggtaatcctagcaaaatcagtttattataatgcttacctagaaa
ttagattaaactaatattttaaaagctcctattatagattctacttagattttagtattt
aatggaattccgctttataaatctttataataaggaagtgttgcaacaaccacagaaaca
tttataggatcataactaggttatatatctaaaatatgctattttgaataatcaaaagtt
tttgcttcactatctgaaagtaatttaaagatatagattaacacaataaataatctttct
agcattttttaagctagcagcggaaatataaagtgcgaaatagtaaattcctctgtacct
tagataacttttgatccttgctcatcataaaatggattacaaatgacaacttaataattt
atagataaatctgtactttaggtaagtgttgagtgctcctttttaggatataatactaaa
gacatagtcgaaatagtttttacaagttaaaattcataaaatatcagaatcgagtataat
gatttattttttacatctaactttaaagatagctttgaaactaatgtctcatttttatca
gatactgtcttaaaataaatttaatttagctatattatatatcctgctacaactttttct
gtgtcttcttagctattataagaccgttataattctaaactttaaattataggttctagt
gtcatgacagaataaattatctttatttagcttatagcatctgcataaaatacagtatct
acattataacttgcagtttaatatttgagctcgtttagtttagatgtggattagaaagtt
atctcgaatttctttccaaataaaggcttaacgattaaagctaacttggttgataacgat
gtcacaatcctagatattagttagttttaattataatggtattgtatttcggaagacact
caaacagaatgcaaagatcgcaattaaaatattatcgttttgggatcctctttaactcta
caagtaaatcctaaaacatttaatttgaatggaaaatttactatattcatactagccaaa
agaaatactaatccaaatgcatagcaaattgctgtaacaaagctagatactggataaact
tagctcactatagttactgatatgaattccttataataaattaactattaagatattatt
ttcattgaactaaaatatgaaactaatttatacataacaaatcagtcataaacctacaaa
gcaattattttaaattctcttacttaaaaaaagaaaacaattgaatcgatttctaataaa
ttatcattcattatttaagatctctttccaaatttagatatgactgttcaaaacaatttt
taaatttaattttaagtttatgattaaactttagattaaattttttcttcaaatacatat
gttatgcaaataagataacctccttaaggatgtaagctagctttaagtccttaagctgct
tttcaaataattactatatctgtaaatagctgtaatttgaatgggtaagatacttagtat
taatttttctattactctagcaaggaatagtaagactaagaaatataaacctcagggata
attgtgaacagaagaatgctaagcctaatttcgtaaaatacataaatcactgcatattta
cctccaggaaatattatagttatggttattacaattggacctaataaccttagatctaat
tttacacagacagctacaattcaagataataattggagctaagctgaatatgagaaatac
ctataaaaccaatacatttaaacttaataataatctacaaagtctatttaagtttttgga
tattaatatatcactaatgcagtggaatactatgaatcttaaaatctaaactatattccc
tcagatagcattaactagttaaaaaattagataattcaatagctaatagactcatcttgg
caaaatgaagatgactaagtttacttgctttcaacttaaattaatattaggataaaataa
tcaaaaataaaaataactttgagttcttctttagcgtctgtaaatgctattgaaaaacaa
gtttaaaatattttacaaaaaattaattaatctcaattagataatcaacaaagatagtat
tattaagaaatattatcttctattatttagaattatatgaaggatatgaataacttgaat
aattggacacctgataactgccagaatgctatcgaataatcaaacaacatcatgtagggt
atagcagaaacaatgattgtgaattagtagccaattcaagtaattactgaaggagattcc
cttttagtagatagggtaaactatatcactttattgtctaagtattatgacgatagcaaa
attgagcctgaccaatcttagtatagctaaagttattatgttttaatttagacatggcca
actactcatcctttatatagggatgaattataataaataaatgagcaatattattcaaaa
tctaccccataataattaagtcttcttcaaaaaacatatccaataattatacctaaaata
ctagaagacgataaaagaagaagataactttctactgcagatgcaaatttaccagggcct
ttttagttataattcccaacttaagatgaaaaactgtaatgcatttagagaaatttaaat
gggtaatgggtatctaatagttgtaaaacttcaatcaagataattaattagtaaagaata
gttaattgctcttgtaaaactcctgaccctacatctattataacagatattacagacctc
tttaataaccaaaatgtttaagacatctttaatggagaaggtttttggagaatattccat
ttaagtaattggtatgaatatgcaccaatctggacgataatagggcttaatatatttttt
attgcactcctaattattggatataaatatgataagcttgacgaacgtaaagatttaaaa
aaggcattcttattttatgattataaaaaaggagaatcctaaactattggttaagaaagc
ttatttatgtaaattaaaaatttacgaactcaataaaataaattaagtaataatgttctc
agcctaatcaattcataaaaaacataagaacattttgaagattaagaggttaataataat
aataataataataacaacaataatattaataaggttagtttggaatttaataaaaaaagc
atatttgctaaaggagacaaggtatactttaacaattaaatagtttaaaatacacctatt
atcaattataatagtgagcatttgacaagtttaaatattatttaataaaatataagagag
gaagtttaaaatggtaattcagaataccatatcgattattagactaaagttttgagtgaa
aaattaaatctaaatgattaaataattcaataaaatgtatcctaaaattaggaaagtaac
aaaaatatatcataataaatctaggaataaaattaaaatgataaagaaaaaaaatttggt
gaaaaatcacaataagataataaaatagttactcaaaatacaattaagtaaggaacaaag
ttaaaaacataataagaaatgataagaattgacttaaatgaaagtaatggataattagaa
gaaaaaaagtcacttagagatcttcaggaaattaattcatctcaaatttctacagatttt
taaaagattgatgaaaaagaaaattattagaaaaatgatatctaaaactttgtgttcaat
actaaaaagtaattcaagtaagactattcaatataatcttcaaatcttgataaaaaatat
caaaatcattagtaaattagttaataataacttcaaattactcctgaaaattaagttaat
atggaaaacataactcctactatagaaaataacaaaacactatcaattaattaaaataat
aatagttcaaatcatgaaaataataataataataatactccttaaattgaaggaaaaact
tcttagtaaatagacgttaataaattatttactcaagaagattacgataatttctagtaa
acaccttagtcaaactatatagtagatcataattttttactaaaaacagattagatttaa
ttagattaatttacaaattaagaagaaaatattttaaaaacttaaacttaaaatttcaat
aattggtaactaaaataagaaattccgattataaataataattaaaccgatgaagaagct
atgaaaatatagcataaaaatgaaatttaagattaaaaagcttgtgatttaaattaaaat
gattaaaaaaaaattgactaaaaaaggtaaaaagaaattgaactgaccttatttttaaaa
gcaaaagagaaattataactctatttgtaaaaagagacaataattagggcagcacttgcc
tatcatatatttttttagacattcataatttacaataataaagtatctagagttctaaga
ttcacaatatactacaatagactgatttggcttttagctataaattctgtttttggagtc
aagttaagcgtagtttaagttctagttttaagtatagtttcaactgtaattatataaata
gttaccactatacttatgctattatacttcagataaaaattaaaaatatttggagtaata
ataaccagtctatttttgatattttgctactatagtatattggtagtaatatcaggatag
tagtcttatgatgcaaatatttggattctatcttatttttcaactttatttttatctgat
tatgtatttggattggctataagttttgcaatgctttatttaactaaaaaatatatagat
taaatataagaccctctatacttgaatattcttggttctgctttactaatttaatctttt
taatattga
DBGET
integrated database retrieval system
