Tetrahymena thermophila: TTHERM_00085340
Help
Entry
TTHERM_00085340 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
7824257
NCBI-ProteinID:
XP_001012681
TGD:
TTHERM_00085340
UniProt:
Q236R4
LinkDB
All DBs
AA seq
1851 aa
AA seq
DB search
MNEIKKKVFFIFLGVVVYSFAKQEQSLIKERAKEQDQFMIMKKDRQLQQCFSNCILCNNS
YCLQCAVDRVLPDCNCREGFFLDTSLNCQKCGENCKTCLHQQQCQICNEHYKVVGGLCVC
DGNCDNTVLYYTTQVGQDLQSIVITFNQIIGIQKTTSKDINSAFTLSYDNCSILTKDTQQ
IYGVFDAGDLQYGGCYIRQSQQNQFIIMLTSKLDQSNLLKAPKIDSTQILIFNGIPIYKP
LQQGVTATTTETQIGSQLAYIPKICYFQQSKIFASLTEQNLSIQITAIQNMYDIFQAGSG
NIKCEIVNSSVPSITFDPCSAQNGLLISTQKFVDQSTLQVSVECSFLGQKAKDIVDIVFT
SQNSQNVRIEYQDLFYTSSFKDNFETKVSFFSDTVLDQIQISQNIYPPSNFAASYQLLQD
SYNCTFQIPGSNIITEQYIFISIIASTQNTVSTLQLAVSYLSSFSLDVDQKVISNFFPSK
SLTIKASLIDNDVTTQDISQFQLQWYCISEDTQTQCKDRNQNVISIQSSLTAQISPKTFN
LNGKFTLFILARRNNNPNTQQIAVTKLDTGQTQFNTVTDMNSLQLINYQDIVFIELKYET
NLYTTNQTCTYKANILNSLTQAQKTYESISNKLSFIIQDLFPNLDVIAQNNFSIQFQVYD
LTIDDTLSSNTYAMQIRQPPQGCKLALSSLAVFQTITISVNSCNLNGQDTQYQFFFYSSQ
EQQDQEIKTSGIIVNRRMLSIISQNTQVTAHLPPGNIIVMVVTVGPNNLRSNFTQAATIQ
DNNWSQVEYEKYIQNQYDSIQQQSTKSIQVFGYQYIANAVEYYESKNSNYIPSDSTNQLK
NQITQQLIDSSWQNEDDQVYLLSTQINIRIKQSKIKISSSSSQAFVNANEKEVQNILQKI
NQSQLNNQQRQYYQEILSSVTQNYMKNMNNLNNWTTGNCQNAIQQSNNIMQGIAQTMIVN
QQPIQVIAEDVSLLVDKVDYITLLSKYYDDIKIEPGQSQYSQSYFVLIQTWPTTHPLYRD
ELKQINEQYYSKSTPQQLSLLQKTYPIMIPKILEDDKRRRQLSTANANLPGPFQLQFPTQ
DEKLQCIQRNLNGKWVSSSCKTTIKFIKQKRVVNCSCQTPDPTSILTDISELFENQNIQD
IFNGEGFWRIFHLNNWYEYAPIWTIIALNIFFIALLVIGYKYDKLDKAKYLKKAFLFYDS
KIGQSQTVGQENLFMQIKNQRTTQNKLSNNPISRLNTQKTQEQFEDQDAINNINNNKNNI
NKISLEFNKKSIIAEGEKVHSNNQIAQKTPINSYNSENLTSVNLIQQNIRQEGQNDYQEQ
LIDNQNKVSNEKSTQNNQIIIENESQTLKFNKSLSQQGQEQNQNDKQKAFGEKSLQDIEN
NNQNRINQEIKSSNQYQIINIDLNENKEQEQQKHSHNDLKEIKNLSHISSDFQKIDEREN
YQQNAIENFQFDIKKQFKKDEFLIYEEQDYSIYSSNLDQKSQDQQQSGLQQIQITPQNQI
NLENVTPDIENNKRPSINIKQSNDSSDIENNNTPQIDGKTPQLESQVQQIQHIDIKKLFI
QEEDDCDNFQQTPQPNSKAEKNFLLNTDQIQLEQFTKQEENILQIQNSNIQQLKQETPII
NNNQNDEEAMKIDHKNESSDQKACDLDINEQKKLDKKRQKEIERSLFLNAKEKLQLYLQK
ETITRATLAYHMFFQTFIIYDNKVSRVLRFTIYYNRLIWLLTINSVFGVKLSVVQVLVLS
IVSTVIIQVVTTLLMLLYFRQKLKVFGVIITSIFLLFCYYSILVVISGQQPYDANMWILS
YFSTLILSDYIFGLAISFAFFYLSRKYIEKIQDPLYLNILGSALLIQAFQQ
NT seq
5556 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacgaaattaaaaaaaaagttttcttcatatttctaggagtggttgtttattccttt
gccaaataagaataaagtttaatcaaagagagagccaaagaacaagaccaatttatgata
atgaagaaagatagacaactataacaatgctttagtaattgtattttatgcaacaatagt
tattgtttatagtgtgcagttgatagagttcttcctgattgtaattgtagagaaggcttc
tttctagatacctctttaaattgtcaaaaatgtggtgaaaactgtaagacttgtctccat
taataacaatgctaaatctgtaatgagcactataaggtagttggtggtttatgcgtttgt
gatggaaattgcgataatactgtactgtattatacaactcaagttggacaagatttataa
agcatagttattacctttaatcagataattggaatttaaaaaacaacttctaaagatatt
aatagtgcatttactttatcttatgacaattgctctattcttactaaagacacctaataa
atctatggtgtttttgatgcaggtgatttacaatatggtggctgctacattcgataatcc
tagcaaaattagtttatcataatgcttacttccaaactagattaaagtaatttattaaaa
gccccgaaaatagattctacttagattttgatatttaatggaattccgatttataaacct
ctataataaggagttactgcaacaaccacagaaacttagataggatcataactagcttat
atacctaaaatatgttatttttaataatcaaaaatttttgcttcactaacagaataaaat
ttatctatataaattactgcgatataaaatatgtatgacattttttaggctggcagcgga
aatataaagtgcgaaatagtaaattcctcagtaccttccataacctttgatccttgctca
gcataaaatggattactaatttcaacttaaaaatttgtagattaatctacgctttaggta
agtgttgagtgctcttttttaggataaaaagctaaagacatagtcgatatagtttttaca
agttaaaattcataaaatgttagaattgagtatcaagatttattttatacatcttctttt
aaagacaattttgaaactaaagtctcatttttttcagatactgtcttagactaaatttaa
attagctaaaatatatatccaccttcaaattttgctgcatcctattagttattataagac
agttataattgtactttttaaattccaggttctaatatcatcacagaataatacatattt
atttcgattattgcatctacataaaatacagtatctacattataacttgctgtttcatat
ttgagctcgtttagtttagatgtggattaaaaagttatctctaatttctttccaagtaaa
agcttaacgattaaagctagcttgattgataacgatgtcacaacccaagatattagttag
ttttaattataatggtattgtatttctgaagatactcaaacataatgcaaggatcgtaat
taaaatgttatctcaatataatcatctttaactgcacaaataagtcctaaaacatttaat
ttaaatggaaaatttactcttttcatactagcgagaagaaataataatccgaatacatag
caaattgcagtcacaaagctagacacaggataaacttagttcaatacagtaactgatatg
aattccttataattgattaactattaagatattgttttcattgaactaaaatatgaaacc
aatttatacacaacaaatcagacatgcacctacaaagctaatattttaaattctctaact
taagcatagaaaacgtatgagtcaatttctaataagctatctttcattatttaagatctc
tttccaaatttagatgtgatagctcaaaataatttttcaatttagttttaagtttatgac
ttaaccatagatgatactctttcttcaaatacatatgctatgcaaattagataacctcct
taaggatgtaagctagctttaagttccttagctgtatttcaaacaattactatatctgta
aacagctgcaatttaaatgggcaagatactcaatattaatttttcttttactctagctag
gaataataagactaagaaataaaaacctcaggaataattgttaacagaagaatgctaagc
ataatttcataaaacacataagtcacggcacatttaccacctggaaatatcatagttatg
gtagtcacagtaggacctaataaccttagatctaattttacacaagcagctacaattcaa
gacaataattggagctaagttgagtatgagaaatacatataaaaccaatatgattcaatt
taataataatcaacaaaatctatttaagtttttggatattaatatatcgcaaatgcagtg
gagtattatgagtctaaaaattcaaactacattccttcagatagcactaattagttaaaa
aactagataactcaataactaatagattcatcttggcaaaatgaagatgactaagtttac
ttgctttcaacttaaattaatattaggataaaataatcaaaaataaaaatatcttcaagt
tcttcataagcatttgtaaatgctaatgagaaagaagtttaaaatattttacaaaaaatt
aattaatctcagttaaataatcaacaaagatagtattattaagaaatattatcttcagtt
acttagaattatatgaagaacatgaataacttgaataattggacaacaggtaactgccag
aatgctatttagtaatcaaacaatataatgtaaggtatagcttaaacaatgattgttaat
tagtagccaattcaagtaattgctgaagatgtctcccttttagttgacaaggtagactat
ataactttattgtctaagtattacgacgatataaaaattgagcctggccagtcttagtat
agctaaagttactttgttttaatttagacatggccaactactcatcctttatatagggat
gaattaaaataaataaatgagcaatattattcaaaatctaccccataataattaagtctt
cttcaaaaaacatacccaattatgatacctaaaattctagaagatgataaaagaagaagg
taactctctactgcaaatgcgaatttgcctgggcctttttagttataattcccaacttaa
gatgaaaagctataatgtatttagagaaatttaaatgggaaatgggtatctagtagttgt
aaaactaccatcaagtttattaagcagaaaagagttgttaattgctcatgttaaactcct
gacccaacatctatactaacagatatttctgagctttttgaaaaccaaaatatttaagac
atctttaatggagaaggtttttggagaatattccatttaaataattggtatgaatatgca
ccaatctggacaataattgcacttaatatattttttattgcactcctagttattggatac
aaatatgataaacttgacaaagccaaatatttaaaaaaagcattcttattttatgattct
aaaataggataatcataaactgtaggttaagaaaacctatttatgtaaattaagaattaa
cgaactacataaaataaattaagtaacaatcctatcagccgactaaatacataaaaaaca
caagaataatttgaagattaagatgctattaataatattaacaataacaaaaacaatatt
aataaaattagtttggaatttaataaaaaaagcataattgctgaaggagaaaaggtacac
tctaacaattaaatagcccaaaaaacacctattaacagttataatagtgaaaatttgaca
agcgtaaatttgatttaataaaatataagacaagaaggttaaaatgattattaagaataa
cttattgataattaaaacaaagtttcgaatgaaaaatcaacttagaataattaaataatt
atagaaaatgaatcctaaactttgaaatttaacaaaagcttatcatagtaaggctaagaa
taaaattaaaatgataaataaaaagcatttggtgaaaaatctctttaggatattgaaaat
aataatcaaaatagaattaattaagaaatcaaatcaagtaactaatattaaattataaat
atagatttgaatgaaaacaaagaataggaataataaaaacattcacataatgatcttaag
gaaattaaaaatttatctcacatttcttctgatttttaaaaaatcgatgaaagagaaaat
tattagtaaaatgctattgaaaacttttaattcgatatcaaaaaataattcaaaaaagat
gaattccttatttacgaagagcaagattattcaatatattcttcaaatcttgattaaaaa
tctcaagatcaacagtaatctggtttataataaattcaaatcacaccttaaaattaaatt
aatttggaaaatgtcactccagatattgaaaataataaaagaccaagtattaatatcaag
taaagtaatgatagctcagatattgaaaataataatactccttaaattgatggaaaaact
ccatagttggaatcacaagtctagtaaatataacacatagacattaaaaaattatttatt
taagaagaagacgattgcgataatttctagcaaacaccttaaccaaacagtaaagctgag
aaaaattttttacttaatactgattagattcaattagaataatttacgaaataagaagaa
aatattttataaatttaaaattcaaatatttagtaattaaaataagagactccaataatt
aataataattaaaacgatgaagaagctatgaaaatagatcataaaaatgaaagttcagat
taaaaagcttgtgatttggatataaatgaataaaaaaagcttgacaaaaaaaggtaaaaa
gaaattgaacggagtttatttttaaatgcaaaagagaaattataactctatttataaaaa
gagacaataactagggcaacacttgcctatcatatgtttttttagacattcataatatat
gataataaagtatctagagttctaagattcactatatattataatagactgatttggctt
ttaacaataaattcggtttttggagttaagttaagtgtagtttaagttctagttttaagt
atagtttcaacagtaattatataagtagttaccactttacttatgctattatacttcaga
taaaaattaaaagtatttggagtaataataaccagcatatttttgctattttgctactat
agtatactggtagtaatttcaggatagtagccttatgatgcaaatatgtggattctctct
tatttttcaactttgattttatctgattatatcttcggattggctataagttttgccttt
ttttatttaagtagaaaatatatagaaaaaatataagaccctctatacttgaatattcta
ggttctgctttactaatctaagctttttaatagtga
DBGET
integrated database retrieval system