Tetrahymena thermophila: TTHERM_00122100 Help Entry TTHERM_00122100   CDS       T01020                                  Name (RefSeq) PH domain protein   KO K19525   vacuolar protein sorting-associated protein 13A/C Organism tet  Tetrahymena thermophila Brite KEGG Orthology (KO) [BR:tet00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    04131 Membrane trafficking [BR:tet04131]     TTHERM_00122100 Membrane trafficking [BR:tet04131]  Endosome - Golgi transport   Rab GTPases and associated proteins    Rab associated proteins     TTHERM_00122100 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  VPS13_VAB VPS13_N PH VPS13_C TerY_C Motif Other DBs NCBI-GeneID:  7845752 NCBI-ProteinID:  XP_001010806 TGD:  TTHERM_00122100 UniProt:  Q22YW0 LinkDB All DBs AA seq 3143 aa AA seqDB search MSEQNLMSCNLTTNDNAYSIKSLIKENGLLKKLLEKREKDIICLKTQLEKEMNTAKALER SKQFLSSQLNSIRNFVNKKTKSILENLIGQPVSDDLQLQKQAQLIAGGEEIEDQYQIQSI YELFTILEERITAHMQTIINRQIDPKQDGQRDQLYVIGQTQSIKQIDNEEKEQIKSNLNG LISSDKKAKKKQQQSVKIVTFQEDQCIQRKDEETIMLGSYKSSSDEQDVMSTSINNYLTS VHTNKINNLTLGSQDILVSPILKSKQCSQKQKNSQFFSFYDEDMRDMVANSQEQLNKNLK NSDSPSQNLPQNQDCQYKNILSYSDCKQSEEVEKQNLNIHGMNNYDNIERKLINKSKSLG VIEQNNSLILNNKSKRLNSATPTNHSLKKKQQETCHFQKKSFFWCEQQLKSQEEQQQQIE SDISSRSCSDFLKLKSNSNFSNLINKNKPDKDQEEENQLIFSDKVIKHSKTGASQEIIIL LDQTYFYVFQNLSQINNFKRFYIKDINQINTSSKDSIKGKIDMFQSLISSVLDKVAGEYV LGLNKENLNIGIFSGEVKIENVSLNPNIVNMLELPINHQYSSIKKLELKVPLKNIGSMPV EVFLDGLYLIATPKEQKEWKFKDYNSFKTKLANVEAFAAECVQKIAAKQKEKLKGGQEAG YIQKLTMKIVDNLQITIRNIHVRFEDTLTKRYSWGFCLDKLEIYTTNIEGVKVFVDRTIQ ENKDKPIRKLLTISNAGVYWNANETRLISDLNEEVKFKILNGMIQKEGQDKTDEPVDFLF KISSQVNLTINNKGNFDVPEIKVILNLEHITLHLQQRQLQQLIEQIEFLSKYSRELEIRK KNEKKISAKEIEALGDLFTNLYTKMQEQKKDKSIACLTEKEKHQFEEAIIKLDMQILLQR TKKIVIQVQRALKIKELEKKKFDEKQGFFARWLWGSRNTNSQTSLVTEEEKAEIDNFIDE IFGEEKIDAPTIIRPQDYVYFVLDYNLHGASIKLSNRVGQEIQSLQFSLNSIYGSVWIRE NNKQIWVNLRSMELQMIDEFLQNNSYKVINILSPTIQNSKNPLIEFKMTSKPLETPHIDQ VIDIKMRSIRADYNPYLVIRAVQFFDVKVKDDQLKQKAKDKIAEQIEKKQSSLSETMKNA SVLKLKIDLESPVIVLPFKTDGSLTNECWVLNLGNLSVYTLEDILKPTLPIQMKVFDMFS ISLSKIKLSYFPSIEYYNNYIANLSDLLMNIQSPAEKRYFHTIEEFSIKVRIIMVKGPAQ GKVNRPNMQIKGGIDQINLKLKPSIYKKLLKLGQCFAVPDEEKRRNSLQTLDQVELEKNL LLKNSTKIGIIYKRGNALKTWEKYNGILSGGYLYLFENPKDLKPVEYIWVKNSTITPMDE NLVGFNSAFNVKNRYVDAYFACEKSNLSQQWMEAIDQVKTTTFLQNTITDDEIQQLIEFQ EKQESEEISPENKKKSSEQNSQYFDVVQMEVSFELGQIQLSMFDENKYYQKPFLAFQTNK LQFFYQQKKNMAVDIGLEEMMQYDSFYQQTDYFLNDFAPNKCSDDAQLFTNKTIIQTNLQ NTLFKIYFSDLKLINKTIRILLEDMQQKPNGTQDQQVNQNNMESDTPKSQQTYTEDVQFS SEEDRIKKKLEDEENQIVALAKSEKSINIFNLDADLQGFQICIINDLNSSYVPIFDLNIF EMNVKLKQSNIQLSVVTMIQFNAAYYNPRVSLWEPIIENAGFSIDFIKSQLSNIKQLIVI EMNPNYPTFNLTFSTQLLSIMTKSIKIAKQEISQKSQKDSHQYAQCFEDQIEQLSIQENC HYASPYTIRNETGYPIEVLTDLSNLENTRQKHKISRMHKKIYSSTLMNYEEKNFEIDMKE SDIINDPIKKQTFVFKKYSDQVKVKVQIPGFNLKYIEQVDLDKVRNRLRACKNKHGKKLF DVITEVKLDPVSLKKILNISSPYYFENDCFRIINIQLYDEKKNFKLEFTVMKGQKVPIPI DLQNGFFKAAFYGDTEFSDSLSINKLCNKYLNQEKEIKLGDTFLIFKVHKDIENDKRFMI CIEPPYKIKNCLPKTITIQFINHKKVTAITQSIPSGDIFEFYNCSQDNESFMKIQIPGHF WSNEAKISQNVIEKIMIKDVNGNQSEIICHQRRLEHQNIGDYRQFYIYCKGYLINESPYK LNIYTANKENKNECKLVGGQQQIYPEEALNTNIILFGQEIGDLMSLSDVKFGKVSQQASI GGVGNTQIDLQTFDAQGATVFQTMGINVSLENVDQEQKLFSKVITISPRFIIVNKTGQSI QVRQSGFGKSTTIEKDSRIPLQWYDQREKRYLNLKILEDKQYWKWSGNLNVLELGTVNFL TRNLKNKMEITFLRIDVRSDASNIFIVVEKVNEKERPYLIKNYSRHFKIELQDLHITLPA YKKNDSQFLRDQHKYYFSWEHPFDKERKVVSCLIPNNQSFQKTNLKFSPDEIYFQDKIQI LPVGQKDPELAREQSLYIKYSIDIDGFTKIIRFEDSSLEDPVDKKEKAAYKKKLQQDKKR RGSVQQIDRKEINITENTENDEEQPEQSEQICIQQQISIYIKDFGLSVIQNHRINEKPTE FLYLTIKGLEFISVAKEESKTYQLRIKLLNIDQNNSYSIVNPVIFTPQKYIMYSSEASHK FFMNVMIEQNLYAKNITLYNNIVIEIDPFAVRIEEQFILTLLDFLKAIREAKQEAETQNV NTLKEYLEESQQIEKIQNTKFKWQDCEIPPTSIPTFVNQLILSNIELSITFKANLKAKDS DLNIVFTALGVALADIEAPIKLKGIRLINCFETVPGIISKLTSHYKDQAITQVLKACGSF NIIGNPVGLFQNISTGVNDLLNKPAEGFVQGPLEGGLGIMQGTSSLIKNTMAGAFYSVNK FTGSLSSGISALCMDEEYLKERDILRSKKPEHFVDGAVQGATSIYSGVANGIAGVFIKPL EGAQRGGALGLLKGIGEGIAGLFVKPVSGFLDAVSSVADGIKNTITYGDDKANEKRLRYP RVFYGREGFYKEYIDLDAGMKLALQLVSKGKFRNSDFLQTFLIQIDENNKKINNVLVITF EIIMLFDEIKKKKKWYFSTSDLAEIELEQNGIFFSTTKKIKKQNSKEVLLQIPCQEQKEY IFKQINTLKFQLEEERKIEELDK NT seq 9432 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgtctgagtagaatttaatgagttgtaatttaactactaatgataacgcttattctatt aaatcattgataaaagaaaatgggcttcttaaaaagcttttagaaaaaagggaaaaggat atcatttgcttaaaaacacaattagaaaaagaaatgaatacagcaaaagcattagagaga tcaaaatagtttctttcctctcaattaaactctattagaaattttgttaacaaaaaaaca aaaagtattcttgaaaacttaatcggttagcctgttagcgatgatttataattacagaag caagcgtaactaatagcaggaggtgaagaaatagaagaccaatattaaatttaaagtatt tatgaattatttactatactcgaagagagaattactgcacatatgtaaacaataattaac agataaatagatcctaaacaagatggctaaagagattagttatatgttattggttaaact taatctataaaatagatagataatgaagagaaagaataaattaaatctaatttaaatggc ttaatttcatcggataagaaagcaaaaaaaaaataataataatctgttaaaattgtcact ttttaagaagactaatgcatctaaaggaaagatgaagagacaattatgttaggaagctat aaaagctcttctgatgaataagatgttatgtcaacatcaattaacaactaccttacttct gtccataccaataagatcaataatttgaccttaggttcctaggatattttagtttcccca atcctaaaatctaaacagtgctcataaaaataaaaaaactcttaatttttttcattttat gatgaggatatgagagacatggttgctaatagttaagaatagcttaataaaaatcttaaa aatagcgactctccttcacaaaatcttcctcaaaattaagattgtcaatacaaaaatatt ctttcctacagcgactgtaaataatctgaagaagttgaaaagtagaatttaaatatacat ggcatgaataattatgataatattgaaagaaaactaataaataaatcaaaatcacttggt gttatagaataaaacaatagtttgattttaaataataaatctaaaagattaaatagcgcc acacctactaaccatagtctaaaaaaaaaacaataagaaacttgccatttttaaaaaaaa agctttttttggtgtgaataataattaaaatcacaagaagaataacaataacaaatagag tcagatatttcatctagaagttgttctgattttttaaaattaaaaagcaactcgaatttt tcaaatttaataaataaaaataaacctgataaagactaggaagaagagaattaactcata ttcagtgataaagttatcaagcactctaaaaccggagcatcctaagaaataataatttta ttggactaaacttatttctatgtattttaaaatttgtcttagatcaataatttcaaaaga ttctatattaaagacataaaccaaataaatacttcatctaaggacagtataaaggggaag atagatatgttttaaagtttaataagctctgttttagataaagttgcaggcgaatatgtt ttaggtttgaataaagagaacttaaacataggtattttttcaggggaagttaagatagaa aatgtttcgctcaatccaaatattgttaatatgctggaactacctatcaatcattaatac tcttctattaaaaagctagagcttaaggttccactcaaaaatattggttctatgcctgta gaagtttttttagatggactttatttgattgctactccaaaagagtagaaagagtggaaa ttcaaagactacaattcttttaaaacaaagctagcaaatgttgaagctttcgctgctgaa tgcgtgcaaaaaatagcagctaagcaaaaagaaaagcttaaaggaggacaagaagcagga tacatctaaaaattaactatgaaaattgtagataatttgcaaataacaataagaaatatt catgtacgctttgaagacacgttgaccaagagatactcttggggtttctgtttggataag ctagaaatttatacaacaaatattgaaggagttaaagtattcgttgatagaactatttag gaaaataaagataagcccattcgaaagcttcttacaatatcaaatgcaggtgtttattgg aatgcaaatgaaactcgcttaatttctgatttgaatgaagaagtgaagttcaaaatttta aatgggatgatttaaaaggaaggataagacaagacagatgagcctgtcgactttctcttc aaaatttcatctcaagtgaacctaactattaacaataaaggtaactttgacgttcctgaa attaaggtcattctaaatttggaacatatcactttacatctctagcaaaggcagctatag cagcttatagaataaattgaattcctctctaaatattcaagggaattagaaataagaaag aaaaatgaaaaaaagataagtgcaaaagagatagaagcattaggagatctttttactaat ttatatacaaaaatgtaagaataaaaaaaagacaaatccattgcctgccttacggagaaa gagaaacatcaatttgaagaagcaataattaagctagatatgtaaatcttgttacaaaga acaaaaaaaatagtcatacaagtatagagagctcttaaaatcaaggagctggaaaaaaag aagtttgatgaaaaataaggtttctttgcaagatggctttggggttcaaggaacacaaat tcgcaaacctctctagttacagaagaggaaaaagcagaaatagataattttattgatgaa atctttggagaagaaaaaattgatgccccaacaataattagaccataagattatgtttac tttgttttagattacaatttgcatggagctagcatcaaacttagcaatagggttggataa gaaatttagtctttataatttagcttaaatagcatttatgggagtgtttggatccgtgaa aacaataaataaatatgggttaatttaagaagcatggaattgcagatgatagacgaattt ttgtagaacaactcttacaaagtaattaacattctaagtcctacaatttagaacagtaag aatcctttaattgaattcaaaatgacatctaaaccattagaaacacctcacatagactaa gtaatagatataaaaatgcgctcgattcgtgctgactataatccatacttagtaataagg gctgtgtagttttttgatgtcaaagtgaaggatgactaacttaaatagaaagcaaaggac aaaatagcagaacaaattgaaaaaaagtaatcatccctttcagagacaatgaaaaacgcc tccgttctcaaattgaagattgacttagagtctcctgttatcgttttgccttttaaaaca gatggatctctcacaaatgaatgctgggttcttaatcttggtaatctttccgtttacaca ttagaagacattcttaaacctactctgccaatctaaatgaaggtttttgatatgtttagt atttcacttagcaaaataaaattgtcttattttccttctattgaatattacaacaactac attgcaaatctaagtgatttattaatgaatattcaaagtccagctgaaaagagatatttt cacactattgaagaattctctattaaagtgagaattattatggtaaagggacctgcctaa ggcaaagttaacagaccaaatatgtagataaaaggtggaattgattaaattaatttgaag cttaagccttctatttacaagaaattgttaaaattggggcagtgctttgcagtacctgat gaagagaaaagaaggaatagcttgcagactttggattaagtggagttagaaaagaattta cttcttaaaaattcgactaaaatagggataatttataagagaggaaatgctttaaagaca tgggaaaaatacaatggtatactttctggaggctacctttatttatttgaaaatccaaaa gacttaaaacctgttgagtacatctgggtaaagaactcaactataacgccaatggatgaa aacttagttggctttaatagcgcttttaatgttaagaataggtacgtggatgcatatttt gcttgtgaaaagagtaatttgtcttaacaatggatggaagctatagatcaggttaaaaca acaacttttttacaaaacacaattactgatgatgaaattcaataattaattgaattttaa gaaaaataagaaagtgaggagatttctccagaaaacaagaaaaagtcttcagaataaaat agtcaatattttgatgttgtttaaatggaagtttcttttgagttaggctaaattcagctt tctatgtttgatgaaaataaatattatcaaaaacctttcttggctttctaaacaaacaaa cttcaatttttttatcagcaaaaaaaaaatatggctgtagatataggcctagaagagatg atgcaatatgatagcttttactagtaaacagattattttttaaacgattttgccccaaat aaatgttcagatgatgctcaactctttacaaacaaaaccataatttaaacaaacctttaa aatactctgtttaagatatatttctctgaccttaaactcataaacaagacaataagaatt cttcttgaagatatgtaacaaaagcctaatggcacttaagattaataagtaaattaaaat aatatggaatctgatactcctaaatcatagtaaacatatactgaagatgtttaattctca tcagaagaagatagaatcaaaaagaagcttgaagatgaggaaaactaaattgtggctcta gctaaaagtgaaaagtcaataaatatctttaatttagatgctgatctttagggcttttag atttgcattataaatgatctgaattcatcttatgttccaatattcgacctaaatattttt gagatgaatgttaagctaaaatagagcaatatctaactaagtgttgttacaatgattcaa ttcaatgctgcttattataatcctagagttagtctttgggaacctataattgaaaacgct ggatttagtatagatttcattaaatcttaacttagtaacataaagtaacttattgttatt gaaatgaatcctaactaccctacgtttaatctgaccttctcaactcaattgttaagcatt atgactaagtcaataaaaatagctaagcaagaaatttcttagaaaagctaaaaagattct catcaatatgcttaatgttttgaagatcaaattgaataattaagcattcaagaaaattgc cattacgcttctccatacactatcagaaatgaaacaggatatccaatagaagttctaact gatctctctaatcttgaaaataccagataaaagcataaaatatcaagaatgcataaaaaa atttatagtagcaccttaatgaattatgaagaaaaaaattttgaaattgacatgaaagaa tctgacataattaatgatcccataaaaaagtaaactttcgtcttcaaaaagtactctgac taagtcaaagttaaagtataaatacctggatttaatttgaagtacatagaataagtcgat ttggacaaagttcgtaatagactaagagcgtgcaaaaataagcatggtaaaaagttattt gatgtcatcacagaggtgaaacttgatcctgtttctttaaagaagatcctaaatatttct tctccttattacttcgaaaatgattgctttagaatcataaatatataactttatgacgaa aagaaaaatttcaagcttgaattcacagttatgaaaggatagaaagttccaataccaatt gatctccaaaatgggtttttcaaagcagctttttatggagacaccgaattttctgatagt ctaagcatcaataagctctgtaataaatatcttaactaagaaaaagagattaagttagga gatacctttcttatttttaaggttcacaaagatatcgaaaacgataaaagattcatgatt tgtattgaacctccttataaaataaagaattgtcttcctaaaaccataacaatttaattt ataaaccacaaaaaagttactgccatcacttaatccataccaagtggtgatatatttgaa ttctataattgctctcaagataatgaatcattcatgaaaatatagattcctggtcatttc tggagtaatgaagctaaaatttcataaaatgtaattgaaaaaataatgattaaagatgta aatggaaatcaaagtgaaataatttgtcattaacgaagattagaacactaaaatataggt gattatagacagttttacatatattgtaaaggctatcttattaatgaatctccttataag cttaacatatatacagccaataaagaaaataaaaatgaatgtaaacttgttggtggataa caacaaatttatcctgaagaggctctaaatacaaatatcatcttatttggataggaaata ggtgacttgatgagtttatctgatgtcaaatttggaaaagtatcttaacaagcatccatc ggaggtgttggtaacacttaaatagacctataaacatttgatgcataaggagctactgta ttttaaacaatgggtattaacgtttcattagagaatgtagactaggagtaaaagcttttt tcaaaagtaattacaatttctccgagattcatcattgtaaataagacaggttaatcaatt taagttagataaagtggatttggtaaatctaccactattgaaaaagattcaagaatacct ttgcaatggtatgatcaaagggaaaaaagatacttgaatctaaaaatactagaagataaa tagtactggaaatggagtggaaatttaaatgttttagagcttggaactgttaactttttg acaagaaatttaaaaaacaaaatggaaattacattcttgagaatagatgttagatctgat gcttcaaacatatttattgtagttgagaaagtaaatgaaaaagaaagaccatatctcatt aaaaactactcacgacattttaagattgaactctaagatcttcatatcactcttcctgct tacaaaaaaaatgatagtcaatttttaagagattagcataaatattacttctcatgggag catccatttgataaagaaagaaaggttgtttcttgcttgattccaaacaattaaagcttc caaaaaacaaatttaaaattttcacctgatgaaatctacttctaagataagatttaaata cttccagtaggataaaaagatcctgagttggctagggaacaaagcttatacattaaatat tcaatcgatatcgatggttttaccaagataattaggtttgaagattcaagccttgaggac ccagtcgataaaaaagaaaaagctgcatacaagaaaaaactttaataagataaaaagagg agaggttctgtttaataaatagatagaaaagaaatcaatatcactgaaaatacagaaaat gatgaagaataacctgaataatcagagtaaatttgcatttagcaataaatcagcatctac atcaaagattttggtttatcagttatataaaatcacagaatcaacgaaaaaccaactgaa tttctatacttaacaatcaaaggcttagaatttatttcagttgctaaggaagaatcaaaa acatactaacttagaattaaattattaaatatagattaaaacaatagctacagtatagta aatccagtaatctttacaccttaaaaatacattatgtatagtagcgaggcatctcataaa ttctttatgaacgttatgatagaataaaatttatatgccaaaaacattaccctttacaat aatatagtaatagaaatagacccctttgctgttagaatagaggagtagtttatattaact cttttggattttctcaaagcaataagagaagcaaaataagaagctgaaacttaaaatgtt aacactctcaaagaatacttagaagaatctcaataaattgaaaaaatttaaaacaccaaa tttaaatggcaagactgtgaaattcctcctactagcattcctacttttgttaattaatta atattatctaatatagaactttctattacttttaaagctaaccttaaggctaaagactca gacctaaatattgtctttactgctttgggagttgctttagcagatattgaagcaccaatt aagcttaagggtataagattaataaactgttttgaaacagttccaggaattataagtaaa cttacttcccattataaagatcaggctattacttaggtgcttaaggcttgtggctctttt aatatcattggtaatcctgttggtttgttctaaaatatttctacgggagtcaatgattta ttaaataaacctgctgaaggatttgtataaggtcctttagagggaggtttaggtataatg caaggaacttcttctttaattaaaaatacaatggcaggagccttttattcagttaataaa tttactggctcactttcaagtggaatttctgcattgtgcatggatgaagagtatttaaaa gaaagagatatattaaggtctaaaaaacctgaacatttcgttgatggagctgtttaagga gctacttctatatattctggtgtagcaaatggtatcgcaggagtttttattaaaccttta gaaggagcttaaagaggcggagctttgggtttgttaaaaggtattggagaaggtattgct ggattatttgttaaacctgtttctggtttccttgacgcagtgtcatcagtggctgatggt attaaaaatacaatcacgtatggagatgataaagcaaacgaaaaacgcttaagatatcct agagttttctatggtagagagggcttctataaagagtatattgatttagatgcaggtatg aaactagccttgtaattagtatcaaaaggaaaattcaggaattcagatttcctgtaaact tttttgatttaaattgacgaaaataataaaaaaataaataatgttttggtaattacattt gaaataataatgctgtttgatgaaataaaaaagaaaaagaaatggtatttctctacatct gatttagcagaaattgaattagaataaaatggaatctttttttctacaacaaaaaaaata aaaaaataaaatagtaaagaagtcctactttaaataccttgtcaagaataaaaagaatat attttcaaataaattaacactcttaagttttaacttgaagaagaaagaaaaatagaagaa ctagataaatga

DBGET integrated database retrieval system