Tetrahymena thermophila: TTHERM_00128620
Help
Entry
TTHERM_00128620 CDS
T01020
Name
(RefSeq) UvrD/REP helicase family protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7832312
NCBI-ProteinID:
XP_001016343
TGD:
TTHERM_00128620
UniProt:
I7M1D1
LinkDB
All DBs
AA seq
1701 aa
AA seq
DB search
MDNQNKYRVINYQDYNGSECEIRPSQEQLKVILSDLNEDQKIIACAGSGKTTTLVIRLKY
LIDQGVQPEQILVTTYNVDAGKNLKKRAKEIIGCQSCRIEIGNIDKVAFKIYQKFILSAQ
KQQSDLKSSVKEFCNKLYQFLQTPEGEQQVLSKYKYFFFDEFQDVNQLQYDILILFKKKG
SNITVIGDDAQNIYGFRDSKLELIQKQIDQDVLKITNKKIHEYQLSLNYRCSKPITEFSN
QIIAKSKYLIQKEMKYNTQKNYQKSQQPQIKLYKNWEHQVNSIIDQIKYLQETYSLNEIA
ILSPTNLPLRFFEEKLEKNNKELINGQIPFIYRSQSIKEFYSINDDDPNDTEPKLTLSTL
HQAKGLEWKIVFFIGINDQHFPGEFMNQRTFKLQKLEECRRLFYVGCTRAINQLNFSILQ
RKPQEKCPIVCRFFSEIDQQYFKVDENIKKEDFAPIQGQENCRHKGLENQTQITKIIEEF
NYHDLEKIDKYLKDIKFFLKEDIHKKPSFDIKQIAKNRLSVDLGIYIDILFQRIIAEKYN
SVQGYTYSDAEKVLFSINWANQRAEIVFKYKQFFENKNLQFDQIEDSDEFIDVINMFYIE
KSKQTFKLQDREIKVLKDIYEELKKFMARNNLNYSNVSHLLIEGKNDRVLQFFPEDFDDK
HIYIESYKKYCNPNYQTMDILYDIYNVSKCGQLVNLIRRSLYRNDFQLFNPIDLKLIIDK
FLDFLKKQNFKKIQVKKRVKDDNLIGEIDFIADDTIFEIKSSSSYEVQKEYIIQCLAYAS
LMRKQGEKINSIAFYNPLQGYTSFYDISNWNQENEFCDFLFQTSLNKIIEKQQQSQSFTN
DPPIDQNEYILIEEDQEDSQDCIEIQSEEFRDNYNTQHYIEQLQDYVKKDNSCNGIQQLI
EVSEHKINEKLGTEYKKLHFVEKISNELEFLESGSQFISSNQKNINQLLENKCELDQNQS
DYQTEQKSQKIHQKNVSNLDFSDTESNYSNKQNQNISLSPSSLNITPIKLSQAIQPEYVV
IEDDQELDFLNNSKNFDKRTLNEMENERQIQQQLFEQKYQEKVNQNVNLFLEQFSNKINY
QNQIINQQNQNINELQNCSNLNPIKLNNETGLNQKIGQNSQERDIGNTIPLINEKIHNRE
QNQCFFNCNDLISIESSHEKEEIQNNDDIQFEQDSLSSELDIMQTSQLQINPINLSEIDF
IQQYDSESQLKTSNIGCKRRDIEVKSESKKGYSQDDVENKDHLKQNQQIYKENLSEKNQI
CDQIYDQITFSQLFNHSDSHKNNQEYENNKEQEQDMKDQKVSIYFEDNQKQPYEHFINCN
LSIQCSINDQYINNQQQKYEDLPQMKQDNSEQESQSQQQFNDQNVEKYIIESQLQNKQNT
VNLNKQQSQSGLKIESQFNVYESEISKQFQVEYKEQQQDNYGQSGQNNLYLSNQSNKTQQ
QIDKSEFQTNQENSKNKQNLQQFNQNGSKLKLQKSNSENIGNGMTNLIENNQMQKNFNKI
ISNLDNQNQFQNTKQLTLQNMESFQIQNYQNGFENLQIANNSNYHQKNDIQFLNQQYNKK
NYHLASHENDEIKNLQSHPLQGEIIEYNNEKKEIVTQKCLEEIHQQTNVENINFPQNYQI
QRFQNIKNIQNSNLKQLNSKRKANETIHQLQKEFQQDIQKKIKIEPNYDIKHTQITFCKE
LLILLSLIWFTFMLFKNKQFQ
NT seq
5106 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacaactaaaataaatatagagtaattaattattaggattataatggatcggagtgt
gagatcaggcctagctaagaataattaaaagtaattttatcagatttaaatgaagattaa
aaaattatagcatgtgcaggttctggtaaaacaacaactttagtgataagattaaaatat
ctgatagactaaggagtttagccagaataaattttagtcactacttataatgttgatgct
ggaaaaaacttaaaaaaaagggcaaaagaaataataggatgccagtcttgcaggatagaa
ataggaaatattgataaagtggcttttaaaatatactaaaaattcattttgagtgcttaa
aagtaataatctgatttaaaatctagtgttaaggagttttgtaataagctttatcagttc
ttataaacgcctgaaggggaataataagtattgtcaaagtataagtactttttctttgat
gagttttaggatgtaaatcaattgtaatatgatattctaatcctttttaaaaagaaaggt
agcaacattactgttattggtgatgatgcttaaaacatttatggattcagagactcaaaa
ttggaactgatttagaaataaattgattaggatgtattaaaaataacaaataaaaagata
catgaatactaactatctttaaactataggtgctctaagcctataacagagttttcaaac
taaattatagctaaatccaaatatttgatttaaaaagagatgaaatacaacacataaaag
aattactaaaaaagctagtagccatagattaagctatataaaaattgggaacactaagtt
aacagcataattgactaaattaaatatctataagaaacatactcacttaatgaaatagct
attctaagtccaacaaatcttccattaagattctttgaagaaaagttagaaaagaataac
aaggagttaattaatggataaatcccttttatttacagatcttagagcattaaagaattt
tactcgatcaatgatgatgatcccaatgatacagaacctaagctcactttaagtactttg
caccaagcaaaaggattagaatggaaaatagtattttttatagggataaatgattagcat
tttcctggagaattcatgaattagagaacatttaaactataaaaattagaagaatgcagg
agattattctatgttgggtgtacaagagctattaatcagcttaatttttctattttataa
aggaaaccataagaaaaatgtcctatagtttgtagatttttcagtgagattgattaataa
tattttaaagtagatgaaaatataaaaaaagaagattttgcacctatataaggccaagaa
aattgcaggcataaaggtttggaaaattagacttaaataactaaaattattgaagaattc
aattatcatgatttagagaaaatagataaatatttaaaagatattaaattttttctcaag
gaagatattcataaaaagccaagttttgatataaagtaaattgcaaaaaatagactttcg
gtggatttagggatttatattgatatattattttaaagaataattgctgaaaaatataac
tctgtctaaggctatacttatagtgatgcagagaaagtccttttttctataaattgggct
aattaaagggcagagattgtttttaaatacaagcaattttttgaaaataagaatttacaa
tttgattagatagaggattcagatgaattcatagatgtaattaatatgttttatatcgaa
aagagtaagcaaacctttaaactttaagatagagaaataaaagttttaaaagatatctat
gaggaattaaaaaaatttatggcaagaaataatttaaattacagcaacgtcagccatttg
ttaattgaaggaaagaatgatcgagtgctttagttttttcctgaagattttgatgacaaa
cacatttatatagaaagctataaaaaatattgtaatccaaattactaaactatggatatt
ttatatgatatttacaatgtcagcaaatgtggctaattagtaaatttaataagaagaagt
ctttatagaaacgatttctagctatttaatccaatagatttaaaattaattattgataag
tttttggattttcttaaaaagtaaaattttaaaaagatacaagttaaaaaaagggtaaaa
gatgataacttaattggtgaaatagattttattgcagatgatactatttttgaaattaaa
tcctcttcatcctatgaagtacaaaaagaatacattatacagtgtttagcatatgcatca
ttgatgagaaaatagggtgaaaaaattaattcaattgcattttataatcccctgcaagga
tatacttcattttatgatatctctaattggaattaagaaaatgaattttgtgatttcctt
ttttagacttctttaaataaaattatagaaaaataataataaagttaaagctttaccaat
gatccaccaattgattaaaatgaatacatattaattgaagaggattaggaagactcttaa
gattgtatagaaatataaagcgaagaatttagagataattataatacatagcattatatt
gagcagctccaagattatgtgaagaaagataactcatgcaatggcatataataattaata
gaagtaagcgagcacaaaattaatgaaaaactagggacagagtacaaaaaattgcacttt
gtagaaaaaatatcaaatgaattagaatttttggagtcaggaagttaatttataagttca
aatcagaaaaatataaattagttactggaaaataaatgtgaattagattaaaatcaaagt
gattatcaaactgaataaaagtcttaaaaaattcattaaaaaaatgtaagtaatttagat
tttagtgatactgaatcaaattattcaaacaagcaaaattaaaatatttcgctatcacct
agtagtttaaatataactccaattaaattaagctaagcgatttagcctgaatatgttgta
atcgaagatgattaggaattagactttttaaataatagcaaaaattttgataaaagaaca
ttaaacgaaatggaaaatgaaagataaattcagcaatagttgtttgaataaaaatattaa
gaaaaggttaattaaaatgttaatttatttcttgaatagttttctaacaaaattaattat
caaaactaaataataaatcaataaaattaaaacatcaatgagttataaaactgttcaaac
ttaaatccaataaaacttaataatgaaactggtttaaattaaaaaataggttaaaatagt
caagagagagatattggcaatacaattccattaataaatgaaaaaattcataatagagaa
taaaattaatgttttttcaactgtaatgatttaatatctattgaatcatctcatgaaaaa
gaagaaatttaaaataacgatgatatttaatttgaataagattccttatcatctgagcta
gatataatgtagacctcacagttataaattaatcctattaacttatctgaaattgatttt
atttaataatatgactctgaatcataattgaaaacaagcaatattggctgtaaaagacga
gatattgaagttaaaagtgaaagtaaaaaaggatattcacaagatgatgttgaaaacaaa
gatcatttaaaacaaaattaataaatctataaagaaaatttaagtgaaaaaaattaaata
tgtgactaaatttatgatcaaattacatttagttaattattcaatcactcagactcacat
aaaaataattaagaatatgaaaacaataaagaataagagcaagatatgaaagattaaaaa
gtcagtatttattttgaagataatcaaaaataaccttatgaacactttataaattgcaat
ttgtctatccagtgctctattaatgactagtatataaataatcaataataaaaatatgaa
gatttaccataaatgaaacaagataactctgagtaagaatcatagtcataatagtaattt
aatgactaaaatgttgaaaaatatattattgaaagctaattataaaataaatagaatact
gtaaatttaaacaaataataatcataatctggtctaaaaattgaaagttagtttaatgtt
tatgaatcagagataagtaaacaattttaggtggaatataaagagtaataataagataac
tatggctagagtggttaaaataacttatatttgagtaattagtctaataaaacacaataa
taaatagataaaagcgaatttcaaactaactaggaaaattctaaaaataaataaaattta
taataatttaatcaaaatggaagcaaactaaaattgtagaaaagcaactctgaaaatatt
ggaaatggtatgacgaatttaatagaaaacaattaaatgtaaaaaaatttcaataagata
atatctaatttagacaattaaaattaattttaaaatacaaaataactcacactttaaaat
atggaatcattttaaatttaaaactattaaaatggatttgaaaatctttaaatagctaat
aattcaaattatcattaaaaaaatgacatttaatttttgaattaacaatataataagaaa
aattatcatttagcttctcatgaaaatgatgaaattaaaaacttataaagtcatccatta
caaggtgaaattatagaatataataatgagaaaaaagaaattgtaacataaaaatgttta
gaagaaatacactaataaactaatgttgagaatattaatttcccttaaaattattaaatt
taaagattttagaatataaaaaatatataaaacagtaatttaaaacaattaaacagcaaa
agaaaagcgaatgaaaccattcactaattacaaaaagagttttaataagatatataaaag
aaaataaaaattgaaccaaattatgatattaaacatactcaaataacattttgcaaagag
cttctaatattattatcgctcatttggtttacatttatgcttttcaaaaataaataattt
taatga
DBGET
integrated database retrieval system
