Tetrahymena thermophila: TTHERM_00145920
Help
Entry
TTHERM_00145920 CDS
T01020
Name
(RefSeq) endo-1,4-beta-xylanase xylA, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
7839543
NCBI-ProteinID:
XP_001011231
TGD:
TTHERM_00145920
UniProt:
I7M0V0
LinkDB
All DBs
AA seq
1136 aa
AA seq
DB search
MHQNNFLFVTGFSSKPEILQRNHSFLNDPKQSGSHDINQNKKPKTDFVQKNKIIIKIQKI
QNQQQNGEQNMEPNPLKNAQIKIKKSQFSKKLNQSVGLDDSRENCSDIVKLSQSFDCKLG
QAKKILRRIIPKDQQYQNRPFSTMERYVEESNENQTKFRTNFIKFEQDKENQDMNQNFQL
QNETNIKDSTCSKSDNLNQNKNSEHGMSSSTKSDQNQKKYGIKCATQPDLDNSIVENNQL
LDMVDLNDINLQNNRLKAQLNNQILTNYIVKDSYFNQDKKRDNLQPKNLKTSVIEAKKKF
INVRNIVNQSLGEPTLDISDETQKIQGNNKNFKILRKSNQHEQNLIDQYDMNSNNNYIKL
QQTQNQLNASKNKKDTDSYSTLTFNQKSTVDQTSPSQQNTKQIYQSQQNNAQQNRSTVNN
QETRINQMQEQNIKINGLNQSYNQQLSENIQSNQQDIPESQTQNSQTVSQINNSQIDNNE
QQFYQQEANIFKHQQRVIHKSYDYQLGVKNFANQNPLYQSNFENEQQLIGSYPQQNLLTE
SNHNQPITEKFNNQNSKNHGLMKQNLILFQNNKKQETLKNNIANQNCSQISSQFQMELVS
DQGFKPQQYGKSPFKQNTKQIIINPNLQKKFNFNQQQVQQNQQQLMNAYIDMNYRANTEP
VSQQNSINQYTPLSLQKKINTQSNINNKSKQNADGHFNNFLEDFNLDSISINANQPLTKS
SQKSRKTVNQVQYHFEINSQSGVTPLSLQNKSNAALKNTIRGQSYSQQNQYNTNNIYQNN
QQIQKYVKSASSLGFNEADQKSNYNIISHPPLLSQSQDNISDSSLLSNNYVPFPMQGNQI
FNSNSTQSRKSGGTGGQNLIFQFHEVNQHQNNQRSQSQNANRNHEMNFNLSIDRTSQISG
SQRSQSNHNNLNQFQNFKPQSLNFAPPSCSSIQSLYSSKCQNQLQSKYCNSNTINSSKNL
IGDFNQNTMMKEMYTELDEDVRIFDCSPKRIMQLKQNNLQRSSVTLSQSQLDFSNTNNLT
STSSKFGLNNQNQQNDLKQFNETAKVFISKLDNTNKASETNQLIEQYLNQVRNRITQLKN
KKKNTEIDLILVNTKIIQEIEQTNTNQKQKMPHNLSQQLDEIYQQIKKNIFIYSCQ
NT seq
3411 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcattaaaataactttttatttgtaactggattttcttcgaagccagaaatactttaa
agaaatcactcttttcttaatgatcctaaatagagtgggtcacatgatatcaatcaaaat
aaaaaacccaaaacagactttgtttaaaaaaataaaataataataaaaatataaaaaata
taaaatcaataataaaatggagaataaaatatggaaccaaatcctcttaaaaatgcataa
attaaaattaaaaaatcttagttttcaaaaaaattgaattaaagcgttggacttgatgat
tcaagagaaaattgcagcgatattgtaaaattaagctaatcgtttgactgtaaattagga
taggctaagaaaatattacgtagaataattccaaaagattagcaatactaaaatcgtcca
ttttctactatggagagatatgtagaagaatcaaatgaaaatcaaactaaatttagaact
aatttcattaagtttgaataagacaaagaaaatcaagatatgaattaaaatttttagcta
taaaacgaaacaaatatcaaagatagtacctgttccaaaagtgataacttaaaccaaaat
aaaaatagtgaacatggtatgtctagtagtacgaaaagtgattaaaattaaaaaaaatat
gggattaaatgtgctacttaacctgatcttgacaactcaattgttgaaaataactagtta
ttagacatggtagatttaaatgatattaacttgtaaaataacaggttaaaagctcaactt
aataatcaaatattaacaaactatattgtaaaagatagctattttaactaagataaaaag
agagataatttacaacctaaaaatcttaaaacttctgtaattgaagcaaaaaaaaaattt
ataaacgttagaaatattgttaattagagtttaggcgaaccgactttagatattagcgat
gagacttaaaaaatataaggcaataataaaaactttaagatcttacgaaaatcaaattag
catgagtaaaatttgattgattagtatgatatgaatagcaataacaattatataaagtta
tagcaaactcaaaattaattaaatgcaagtaaaaataagaaagatactgatagctattca
actttaactttcaattaaaaatccactgttgattagacttctccaagttaataaaatact
aaacaaatttattaaagccaataaaataatgcttagtaaaatagaagtactgttaataat
taagaaacaagaatcaattaaatgtaagagtaaaatataaagataaatggcttaaatcaa
tcttataatcaacagctttcagaaaatatttaatctaattaataagatattcctgagtct
caaactcaaaactcttaaacagtttcgtaaattaacaactcataaatcgataataatgag
taacaattttattaataggaagctaatatttttaaacattagcaaagagttattcataaa
agttatgattactaattaggtgttaaaaattttgcaaattaaaatcctttatattaatca
aattttgaaaatgaatagtaattaataggcagttatccacaataaaatttattaaccgaa
agtaatcataattaacccattacagaaaaatttaataactaaaacagtaaaaaccatggg
ttgatgaaataaaatctaattcttttctaaaacaataaaaagcaggaaactcttaaaaat
aatatagccaactagaattgtagttaaatttcttctcaattttaaatggaattagtttct
gactaaggattcaagcctcagcaatatggaaaatcacctttcaaataaaatacaaaataa
ataataatcaatccaaatctataaaaaaaatttaattttaattagcagtaagttcaataa
aattaataataattaatgaatgcttatattgatatgaattatagagccaatactgaacct
gtttcttagtaaaattcaataaatcaatacactcccttatctttataaaagaaaattaat
actcaaagtaacataaataataagtctaaataaaatgcagatggccacttcaataacttt
ttagaggattttaatttagatagtatctctatcaatgcaaaccagcctttgactaagagt
agccaaaaaagtcgtaaaactgttaactaagtttaataccactttgaaataaattcacaa
tcaggagttacacctttatctttgtaaaataaatctaatgctgctcttaaaaatactata
agagggtaaagctattcttaatagaaccaatacaatactaataacatatatcaaaataat
taataaatctaaaaatacgttaaaagtgctagcagcttgggatttaacgaagcagaccaa
aaaagcaactacaatataatatcacatcctcctcttctttcacagtcacaagataatatt
agtgacagttcactattatcaaataattatgtgccatttcccatgtaaggaaattaaata
tttaattctaattcaacttaatcaagaaagagtggaggaactggagggtaaaatttaata
ttttaatttcatgaagttaactaacattaaaataactaaagatcccaaagttaaaatgca
aatagaaatcatgaaatgaatttcaatttatctatagatagaacctcataaattagtggg
tcttagagaagttaatcaaatcacaataacttaaactaatttcaaaattttaaaccttag
tctcttaactttgctccaccttcttgttcatcaatttaaagcctttattcatcaaaatgc
caaaatcaattacaaagcaaatattgtaactcaaacacaataaacagttcaaaaaattta
ataggagattttaactaaaatacaatgatgaaagaaatgtatacagaattagatgaagat
gttcgtatatttgattgttctccaaagagaataatgcaattaaaataaaataacctttaa
agatcttctgtaactcttagttaaagttaattggactttagcaacacaaataatttgaca
tctacttcatctaagtttgggctaaataactaaaactaataaaatgacttaaaatagttt
aacgaaactgctaaagtatttatcagcaaattagacaatacaaataaagctagtgaaact
aattaactaatagaacaatatttaaattaagtacgtaataggataacataattaaaaaat
aaaaagaaaaatactgaaatagatcttattttagtaaacactaaaattatctaagaaata
gagtaaacaaatacaaatcaaaagtaaaaaatgccccacaacctctcttagtaattagac
gaaatatattagtagattaaaaaaaatatttttatttattcttgccaatga
DBGET
integrated database retrieval system
