Tetrahymena thermophila: TTHERM_00146330
Help
Entry
TTHERM_00146330 CDS
T01020
Name
(RefSeq) AAA domain protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_12
AAA_11
UPF1_Zn_bind
AAA_19
AAA_30
DEAD
PhoH
AAA_22
UvrD_C_2
RNA_helicase
AAA
AAA_5
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7840154
NCBI-ProteinID:
XP_001011272
TGD:
TTHERM_00146330
UniProt:
I7MI99
LinkDB
All DBs
AA seq
1186 aa
AA seq
DB search
MKGNQQNRHLVWQKVSEIKGFQVLCLDCRVFFDNQRNPNNSNNSSSIVSHLIQSKHNKVQ
LLINSGIAVQKHIVCSSCKLGDVFKLQIYDYPQGILLLCNECSFKFINQTKFKQDSEVKH
STVIQQNEINSILFDAKRVQLNPDILQINQNKKSKVQYIRKVDVVEANAGPQNISQAQQQ
KSTNNLNQNPQLIGSDKIQNKNQNASQEQKIEKLLKIQCLDCKQYFDNQKINGSLKTSII
KHLTKQNHNRITCILNQNQQKNITPDCYKCKKRNVFDLTICKVNNEQYLLCSQCLNKSNG
SLFTNDPNIAMKLVSTFPNEPLITNYSINSTFLDQLTKSDQPKQIQSDQTQLNQQSIPQN
IQIGLNNNNNQLLVSNNSNNEDTQVKCLQCNNIFQNQRNKHDSVTQIVKHLKKCSHNKIE
IQEKARKTSFSTFKCLSCNQNNIFVLFIVEIESFYFVLCNQCINSKMIQFQGKDSQSIEK
CKKSAIVQNGSINTLLMNLTIKKKEYYPVNNEHKNQPDQNQIEQDNNDDDYDFCLNGGND
NQVQVGMLNDPKTQNINNQDRNFDQSRNLQSIQVNSREEKKIEIFKNVEAYQHFFKKILN
QEQYEISKQIQQSVLTTKALILSENQLQIQVSSNHLLKQGKELKIKWGNFKSKFYVESID
DHKIVIKIQDSNKSLSRFKVGNVVENVQIKLINPKQIFERILQGINKFSSLEESLQKKIL
GQFEKDDKSIKSDDSLEIIDEQAQQDIAQLNQSQLQAIQSSLSKNISLIQGPPGTGKTET
AAQLVLEIWYKINKNQQNEKILVCAPSNLAADNISDRIHAQNREIKVIRIVSQARQRVKV
SYQFQDIVLHKVLKKEGFFNKNSVLKRAKQLIENADVICTTCINSVDKFIKGISFSTVVI
DEANQAIEPETIIPLQHQAKKLILIGDHKQLPPIILSIQASKDGLKRSLFSRLVQAGLIP
QFLSIQYRMHPEIRKLASSIFYQNQLKDGVNEQDRTPTPKFNWLNNKIPIQFYDVQGQEI
TLQDGKSFINEEEAKLVKSLVSQLIQAGVKDNDIGIITPYLSQSNYISQLIKNSNILIDT
TYSFQGQERDYIIISCVRINNFQNLGILRTPQLINVSITRAKRGLLIVGNKKHVSYSRWW
KQIIDYLDKLKLIQEIKKEPIENIYSIENNKIINKIDERLCFHKKS
NT seq
3561 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaggaaactagcaaaatcgtcatcttgtttggcaaaaagtatctgaaatcaaaggc
ttctaggttttatgcttggattgcagagtttttttcgataactaaagaaatccaaataac
tctaataattcaagtagtattgtttcgcacttaatctaatcaaagcataacaaggttcag
ttacttatcaattcaggcatagcagtttaaaagcatattgtttgctcatcatgtaaatta
ggggatgtttttaaactttaaatttatgattatcctcaaggtattctactgctttgtaat
gagtgttcttttaaatttataaattaaactaaatttaaataagattctgaggttaagcac
tcaacagttatctaataaaatgaaatcaattccattctttttgatgcaaagagggtttaa
ttaaatccagatattctacagataaactaaaataaaaaatctaaagtttaatacatcaga
aaagttgatgtagtagaagcaaatgctggaccacaaaatattagttaagcttaataataa
aaatcaacaaataatttaaattaaaatccctaattaatcggatcagataaaatataaaat
aaaaattaaaatgcatctcaagagtaaaaaattgaaaaacttttaaaaatttaatgctta
gattgcaaataatattttgacaactaaaaaataaatgggtctctcaaaacaagcatcatt
aagcatcttactaaatagaatcataatagaattacctgtatattaaactaaaattaataa
aaaaatattactccagattgctataaatgcaagaaaagaaatgttttcgatttaacaata
tgtaaagttaataatgaatagtatttactatgctcttaatgtttaaataaaagcaacggc
agtttatttactaatgatccaaatatagctatgaaattggtcagcacttttccaaatgaa
ccacttattactaattattcaattaattctactttccttgatcaattaacgaagagcgat
taacctaaataaatttaatcagattaaacctaattaaattagtaatctatcccacaaaat
atttaaataggcttaaataataataataattaacttttagtcagtaataacagtaataac
gaagatacataagtaaagtgcctttagtgtaataatatattttaaaactaaagaaacaag
catgacagtgtaactcaaatagtcaaacatttaaaaaagtgttcccacaataaaatagaa
atataagaaaaggcaagaaaaacttctttttctacatttaaatgcctatcatgcaattaa
aacaacatttttgttctatttattgtagaaattgaatcattttactttgttttatgtaac
taatgtataaatagtaagatgattcaattttaaggtaaagactcacaatcaattgaaaaa
tgtaagaagtctgctattgtgtaaaatggatcaataaatactttattgatgaacctgacc
atcaaaaaaaaagaatactatccagtaaacaatgagcacaaaaattaacctgactaaaac
taaatagaataagataataatgatgatgattatgatttttgcctaaatggaggtaatgac
aatcaagtttaagtaggtatgttgaatgaccctaaaacctaaaatatcaataattaagat
agaaattttgactagtctcgcaatctccaatcaatccaagttaattctagagaggaaaaa
aaaattgaaatatttaaaaatgttgaagcttattaacatttttttaaaaagatcttaaat
taagaataatatgaaatatctaagtagatataataaagtgttttaacaactaaagcactt
atcttatcagaaaatcagttgtaaatataagtttcctccaaccatctattaaaatagggt
aaagaattaaaaattaaatggggtaattttaaatccaaattttatgtagagagtattgat
gatcataaaatcgttattaaaatttaagattctaataaatctttaagtcgtttcaaagta
ggaaatgtagtagaaaatgtttaaataaaattaatcaatcctaaatagatttttgaaaga
atactgtagggaattaacaaattttcaagtctagaagaatctttgtaaaaaaaaatactt
ggttaatttgaaaaggatgataaatctattaaaagtgatgattcattagaaataattgac
gaataagctcaataagatatagcttagctaaattaaagttagctgtaagcaatttagtca
tctctctcaaaaaatatttcgctgatttaaggtcctccaggaacaggaaaaactgaaaca
gcagctcagctagttttagaaatatggtataaaattaacaaaaattaacaaaacgaaaag
attttagtttgtgctccatcaaacttagctgcagataacatttcagataggattcatgca
taaaatagagaaataaaagtaataagaatagtttcttaagctaggtaaagagtaaaagtt
tcatattaatttcaagatatagttctgcataaagtactaaagaaagaaggtttctttaat
aaaaatagtgtattgaaaagagcaaaataattaattgaaaatgctgacgtcatttgtact
acttgcattaattctgtagataagtttataaaaggtattagtttttcaacagtagtaata
gatgaagcaaactaggcaatagaaccagaaacaataatacctctttagcattaagctaaa
aaattaattttgataggtgatcataaataattgccacccatcatcttaagcatttaagct
tcaaaagatgggttaaaaagaagtttattttcaagacttgtttaagctggtcttatccct
taatttttatcaattcagtataggatgcatccagaaataagaaagttagcatcttctata
ttctatcaaaactagcttaaagatggagttaatgaataagatagaactcctactccgaag
ttcaattggctaaataataaaattcctatctaattttatgatgtctaaggttaagaaatt
actttgtaagatggtaaaagttttataaacgaagaagaagcaaagcttgtaaaaagttta
gtttcttagcttatataagcaggtgttaaagataatgatattgggataataacgccttat
ttatcttaatctaattatataagttaattaataaaaaatagcaatattttaattgataca
acatacagtttctaaggacaagaaagagactacataataatttcatgtgtaaggatcaat
aatttttaaaacttaggaattttaaggacaccatagctgattaacgtatctataacaaga
gctaagagaggtttactaatagttggaaacaagaaacatgtgagttattcaagatggtgg
aaacaaatcattgattatttggataaattaaaacttatttaagaaattaaaaaagagcct
atcgaaaatatttattctattgagaacaataaaatcataaataaaattgatgaaaggcta
tgcttccataaaaaaagttga
DBGET
integrated database retrieval system
