Tetrahymena thermophila: TTHERM_00155570
Help
Entry
TTHERM_00155570 CDS
T01020
Name
(RefSeq) 50S ribosome-binding GTPase
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MMR_HSR1
RsgA_GTPase
AAA_16
AAA_22
AAA_29
TniB
ABC_tran
DUF5919
Roc
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7838457
NCBI-ProteinID:
XP_001009683
TGD:
TTHERM_00155570
UniProt:
Q22WH9
LinkDB
All DBs
AA seq
1753 aa
AA seq
DB search
MEEVKEAHDKYNLFILNQQNNDSFEDKKLMFQLFLKHIENDIKCIEDEDYDMYCFYKYLI
ANQSIKYLNLNENQKKIFLYHLKTYKVSVIKKIKNTEIELNQLSSQLPTNNQLIQQCQNK
LKAEVELIKNEDKSLYDKYQKLMSERFDDKSVKIKKILNDIIELISYSSFQEDFQKQILQ
ALKLLEERIIILEEEEEEEEQEGFDRYGYYCFLLAYYIQENQNLNSKNAENCENIKKKYL
DNILNKIEKIYNNILNITSKQSIDQANFQKYLNSLQIEIQFLEKENFQKFGYYKYIIAEN
KLSYLKLNEKQKKKCEQEKKIFMDYYEQQLSLKSKENFQNENLKTRNIDLNIINQKQIQY
NQLDQSTPTLDVNLSQHQNQEQKQEEEARNQNINTSNISSQNSQYSQIQSQIQIQSNHLF
QKQTTVQQSISSSDNLDISSLSENESVILSQFQYYEQEYKQKLEEGNENINTSNISSQIP
QYSKIQNQIQVLSNQASQKQTTMQQSIYISQTLGISNLQQDESSIQSQLFLSNQILNKSI
YENQIQEKEKWKNQILFEFSKNNTVANINTIISQSQKDAFETQKVYLIMGETGVGKSSFV
QYLTGDPRAEIGHLGNSHTQKCRTFKKNELKFIDSPGINDTQDDRYQILLNIVKYLKQYK
YRFQDLFIICVSNKDINNHLKHIQEFSYTYFLYDLFGDQIKFKDVEQLVDEYFQSTCLLN
WQEAGFHYLQDQYTGKRVEIFKKKDQALNYIQYAQNLHIVVKTCFDKTHQENLKIFNNYK
VDFLKQQIWSNKKENINDLLAYKEYIQSQEVHLFNKIKKIIQFWDEVQIWNQGEQIQHLL
LIGGSQVGKSSLIEQLKQISGLRGSGTTSITSFCQIFLVEYNKVKYFFIDTPGFEGTEAN
QNQYHNLKIISDFLRRNRITEFKVLYMRDAERDVRDGMPQVLNKLFFFIQEMFDQDSSFI
DSLYLRELMTFQFSQTNNQSDYIKYQLNLIEKKILTIERVEKRNNKGLVYMNKFNKQSVE
FQSNFFTEYGKFIQVDIIEDDLQKKTLFEGVNQIEPICVDEKIFMKIKKTINSKIINNLD
DYMTAFKKVLELYQQYNNIFNLINIGRQNKQNISKDLNDQRIKIAEKLSNIIYIVIGDFQ
NTPEMKNYISKLFLNKISSNNEQNHQNELNNKVLNSIQKHFLKASYTPFLFEAQQNPNNI
FLSRKQLYYSSLAHQLSPFLRKSRPDHQKIIEKLSIIKILQELTFQSHVQSKQIELEINS
APEKIIDKIDAFISGINNIFGSGGQFFRQFYLINNVVEDIFKFKQVFNVAAKWQNYFLST
ISFGFDAYSYSKGKICRRQMELMTYFNIANTILPYCLSVSGIGWLGLFALGFIAERYLTQ
SFTSSQIFDKTLGLVLKTIIDDQHPNQVLLYFQKSEFLKQHKITNYSQTQSKEAYEMFRQ
LEEKNYKSGEQNKFLLKLFNQSEQPKRLKDEISKHIVKNIISKHFQFEFEQIQGQNLIQG
IEKQLKSNKQIIDTFYQRFNFNNLLKNIKQDQKKLKETLHQNEKQTNICLHDDTDFLQKL
NTYQQSLNVFIKHIENTSYNYKEQKEFCEKIPLSKCQYYPITFKGYCNLVHQKSQYIFMQ
DTISEIFKNNNCFEVKPENNFNHEFFQFQNDDELTYYLNLLILSDKFITSRYILKVKGNK
QPYLSFMNGTEVIDAEVEYSIDLFQKANESFNLKDFVEIIKIETKNQFNIDKEIYLRLKN
FFESIGNLKQIFG
NT seq
5262 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagaagtaaaggaagcacatgataagtataatttattcattttaaactaataaaat
aatgatagtttcgaggacaaaaaattaatgttttaactctttttaaagcacattgaaaat
gatattaaatgtatagaagatgaagactatgatatgtattgtttctacaaatatttaatt
gcaaattaaagtataaaataccttaatctaaacgaaaattagaaaaaaatatttttatac
catttaaaaacatacaaagtgtcagtaataaaaaaaattaagaatactgaaattgaatta
aatcaactcagttcttagttacctacaaataactaacttattcaataatgccaaaataag
ttaaaggctgaagtagaactaattaagaatgaagataaaagcctgtatgataaatattaa
aaactgatgtctgagagatttgatgataaatcagtaaaaataaaaaaaatattgaatgat
ataattgagcttatttcatatagctcattttaagaagacttttaaaaataaattttacaa
gctcttaaattattagaagaaagaataataattttggaagaagaagaagaagaagaagaa
taagaaggctttgatcgatatggatattattgttttctgttagcatattatatataagaa
aactaaaatttaaattccaaaaatgctgaaaattgtgagaatataaaaaaaaaatattta
gataatattttaaataaaattgaaaaaatctataataatatcttaaacattacctctaaa
taatctatagactaagcaaatttttaaaaatatctaaatagtttgcagattgaaatctaa
tttcttgaaaaagaaaattttcaaaaatttggttattataaatacataatagctgaaaat
aaattaagctatcttaagcttaatgaaaagtaaaaaaagaaatgtgaataggaaaaaaaa
atttttatggattattacgaataataattatcattaaagagtaaagaaaatttttaaaac
gagaatttaaaaaccagaaatattgacctcaatattataaattaaaagtaaatctaatat
aatcagcttgattaatcaactccaactttagacgtaaatttgagttagcattaaaattaa
gaacaaaaataagaagaagaagcaagaaattagaatataaatactagtaatatttcatca
cagaattcttaatattcctaaattcagagctaaatttaaatctaaagtaatcatcttttt
taaaaataaacaacagtataataatctatttctagtagtgataatttagatatttctagt
ttatcagaaaatgaatcagtgatattatcttaattttagtattatgaataagaatataaa
taaaaattagaagaaggaaatgagaatataaataccagtaatatttcgtcatagattccc
taatattccaaaattcagaactaaattcaagttttaagtaatcaagcttcttaaaaataa
acaacaatgtaataatcaatttatattagttaaactttaggtatttctaacttataataa
gatgaatcaagcatataatcttaattattcttatctaattaaatattaaataagtctatt
tatgaaaattaaatttaagaaaaagaaaaatggaaaaattagattcttttcgaattttcc
aaaaataatactgtagcaaatattaatacaattatatcttaaagccaaaaagacgcattt
gaaacttaaaaagtatatttgattatgggagaaacaggagtaggaaaaagcagttttgtt
taatatttaactggtgatcctagagcggagataggtcatttaggaaactcacatacataa
aaatgtagaacctttaaaaaaaacgaattaaaatttatagattctcctggtataaatgat
acataggatgatagatactaaatattactgaatattgtgaaatatctaaaataatataaa
tatagattctaagatttatttattatttgcgtatctaataaagatattaacaaccatcta
aaacatatttaagaattttcatatacctactttctttatgatttgtttggagattaaatt
aaatttaaggatgtggaatagctagtcgacgaatacttctaatcaacttgccttctcaat
tggcaagaagctggattccactacttataagactaatatactggaaaaagagtagaaata
ttcaaaaaaaaagattaagctttaaattatattcaatatgcttaaaatcttcatattgtt
gttaaaacatgctttgacaaaactcatcaagaaaacttaaaaatatttaataattataaa
gttgattttttaaaataacaaatatggtcaaataaaaaagaaaatattaatgatttacta
gcatacaaagaatatatttaaagctaagaggttcatttatttaataaaattaaaaaaatc
atttaattctgggacgaggtataaatttggaattaaggagaataaatctaacatctactt
ttaattggtgggtcttaagtcggaaaatcgtctttaattgagtaattaaaataaatttca
ggactaagaggatcaggaacaacatcaataacaagtttttgttaaattttcctagtagag
tataataaagtgaaatactttttcattgacacaccaggatttgaaggaacagaagctaat
taaaattaatatcataatttaaaaataatttctgattttttaaggagaaatagaattaca
gaatttaaagttctttatatgcgtgatgctgagagagatgtaagagacggaatgccataa
gtcttaaataaactctttttttttatttaggaaatgtttgattaagattcttcatttata
gattcattatatttaagagaactaatgacatttcaattttcttaaactaataattaatct
gattatataaaatattaattaaatttaatagaaaaaaaaatattaactatagaaagagtt
gaaaaaagaaataataaaggattagtttacatgaataaatttaataaatagagtgttgaa
ttccaaagtaatttctttactgaatatggaaaatttattcaagttgatattatagaagat
gatttgtaaaaaaaaactctatttgaaggagtaaattagatagaaccaatatgtgttgat
gaaaaaatatttatgaaaataaaaaaaacaattaatagtaaaataataaataatctggat
gattatatgactgctttcaaaaaagtacttgaattgtattaataatacaacaatattttt
aatttaattaatattggaaggtagaataaataaaatatttctaaggatttgaatgattaa
agaattaagatagccgaaaaattgagcaatattatttatattgttatcggagatttttaa
aataccccagaaatgaaaaattatatttcgaaattatttcttaataaaatatcaagcaat
aacgaataaaatcatcaaaatgaattaaacaataaggttttaaattctatacaaaagcac
tttttaaaagcatcatatacaccctttctatttgaagcataatagaatcctaataatatt
ttcctatctcgaaagtagttatattactcgtcattagcacattaattaagcccttttttg
agaaaaagcagaccagaccattaaaaaatcatagaaaaactttcaataattaaaattcta
taggaattaacttttcaatctcatgtttaatctaaataaatagaattagaaattaatagc
gctccagaaaaaattatagataagatagatgcatttatttctggaataaataatatattt
gggagtggaggataattttttagataattttacttaattaacaatgtcgttgaagatatc
tttaaattcaaacaagtatttaatgttgctgcaaaatggcaaaattatttcttatctact
ataagctttggatttgatgcatattcatattcaaaaggaaaaatatgtagaagatagatg
gaattaatgacctactttaatatagccaatacaattttaccttattgcctttctgtctca
ggtattgggtggttaggtctatttgctttaggattcatagctgaaagatatttaacttaa
agttttacatctagttaaatatttgataaaacattgggtttagttttaaaaactattata
gatgattagcatcctaattaggttttactttacttttaaaaatcagaatttttaaaacaa
cacaaaatcaccaattattcttaaacttaatcaaaagaggcgtatgaaatgttcagataa
ctagaagaaaaaaattataaatcaggagaatagaataaatttctcctaaagctattcaat
taaagtgagtaacctaaaagattaaaagatgaaatttctaagcatatagttaagaatatc
atatcaaaacatttttaatttgaatttgagtaaatttaaggttaaaatctcatttaaggt
atagaaaaatagctaaaaagtaataagtaaataattgatactttttatcaaagatttaat
tttaacaatctacttaaaaatattaaataggattaaaaaaaattaaaagaaactttgcat
taaaatgaaaaacaaactaatatttgcttacatgacgatacagattttttataaaagcta
aatacctatcaataatctttaaatgtatttattaaacatatagaaaatactagttataat
tataaagaacaaaaagaattttgtgaaaagatacctttaagtaagtgtcagtattatccc
ataacttttaaaggttattgtaatttagttcattaaaaaagctaatacatttttatgtaa
gataccataagcgaaattttcaaaaacaataattgttttgaggtgaaacctgaaaataat
tttaaccatgaatttttttaattttaaaatgacgatgaattaacatattacctcaacttg
ttaattttaagcgataaatttattacaagtaggtatatattaaaagttaaaggtaataaa
taaccttatttaagttttatgaatggtacagaagttattgatgctgaagttgaatattca
atcgatttattccaaaaagcaaatgaatcatttaatttgaaagactttgttgaaataata
aaaattgaaactaagaattaatttaatattgataaagaaatatatttgagattaaaaaac
ttctttgaatcaataggtaatttgaagtaaatttttggatga
DBGET
integrated database retrieval system