Tetrahymena thermophila: TTHERM_00157850
Help
Entry
TTHERM_00157850 CDS
T01020
Name
(RefSeq) rab-GTPase-TBC domain protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RabGAP-TBC
RabGap-TBC_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7835246
NCBI-ProteinID:
XP_001009713
TGD:
TTHERM_00157850
UniProt:
Q22WE9
LinkDB
All DBs
AA seq
2366 aa
AA seq
DB search
MGSGCSLGFRQTKNPVSKHKGQQFDNQSQNPEKDKNGHYNESQKSNHQTHLTNPLSTDNY
GANEEFIQQVHEFEKVNQIGRYFLESEMNRAINAKAIQKWDKFLSEGYKKYIKMKKSNQC
RHIFTKQNESFLFKNKELYLTVIYYDGKEKELSQFIERGLVPQSDRWSAWKAKLNVQKYF
IKGLYEGLLRKQSKYVKDIKRDIGRGLNHPFFKQEDQIHSPFKSELKQQQQQQEEEELSN
KKQYIFTQKEVLNTKQSIKEYNAAVQNSPNFSKKNFDQLSQQQLDQLNTYNYAKKSVTLQ
KNSQINQNEEFDDDRLSRHFSVKNKKTSTIQNEMNEQIKEQFSKINLDKPDNEEVHERFQ
TQISNSKNPYYTAHRKLIQNNQKKNHLFDYESIQNQFKCIGQESLSKVLRAISNYFPNIG
YTQGMNIVVGFLLLVNGGNEEEAFWMFVSLARSENFLFMGLYEKDLPIMNLMAYVLDDKL
RSLYPRLHHQILKELEVNYQEWFTWWSLSIFLEKFPLYACLRFWDFIISQGSLFSIVSII
IALLKQFDQQIIGQDDRGMFQELLDSFMKGSVTDQIVESVLLNAKKIQMTKSYISQISIQ
YLNSTFCISKITEKHNIYTDYLTQLNKSSQMQQQALFILTKEIEKKVCQEIVNPLSEEGN
KQGTERNDIKDNQASKHQDQNSELSERQVVQQPQIDYMSSDIDYNNRRLKNSPDKSTKLQ
SKLPPIKQKKKDVQLIQPDDSNEPAKNKLLAIKNSNNKSKDEQINKNLFQGSNETEEKQK
SNLPLIHLQSIQSNEIFSQQQQQRQSFTNQQQQLNQKNNSLKNTKNSIHKRRSSFQDVHV
MSLDQIEPIQDQNNQNQHQDLITNQKNHFNKLQNLILKTTGESTPHSKYFFNSPNKNKIP
KRPLSSYQDTSKKFNSSHNLYQNKRNQVDEMNEIKNAQSILKEDQENQIFKNPKEIISSS
QIDQKQQILNQQMGEKDKEMQKSLSQVGSSAKQKNFSSQNSIIQSSQNEKPSTKLPSIYL
QPEKISQQLFNQGQNVLNKQEQLPEKNENVIDTNQQHEESNSQTQSHGIDNDDDFNIEQN
VPQKKPLSHQTTNSIPNSSHKINKYHNVQLDSIENKTKNQQNFKTSNYSSRPSSHYSSKY
EHEKRMQKQQAAAAAASMIQPNHQQNLSNFSTPSVKQRQLPSLSFQKATQAFNHIEDTTQ
PDNQFQANTSINQPPLLQVRDRNKQRKFRPFSNTMNQPAENNQKYYSSKQVEESQQEKNQ
SYEKNISKKSTIKTPQEKQQLNESEVLKNQQNEKPQSRQNLEINKENYINKPEQTSQNYE
TQNLNVNSSSKTQDINRLHNNEETQSQEPENKLQKNDQSFLNQLNNPSYQLEETKQNEIK
FQNPNQNKDHYDQYESVEKIANNIQQDKYNQAQLYQETEQSKNSKESYQEQLDQYPISKE
QYKISQEQYPISQEQYQISQEQIQINKEQYQINQQQYPIGQEQYQVRDEQYPIKQKDEYQ
ISEEGEKIYEQYQAKQEEYQTNIEHQYQISNQHYQISKEQYQIEPLKIDLGEQKINLVQQ
KSENKDSEIDVNNQQNQQFQNINYDPNNNNNQQLYHKDSLNSQVKKEDIAFNSNLQNDMS
AYMNEFQQHNYSGFSINLTQGGAHNFQNSIHNSNIQQNQAKIFSVNQIPSLNNSRINDDN
RSQISEYGFQNQGGISDQQQKISFSNIPDQVNNEITYSADENKQRELKEKSLRVQQQSTL
EHLRDSDINQISAEDKNSDQLKKTLEQADLEGKLQFQSSSFTQTKPVDTTNKQFQIQSNE
TAQSSPFSQPRPQFTPKTERYESSFNVIPTQSPFNSQIILSQQQVQKNYQKSNSLNQLGS
VASQNVLHSVSQISQNNIANQNGKFKNLGSSQGYIPSNGYDKINNFIPNHLPYSSSNYYL
QEIKEENYGERNMKQKQNKDQQQSQLQISYEEEHQTYEQSKLNNSSLSHKTQMSNKERLQ
NFAENQNDILDEVSSSQFNSNVSAASKPPQPSSHHRKSSFTIQSQMQQQLQKQALQQQNQ
QLQQQQQQEFTPQRIISSAAQKNIILTQQTNTITESNSLGQLNVIQNKQLNNEQIVNMKR
ASIKINKDYQTPKMHRNSIQNDQSKSYSNITSQGKPNFTPQISQNDNQEATLDKQNSKRL
NPLAQSVDEKPEQLKSIHSNTDFFQNFSAQKEFFQNSSAQKNFNKQLQDESSNLSSSIVS
FPIPKHLITISPSTTHLQQIDQNQEINEYNQSNQNISPLKNERKNHSENEIPFSNDNEQQ
NVQNIHNQMDNINQNEKNDENQNKTEQFQENQQIPNNSFNNLEEKQQKPQTQNARKQSQH
KSIDNPSIDFLKYNFSASINNLNNQI
NT seq
7101 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggttcaggatgctcgctgggttttagacaaactaaaaatccggtttcgaagcataag
ggtcaataatttgacaattaatctcaaaatcctgaaaaagataaaaatggtcattacaat
gaaagccaaaaaagcaatcaccaaactcatttaacgaatccactttctactgataattat
ggagcgaatgaagaatttatacagtaggttcatgaatttgaaaaggtgaattagatagga
aggtatttcttagaaagcgaaatgaatagagcaattaatgcaaaagctattcagaaatgg
gacaaatttttaagtgaaggctataaaaaatacataaaaatgaagaaaagtaatcagtgt
cgccacatttttacaaaataaaatgaatcgtttctctttaaaaataaggaattatatttg
acagttatttattatgatggaaaggaaaaagaattaagctagtttattgaaaggggatta
gttccctagagtgatagatggagtgcttggaaagcaaaattaaatgtgtaaaaatacttc
attaaaggactttatgaaggacttcttaggaagtaaagtaaatatgtaaaggatataaag
agagatattggaaggggtcttaatcaccccttcttcaagcaagaagattaaattcattca
ccctttaaatcagagttgaagtagtagcaatagcagtaagaggaggaagagttatcaaat
aaaaaacaatacatttttacacaaaaggaagttctaaatacaaagtagagcataaaggag
tacaatgctgcagtttaaaattctcctaatttttctaaaaaaaattttgattagctttct
tagcaataattagactagctaaatacctacaattatgctaaaaaatcagttactttacaa
aaaaattcatagataaatcaaaatgaagaatttgatgatgatagacttagcagacatttc
tcagtcaaaaataaaaagacatcaacaatataaaatgaaatgaatgaataaataaaggag
cagttttctaaaatcaacttggataagccagacaatgaagaagtccacgagaggttttaa
acttaaatttccaactcaaaaaatccttactatacagctcatagaaaattaatctaaaac
aattagaaaaaaaatcatctattcgattatgaatccatctaaaattaatttaagtgtatt
ggataagagtctttaagtaaagtactgagagctatatcaaactattttcctaacattggg
tatacttaaggcatgaatatagttgtaggatttcttctattagttaatggtggaaatgaa
gaagaagctttttggatgtttgtttctcttgctcgttctgaaaattttttatttatgggt
ttgtatgaaaaagatttacctattatgaatttaatggcgtatgttttagatgacaaatta
agatctttgtatccaaggcttcatcattaaatcttaaaagaactagaagtaaattactaa
gagtggtttacttggtggtcattaagcatttttttagagaagtttcctttatatgcctgc
ttaagattttgggatttcataataagccaaggtagcttattttcaattgtatcgattata
attgctctgcttaagcaattcgattaataaataataggacaagatgatcgtggtatgttc
taggagttgttagacagttttatgaaaggaagtgtgactgatcaaatcgttgaatccgtt
ctattaaatgcaaaaaaaatataaatgactaaatcatacatttcacaaatatctatttaa
tatttgaattctactttttgtatctctaaaatcactgaaaaacataatatctacacagac
tatctcactcaattaaataaaagttcccaaatgcagcagtaagccttattcattttaaca
aaagaaatagaaaaaaaagtttgttaagaaatcgttaatcctctttcggaagaaggaaac
aaataagggactgaaagaaatgatattaaagataatcaagcttctaagcattaagactaa
aatagtgagctaagtgaaagataagtagtttaataacctcaaatagattatatgagttct
gatattgattacaataaccgtcgtctaaaaaattcaccagataaaagtacaaagctctag
agtaaactgcctccaatcaaataaaaaaagaaagatgtttagctaatttagcctgatgac
agtaacgaaccagcgaagaacaaattactcgctataaaaaattctaataataaaagcaaa
gatgaataaataaataaaaatttattttaaggcagcaatgagacagaagaaaaacaaaaa
tctaatttacctttaattcatctctaatctatttaatcaaacgaaatattctctcaacaa
caacaacaaagataatcatttacaaattaataataataattaaatcaaaagaataattcc
ctcaaaaataccaaaaattctatccataagaggcgttcgagcttttaagatgtgcatgtg
atgagtttagattaaattgagcctatttaagaccagaataatcaaaattaacactaagat
ttaattacaaattaaaaaaatcactttaataagctttaaaatttaattttaaagacaaca
ggagaatccactccacattctaaatattttttcaattctccaaataaaaataaaattcct
aaaagacctctttcttcttactaagatacatctaaaaaattcaacagcagccacaatctt
tatcaaaataagagaaatcaagttgatgaaatgaatgaaataaaaaatgctcagagcatt
ttaaaagaggattaagaaaatcaaatatttaaaaaccctaaagaaataataagctcttct
taaatcgatcaaaagtaataaattttaaattagcaaatgggagaaaaagataaagaaatg
caaaaatctctaagccaagttggttcatcagcaaagtagaagaatttttctagctaaaat
tcgataatctaatctagctagaatgagaaaccatcaacgaaactcccctctatttatcta
taaccagagaaaataagctaataactgtttaattaaggttaaaatgttttaaataaataa
gaacaattacctgaaaaaaatgaaaatgtaatagacactaattaatagcatgaagaaagc
aacagctaaacttaatctcatggaatagataatgatgatgattttaatatagaataaaac
gttcctcaaaaaaaacctttgtctcatcaaactacaaactccattcctaattcttcacat
aaaattaacaaatatcacaacgtttagcttgatagtatagaaaataaaacaaaaaattaa
taaaattttaaaacttctaattattcatcaagacctagttctcattattcttctaagtac
gagcatgaaaaaagaatgtaaaagcaataagcagcagctgctgctgctagcatgatccag
ccaaatcattaacaaaatctatcaaatttttctacgccctcagtaaagcaaagacaactt
ccttcactgtctttctaaaaagcaacctaggctttcaatcatattgaggatacaacatag
ccagataattaattttaagcaaatacatctataaattagcctccactattacaagttaga
gatagaaacaagcaaagaaaattcaggccattttcaaataccatgaattagccagctgaa
aataatcaaaaatattattctagtaaataagttgaagagtcgtaataagaaaaaaattaa
agctatgaaaaaaacatctctaaaaagagtaccataaaaactcctcaagaaaaacaacaa
ctaaacgaaagtgaagtactcaaaaattaataaaatgagaagcctcaaagcagataaaat
cttgaaataaataaagaaaattatataaataaaccagagcagacaagccaaaattatgaa
acataaaatttaaatgtaaacagctcctcaaaaacataagatataaataggttacataat
aatgaagagacttaatcacaagaacctgagaataaattataaaaaaatgattaaagcttc
ttaaatcaattgaataatccttcttattagcttgaagaaacaaaataaaacgaaattaaa
ttttaaaatccaaatcaaaacaaagaccattatgattaatatgaaagtgtagaaaaaata
gcaaataatatccagcaagataaatataatcaagcttaattatattaagaaacagagcag
agtaaaaattctaaagaaagctactaagaacaattagattaatatccaataagtaaagag
taatataaaataagttaagaataatatccaataagctaagaatagtatcaaataagttaa
gaataaattcaaattaataaagaataatatcaaataaattaacaataatatccaatagga
taagaataatatcaagtaagagatgaacaatatcctataaaatagaaagatgaatattaa
ataagtgaagaaggagaaaaaatttatgagcaatattaagctaagtaagaagagtattaa
acaaatatagagcattaatattaaataagcaatcagcattattaaataagtaaagagcaa
tattagatcgaacctttgaaaattgatttaggagagtagaagataaatttagtgcaataa
aagagtgagaataaagattctgagatagatgtaaataattaatagaattagcagtttcaa
aatataaactatgatcctaataataacaacaatcagtagctttatcataaagacagcctt
aatagctaggtaaaaaaagaagatattgcttttaatagtaatctacaaaatgatatgagc
gcttatatgaatgaatttcaatagcataattacagtgggtttagcattaatcttacttaa
ggaggagctcataatttttaaaacagtatacataattcaaacatttaatagaattaagct
aaaattttttcagtgaattaaattccttctctcaataatagcagaattaatgatgataat
aggagctaaatttctgagtatgggttttagaatcaaggaggcatatctgattaataatag
aaaatttctttttcaaatattcctgattaagtcaataacgaaattacatattcagctgat
gaaaacaaataaagagaattaaaagaaaagagcttaagagtttagcagcagtctacactc
gaacatttaagagattccgatattaatcaaatatctgctgaagataaaaattcagattag
ttaaagaaaacattagaataagcagatttagaaggtaaattataattccaatctagttca
tttacttaaacaaaacctgtagatacaactaataaataattttaaatttaatctaatgaa
actgcttaaagcagtccattttctcagcctcgcccacagtttacaccaaaaacagaaaga
tatgaatcatcttttaacgtaataccaacttaatctccatttaattcctagattatccta
agtcagcaacaagtataaaaaaactactaaaaaagtaatagtctaaattagcttggcagt
gttgcttcttaaaacgtactccactcagtatcttaaattagttaaaataatatagcaaac
taaaatggtaaatttaaaaaccttggtagctcttaaggttatattccatcaaatggatac
gataaaattaataattttatacctaaccatcttccttactccagctcaaactattattta
taggaaataaaagaagaaaattatggtgaaagaaacatgaagtaaaaatagaataaggat
taacaatagtcttagctttaaataagctacgaagaagaacaccaaacatatgaataaagt
aagttaaataatagcagcttatcacataagacttaaatgagtaataaagaacgtttgtaa
aattttgctgaaaattaaaatgatattttagatgaagtgagtagttcttaattcaattca
aatgtttctgctgcttcaaaaccaccttagccttcttctcatcatagaaagtctagcttt
acgatttaaagttaaatgtaataataattgcaaaagcaggctctataatagtaaaattaa
taattacaatagcaatagcagtaagaatttactcctcagagaataattagctctgcagcc
caaaagaatattatattaacctaacaaacaaatactattactgaaagcaactctttgggt
taattaaatgtgatctaaaataagtaactaaataacgagtaaatagtaaacatgaaaaga
gcatctataaaaataaacaaagactattagactcctaaaatgcacagaaacagcatataa
aatgattaaagcaagagttattctaacataactagctagggtaaacctaattttactcct
taaatttcttaaaatgataattaagaagccacacttgacaaataaaattcaaagaggtta
aatccattagctcagtctgtagatgaaaaacctgagtaattaaaatcaattcatagcaac
acagatttcttctaaaatttctctgcataaaaagagtttttctaaaatagctctgcctaa
aaaaattttaacaaacagctacaagatgaaagctcaaatttatcctcatcaattgtatcc
tttccaattcctaaacatttaataaccataagcccatcaacaactcatctttaacaaata
gattagaaccaagagataaatgaatacaattaaagcaattaaaacattagtcctctaaaa
aatgaaagaaaaaatcattcagaaaatgaaatcccttttagcaatgataacgaacaacaa
aacgtataaaacattcataattaaatggataatataaattagaatgaaaaaaacgatgaa
aactaaaataaaacagaataattccaagaaaatcaataaattccaaataattcttttaat
aacttagaagaaaaataataaaaaccttaaacataaaatgcaagaaagtaaagctagcac
aaaagtatcgataatccaagtatagactttcttaagtacaatttttctgcttcaataaac
aacttaaacaaccaaatatga
DBGET
integrated database retrieval system