Tetrahymena thermophila: TTHERM_00188410
Help
Entry
TTHERM_00188410 CDS
T01020
Name
(RefSeq) endo-1,4-beta-xylanase xylA, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
7831350
NCBI-ProteinID:
XP_001016517
TGD:
TTHERM_00188410
UniProt:
I7MJE8
LinkDB
All DBs
AA seq
862 aa
AA seq
DB search
MNQKLQTELASSSVPLHQDQIQQKSQVTSQFIRKKRKLQSAQQFKSQSKINFEQVNNISS
SSKKLLSSKESKESILNFQQGYFERAETPSEGLFEDNKLVQQVFVRSSLTLNNSSNLSPV
KQQICQKSTNENSFMNIQQQIEPIQIKINKQNSKGSSFSTLDGKKATEIVNQSIQNSLKV
EIKIQNIKGDDDDNNNNQSLSNKPKNVIEIYKMSNSKEKGQQQNNYVQDDIQQFQTIQKI
KNQGFNVISNLLDQQKSNARSNRYSYSQDLSGQVQGRSNQNSLECKNFKLADNSQKIIGE
DNLKQSKHTLKEEEQQQQINIQYNSQRRDISNNYREYLKNKLQYSYPPQIQQQMEYQEED
HQRILKGGIIVGKQVQRTRKNTSYGKGISVFENLLQRKQLQINQSQNAQEQKKLVNKQNQ
VNFTQSFYQNLIKQSKRLNNLINQQEQDWNRKQKYINLHTKSNQESLTSTKQYNNLEANL
QQQLSSSKEKFQTNAYPQSQQLCQNYSFKNDQECKENINCSLVNVEQDILGETHRSTQDV
NEIFNNQLIINQAQQSSTLEIQSQKAKMQNIERPYSQSLNRSKKQKNAFDENNQISYEQQ
YLYNFKKKQNLYINPESNQSQQEINDSVNSVSSSFTDKVIKHFRFSNTMKNSEVKNLTSL
QQQNNVQQDCQVNNFLVIQDQKDAESSNDQIIEHKIVNENSFLKKDSKQSLNKCSFTSKT
SNLFDKNNFKKYKLQNNESSNNNSFQRIPNKKIISQRGSLSIPYSNRTGETLPHQFYHIQ
NIQDKRRSLCIESQRIINTSKNNKSSYSISPDKKIQLTSNKKIQNYVSELVNKYSHQYKM
DEECGPWADDDEDDINDVAAVS
NT seq
2589 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattagaaattgcaaacagagctggcttcctcatccgttcctcttcattaagatcaa
atttaataaaaaagctaagttacaagttaatttattagaaaaaaacgcaagctataatca
gcacaatagtttaaatcataaagtaaaataaattttgaataggttaacaatatttctagc
tctagtaaaaagttattatcaagcaaagaaagtaaagaaagcatattaaattttcaataa
ggatattttgaaagagctgaaactccttcagaaggtttgtttgaggataataaacttgtt
cagcaggtatttgttcgtagttctttaacattaaataatagcagtaatttaagccctgta
aaataacaaatatgttaaaaaagtaccaatgaaaactctttcatgaatatacaatagcaa
attgaacctatttaaatcaaaataaacaaataaaattcgaaaggatctagcttctccact
ttagatggaaagaaagctactgaaatagtgaattaatcaatataaaattctttaaaagtt
gaaataaaaatttagaatataaaaggagatgatgatgataataataataattaaagttta
tctaataaacctaaaaatgtaattgaaatatataaaatgtctaattcaaaagaaaaggga
taacaacaaaataactatgtttaagatgatatttaataattttagacaattcaaaaaatt
aaaaactaaggatttaatgtgattagtaatttattagattaatagaaatcaaatgctaga
tcaaatagatactcttatagttaagatttatctggttaagtgtaagggagatcaaattaa
aactctttagaatgcaaaaattttaaattagctgataattcctaaaaaataataggcgaa
gataatctaaagtaaagcaagcacacacttaaagaggaagaatagtaataataaattaat
atttaatataatagctaaagaagagatatttcaaataattatagagaatacctaaaaaat
aagcttcaatacagctaccctccttaaatttagcaatagatggagtattaagaagaagat
cactaacgtatactgaagggtggaataattgtaggaaagtaagtttaaagaactcgtaaa
aatacatcgtatggaaaaggcatttctgtttttgagaatttgctttaaagaaaacaatta
taaataaattagtctcaaaatgcacaagaataaaagaaattagttaataaatagaattag
gttaactttacccaaagtttctactagaatttaattaaataatctaaaagactaaataac
ttaattaactagcaagaataggattggaatagaaagtaaaaatatataaatttgcataca
aaaagcaatcaagaatctttaacatcaactaaataatataataacttagaagcaaattta
taacaataacttagtagttctaaggagaaattttaaacaaatgcttatccttaatcttaa
tagttatgtcaaaattatagttttaaaaatgattaagaatgtaaggagaacattaattgc
tcattagtaaacgtagaataagatattttaggagaaacacatagaagcacataagatgtt
aatgaaatattcaataattaattaataatcaatcaagcataataaagtagtactcttgaa
atacaaagctaaaaagcaaaaatgtaaaatattgaaagaccttatagttaatctttaaat
cgttctaaaaaataaaaaaatgcttttgatgaaaacaattagatatcatatgaatagtaa
tacttatacaactttaaaaagaagtaaaatctttacataaacccagaatcgaattaaagc
tagcaagaaatcaatgattctgtaaactctgtttcaagtagttttaccgataaggttatc
aaacactttagattttcgaatactatgaaaaatagtgaagtaaaaaatctaacctcttta
cagcagcaaaacaatgttcaataagattgttaagtgaataattttttagtaatctaagat
caaaaggatgcagaaagctctaatgattaaattattgaacataaaatagttaatgaaaac
tcatttcttaaaaaagatagcaaacagagcttaaataaatgctccttcacatcaaagact
tctaatctatttgacaaaaacaattttaaaaaatataaattacaaaataacgaatcaagt
aataataacagcttccagaggattcctaataagaaaataataagtcaaagaggatcatta
agtataccttactccaatagaaccggagaaacactgccacattaattttatcatatttaa
aatatctaagataagagaagatcactgtgcatagaatcttagaggattattaatacatca
aagaataacaaaagttcctattcaatatcgcctgataaaaaaatttaattaacatctaat
aaaaaaatataaaactacgtatctgaattagttaacaaatacagtcattaatataaaatg
gatgaagagtgtggtccctgggctgatgatgacgaagacgatataaacgatgtggcagct
gtatcttga
DBGET
integrated database retrieval system
