Tetrahymena thermophila: TTHERM_00194540
Help
Entry
TTHERM_00194540 CDS
T01020
Name
(RefSeq) TATA-binding protein interacting (TIP20) protein
KO
K17263
cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tet00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
tet04121
]
TTHERM_00194540
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04147 Exosome [BR:
tet04147
]
TTHERM_00194540
Ubiquitin system [BR:
tet04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
Multi subunit type E3
Multi subunit type E3 associated proteins
TTHERM_00194540
Exosome [BR:
tet04147
]
Exosomal proteins
Exosomal proteins of haemopoietic cells (B-cell, T-cell, DC-cell, reticulocyte, and mast cell)
TTHERM_00194540
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TIP120
HEAT
HEAT_EZ
HEAT_2
Htt_N-HEAT_1
TOR1L1_N
ARM_ECM29_C
RTP1_C1
DUF7326
RasGEF_N_2
Cnd1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7823180
NCBI-ProteinID:
XP_001017207
TGD:
TTHERM_00194540
UniProt:
Q23K81
LinkDB
All DBs
AA seq
1269 aa
AA seq
DB search
MQSAQQQQQQLLDQKRFDELVQDAKDFDPDKKFMAANDLSNALSNGQLKDTDYDTVVKIL
LNQLNDDSNEVQGNSIRCLSKIINKLQETQVENVSKTMIVKVIEDKGEYRDVYATCLKTL
INGVPSNYAKAVQPILLHAIQGMEQKLNNKEFDVQEELCDILNNLFKKWGQSLSTTNANV
KNLTNILMSNISKGERNSLKKKSCSCLGSLGLILHKDDIGRVVKELLQNIKKPDNQKQIQ
QHLREKQIYVVYALSAISKTVAKKLGSNLKDLINIILKDINQYVEEVDDYDLIITISEMF
ESYLSILESLIKGCPDEIKEYFPQIVDLSSQLINYDPNGQARISNGGEMEIEDGGEEDEY
DYLSDDQDGDDSSWRVRRAALNIIETLVKSDSEMIRPIFEKCVSSQSEQSTIVYRLGERN
ENIRFATFSCLQTIIRAIVISDVSHDKGDDDFDQELNSGPQLVRVKSAVKEFNISEIISE
IFNTLTFILEKEKKVTQAILTGAYKLIESISRNLSRQVVSDPSIWRLAFDLIKRTIENKA
SPNELKVTAFSSLRKLLKNYHESSEIAHLQNDIPNIFKLASVGLVQDYFKIVAESFRCLN
SLFNMINKQFNSAIPTFSASIQQIFPQISVKLNSSDIDQEIKQSVLSCTTSLLVSLPQTI
QAQQIKDIINAISEKIKSETKKIPVLKLLKKIPLSVHPHITADSIKLLNSSAESICDLLA
KQDRSLRVASLEALDKTLVLLSEKKSPLSAKARDNFIALAYDFLNDKDTWVAQLYLSVLK
KSIENAPQSPQYYTKIIESITKFSNSSIVSSAHFSSLYEVFATLSKLNLSNRSQMIQNLI
ATGSKDSINSVSRAISSIIIELPAGEQQTFINQIFSTASSDKEVVLKRQICLVTLGEIGR
HVNLCSGNILQEVQKILNNKQNNEEIRTAASISLGGIAIGNLNMVLPQVIQTINSGSEGQ
YLMLNSLKQIIEHSQQLSQSIIQIIPNLFKATENGDESLCNIISYIIGKVTHLNLKEMKP
LILQNLSSKNQNTKYTTASSFKYFCLKTLKIDNDLRELVYALMNNINEKDIRTRTAILKS
LNMISYNLPNAIIQHINKNEFFLPVREALRFTQIREIDFGPFKQKNDDGEPVRNAAFTLL
DTAIDHLHYRGVENFEREILEEVLYEFANESSEDIKILRFQICTKFAHKVPLKVTPFLDQ
ISEVFLNVLKPYASKADGDRAADMVRTGLICCLTLKSIAEDESNTKYLNFWELVMKTEKY
RNIINSMTN
NT seq
3810 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaatccgctcaataataacaacaacaacttttagattaaaagagatttgatgaacta
gtttaagatgccaaggatttcgatcctgataaaaagttcatggctgctaatgatttatcc
aatgctctatccaatggctaattgaaggatacagattacgacactgttgtcaaaattctt
cttaattagcttaatgatgactctaatgaagttcaaggtaactcaattagatgtctctct
aagatcattaataagctctaagaaacttaagtcgaaaatgtttctaagactatgatagtt
aaggttattgaagataaaggagaatatagagatgtttatgctacttgcttgaaaactttg
attaatggtgtgccttctaactatgctaaggctgtctaacctatccttttacatgcaatt
taaggtatggaacaaaagctcaataataaggaattcgatgtttaagaagaactatgtgat
attctcaacaatctctttaagaaatggggttagtctttaagcacaactaatgctaatgtt
aagaatttgacaaatatattaatgagcaacatttcaaagggtgaaagaaattctcttaag
aagaaatcttgcagctgcttaggaagtttaggtcttattttacacaaggatgacatcgga
agagttgtcaaggaactcttgtaaaatattaaaaaacctgataaccaaaagcaaattcaa
tagcatttaagagaaaagcagatttatgttgtctatgctttaagtgccatatccaaaact
gttgctaaaaaactcggctcaaatttgaaggatttaattaacatcatactcaaagatatt
aactagtatgttgaagaagttgatgactacgatttaatcatcacaatctctgaaatgttc
gaatcatacttaagtattttggaaagtctcattaagggatgtcctgatgaaatcaaggaa
tatttccctcaaatagttgacctttcttcataattgattaactatgatcctaatggtcaa
gctcgtatcagcaacggaggcgaaatggaaatagaagatggaggtgaagaagatgaatac
gattatctttcagatgatcaagatggcgatgattcttcatggagagttagaagagctgcc
ttaaatattattgaaactcttgttaagagtgatagcgaaatgattcgtcctatttttgaa
aagtgtgtttcttctcaaagtgaataaagcaccatcgtctatagattaggagaaagaaat
gaaaacatccgttttgctactttctcttgcctttagactatcatccgtgctatagtcatt
tcagatgtatcacatgataagggagatgatgatttcgattaagaattgaactctggtccc
caattagttcgtgttaaatctgctgtcaaagaatttaacatttctgaaattattagtgaa
atattcaacactctcactttcattcttgaaaaggaaaaaaaagttacataagctatctta
acaggtgcatacaagttaattgaaagcatttcaagaaatttaagcagataggtagttagc
gatcctagcatttggcgtttggcttttgatttgattaaaagaactattgaaaacaaggcc
tctcccaatgaattgaaggttactgctttttcaagtttacgtaagcttttgaagaactac
catgaaagcagtgaaattgctcatctttaaaatgatattcccaacatttttaaacttgcc
agtgtaggtcttgtttaagattactttaagattgttgcagaatccttccgttgcttaaat
agcttgttcaacatgatcaacaaataatttaactctgctatacctacattcagcgctagt
atctaataaatattcccttagattagcgttaagttaaatagctccgatatcgattaagaa
attaagcaatcagttctcagctgcacaacttcattactcgttagtctccctcaaaccatt
taagcctaacaaattaaagatatcattaatgctatttctgaaaaaattaaatctgaaacc
aagaagattcctgttcttaaacttttaaagaaaatccctctttcagttcatccccatata
actgctgatagcattaaactcttgaattcatcagctgaaagtatttgtgatttgcttgct
aagcaagatcgttcacttcgtgttgctagtcttgaagctttagacaagactttagttctt
ttaagcgaaaagaagtctcctctaagtgctaaagccagagataacttcatcgctttagct
tatgatttcttaaacgataaagatacttgggttgcttaactctatttatcggttctcaag
aaatccattgaaaatgctcctcaaagtcctcaatattatacaaaaattattgaatccatt
accaagttctcaaattcttctattgtttccagtgctcactttagctctctttatgaagtt
ttcgctaccttatccaagcttaatctctctaacagaagctaaatgatttaaaatttgata
gctactggtagtaaagatagcatcaattcagtttctcgtgctatttcttctattatcatt
gagcttcctgctggagaacaacaaactttcattaattaaatcttttcaactgcctcttct
gataaagaagttgttttgaagagacaaatatgcttggtcacacttggtgaaatcggaaga
catgtaaacttgtgctcaggaaatatcctccaagaagtttaaaagatcttaaacaataaa
taaaataacgaagaaataagaactgctgcctctatttctttgggtggtattgctattgga
aacttaaatatggttcttcctcaagttatctaaacaatcaactcaggttctgaaggccaa
taccttatgcttaactctttgaagtaaatcattgagcattctcaacaactttcatagagc
atcatctaaatcattcctaacctcttcaaagcaactgaaaacggtgatgaatctctctgc
aacattatttcctacatcattggtaaggttactcacttaaacttaaaggaaatgaaacct
ctaatcttataaaatttatcctccaagaactaaaatactaagtacactactgctagttca
tttaagtatttctgcttgaagactttgaaaattgataacgatttacgtgagttagtttac
gctcttatgaataatatcaatgaaaaagatatccgcactcgtactgctattcttaaatcc
ttaaatatgatatcatacaatcttccaaatgctataatttaacacattaataaaaatgaa
ttcttcttaccagtaagagaagctctcagattcacctagataagagaaatagatttcggt
cctttcaagtaaaagaatgatgatggtgaacctgtacgtaatgctgcattcactcttctt
gacactgctatcgatcatctccactacagaggtgtcgaaaatttcgaaagagaaattctt
gaagaagttctctatgaatttgcaaatgaatcatctgaagacattaaaattcttcgtttc
taaatttgcacaaagtttgctcataaggttcctctcaaagttactcccttccttgattaa
atttcagaagtattccttaatgttttgaaaccttatgcttccaaggctgatggtgatcgt
gcagctgatatggttagaactggtttaatctgttgcttaactctcaaatctatagctgaa
gatgaatccaatactaaatatctcaacttctgggagttagttatgaaaactgaaaaatat
agaaatattattaattcaatgactaattga
DBGET
integrated database retrieval system
