| Entry |
|
|---|
| Name |
(RefSeq) helicase carboxy-terminal domain protein
|
|---|
| Organism |
tet Tetrahymena thermophila
|
|---|
| SSDB |
|
|---|
| Motif |
|
|---|
| Other DBs |
|
|---|
| LinkDB |
|
|---|
| AA seq |
1717 aa
MDFNLNIQEDTLLQIEQILSQYSQNGKLIFGKTQLVLSSLLCPFRGNWNKHLQDLDYTLK
ISRNIALDPIKARNLNPYFIELYERCVNNNQNKQTAAQAVFSQNKIITQQQETQITDTLE
SVQLIIDSYLTSFNNKSLSLLVVISSLLSEDLNKMSFTEKLFAYTQQLNQIKIQLPTDNT
QTPQQKNSACPNTFQNKNLKVQDFIKNNKIQQENKLVGLSNQNIYENQNLNVLNRQKSSN
QNEQETQFKKPYEKNNIEQYPQNSNLKNDNKQKQQQYLTKLQPKIQKDINVCENLNQIQQ
NIFNQNNVQLKKLLSLNIQDKQKNQQIQLKKQFSNQIQINSNKLNSQPLNLKNQCEIKHF
NQQEPIKFIENRQTSIQNQPKFYSEEVDSILKQIKELTENEREIFMKLFGKYLDGMNGQF
LDDLKKRYPEIYYLIQSSKALEKVSKMTPRSVQIVSCLLFLYKQKQKGRILQINTGEGKS
ITVAMIAATRCLMKDKVDVFTSNKELAKRDCEEFQMFYKELGLTCGSIGSEQFRSSEPNE
TYKKNVVYGDVGSYAADLLGDYYEQRGTRCGRLFDFAIVDEVDCMLIDQHNHSTSLAKSI
PGLTKLNTILWLIWYKITQMRDQYLEGYYYFVENQDKKYCCRAEDFITEFINQTLMRGEI
SAKIDELIPNHIKSFAMSQMKEWVMNGFYAQQLQRNKEYKVENDKIIPIDYDNTGVAQLN
TQWRGGLHQFIQMKENVTVTPMNMTVNFVSNIYMFLLYKTNLVGLTGTLGSFKSIDVLQQ
FYQVDTLKVPPFKPRKLQILPPIIEQTTLDFQKTIINEIGLQMNKGSPCLIISESEKFSK
HISKLISKRFQNIKIVEYYTGNESIEKESINEFCIILSTNLAGRGTDIKLSTQIINNGGL
HVIVTFTPKNKRVEDQAFGRAGRCGQDGSAQMVIDGSKDSFIIKNKIQSNLIEERDKVDA
QICEKQLQNMIDISKMDEIFWDYCKTLNTCEILKKKQYLRKQEEEIWATFYCKIQNMRKE
PEKAMKEYMIFKEDFQKRVNERNVVNPSYLISEGMKLLIEKKFTEALQISDEIILKNPKN
LAAHYIKAIAFTSLKQHSISLQMLDKCEMILQQKNSLHQALQILQLQSQSLVQQEYNQEL
YEQSILLSKNFMNQAQESKIFNINKYDRKQLESYISESGCFKRIKDEELIRGKILEQIRD
LKGEIKVLQRNISKKENLNFIRIDEFFQDDKITQQIIKEYLNEELPFVINLFERKPLQWK
SLIPLACSIFQLSNSLYLMQDSIIQKDNQNNLNKQNMKLMNDNQNYFQNDNYIEVIQEHN
DQVQGIANAIEKMMLIDGLNLKEYMSQESIVIIYHIRKFQIQDYVHMLTQISDHSANKIQ
KELIIQISFKDALTKEVAKYSKQIAYITQQMAQDQKFLNISQLQTKFQLNCSKILEQTQA
FQLINKNQIENIYKAFKQQFQYLNFQHFERDIVRNLRQNLIQHHKKQIIDNLESFIKDNY
ELLLSPNQFFELVYNLMQDPLNNVINLTIQNMQTIVCDTICSYLVHKIKQEINYLKQLLQ
NQAQKMQKLQQNNNYTINTQNKIKNYEKIQNQLEQDEGIIQQFMNSLKQAITQFKLDVNN
SLSLQPQMLEKVQIKNFILNNNQNLVQKEEFLTLIQQILIQLQEKNQLQYNSKEFQNYFV
KKIQIEILIPTFKTVSHIFLQQIESNAIQGLFSHIIQ |
|---|
| NT seq |
5154 nt +upstreamnt +downstreamnt
atggattttaatttaaatatttaagaagatactcttttgtaaattgaataaatattaagc
taatactcttaaaatggcaagctaatttttggaaaaacacaacttgttttatcttcttta
ttatgcccatttagaggtaattggaataaacatttataagatttagattatacacttaaa
atatcaaggaatatagctttagacccaataaaagcaagaaatcttaatccatattttata
gagctatatgaaagatgtgttaataataatcaaaataaataaactgcagctcaagctgtc
ttttcgcaaaataaaatcattactcaacagtaggaaacgtaaattactgatacgcttgaa
tctgtttaactcataattgattcttatttgacatcatttaacaataaatccctctcttta
ctagtagttatctcttctctattatcagaagacttaaataaaatgtcttttacagaaaaa
ctattcgcctacacataataactcaattaaattaaaatttagctacccaccgataatact
tagacaccataataaaaaaatagcgcatgtcctaacactttctaaaataaaaatttgaaa
gtttaggattttattaaaaataataaaattcaataagaaaacaagttagtaggactttcc
aattagaatatttatgagaattaaaatctaaacgttctaaatagatagaaatcatctaat
taaaatgaataagaaacataatttaaaaaaccatatgaaaaaaacaatattgaataatat
cctcaaaatagtaacttaaaaaatgataataagtagaagtaataataatacttaacaaaa
ttataaccaaaaatttaaaaagacataaatgtttgtgaaaatttaaattaaatttaataa
aatatttttaattaaaataatgtttaattaaaaaaattactttctttaaatatttaagat
aaatagaaaaattagtaaatttaattaaaaaaataattttctaattaaatctaaattaat
agcaataaattaaattcttagcctttaaatctaaaaaattagtgtgaaataaaacatttt
aattaataagaaccaattaaatttattgaaaatagataaacttctatttagaattaacca
aaattttacagtgaagaagttgattccattttaaagtagataaaagaacttacagagaat
gaaagagagattttcatgaaactttttggtaaatatctagatggcatgaatggataattt
ttagatgacttgaaaaaaagatatcctgaaatttactatttaatttaatcaagcaaagct
ttggaaaaagtttcaaaaatgacaccacgctcagtttagatagtttcttgcttgcttttt
ttatacaaataaaagtaaaaaggaagaatcttacagattaacactggagaaggtaagtct
ataactgttgctatgattgctgctacgagatgcttgatgaaagataaagtcgatgttttc
acttcaaacaaagaacttgcaaagagagattgcgaggagttttaaatgttttataaagag
ctaggtttaacatgtggatctattggctctgaataatttcgttccagcgaaccaaatgag
acttacaaaaaaaatgtggtatatggtgatgttggaagttatgctgccgatttacttgga
gattattatgagtaaagaggcactagatgtggtagactgttcgattttgctattgttgat
gaggttgactgcatgctcattgatcagcataaccattctacctctcttgctaaaagtatt
ccaggattaactaagctgaatactattctgtggctaatttggtataaaataacttagatg
agagatcaatatttagaagggtactactactttgtagaaaactaagacaagaaatattgt
tgcagggctgaagattttattactgaatttatcaactaaactctaatgagaggagaaatt
tctgcaaaaatcgatgaattaatacctaatcacataaaatcttttgcaatgtcttaaatg
aaggaatgggtaatgaatggcttttatgcttaataacttcaaagaaacaaagaatataaa
gtagaaaatgataaaataattcctattgactacgacaatacaggtgttgcccaattaaac
acttaatggagaggaggtttgcatcaatttatttaaatgaaagaaaatgtgactgtgact
cctatgaatatgactgttaactttgtctctaatatatacatgtttttgctctataaaact
aatttagtaggactgactggaacattaggctcatttaagtctattgatgttctgtaatag
ttttactaggttgatactctgaaagttccccctttcaaacctagaaagttataaatattg
cctcctattattgaataaacaacactagatttccaaaagacaattattaatgagattgga
ctttaaatgaataaaggaagtccatgcctgataatttcagagtcagaaaaattcagcaaa
cacatttctaaattaatttcaaagagatttcaaaatataaaaatagtagaatattacact
ggtaatgagagtatagaaaaagaatcaattaatgaattttgtatcattttaagtactaat
ttggcaggtagaggaactgatataaaactttccactcaaattataaacaatggtggctta
catgtgatagttacatttacgccaaaaaataaaagagtggaagattaagcatttggcagg
gcaggtagatgcgggtaagatggtagcgctcagatggtaattgatggttcaaaagacagt
tttattattaaaaataagatttaatcaaatttaattgaggaaagagacaaagtggacgct
tagatttgcgagaaatagctgcaaaatatgattgatatttctaaaatggatgaaatcttt
tgggactattgcaaaactttaaatacttgcgaaatactaaaaaaaaagcagtatctgagg
aagtaggaggaagaaatttgggcaactttttattgtaagatttaaaatatgagaaaagaa
ccagagaaagccatgaaagaatatatgattttcaaagaagattttcaaaaaagagtgaac
gagagaaatgtcgttaatccttcttatttaattagcgaaggaatgaaattgctaattgaa
aaaaaattcacagaagcactccaaatatcagacgaaattatcttgaaaaatccaaaaaat
ttagcagctcactacatcaaagctattgcatttacttctttgaaataacattctatttct
ctttaaatgcttgataaatgcgaaatgattcttcaataaaaaaatagtttacactaagca
ctacaaattctataactataatcttaatccttagtatagcaagaatataattaagagtta
tatgaataaagcattttattgagcaaaaattttatgaatcaagctcaagagtctaagata
tttaacataaataaatatgatagaaagtaattagaatcttatatttcagagagtggatgt
ttcaagaggattaaagacgaggaactaataagaggaaaaattttagaataaataagggat
ttaaaaggtgaaataaaagttttgtaaagaaatatttcaaagaaagaaaatttaaatttt
atcagaatagatgaatttttttaagatgataaaattacttaatagataataaaagaatat
ctaaatgaagagctgcctttcgtcataaatttgtttgaaagaaaaccattgcaatggaaa
tctttgatcccccttgcttgcagtatattttagctctctaattctttatatttaatgtaa
gattcaatcatttaaaaggataatcaaaataatttaaataaacaaaatatgaaattaatg
aatgataattagaattacttttaaaatgataattatattgaagttatctaagaacacaac
gactaagtttaaggaatagcaaatgcgatagaaaaaatgatgctcattgatggactaaat
ttaaaagaatatatgagctaggaatcaattgttataatttaccatatcagaaaattttaa
atataagattatgttcacatgcttacataaatcagtgatcattcagcaaataaaatataa
aaagaattaataatttaaatatctttcaaagatgctctaacaaaagaagttgccaaatac
tccaaataaatagcctatatcacataacaaatggcctaagatcaaaaattcttaaatata
agttagcttcaaacaaagttttagctaaattgcagtaaaattttagaataaacgtaagca
ttctaattaattaataagaattaaatagaaaatatttacaaggcattcaagtagcaattt
taatatttaaatttttaacactttgaaagagatattgttagaaatttaaggtagaattta
atataacaccataaaaagtaaattatagataatcttgaaagttttattaaagacaactac
gaattacttctttctcctaattagtttttcgaattagtttataatttaatgcaagatcct
ctcaataatgtaataaatttgactatttaaaacatgtaaaccatagtttgcgatactatt
tgcagttatttagttcataaaattaaacaagaaataaattaccttaagtaattattgcaa
aattaagcataaaaaatgtaaaaattataacaaaataataattatactattaacacatag
aataaaattaaaaattatgagaagatttaaaattaattagagtaggatgaaggaataatt
taataatttatgaatagtcttaagtaagcaataacttaatttaaattagatgtcaataat
agtctgtctctataaccttaaatgcttgaaaaagtttagataaaaaactttattttaaat
aacaactaaaacttagtttaaaaagaagaatttttaactctaattcagcaaattttgatc
taattgcaagaaaaaaattaattgcaatataattcaaaagagttttaaaactattttgta
aagaaaatttaaattgaaatattaattccaacattcaaaacagtctctcatatattttta
caacaaattgaaagcaacgcaatataagggctattcagtcatataatttaatga |
|---|
