Tetrahymena thermophila: TTHERM_00218430
Help
Entry
TTHERM_00218430 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transporter family ABC domain protein
KO
K05643
ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 3
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
Pathway
tet02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tet00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
TTHERM_00218430
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tet02000
]
TTHERM_00218430
Transporters [BR:
tet02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCA (ABC1) subfamily
ABCA1, 2, 3, 4, 7, 12, 13 subgroups
TTHERM_00218430
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC2_membrane_3
AAA_21
SMC_N
SRP54
AAA_22
R1_ABCA1
AAA_29
RsgA_GTPase
AAA_30
MukB
AAA_27
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24442527
NCBI-ProteinID:
XP_001020515
TGD:
TTHERM_00218430
UniProt:
X1W3S2
LinkDB
All DBs
AA seq
1341 aa
AA seq
DB search
MASVLKQTGIIIKKNAMLNLRNYEYLKDIIPPAISAVFNIVAKSQSSLSFIAALYLPLSL
SGFLRSFVYNFINEKSEKYKETQKIMGLKSLSYNLGWFIFNYSKAFIIGFIYLLPCLIAQ
AFSSSNLSLGEIVLAYLLFICAALSQCYMYTTFFSHPKLPSDLITLVHLIASALQYVAAV
QSVQENNSLLSLLCLFPQTCVIFIFLQAGWNQQGSGGGFSYSDMNFSYSNGISMLILDTI
VYFLLYVYFDNVIKNEYGTQKDALFFINWIWKKKSNKKSFGSSNELRENLSVNQQENDEE
INYSTNQVDYSSAKYKEEFRNLNNLSVTIKVRDLVKTFGDFTAVDHLSLTLYEQQIFCLL
GHNGAGKTTTISLLTGLLQKNQGKIIMNNLDFDENLDQIRQNIGLCQQRDVLYDNFTVEE
HLQFIGRIKGREGEELENEINYLIQKCQLSNEVGKTAKILSGGNKRKLSLAMALIGGSKI
VFLDEPSSGLDFNARKEIKEILLELKKEQRTIILTTHHLEEAEECADRIAIMARGQLLTL
GTNEFIKKNFGVGYHLTITRKSENMMKRSSRQSIDHNRPSSGFNYNQQQPQPTIQGEYQL
SPEKCEQVKQIVNQIIPEAKYNPQSSLGTVQFTLPFTSKQKFPNLFSTLEQQPELSLDLE
MNTLEDAFINIGMDEEKYLNPGENQGQEKFTDFSNIPVPECLQKPPVFDFVNQTLACFQR
KIFMTIRSVSIFISFFLPMALQLAGLFVAKFAITESAIDNSDVDPDKQISLEFFQVIIFG
IFGMLAYVFVTTSFCGVPVMERELKLRYSLNVMGCRSLPYWLGTFAFDFIFISINLYIFF
IFCYIVQFNAITNYFGSFFGITQLFMFSIICQSYFLSFLFKKAQTAYKLVFFVNYLFFYT
VPAIIASQSTTLQGYMVLISPYLCYSMGTQVIAANTQPYPDMYLSNNYPTWQNKVYQYIL
ILFAQGIVYGLLALRIEKKLEKFPKEPEVDYSQFQNQSVPQEVAAEDQRVSNINCQDKIK
VSKLYKTYKINKKTPPFTAIKNNSFGVQNGEILGLLGPNGAGKSTTFNILTALIPKSQGS
VKLKNIEVESGLMEIYQDVGICPQFDNIYENLSVIEHLRLFGRMKGLKGQDLNDSIQYFL
KVMQLEDYVHRRAGKLSGGNKRKLCVTMALIGGPDMQFFDEPSSGVDPIARRFLWNTLSQ
SLKLRKGAIVLTTHSMDEAESLCSKIGILINGKFMCYGTPQFLKEKYGEGYKIHFKTENR
DAAIREIQATFQQAKFLSDTTQNDQVDLILPYQDFSLSKTFNFFENHLCLSRGLINDFQI
SQSSLASIFVYFTQFQEKREV
NT seq
4026 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctagtgttttaaaataaacgggcattatcattaaaaagaatgccatgcttaactta
agaaactatgaatatctaaaagatataattcctccagctatttcagctgtctttaacata
gttgcgaaaagctaaagttctctttcgttcatagcagcgttataccttcctctgtctctt
tcaggatttctgagatcatttgtttacaattttataaatgaaaaatctgaaaaatataag
gaaacttaaaagattatgggacttaaaagcttatcatataatctaggttggttcatattt
aactactctaaagcattcattattggttttatttacttgctaccttgtttgatagcttaa
gcatttagttcaagtaatttgagcttaggagagattgtattagcttatcttctgttcata
tgcgctgcattaagttagtgttatatgtacactacgtttttctcccaccctaaactccct
tcagatttgatcactttggtacatttaattgcttctgccttgtaatatgtagccgcagtt
caatcagtttaagaaaataattctttgcttagccttctatgtttgttcccttaaacatgt
gtaatatttattttccttcaagcaggttggaactaataaggctcaggtggtggttttagt
tactctgatatgaactttagctattctaatggcatatccatgcttatactggatacaatt
gtctacttcctcctttatgtatacttcgataatgttattaaaaatgaatatggtacttaa
aaagatgctttattctttataaattggatttggaagaaaaaatcaaataagaagtcattt
ggttcctcaaatgaacttagagagaatctaagtgtaaatcaataagaaaatgatgaagaa
attaattactctactaactaagttgattatagctctgccaaatataaagaagaatttaga
aatcttaataatctttcagtgacaattaaagttagagatttagttaaaacttttggagat
tttactgcagttgatcacttatccttgacattgtacgaatagcaaattttttgtctctta
ggacacaacggagctggtaaaactacgactatatctttactaactgggttactataaaaa
aatcaaggaaaaatcattatgaataatttagattttgatgagaatttagattaaattcgt
taaaatattggattatgctagtagagagatgtcttatacgataactttactgtagaagaa
caccttcagtttataggaagaatcaaaggaagagaaggcgaagagttagaaaatgaaatt
aattatctaatttaaaaatgctaactttcaaacgaagtaggaaaaacagctaaaatccta
agtggtggtaataaaagaaagctttcattagctatggctcttattggaggatcaaagatt
gtatttttagatgaaccctctagtggcttagatttcaatgcaagaaaagaaatcaaagaa
attcttttggagctaaaaaaagaataaagaactattatccttacaactcaccatttagaa
gaagctgaagaatgtgctgatcgtatagccatcatggctagaggttagctattaactctt
ggtacaaatgaatttattaaaaagaactttggtgtgggctatcacttaacaataactaga
aaatcagaaaatatgatgaaaagaagtagtagacaatcaatagatcataatagaccttct
tcaggctttaattacaactaacaacaacctcaacccactatttaaggtgaatactaacta
tctcctgagaaatgtgaataggttaaataaattgttaaccagattatacctgaagctaaa
tacaacccccaaagctcattgggaactgtttaatttactcttccatttacttccaaataa
aaattcccaaatctcttttctactttagaataacaaccagagctaagcttagatctagaa
atgaatactcttgaagatgcctttatcaatataggtatggatgaagagaaatacttaaat
ccaggagaaaactaaggataagaaaaattcacagacttttcaaatattcctgttcctgag
tgtctttaaaagcctccagtttttgattttgtcaattaaacattagcatgtttctagaga
aaaatatttatgactattagatctgtctctatttttatcagtttcttcttacctatggct
ctccaattagctggtctttttgtagctaaatttgctatcactgagagtgcaattgataat
agtgatgtagaccctgataaacaaatatcacttgaatttttctaagttattatttttggt
attttcggtatgcttgcatatgtctttgtgactacaagtttctgtggtgtaccagttatg
gaaagagaattaaagttgagatactctttaaatgttatgggatgcagaagtttaccttac
tggttaggaacattcgcctttgattttattttcatttcgataaatctatacatcttcttt
atcttctgctatatagtttaattcaatgcaatcacaaattactttggcagcttcttcgga
attacataattatttatgttttctattatttgctaatcatatttcctttcgtttttattc
aaaaaagctcaaactgcctataaattagtcttctttgtaaattatctctttttctacaca
gttccagctataattgcatcttagagtacaacactttagggttatatggttttgatatca
ccttatctctgctatagtatgggtacttaagttatagctgctaatactcaaccttaccct
gatatgtatctttcaaataactatccaacatggtaaaataaggtctattaatacatcttg
atactttttgcacagggaattgtgtatggattacttgctttgaggatagagaaaaaatta
gagaaattccctaaagaacctgaagtggattactcttaattctaaaattagagcgtacct
taagaagtagcagctgaagattaaagagtatctaacattaattgttaagataaaataaag
gtatcgaagctttataaaacttataaaataaataaaaaaactcctcccttcacagcaatt
aagaataactcttttggagtttagaacggagaaattttgggtttgttaggacctaacggt
gctggtaaatctacaacatttaacatcctaactgctttgatccctaaaagttaaggtagt
gtaaaattaaaaaatattgaagtagagagtggtttaatggagatatactaagatgtaggt
atttgtccttaatttgataatatttatgaaaatttatcagttattgaacatctccgtttg
tttggaagaatgaaaggcttaaagggttaagacctaaatgacagtatttaatacttcttg
aaagttatgcaattagaagattatgttcatagaagggctggtaaactcagtggaggtaat
aaaagaaaactatgtgtaactatggctctaattggtggtcctgatatgtaattctttgat
gaaccatcttctggtgtagatcctattgcaagaagattcctatggaatacactcagttag
agtttaaagctaagaaaaggagctattgttctaactactcatagtatggatgaagcagag
tccctttgctctaaaatcggtatccttattaacggtaaatttatgtgttacggaacacct
caattcttgaaagaaaagtatggtgaaggctacaaaattcactttaaaacagaaaataga
gatgcagccataagagaaatttaagctactttccaacaagctaaattcctaagtgataca
acttaaaatgactaagttgatcttatcttgccataccaagatttttcgttgagcaagaca
ttcaacttcttcgaaaatcatctctgcttgagcagaggattgataaatgatttctaaatt
tcttagagctcattagcatctatctttgtttatttcactcaattctaagaaaagagagaa
gtatga
DBGET
integrated database retrieval system
