Tetrahymena thermophila: TTHERM_00218470 Help Entry TTHERM_00218470   CDS       T01020                                  Name (RefSeq) RING Zn-finger protein, putative   KO K22377   E3 ubiquitin-protein ligase listerin [EC:2.3.2.27] Organism tet  Tetrahymena thermophila Brite KEGG Orthology (KO) [BR:tet00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03009 Ribosome biogenesis [BR:tet03009]     TTHERM_00218470    04121 Ubiquitin system [BR:tet04121]     TTHERM_00218470 Enzymes [BR:tet01000]  2. Transferases   2.3  Acyltransferases    2.3.2  Aminoacyltransferases     2.3.2.27  RING-type E3 ubiquitin transferase      TTHERM_00218470 Ribosome biogenesis [BR:tet03009]  Eukaryotic type   Pre-60S particles    Ribosome quality control proteins     TTHERM_00218470 Ubiquitin system [BR:tet04121]  Ubiquitin ligases (E3)   Single Ring-finger type E3    Other single Ring-finger type E3     TTHERM_00218470 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  UBC_like zf-RING_2 FANCL_C zf-rbx1 zf-ANAPC11 zf-C3HC4_2 RINGv zf-RING_16 zf-RING-like zf-C3HC4 MDN1_4th C1_1 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  7838604 NCBI-ProteinID:  XP_001020519 TGD:  TTHERM_00218470 UniProt:  I7M8Y2 LinkDB All DBs AA seq 1845 aa AA seqDB search MDAVELKQKKKGGKDKSALSKQGQSTGLLSHVNENVNMFSQLSAMFLANKAEKSDQVKKF LDKTEDKQVFQQHSYDPEIQQCLSQLNKKSQITKLKALNTLKELLQKQPEEFFEQFISTW TYLYKQFVNSEYDRKVFEESNNVLIIIISKNRKCLQAQFKELFPYWFIQMNDPSADVSQI ANQAFDKMFPKEKQAQAFNLCMEKYILNLKYYLSITQKQIESENNNLSEHESQEIYDRLV VSSLNSIARAIQLNKDSKDPNIFISQLEEELFAQGKKSILIELLSKKRIKVRAAVIEVLQ VLMNTISQEVLEQNIEVIAKNIMPLIDDKERQIQYSLWKGCLLTVLDKAPVAIIAKCDLK MIEVKSLEVLKKAASGIGKQFYQNIIIFLSKLPMAAFTSILNKESVQQQNKFNPEEYIKE RFSFIKKFFESILAGFTHDEIKFFGDQLVQSYFECIYFIVLKRISVVLDKEEVKSLKNVQ KQARNLIRDLICNILNIYLEQNIADNVMNPYKQIPNSLGQLINNFNTESINSNETDLFDE FVYEFSSIFSKTAKKDTTKYNNYILLLQSIANLVNKNSVLFNKLDSAVQKMHEDLLNDLK GQIQPLMNDSHIEKILPICTQYKLYANLFNSSQQKSQKKQEQEQEEEQKSPEIQLGVFSN LVTQQTVASLETINFSVQSIIQNIKTITNPTSLEKFTTFISQIYYSWSESLDEQHPQYSS FQQILKDIQNHIKMLNQVDPKALLHLQFILHFALPETSPTYFSQFCTHVNKIKPIDDILI LRNLSALESAQSQKNRVHMCTRLQNNQEYQTLAFGILSHIFGKMDRYLGVSLPLLVIIFK NYLNRDNKIKLISQIQANISKKRESIFNGEIQEKNTSRVIDELELNYLFCIQIYKDLPKV IDQNFDHLQFFNDFFKFIYFCFEKKLKSRIQQAFKIFKYLINDQAALTRIIENATCIFKF ELNTIFIDKKQTKFDTLLKLIVDTFSFLKSHKKKDEILQLTSTILEPQYFENIIFEQRNW RLLEALFEQITVSIDFNAYIQKLFVSQNGFWLISNLISSQQIFAILNSIQLKKYFKDLAN NFIKPLIHKQIEEEFETALQFLNYMMKLAIEKSLIYGNSLKACLKQIMIDGIETHKQQQI FNDIVKTKLDQLFVLENIDLMVREGILIKNLLPLFQEQLEKDSGSIEDLLRKKVSEVCRM NAQELTDNHKLSSLISLDILMASFYNDFYTTEGQQIQLTEYMLTNFEKFDSYNNYQNYYT SVFFTFINVVIEKIGIEPFSTNLIAIENHFRKSIEYNAKPRKLSSNALISLLVFLRKIVN IIEGFSSDFKEFVIQNIMDTCLIKLTEFEQDQSQRNNIDNNLIIDESNDVVIIEFAETIS RFVTILNEYFDENLSYELLNCRYPSIQKSSFILLKQFYQAFSPKVDLTLKCQASDEDFED KLLQNIYDQKMNVENLLKYLDVTNVILTEEEKQKHIAQIKKQQGIQSDDEVELQKEEKKT NQDNNSTNPQSEETDNINYLNPFEEKEGKDADEDDEDESENQDIIDPKTYGHLLTWISFV NKLNSPETDENHELVKKALKIYLDENKFIYKNFLTVLFQWIEYLEIPESQYKDTISIEDV QNVNPEWSDFLSKESLFQLLVQSLYIFSSKFPFFLRNWLENTAEKRFIKVAESLIKSFIS NALYLKEVETIELSQIEWQSEEFNIYVLKKTREINAIYMKENQKLEINLKIPLEYPIKHI QTEVKRGMKVNLQKTNKWMLMMKSLLFNQNNTIKNALLMWKDNLDKELEGLEECAICYYV INSTSGELPKLPCKTCKKKFHSSCIHKWFKSSNKSECPLCKSQFL NT seq 5538 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggacgcagtagaattaaagtaaaagaaaaagggaggtaaagataagtcagctctttct aagcaaggttagagcacaggtttattatctcatgtaaatgaaaatgttaacatgttttca caattatcagccatgtttttagcaaacaaggctgagaaatcagactaagtaaagaagttt ttagataagacagaagacaaacaagttttttaatagcattcttacgatcctgaaatataa taatgtctaagtcaattaaacaaaaagagttaaattacaaagctaaaagctttaaacact ctcaaggaacttctttagaagtaacctgaagagttctttgaacaattcatttctacatgg acttatttgtacaagtagtttgtcaattcagaatatgatagaaaagtttttgaagaaagc aataatgttttaattattatcatttctaaaaaccgtaaatgtttgcaagcctagtttaag gaactctttccttattggtttatataaatgaatgatccatctgctgatgtctcataaatt gctaatcaagctttcgacaagatgttccctaaagaaaaataggcctaagcgtttaattta tgcatggaaaagtacattcttaacttaaaatattacctcagtataacgtaaaagtagatt gaaagcgaaaataataatttaagtgagcatgaatcataggaaatatatgatagattagtt gtttcctctcttaattctatagcaagagcaatttagcttaataaggatagcaaagatcca aatatttttattagctaattggaagaagaactatttgcacaggggaaaaaaagcatactc atagaactactttctaaaaagagaattaaagtgcgtgcagctgttattgaagttttatag gttcttatgaacaccatttcataagaagttttagaataaaatattgaagttatagcaaaa aatataatgccacttattgatgataaagaaaggtaaatttagtattctttgtggaaagga tgtcttttaactgttttggataaagctcctgttgcaataattgctaagtgtgaccttaaa atgattgaagtcaaatcacttgaagttcttaaaaaagctgcttcaggtatcggaaagcaa ttttactaaaacatcattatctttttaagtaaactacctatggctgcattcacttccatt ttaaacaaagagagtgtttaataacagaacaagtttaatcctgaagaatatattaaggaa agattctcatttatcaaaaagttctttgagtctattcttgcaggttttactcatgacgaa attaaatttttcggagattagcttgtttagtcatactttgaatgtatttatttcattgtt ctcaaaagaatttctgttgttttagataaagaagaagtaaaatcccttaaaaatgtttag aaataagctcgtaacttaataagagatttgatttgcaatatattaaatatctatttagaa taaaatattgctgataatgtaatgaatccctataaataaatccctaactcattgggttaa ctaattaacaatttcaacactgaatcaatcaattctaacgaaacagatctttttgatgaa tttgtttatgagttttcatctatttttagtaagacagctaagaaagacactactaaatac aataattacatacttttattatagagcattgcaaatttagtcaacaagaatagtgttttg tttaataaattagattcagctgttcaaaagatgcatgaagatctccttaatgatctaaaa ggtcaaattcaacctttaatgaatgattctcatattgaaaaaattctgcctatttgcact taatacaagctatatgcaaatttattcaattccagctaataaaaatcccaaaaaaagcaa gaataagaataagaagaagaataaaaatcacccgaaatataattaggagttttctcaaac ttagttacttaacaaacagtagcttctttagaaacaattaatttttcagtttaatcaatt atttaaaatattaaaacaataacaaatcctacttctcttgaaaagtttacaacttttatt tcttaaatttattattcttggtctgaatcactagatgagcaacatccttaatatagctca ttttagcaaatcctaaaagatatttagaatcacattaaaatgttgaatcaagtagatcct aaagccctccttcacttataatttatacttcattttgctcttcctgaaacaagtcctact tacttctcctaattttgcactcatgtaaataaaataaaaccaatagacgacatattgata ctaaggaatcttagcgccttggagtctgcttaatctcaaaaaaatagagttcacatgtgc acacgcctataaaataaccaagaatattagacccttgcttttggaattttatctcatatt tttggaaaaatggatagatatttaggtgttagtttacctttattagttatcatttttaaa aattacttaaacagagataataaaattaagttgattagctagatttaagccaacatttcc aagaagagagaatcaatctttaatggagaaatctaagaaaaaaatacaagcagagtaatt gatgagcttgagctaaattacttattttgcatataaatttacaaagacctcccaaaagtg atagatcaaaactttgatcatttacaattttttaatgatttctttaaatttatttatttc tgctttgaaaagaaattaaaatctcgtattcaataagcatttaagatatttaaatacctc ataaatgactaagctgcattaactaggattatagagaatgctacatgcatttttaaattt gagctgaatactatctttattgataaaaaataaaccaaattcgatactcttcttaagttg atagtagacaccttcagcttcttgaaaagccataaaaagaaagacgaaatactttaactc acttcaacaatcctcgagcctcaatattttgaaaatataatattcgaacaaagaaattgg agattattagaagctctgttcgagtaaattactgtatctattgactttaatgcttacatt tagaaactatttgtctcttaaaatggattctggttgatttcaaatttgattagcagttaa cagatatttgctatacttaattcaattcaacttaaaaaatattttaaggacttggcaaat aattttatcaaacccctcattcataaataaattgaagaagagtttgaaacagccctccaa ttcttaaactatatgatgaaattggctatagaaaagagtttaatttatggtaactcattg aaggcttgcttaaaataaatcatgattgatggaatagagactcataaacaataacaaata ttcaatgatatagtcaaaacaaaattagattaactttttgtattggaaaatattgatctg atggttcgtgaaggtattttgatcaaaaatttactacccctattttaagaatagcttgaa aaagattcaggtagcatcgaagatttgttacgtaaaaaggttagcgaagtttgtagaatg aatgcctaagaacttactgataaccataagttatcctctttaatatctttagatattttg atggcttctttctacaatgatttctacacaactgaaggataataaatttagcttacagag tatatgctaactaatttcgaaaaatttgactcttataacaactattagaattattataca agtgtatttttcactttcattaatgttgttatagaaaaaattggaattgagcctttttca actaatcttattgcaatagagaatcatttccgtaaatcgattgaatataatgctaaacct agaaaattaagctctaatgccttgatttctctcttggtatttttgcgtaaaattgtcaac atcattgaaggattcagttcagatttcaaagagtttgttatccaaaatattatggacaca tgcttaattaaactgactgaatttgaataagactaaagctaaaggaataacatagataat aatttgattatagatgaatctaatgatgttgtgattattgaatttgcagaaacaataagc agatttgtcacaatattaaatgaatattttgatgaaaacttatcatatgagttactcaac tgtagatatccttctatataaaagagtagtttcatactattaaaacaattctatcaagct ttctcaccaaaggtagatcttacattaaagtgctaagcctcggatgaagattttgaagat aagctattgcaaaacatttatgattaaaaaatgaatgttgaaaatctgttaaaatattta gatgttacaaatgttatccttactgaagaagaaaagcaaaagcatattgcttaaattaag aaataataaggtatatagagtgatgatgaagttgaattgtaaaaagaagagaaaaaaaca aatcaagataacaattccacaaatccctagagcgaagaaacagataatattaattattta aatccttttgaagaaaaagaaggtaaagatgctgatgaggatgatgaagatgaaagtgaa aattaagacattatagaccctaagacttatggtcatttgctaacttggatatcctttgtt aacaagcttaactcccctgaaacagacgaaaaccatgaattagttaaaaaagctttaaaa atctacctagatgaaaataagttcatttacaagaactttttaactgtcttattctaatgg attgaatatttagaaatccccgaatcttaatataaagataccattagcattgaagatgtt tagaatgtaaatcctgaatggtctgatttcttgtccaaagaaagcttgttttaactattg gtctaatctttatatattttctcatctaaattccccttctttttacgtaactggttggaa aatacagcagaaaaaagattcattaaggttgctgaaagcttaatcaagagctttatcagc aatgctctttacttgaaagaagtagaaaccattgaattaagttagattgaatggtagtct gaagaatttaatatttatgttctgaaaaaaacgagagaaataaatgcaatatacatgaaa gagaactaaaaattagaaattaatttgaagatacctttagaatatcctataaaacacatt taaacagaagttaaaagaggcatgaaagttaatttgcaaaaaactaataaatggatgtta atgatgaagtcattactatttaattagaacaatacaattaaaaatgctcttttaatgtgg aaagataatttagataaagagttagaaggacttgaagaatgcgctatttgctactacgtc attaactctacttcaggtgaattacctaaattgccttgtaaaacttgtaagaagaaattc cactcttcctgtatccacaagtggtttaagagttctaataagagtgaatgtcctctatgc aaatctcaatttttgtga

DBGET integrated database retrieval system