Tetrahymena thermophila: TTHERM_00227090
Help
Entry
TTHERM_00227090 CDS
T01020
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Collectrin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7834437
NCBI-ProteinID:
XP_001014240
TGD:
TTHERM_00227090
UniProt:
Q23BX3
LinkDB
All DBs
AA seq
1898 aa
AA seq
DB search
MNFDYSIKFQQGDLSTKKDDQNTQRSDYELQNSYYDQNLYGPLSNQMNNHSRNNYNDDQF
QQNKRSSSQKSEKYDRNDIQNGEIQNLNANSTDKSINRVQKKDAQDATSGNQKLKREMQE
TINENEEEKSQIVIQENANFEDNNQFQQFIGHNLINESQNQNLNFYFQTYQNFQCDLQNS
ERDQRENITQQSHNQQLRNNIQLQSNSNHQHNQIIKNNGFERQSSVKQMHPRKTSEQINN
NDIINIQSQQDTHNQFQNKDNNLYQSGINQTSQEGIQDQYCFQGINTIESQQKMQQNPYI
YEQQTQNNSKSSTNKKNLVLKRQYFDVEPSKVLENQQKNRGYQSNDEKQEMCKYNLQYGV
CESQSNQFKQSKSQFQYQGQEEEEEKEQKMNNQFSYGMNSLQKNTKDLIFTNNQNNNKFY
DDDNQSTQLLKEVDNFQFQQSQEPDQQDQEKQKLQVQLECKYDHEFQNLIYKYTDPNYSK
QLKQKIEFNNQKEYLQEMLNCQLENETKYIRNQKDNFKQAQVFPFNFKIRKIKFEEQGLI
VQGIAEFKQDINLKQYINNNLVINQNKNEFTSQILSFSKNCNDNINDSKDFESENNDEEE
ENSFANLGLNYAEQNKQPQNKKDQKTYNIKMKVHINQINGIPIILQFYSQQESRQKLELI
LFQIHSKEIKNNFFILKSLIDDDSKNNSIERIIKNYNQMDKNTNNEFELPNYSFLKDIDK
KIFFNCIEQKANSLNDSYDLNQSQIECIKFMLTRSVALIQNPKIFNQIKQKEDIQDNLNQ
QNNRQQFQGKQNKNNNLKKNNINQNQKFNDDLFFNFQTQFEALKILLNFYSRQEKRKPIL
IICSNNQVIQQYKFKLLQYQGIYEFSSKYLESEKTLKFNSLYRLSKIIEKEKQKNPQKFT
NKIKDINDTWKFLIKYKSKMVQRVIKLQELKAFQDQFNQQEKVQKINFSSKITQLLINEY
FKDATDNVRSDKIELEEKIFDSWSQLDLNSQKIKEIIKIDLTDQQIKIIDYNLNQLREQK
KFYDKNFNSDYFRIIPVIFNLEGKQLDNSPESFSEFFNSFQKLSQINYYHMMSILDFIFF
YQAKNSLTKFFQKFESSILDDQKSLTEYIVSNLNKQDVILATVEESIIHYQALKNINPEI
IIVDETLVQKKEYQTTHIISSFQPKHLIYFGDLFQLKLIPSSNQLEISGRNIFNQFERLE
KLHFPFFQIIKQINNNTLQVFDDEYDDKELKSFNKVEIFQYEFEISSQYIIIIESIKQQK
QYISDLMSKIIQQRNENNNQNKENSLKLETIYYNKNNDFLIITCRQTNTQSILNRKIQSY
KIEFDKVNEDLNRPLLAHVAIYLDQNIPKHNFKYIKLKYKKIDYQIQQKQIQIENQINQS
YQSDQILNPINNYVSQQEQDSRKSSKEIDEIENKSSLNDSDSDSDRDSDSGDDDDKEIVE
EESKSQYQEKYQNKQEKSQEQIIDHRSYNEDEEGEGEEKKEINEIQIKKQHQNEIHMKCY
EENDVNIEDIIERKEEFQQITNKKNKKKEKLSKQKQRNNILPNEFTNQNGDDDSYESEEE
ISYDKEYEQAFKNAKQSFKDILYQKEHSIFVKNLVLLEENLIKLIRQNKFLLQKLDYVLL
CFIDIQDQNTETASIDEQQINYYIQEFQQKINTASINEQQTIIDLQEFYQNILQTQCNFK
VFKNSRIIELIDISGKHLEQQQFKIHDDDQKVFQNNQRKIKRLNLAKEYKTQIIDFYWVI
IQFLLQGFKYYKVLYEINNLSVKIKYKKDNFEDIKFSYEQINCKENKQSDDIQNLNSYFK
EIFAQEYVPFIFILTYSKDNGWNFQQFSVEDNFFELKQQFSLAFILVQNNNNDEQIQNNN
NQNEIKKNKDKIQELNQIMKLNSETLKSIGIVSIINNI
NT seq
5697 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattttgattatagtattaaattttaataaggagatttatcaactaaaaaggatgat
caaaacactcagagatcagattatgaattatagaatagctattatgatcaaaatttatat
ggtcctctaagtaattaaatgaataatcatagcagaaacaattataatgatgattaattt
tagtaaaataagagatcttcttcataaaaaagtgaaaaatatgatagaaatgacatttaa
aatggagagatttaaaatttaaatgcaaatagcacagataaaagtataaatcgcgttcaa
aaaaaagacgcgtaagatgctactagtggaaattagaaattaaaaagagagatgcaagaa
acaataaatgaaaatgaagaagaaaaatcttaaattgtaattcaagaaaatgcaaatttt
gaagacaataattaattttagcagtttataggacataatttaataaatgaaagttaaaat
taaaatctaaatttctatttttaaacatatcagaatttttagtgcgatttataaaattca
gaaagagaccaaagagaaaatatcacctaataatcacataatcaatagttaagaaataat
atttagttacaaagcaatagcaatcattagcataatcaaattataaaaaataatggtttt
gaaagataatcatctgtaaagtaaatgcatcctagaaaaacttcagaatagataaacaat
aatgacattattaatattcaaagctaataagatactcataattaattttaaaataaagat
aataatttatattaaagtgggattaactaaacttcgtaagaaggtatttaggatcagtat
tgcttttaaggcataaatacaatagaatcttaataaaaaatgtaataaaatccatatatt
tacgagtaacaaacacagaacaattccaaaagttctaccaataaaaaaaatcttgtatta
aaaaggtaatattttgatgtagaaccatcgaaggttttagaaaattagcagaagaataga
ggttattaaagtaatgatgaaaaacaagagatgtgtaaatataatttatagtatggagtt
tgtgaatcataatcaaactaattcaaataatcaaaatcttaatttcaatattaaggataa
gaagaagaagaagaaaaagaataaaaaatgaataattaattctcatatggaatgaattcc
ttacaaaaaaacactaaggatttaatattcacaaataattaaaataacaacaaattttat
gatgatgataattaaagtactcagttattaaaggaagtggataatttttaatttcaataa
tcataagaacctgatcagcaggattaagaaaaataaaaattacaagtttagctggagtgt
aagtatgatcatgaatttcaaaatttaatttacaagtataccgatccaaattattcaaaa
caattaaagcaaaaaattgaatttaataattaaaaagaatacttgcaagaaatgctaaat
tgctaattagaaaatgagacaaaatatattagaaatcaaaaggacaattttaagtaagct
taagtgtttccatttaattttaaaattcgaaagattaaatttgaagaataaggactgatt
gtttaagggattgcagaatttaaataagatataaacttaaaataatatataaataataat
ttagttataaatcaaaacaaaaacgagttcacttcatagattttatccttcagtaaaaat
tgtaatgataatataaatgatagtaaagattttgaaagcgaaaataatgatgaagaagaa
gaaaattcatttgctaatttaggcttaaattatgcagaataaaataaataaccttaaaat
aaaaaagactaaaaaacttataatatcaaaatgaaagtacatattaactaaattaatggt
attccaattatcttgcagttctattctcaacaagagtcaagatagaaattagaattgatt
ttattttaaattcattctaaggagatcaaaaataatttttttatcttaaaatctttaatt
gatgatgatagcaagaataactcgattgaaagaattataaaaaattataattaaatggat
aaaaatacaaataatgaatttgaacttccaaattacagttttcttaaagacattgacaaa
aaaatattttttaattgtattgagcaaaaagcaaattcattaaatgactcgtatgaccta
aattaatctcaaattgagtgcattaagtttatgctaactagaagtgttgcattaattcag
aatcctaaaatcttcaactaaataaagtaaaaagaagatatttaagataatttaaattaa
tagaataatcgataataattttaaggtaaataaaacaagaataataacttaaaaaaaaat
aatatcaaccaaaattaaaaatttaatgatgatttattcttcaatttttaaactcagttt
gaagcattaaaaatattgctaaatttttattctagataagaaaaaagaaaacctattcta
ataatttgctcaaacaactaagtcatatagtagtataagtttaagctgctttaatattaa
ggaatttatgaatttagtagcaaatacttagaaagtgaaaaaaccctaaagtttaatagt
ttatatagactaagcaaaataattgaaaaagaaaagtaaaagaatccatagaaatttaca
aataaaatcaaggacataaatgatacatggaaattcttaattaaatataagtctaaaatg
gtttaaagagtaattaaactctaagagctgaaggcattctaagattaattcaattagtaa
gaaaaagtccaaaagattaatttctcttcaaagattactcagttgctaataaatgaatac
ttcaaagatgctacagataatgtaaggagtgataaaatcgaacttgaagaaaaaatattt
gattcatggagttagctagaccttaattctcaaaaaataaaggaaataatcaaaattgat
ttaacggattaataaataaaaataattgactataatttaaatcaactaagagaacagaaa
aaattttatgataagaattttaattcagattattttagaattataccagtaattttcaac
ttagaaggaaaataattagataactctccggaatctttttcagagtttttcaatagcttc
caaaagctgagctaaataaattattatcacatgatgtctatcttagactttattttcttt
tattaagctaagaatagcttaacaaaattttttcaaaaatttgaaagtagtattttagat
gattaaaaaagtctaactgaatatatagtctctaatttaaataagcaggatgtcattttg
gcaacagttgaagagtcaataattcattactaagcattaaaaaacataaatccagaaata
attatagtagatgaaactttagtataaaaaaaggaatactaaacgactcacataatttct
tcttttcagccaaagcatttgatatactttggagatttgttttaattaaaattaatacct
agctctaattagctagaaataagcggaagaaatatttttaattaatttgaaagactagag
aaacttcattttccttttttttaaattattaaataaataaataataatactttataagta
tttgatgatgaatatgatgataaagaattaaaaagttttaataaagttgaaattttttaa
tatgaatttgaaatatcttcttaatatataattattattgaaagtattaagcagtaaaaa
taatacatttctgatcttatgagcaaaattatctaacaaaggaatgaaaataataatcaa
aataaagaaaactctttaaagctagaaactatttactacaataaaaacaatgattttctt
atcataacttgccgtcaaactaatacttaaagcattttaaatagaaaaatttaaagttac
aaaatagaatttgataaagtaaatgaggatcttaatcgacctcttttagctcatgtagca
atttatttagattaaaacatccctaaacacaactttaaatatattaaactaaaatataaa
aaaatagattatcaaatataataaaaataaatttaaattgaaaattaaatcaattaaagt
tattaaagtgattaaattttaaatccaataaataattatgtttcataataagagcaagat
agtagaaaatcttcaaaagaaatagatgaaattgaaaataaaagtagtcttaatgatagt
gatagtgatagtgatagggatagtgatagtggtgatgatgatgataaagaaatagtagaa
gaagaatcaaaaagctaatattaagaaaaatattagaataaataagaaaaatcataagaa
taaataatagatcatagatcatataatgaagatgaagaaggagaaggagaagaaaaaaaa
gaaattaatgagatacaaataaaaaaataacatcagaatgagattcatatgaaatgttat
gaagaaaatgatgtaaacatagaagatataattgagagaaaagaggaattctaataaata
acaaataagaagaataagaaaaaggaaaaactatcaaaataaaagcagagaaataatatt
ttaccaaatgaatttacaaattaaaatggtgatgatgattcatatgaatctgaagaagaa
atttcttatgataaagagtatgaataagcatttaaaaatgcaaaataatcgtttaaagat
attctctattagaaggagcattctatttttgttaagaatttagttctacttgaagaaaat
ttgataaaattaattagataaaataaatttttattataaaaattagattatgttctcttg
tgctttatagatatataagattaaaacactgaaacagcctcaattgatgaataataaatt
aactattatatataagagttttaataaaaaattaatacagcctcaattaatgaataataa
actatcattgatcttcaagagttttattaaaatattttgtaaacttaatgcaattttaaa
gtttttaaaaatagtaggattatagaattgatagatatctctggcaaacatttggaataa
taataattcaaaatccacgatgacgattaaaaagtgttttaaaataattaaagaaaaatt
aagagattaaatttggctaaggagtataaaacttaaattattgatttttactgggtcata
atttagtttttattgtaaggttttaagtattacaaagttttatatgagataaataattta
tcagtcaaaataaaatataagaaagataatttcgaagacataaagttctcttatgaataa
attaattgcaaagaaaataaataatcagacgatattcaaaatctaaattcttattttaaa
gaaatttttgcttaggagtatgtgcctttcatctttattttaacctattccaaagataat
ggttggaatttttaataattttctgttgaagataatttttttgaattaaaataataattt
tcattagcatttatcttggtttaaaataataataatgatgaataaatttaaaacaataac
aatcaaaatgaaattaaaaaaaataaagataaaatataagaacttaattaaataatgaaa
ttaaattcagaaactttgaaatcaataggtatagtgagtataattaataatatttga
DBGET
integrated database retrieval system