Tetrahymena thermophila: TTHERM_00227350
Help
Entry
TTHERM_00227350 CDS
T01020
Name
(RefSeq) helicase carboxy-terminal domain protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
SecA_DEAD
RsgA_GTPase
AAA_22
T2SSE
AAA_18
Zeta_toxin
AAA_29
ABC_tran
PEP-utilisers_N
CT_C_D
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7831274
NCBI-ProteinID:
XP_001014266
TGD:
TTHERM_00227350
UniProt:
Q23BU7
LinkDB
All DBs
AA seq
2415 aa
AA seq
DB search
MNQPEISNRENNLDAKKLIELFQEYEQDYSELKDKDIILLAGPTGSGKSTTANYLLGYEM
FFEKIEIEKEVDGEIYQSETEVFNSNGIFEIGHSGKSHTSTLQKAHLQGNYFLCDSPGFF
DNRGTEIEIANAYSLKQFMLNCNSVKMVVLISFFELEARRGALFQEIFKLVTRILQNPEQ
EQFEKIIFLFTKVPNDKSFKTINSKILDFLDIMKNQEEDRESFTMKTFLKVILNQLKINS
NLVIVNPADGNHRLLLQKILSHQSFSNPAEEFCFSVSENANQQIKLYTEETSKIILKQQQ
YGKYMEVKNRMVEFKQIRDYTGNEFLLYSYQDLSKEIVRIFEKQKNQAFNTFKEASEQSN
IFSSQNIKEILDIISYLQMIDEFKAEVFEQGQFKTSENQFKQEIEQVCFEISKRITEDFP
QNIENVKNNLQKLKDFSDQTSLGLQIYKQTQNEIRDKYLLEIEDLKQLSERFYIRTQQLE
VNSIKDSVTNIAQKIGFIKLIEKFLKAFILNEGENFYETIVQLHKQKNNGLLSNLKLIIA
DITEEIQKQPSMDDSEIVFNPQLECLPNFEISILKIQNQNSKYSEYIPDCEILYNEALLH
LKEFNQQVFNFIKENSQEDFHLHKLQNILKILDEIRNQDDLIQGKTADEYRQIKDEIKQK
INKKAREAKKILNQYLQEIEEEENNCDEEEDEDDINSIKSNDLVKNFKLKQQNDFKQLLK
AYNFLSDMHWTDQYFQTKFTQTSINKLEVKLNKYLEQCKQNVFNLIKNDKFCQIKKVFLR
ISCISVFKDVVKNYEGQYQMCVDSVKKKVSELNEQIKKFISCKRGDNIFNSEGWEKLNQY
ILLLSKIETLDKIADVKGDSNSSLIEIKCLIQTYFEENFQLIKNLSRAKVNPNDEDFTIQ
SNFVKQAKLINIEYQYIKSLLKRFSFEQLMALVQNVYDEMVTDYISKKEYIENLQEIQGS
YDRINRFIQSMSEFDFLKEKFKSLPRPKETIQQVFKNLENLIKNEDFQNLDSEIYLLSQL
KSDTDKQALDKSFQKIYDKLYNEIQQVKSYFYFKQNGGFSENIRKNLKIVSEILRVLEKY
KNQLYQQSRNELNIFLNIFRQNYIKSQKQMIFSKIKQLKFQEMEQQYEQLMQTFTGLSEF
KYIFQQDDWNTFSSEIQNIKEEISKSILNLHHLSKELIYLLNLLQGLNEAQKHPSDFSET
FQQELQNSQQEIKLVFNNYETSIRNKIKNKDSFIKTDLKVLKNFAQKAENIEQLNYCDFQ
VKLFQIEEEIYEESNKNYQEIQNLLVKKDYDQAKKQLLQIKQANEQFFDRIIKNMQIMIS
KATDQIKDQFPFIEVSCFQNTFLTALNNLKIIKHFVNQDEYLQHETTITKLITHIFTQSR
KFFEECDKILIYNDQSFTYQNLINLFKHHSFFEVIQRETVQGAEQAKPLQDLFKSILVKV
KEGLLKVKQAQQLIKEKMQVDQALNKNWKKFNALNQILKDSPQLFEQSEELKKIKEIGLQ
ILNDDQLVKEIQKNVESNDQAFQTALENCNFQRVKEIIFSIRKYSQINQEFNTEFIDINS
MLKKIEQKVNQIVQEALNIVKASIIYDQKMNDLMNMIYNADEHLKSIDQYPYEPQIQIVL
KELTNKLDQEISDLPKQSFMYQSNLKELSQFLISLQKISDQVSKFTQIVDKKLFEAFEII
MQTLGEDVIFELGNILKQDASGAQIVSKIPQFYSYRIDTFNEQVGKHDINYILDKLQQSE
RGEVKQPLDAKLKLELKQYYETYLKKYEQTIDKYKYIKNKWEEIVDCVKLLSKQINLPNK
KVWEEKNTILHLLAQICAYWTLIDSGEQKQGKKDIFKKPNHTQIISIIMLLGIHREIGLW
QGVKNYFSRGSQIQFKNQLIEILTGEGKSITLGFCSLTLALLGCEVDVVCYSSYLSERDD
KDFRKLFNLFGVSDKIKYGTFKQQAERYLESYLDVRQNTLNIINQSRQNDNRNPLQNTIN
NKILLIDEVDIFFNLDYYGKTYNPSVSFQTQEIVNIIKEIWNQRGKQESSIITNILQSSS
YKQLINKYPAYEKLFQRHIKQLAGDVNNVQQHKKNKNYVVRNNQIGYRQNDSTISFSTCY
NYLTLFAYFLENSNGNIDNQALQKEISLNIECGNISYALLPDTYSAILGVTGTLQSLNQQ
MKQCLKKYKFSTEIYIPSMFGNSKLDFREGDMVKVEIDLENQYLKIQEISFSAIKQQQSV
LIFFKDSQSLLQYHESNYLCFSKEKYIVVTDHESSEDFNFLIQKVTRSGQIGLFVREYGR
GTDFISLDPNVNNSDGVVVIQTFLSDNKTEEIQIKGRTARQGQKGQYYLILNQQDLIKDF
GLQDYQIQQWKNNQINKSFYANLNEVRNAKENKMYANIENNIMQAANLHQKSIEYIQNIK
NQKYNQAISYINDNC
NT seq
7248 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatcagccagaaatatcaaatagagaaaacaatttagatgccaaaaaattgatagaa
ttattctaggaatacgaataagactatagcgaattaaaagataaggatataatcttatta
gcaggacctactggaagcggaaagagtactactgctaactatcttttaggttatgaaatg
ttttttgaaaagattgaaatagagaaagaagtagatggtgaaatctattaaagtgaaact
gaagtttttaattcaaatggaatatttgaaattgggcactctggaaaatcacatacttca
acactgtaaaaagctcatttacaaggtaattattttttgtgcgattctcctggatttttt
gataatcgtggtactgaaatcgaaatcgctaatgcatattctttaaagtaatttatgttg
aattgcaatagtgtgaaaatggttgttttgataagcttttttgaattagaggctcgaaga
ggagcattattttaagagatatttaaacttgtaactagaattctttaaaacccagagtaa
gagtaatttgaaaagataatatttctatttactaaggttcctaatgataaaagctttaaa
actattaatagtaagattctagattttcttgatattatgaaaaactaagaagaagatagg
gaatcatttacaatgaaaacctttttgaaagttattttaaattaacttaaaatcaatagt
aatttagtaattgtaaatcctgctgatggaaatcataggttattactttaaaagatcctt
agccattaatctttcagtaatcctgctgaagaattttgctttagtgtttcagaaaatgca
aattaatagataaagttatacacagaggagacgagcaaaattatattaaaataataataa
tatggaaagtatatggaagtaaagaatagaatggttgaattcaagtaaataagggactat
acagggaatgaatttttgttatattcatatcaagatttatcgaaagaaattgtaagaatc
tttgaaaaataaaaaaactaggcttttaacacttttaaggaagcttctgaataaagcaac
atattttcctcccaaaatattaaagaaatactagatattatttcatatttataaatgatt
gatgaatttaaagctgaagtttttgaataaggctaatttaaaactagcgaaaatcaattc
aaataagagattgaacaagtttgctttgagataagtaaaaggataactgaagatttccct
taaaacatcgaaaatgttaagaataatctataaaaattaaaagatttttcagattaaact
tctttaggtttgtaaatatataagtaaacctaaaatgaaataagggataaatatttgtta
gaaatagaagacttgaaataattgtctgaaagattttacataaggacataataattagag
gttaactcaatcaaagatagtgtaaccaatatagcttagaaaattggctttataaaatta
attgaaaaattcctcaaagcttttatcttaaatgaaggcgaaaatttttacgaaactata
gttcagttacataagcaaaaaaataatgggctgttatcaaatctaaagttaataattgcc
gatattactgaagagatttaaaaataaccctctatggatgactctgagattgtttttaat
ccttaattagagtgcctgccaaattttgaaattagcatactcaaaatataaaactagaat
agcaaatattctgaatatattccagactgcgagattttatataatgaagctcttttacat
ttaaaagaatttaattaacaagtatttaattttatcaaagaaaattcttaagaagatttt
catttgcataaactataaaatatcttaaaaatattagacgaaatcagaaatcaagatgat
ttgatttaaggtaaaactgctgacgaatatagataaatcaaggatgaaataaaacaaaaa
attaataaaaaggctcgtgaagctaaaaaaattttaaattaatatttataggaaattgaa
gaagaagaaaacaactgtgacgaagaagaagatgaagatgatattaattcaataaaatca
aatgatttagtaaaaaactttaaattaaagtaataaaatgactttaagtagttgttgaag
gcatacaattttcttagtgatatgcattggacagattaatatttttaaacaaaatttaca
taaactagcataaataaactagaagtaaagttaaataaatatttagagtagtgcaagtag
aatgtttttaacttgatcaaaaatgataaattctgttaaataaaaaaagtctttttaaga
ataagttgcattagtgtttttaaagatgtagttaaaaactatgaaggacaatatcagatg
tgtgtagattcagtgaagaaaaaagtatcagagttgaatgaacaaataaaaaaatttatt
agttgtaagagaggagataatatatttaatagtgaaggctgggaaaaattaaattaatat
atattgcttttgtctaagattgagactttagacaagattgctgatgtcaagggagattct
aattcttcactaattgaaatcaagtgtttaatctagacatattttgaagaaaatttccaa
ttaataaagaatttatcaagagctaaagttaacccaaatgacgaagatttcacaatttaa
tctaattttgttaaacaagcgaaattaataaatatagaatatcaatatattaagtcgctt
ttaaaaagattctcttttgaataacttatggctttggtttaaaacgtttacgatgagatg
gtcactgattacatttctaagaaagaatatattgagaatctttaagagatttaagggagc
tatgatagaattaacagatttatctaaagcatgagtgaatttgatttcttaaaagagaaa
tttaaaagtttgcctagaccaaaagagactatatagtaggtatttaagaaccttgaaaat
ttgataaaaaatgaagatttttagaacctagattcagaaatatacttattgagccaactt
aaaagcgatactgataaataagctttagataaatcattttaaaaaatatacgacaagctc
tataatgaaatataataagtaaagagttatttttattttaaataaaatggaggtttctct
gagaatattagaaaaaatctgaagattgtatctgaaatattaagagtgctcgagaaatat
aagaatcagctttactaataatctcgtaatgaattaaatatttttttgaatatctttagg
taaaattacataaagtcttaaaagtaaatgatttttagtaaaataaaacaactaaaattc
taagaaatggaatagtaatacgaataattaatgtaaacttttactggcttgagtgaattt
aaatacattttctaataagatgattggaatacttttagctcagaaatttaaaacataaaa
gaggaaatttcaaagtctattttaaatcttcatcatctttcgaaagagttaatatatctt
ttaaatttgctttaaggactaaatgaagcttagaagcacccttcagatttttcagagaca
ttttaacaagaattacaaaattcccaataagaaattaagttagtatttaataattatgaa
acgagcattagaaataaaataaaaaataaggatagctttattaaaactgacttaaaagtt
ttgaaaaattttgcttagaaagcagaaaatattgaataattgaattattgtgatttttaa
gttaaactattttaaattgaagaagaaatatatgaagaatcaaataagaattattaagaa
atttaaaatttattggttaaaaaggattatgactaggctaaaaaacagcttctacaaatt
aagtaggcaaatgagcagtttttcgatagaataataaaaaatatgtaaattatgatatcc
aaagctacagattaaattaaagaccaattcccctttatagaagtttcatgcttctagaat
acttttttaactgccttaaacaacctgaaaataataaaacactttgtaaattaagatgag
tatcttcaacatgaaacaacaattactaaacttattactcatatatttacataatcaagg
aagttctttgaggaatgcgataaaattctgatctacaatgatcaatcgtttacatattaa
aatttaataaatctatttaaacatcactcattttttgaagtaattcaaagagagacggtt
taaggagcagagtaagcaaagcctttataagatctttttaaaagtattttagttaaagta
aaagaaggactattaaaagtaaaataggctcaacaattaattaaagagaaaatgtaagtt
gatcaagccttaaataaaaattggaaaaaattcaatgctcttaatcaaatcctaaaggac
tcaccttaattgtttgaataatctgaagaacttaaaaaaataaaagaaattggtcttcaa
attttgaatgacgattaactagtaaaggaaatttaaaaaaatgttgaaagcaacgattaa
gctttttaaactgcattggaaaattgcaatttctaaagagttaaagagatcatttttagc
ataaggaaatactcttaaataaattaagaatttaatactgaattcatcgacattaattcc
atgctaaaaaaaattgagtaaaaggttaatcaaatagtgcaagaagcactaaatatagtg
aaagctagtattatttatgactaaaaaatgaatgatttaatgaatatgatttataatgca
gatgagcatttgaaaagcatagattaatatccttatgaaccttaaatctaaatagtttta
aaagagcttactaataaattagatcaagaaatctctgatcttcctaaatagagctttatg
tattaatcaaacctaaaagaattaagccaatttttaattagcttacaaaaaatttctgat
taagtgagtaaattcacttaaattgttgataaaaagttatttgaagcttttgaaatcata
atgtaaactttgggagaagatgtaatatttgaattaggtaatattctaaagcaagatgct
tctggggctcagattgtgagcaaaataccttagttttattcttacaggattgatacattt
aatgaataagtaggtaaacatgacatcaattatattcttgacaaattgtaataatctgaa
agaggagaagtcaaataacctttagatgctaaattaaagcttgaactaaaatagtattat
gaaacttacttaaaaaaatatgaataaacaattgataaatataaatacattaagaataaa
tgggaagaaattgtagactgtgtaaaattactatctaaataaataaatcttccaaataaa
aaagtatgggaggagaagaatacaattctacatttgcttgctcaaatttgtgcgtactgg
actctaattgatagcggagaataaaagtaaggcaaaaaagatatctttaaaaaaccaaac
catactcaaataattagcattataatgcttttaggaattcatagagaaattggattatgg
caaggagttaaaaattacttttcaagaggcagctaaatttaatttaaaaattaattgatt
gagattttgactggagaaggaaaatcaatcacattaggattttgctctttaacacttgcc
ttgttgggttgtgaggttgatgtagtttgctatagttcctacctttcagagagagatgat
aaagactttcgtaagctctttaacttatttggagtttctgacaaaatcaaatatggaact
tttaaataataagcagaaagatacctagaaagctatttagatgttaggcaaaatacctta
aatataataaattaaagcaggtaaaatgataacagaaatcctttacaaaatactatcaat
aataaaatattgttaattgatgaagtagatatctttttcaatctagattattatggaaaa
acttacaatccttcagtaagtttttagacttaagaaatagtaaatataattaaggaaatt
tggaattagagaggaaaataagaatcaagcattattacgaatattttataaagtagtagc
tataaacaattaatcaacaaatatccagcatatgaaaaacttttctaaagacatattaaa
taacttgctggagatgtgaataatgtataatagcataaaaaaaataaaaactatgtagtt
agaaataattaaattgggtatagataaaacgattcaacaatttctttcagtacatgttat
aattacttaactctttttgcatatttccttgaaaattctaatggaaatatagataactag
gcactttaaaaagaaatttcattaaatattgaatgcggaaatatttcttatgcactatta
ccagatacttattcagctatattaggggtaaccggtactctttaatctttaaattaacaa
atgaaacagtgtctcaaaaagtataaattctcaacagaaatttatatcccttcaatgttt
ggaaattccaagctagattttagagaaggagatatggtaaaagtagaaatagatttagaa
aactaatatttgaaaattcaggagatctctttctcagcaattaaataataataatctgtg
ctcatattctttaaagatagttaatctttattataatatcatgaaagcaattatttatgc
ttttctaaagaaaagtacattgtagttactgatcatgaaagtagtgaagattttaatttt
ttaattcaaaaagtgactaggtcaggtcaaattggactttttgttagagaatatgggaga
ggaacagattttatttcattagatcctaatgtaaataattcagatggtgtagtagtcatc
taaacatttctttcagataacaaaacagaagaaatccaaatcaaaggaagaactgcaagg
caaggctaaaaaggataatattacttaatcttaaatcaataagatttaataaaagatttt
ggattgtaagattatcaaatttagtaatggaaaaataattaaattaataagtctttttat
gctaatcttaatgaagtaagaaatgctaaagaaaataaaatgtatgcaaatattgaaaat
aatataatgtaagctgctaatttgcactaaaaaagtattgaatatatttagaatattaaa
aattaaaaatacaattaagctattagctatattaatgataactgttga
DBGET
integrated database retrieval system
