Tetrahymena thermophila: TTHERM_00248270
Help
Entry
TTHERM_00248270 CDS
T01020
Name
(RefSeq) tetratricopeptide repeat protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_1
TPR_12
TPR_10
TPR_2
TPR_8
LAGLIDADG_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7844525
NCBI-ProteinID:
XP_001023857
TGD:
TTHERM_00248270
UniProt:
Q245M1
LinkDB
All DBs
AA seq
1722 aa
AA seq
DB search
MDEVSQKKQNKLHRISNQLKAYISNNLTQILIVFITLFPTIIITFATFTSIQFSQNVSVD
LINDFAEQLFQDQIESSKQQNLAVVFQLKSQVQKIPWQINLLNEFQGKNLLGAVIKNSKH
IPAIHNIDRSFYMKENKTVLNMFLKNSIQTSVWHHVNFSYLEQLDERQIKQLYDGYRLDS
IWKAIKFDNQNQNNMWLKIKDIFNAHDYDGLIYMTSINTTYTTYPIPPGCPYNGTYKFDI
RCRFYYKPTMADISTILYDPQIFYTNANPYLASVFCQRRLRYFNQDPNSQAEKYSVLCIT
LDLTQTPQYFQNFGQNSKFQIILDPRKLTVIYDSSIINIKRDQILKIQQAETDYLQDQSQ
SQIFIENISLMSQYILDQKDNINELQIDSEQLQRTFQYNRNGTVCFVIQNLIIMIDKIPS
FEALKRGSSSKKFQLKSAFIFLDVLSKEKMTQYSNDLQIKIKYYNQIFSYCCWVLIILAT
IFQLYFSIILGRLLIHPIIHLTNILKQIKIKNQSIQQLSNNLIKDSQQATYQMTNTNFKS
QKEIFQSDVSILSFEDQIQFEFNINSDFDGICFSSDTQQLLNSFQNMFKILKFTNSNILK
QNESTSLLNLNIQVQYFEKFCNYRALGVCYNNIGVIHYNSGRYQESVENFQKAVIFAKYE
LNIYAHDNLKEELSLQKKRLTSIFNMNILENKNKSSKLSFGKYNQIDEKEEIPFQFEDIV
ENEQLYWNLFNRKENLLKSLSKYLNSNSGLWDIYYELAKENAIISKIFLPPSFKREMFNY
YPILISYFQSKDTVNAEDILKKISILYIKNYEQKNNQNEIQSEKPQTISNFSNKLLALQN
SLFMQNTEDSLFLQKKLTVYSNQISQINTSQVLMSPIKKSIVKKQTLKFKEGQEKEQIYS
QSNQKRLSCLAEGVFDSIQHHQSQKKQAKQIQKNLSFSIFQNQESNLKVKKESIYQEDPY
MKTRKESSFKKKYKTNRKKDTLIIKQVNHKKARKSNYLNSIQLNMLSNTKKKFLSFYKVK
KCNNTDKISKYEFSSDVNFLYYALSQAQFLAQSQNFNKAATILTNSLESCRYYLPHLKAQ
ALNILSDIFRRNNIFADDLEEMKNSYEQLMNCNFHVYIITACQQRKSNKKVCKISSDLLK
DILFKDQDSFGLISYSFYESIFEQFMAQIYIQIIKSHPHLLQLLLISYTQKYIQNDSHYI
NLGRQHQVNNNQGEQDEDIKEISPLASNRNKQSVCKLDKSSIIQKQLVKQNNEDSFLNEE
SKYDGANRSLDIKENTYSNNNKIQTQTNSKISNFLNKNYQQIKKIQNQLLQQSISSIIPN
YQFNFLPVFMGQHKRQKDLSIKQRPLENELSKKEKLNENIQNQNCDFNQNIQNSFNSISK
NRNFQEFNIREVSPIMFDKIESQQKYFQQQWLESSPCKLINGGEGDRLRNETQIINQTFR
LDSSFSNVQKDTFKIDQHNGDEHLDYDQLSKSNISLKQYSSNTNLNILNETFSNQFNGIQ
QPQTIQNDDISPCIQTNNQKNNFYSNQYDYLIAGQFQSENQENNQNNNGKQENQVKGEND
FYHQAKENQQQFNNKKINKNSEEIFHLGIQAALKQFILSTKEKINIYLSLKKYKESQKNK
QFQLQKQNQIILIYITDLQLQFKNDDFINELSQLLLNLDIQLLILVINQQQQTYEYDELQ
DIIISGKNIIKFFNSEQKLLQYIYNQREHVKNNLIPMMIEYF
NT seq
5169 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgaagtaagttaaaaaaaataaaataaattgcatagaatatctaattagttaaaa
gcttacataagtaacaatttaacttaaattctaatagtatttataaccctatttcctacc
ataataataaccttcgcaacttttacaagcatttaattttcttagaatgtaagcgttgat
ctaatcaatgacttcgcagaatagctcttttaagactaaatagaaagttccaagtaataa
aatttagctgtagttttctaattaaaatcacaggtttaaaagattccttggcagataaac
ttgcttaatgaattttaaggcaaaaatctacttggtgcagtaattaaaaactctaaacat
attcctgcaatccataatatagatagatcattttatatgaaagaaaacaagactgtatta
aatatgtttttgaaaaactcaatatagacgagtgtctggcaccatgtaaattttagctat
ttagaataattagatgaaagatagattaaacaattgtatgatggttatagattagattcg
atttggaaagcaattaagtttgataattaaaattagaataatatgtggctaaaaatcaaa
gacatttttaatgcccatgattatgatggtctgatttatatgacaagcataaatacaact
tatacaacataccctattcctccagggtgtccttataatggcacttataagtttgatatt
agatgtaggttttattataaacctactatggccgatatatctacaattctatatgatcct
taaatattttatactaatgctaatccttatttagcaagtgtcttttgctagaggagattg
aggtactttaactaagatcccaactcttaagcagaaaaatattctgtactctgcataact
ttagacttaacttaaactcctcaatatttttaaaattttggataaaactctaaattttaa
attattttggatccaagaaaattgacggttatttacgattcttctatcataaatattaaa
agagatcaaatcttaaaaatttaataagcagagacagattacctccaagattaaagttag
tcatagattttcattgaaaatattagtttgatgtctcaatacattctagactagaaagat
aatataaatgagctttagatagattcagaataactttagagaacattctaatataataga
aatgggactgtgtgttttgtaattcaaaatctcatcattatgattgataaaattcctagc
tttgaagcattaaagagaggaagttcttctaaaaaattttagctcaaaagcgcatttatc
tttttggatgtgctctcgaaagagaagatgacttaatattctaatgacctttaaattaag
ataaaatactacaattaaatatttagctactgttgttgggtcttaataatattggctacc
attttttagctttacttttcgataatcttagggcgattattaatccatcctattattcat
ttaacaaatattttaaagtaaatcaaaattaaaaaccaaagcatttagcaattgagtaat
aatttaatcaaagattcataacaagctacatatcaaatgacaaatacgaattttaagagc
caaaaagaaatattttaatcagatgtttcaatattgagctttgaagattaaatacaattt
gaatttaacataaattcagattttgatggtatttgcttttctagcgatacacagtagttg
ttaaacagcttctaaaatatgtttaaaattttaaaatttactaactctaatatacttaag
taaaatgagagtacttctttgcttaatcttaatattcaagttcagtactttgaaaaattt
tgtaattatagagcattaggagtgtgctataataatataggagtaattcattacaacagt
ggtagatattaagaatctgtagaaaatttttaaaaagctgttatatttgctaaatacgag
ctaaatatctacgcccacgacaatttaaaagaagaactttctttataaaaaaagaggctc
acttctatttttaatatgaatatccttgaaaacaaaaataaaagttctaaattaagtttt
ggtaagtataatcagatagatgaaaaagaagaaattccattctaatttgaagatatagtt
gaaaatgaataactctactggaatctatttaacagaaaagaaaatttacttaaatcccta
tcaaaatatttaaattctaattctggtttatgggatatttattatgaacttgctaaagaa
aatgcaataataagtaaaatatttcttcctccatcttttaaaagagaaatgttcaattac
tatccaatattgatttcatactttcaatctaaagatacggtaaatgctgaggatatatta
aaaaaaataagtatattatatataaaaaactatgaacaaaaaaataactaaaatgaaata
taatcagaaaaaccttaaacaatctcaaacttttcaaataaattattagctcttcaaaat
agtttgttcatgtagaataccgaagattcattatttctctaaaaaaagttaacagtatac
agtaattaaattagctaaattaacacttcataagttttaatgtctcctattaagaagtct
atagtaaaaaagtaaacactaaaatttaaagaggggtaagaaaaggaataaatttacagc
taaagtaattaaaagcgattatcatgtcttgctgaaggagtttttgatagtatccagcat
cactaaagttaaaaaaagcaagcaaagcaaatataaaaaaatctatctttctcaatcttt
taaaattaagaatctaatcttaaagtaaaaaaagaatcgatttactaagaagatccatat
atgaaaacaagaaaagaatcatcttttaaaaaaaaatacaaaacaaataggaagaaagac
acactaataatcaaataagtaaatcacaaaaaggcaaggaaatcaaactatttaaattcc
atacaactgaatatgctctctaacacaaaaaagaagtttttatctttttacaaagttaag
aaatgcaataatacagataaaatttctaaatatgaattcagctcagatgtgaattttttg
tattacgctttgagttaggcttagtttttagcgtaaagctaaaattttaataaagctgca
acaattttaactaattccttagaatcttgtagatactatttacctcacttgaaggcgtag
gctttaaatattttatctgatatatttcgtagaaataatatttttgctgatgacttagaa
gaaatgaaaaattcatatgagcagttaatgaattgcaattttcatgtttatattataaca
gcctgtcagtaaaggaagagcaacaaaaaagtttgtaaaataagttcagacctactcaaa
gatattctatttaaagactaagattctttcggattaatcagttattctttttatgaaagt
atatttgaacagtttatggcttaaatatatatccagattataaaatcccacccacattta
ctttagctattgctcatttcttatactcaaaaatatatttagaatgattcacattacata
aatttagggcgataacattaagtaaataataactaaggagaacaagatgaagatataaag
gaaattagcccattagcatcaaatagaaataaataaagtgtgtgtaaattagataaaagt
agtattatataaaagtaactagtgaagtaaaataatgaagattcttttttaaatgaagaa
tctaaatatgatggggctaatcgttcattagatataaaagaaaatacttacagtaataat
aataagatttaaacttaaacaaactcaaaaatctctaattttttaaataaaaattattaa
taaattaaaaaaatataaaattaattgctttaataatcaatctcatctataattccaaat
tattagtttaattttttaccagtatttatgggataacataaaaggcaaaaagatttgtca
attaagtaaagacctttagaaaatgagttaagtaaaaaagaaaaattaaatgaaaatata
caaaactaaaactgtgacttcaaccaaaatatttagaattcatttaactcaataagtaaa
aataggaatttttaagaatttaatatcagagaagtatcaccgataatgtttgataaaatt
gaaagccaataaaaatatttttaacaataatggttagaatcctcaccttgtaagctaata
aacggtggagaaggcgatcgtttaagaaacgaaacataaattattaattaaacgtttcgt
ttagattcttcgttctcaaatgtgtagaaagacacctttaaaattgattaacataatgga
gacgaacatttagattatgattaattaagcaagtcaaatataagcttaaaatagtattct
tcgaacacaaatcttaatatactaaatgaaaccttttcgaattaatttaatggaatttaa
taaccccaaactattcaaaatgatgatataagcccatgtatttaaacgaataattaaaaa
aataatttttactcaaactaatatgattatttaattgctggttaattttaatcagaaaac
taagaaaataattaaaataataatggtaaacaagaaaattaagttaaaggtgaaaacgat
ttttaccattaagccaaagaaaattagtaatagtttaataataaaaagattaataaaaac
tcagaggaaatattccatttaggaatacaagcagctcttaaataattcattttgagtaca
aaagaaaaaataaatatttatctttctttgaaaaaatataaagagagctaaaaaaataag
caattttaactttaaaaataaaattagatcattttaatttatattacagatctacaacta
taatttaaaaatgatgattttataaatgaattgagtcagcttttgcttaatctagatatt
taattgttaattttagtgattaattagcaacaacaaacttatgagtatgatgaacttcaa
gatataataatttctggaaaaaatattattaaattttttaacagtgaataaaagctactc
caatacatttataatcaaagagagcatgtcaaaaataatcttatacctatgatgatagaa
tatttttga
DBGET
integrated database retrieval system