Tetrahymena thermophila: TTHERM_00248340
Help
Entry
TTHERM_00248340 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_10
TPR_2
TPR_1
TPR_11
TPR_8
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7824051
NCBI-ProteinID:
XP_001023864
TGD:
TTHERM_00248340
UniProt:
Q245L4
LinkDB
All DBs
AA seq
2269 aa
AA seq
DB search
MSWQLNLLNQFHDKVINQRVKQNPNYIYQNNVLNIDRAYENDEEQLLLDLFRKNKLLTSS
WHTPSIAYIDQLDLQSRQQLQNVSSLDSIWRAIVYDNNLNDISNNRKLKFRDIFVGFDYD
GMVYMTAINTTYQNMQLPPGCVRQKYVFDVRCRYYYENTKNQISLQMYQPNLLYTDGNPF
IASVLCQKLMKTNNQNSTSLHSIICNDIDLTQIPEYFSNFNKESSIQIVLDPNSLEIIYH
SQIQTQRQQIFNLKNISLIQSDSNQTQVTDVSSSDQEQQEMLIQFIQNNYQNWSLNQYNN
INMIEIQDKQENLKTYEINFNSGSHYFIVMNVVKLIDKIPSYEMKLNNIPKYQTERAILY
MNILSKEVLTKDMTKLKDDVTKFFIYFTCFSIFGFVVILLFIILKANVISLSIINGVKHL
TKVLSKIKWETSEEGNVQFQDLIETNLNIESIFLSKEMQILYGSFQNLFKTLHYTTSNIY
SQSDGHNLLNLNMQLQYFEQFQNFRALGVCKNNIGNIHYNSGRYFEAMESYQKAIICSNY
DLGLYKENIQQEEHQEIYQGNLSESSKRKGSLYKYDFRSEKSDRSDKEITYWNHFNRKMN
YLKAFLSYLNENNQDHLWICAENLVEELIQISKTQLFNCYSRQIVLLYYKSVTLFKQGKI
DLYEQNLNRGIKKYNKYLALKCRVLNSFVYQPSLILNSPPFKQYQTINSNKQFQLSPQPL
QNNIQNAFIQSNSQQVNKQFSHNQLNTSQNIKICSPQMQKEKTLSSFTHARITTYSAANE
NQPKTLADLPNLVASNNLNDVSQQDCQPQLPSHINQSNCQINCKISNGKSMSLQQQQYSS
NQINIKSTNPSSINQQRSTQPNSQCQLKSLQSKNELINNSNIVLQNNNNEINLCQDLNLQ
NTTILNVNDLNQKMTKQNTPISSIQNLNETDKKIPHSNIQLLLTQEIEQTKHKKYTNNGN
QFDLDSNLKNANKLQQIIQTNQANQNQNNQNQGFSFQKKYKSQPQNVQQFKQIKEQDSYN
KENKDNTTPTNILEQIQEGKQEYRENTIFQKFKSYVEKFRSVFSKKRGEQKNQKPQNKQI
QIIEITQLPKLRNNKINTIQNNETQHVQSQYYQKYRKSPSSNIKLHKRSKNISQINRKRS
QLSSKEYNYSKPNLLFQNTLNNSNKYTKQIINSSAQNSFNQINANKSYKQQGSIHHFNYL
SGNSSFGTNQINLSQKQKLYFINQQISQNHEQQQKSLSIQISKIKKNYNDEQISRNIFPQ
SILDCFLALQQSELLYLKGEYYKAAQLLTQQLQDEELYLQHLRHKRLLMLQKIFYRADIQ
NIQLDKMIKNQMHNYIFKIQFVSNCRDSQSLSRSFELINDIFYEILKQDLDQLGLVTYNY
DEKCYCQELQMTQYAQLKLSNSSFIDNLLISVFQKSSSNKNINNDFKNLKITKCISYQNQ
EGQIKQDPKNSFQSQANYQESLQSESNNHEKENIFKQQLQNKTKLQQPYQADSIFENLFH
KQDSQKNNQMHISNLEFQDLQINTFTNQKNQNEQTLGNTQIIQNSVYNTNELKSINQLYD
NQKTFQQLQNKQKLLDENYQDQSLANMSIYSNLLNQKNRRQSNKLLLNQVTKEAKDLNII
NNSNRGCFKDDEYSAATFKNQKSNFFNDYEDLNDFQQLVSKQELFQDSFSNNLYSPIKID
SPFEQQKNQKPQIFFGSSVKEEAHQQIFRNQTVAQTFEKNSSNLQKLDVDLIVNAAQKNA
YQIQDAQSKIESARSSINYQVSPPNIRKAESFLYVQQPIDSLEQTNKQQQIDSQQKLSLF
SKQQNLQKTNYLEHQSQINQNSINPNQVTSSIEKQKLIEQIKKKSLSLQKQKSNPYKLNT
NNHQQNLIINDLSQEQTEQDDSFFSNINESKVEQSFSVSSQLNTYDKQSQIKSPISQRAK
PLKQMNVNLKKINSLQNFQDYSSQSQQVNQNDIQSKQSNNINEDKNSIQIYKRNLFRRLS
VQSYHQKQQIFKRESYSLTPTSNKNYILQEFNRNNANTNVQSYEHQQQNSSENQQFLNLP
QSPCFLTFPQSSNHLESQSKIDQRVLKDYKNNQPQIKMQSNEDKQFHLGMQKAIVSLLQS
NNENQTYNFIKSKFEFNQCISKVEKQKITLKKQCESPKQKFQQQKQNSESQFTHQYLTDQ
VAISVKKFIIFATDQNQIDQNTEMYSKLCQMLYNSEIELLILQLNSQDSVNETSIDSDSY
YQQKCVIKFFFSSNKLLQYIYSQRSNFNVNLLPLIIEHFQTTFLFVFLF
NT seq
6810 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttggtagctcaatcttttgaattaatttcatgataaagtcattaatcaaagagtt
aagcaaaatcctaactatatatactaaaataatgttttaaatattgatagagcttacgaa
aatgatgaagaataactcctattggacctttttcgtaaaaataagttgctgacaagttca
tggcacactcctagtatagcatatatagattagctagatctataatctagataataactt
taaaatgtctctagccttgatagtatttggagagctattgtctatgacaataacttgaat
gatatttcaaataatagaaaactaaaatttagagatatttttgtaggatttgactatgat
ggaatggtatacatgactgctataaatactacatattaaaatatgtaattacctcctgga
tgtgtaaggtaaaaatatgtattcgatgttcgttgtaggtactactatgaaaatactaaa
aatcaaatttctttgtaaatgtattaacctaatcttttgtatactgatggtaatcctttt
atagctagtgttttgtgctaaaaattaatgaaaacaaataattaaaatagcacatctttg
cattctattatttgcaatgatattgacttgacatagattccagaatatttttccaatttt
aacaaggaatcttctattcaaatagttttagaccctaattcattagaaataatttaccac
tcttaaatttaaactcaaagacaatagatttttaatcttaaaaacatatctcttatctag
tctgactcaaactaaacataagtaactgatgtaagcagctcagactaagaatagcaagaa
atgcttatttaattcatacaaaataattattagaattggagtttgaattaatataataac
attaatatgattgaaatttaagataaataagagaatctaaaaacatatgaaattaatttt
aatagtggaagtcactactttatagttatgaatgtagttaaactcatagataagattcct
tcttatgaaatgaaattaaataatattcctaaatactaaacagaaagagctattctctat
atgaatatcttatccaaggaagtgcttactaaagacatgactaaacttaaagacgatgtc
acaaaattttttatctatttcacttgtttctcgatttttggatttgttgtgattctctta
tttataatactaaaagcaaatgttatttcattaagcataattaatggtgttaaacattta
accaaagttctctctaaaataaaatgggaaacaagtgaagaaggaaatgtctaattttaa
gatttaattgaaactaatttaaatattgaatctatttttttatctaaagaaatgcaaata
ctttatgggagcttttaaaatctatttaaaactttgcattacactacttcaaacatttat
agttaaagtgatgggcataatttattaaatctaaacatgcaattatagtatttcgaataa
ttttaaaattttagagcacttggagtttgcaaaaataatataggcaatatacattataat
tctggtagatattttgaggctatggaatcatactagaaagctattatttgttcaaattat
gacttaggattatataaagagaatatttaataagaagagcattaggaaatctattaaggt
aatcttagtgaaagtagtaaaaggaaggggagtttgtataaatatgattttcgttctgaa
aaatcagatagaagtgataaagaaattacatactggaatcactttaatagaaaaatgaat
tacttgaaggcttttttgtcctatttaaatgaaaataattaagaccatttatggatatgt
gctgagaacttagtagaagagcttatttaaataagtaagacatagttatttaattgctac
agtagacaaattgttctactctactataaatcagtaactctattcaaacaaggtaagatt
gatttatatgaataaaatttgaatagaggaataaagaagtacaataaatatcttgcccta
aaatgcagagtccttaatagctttgtatattaaccttctctgatattgaattctcctccc
tttaaataatatcaaacaattaattcaaataaacaattttaactatctcctcaaccctta
taaaataacatctagaatgcttttattcaatcaaattcttaataagttaacaagcagttt
tctcataactaattaaatacttcttagaatataaaaatatgttcaccacaaatgtaaaag
gaaaaaactctatctagctttactcatgcaagaattaccacctattccgctgctaatgaa
aactaacctaaaactctagctgatttacctaatttagtcgcttcaaataatttaaatgat
gtctcttaataagattgctaaccatagttacctagccatatcaactaaagtaattgttaa
attaactgcaaaatttctaatggcaaaagcatgagtttataataatagtagtattcttca
aactaaataaatataaaatctaccaatcccagttcaataaattagcagagatcaacctaa
cctaattcttaatgttaattaaaatcattataaagtaaaaacgaactaataaataactca
aatatagtcttataaaataacaataatgaaatcaatttatgttaagatttaaatttgtaa
aatactacaattctaaatgtgaatgatttaaattaaaagatgacaaagcaaaatactcct
atttcttctatttaaaatttaaatgaaactgacaaaaaaatacctcactcaaatatttaa
ttacttttaacttaagaaatagaataaaccaaacataaaaagtatacaaacaacggaaat
caatttgacttggattcaaatcttaaaaatgcaaacaaattatagtaaataattcaaaca
aattaagctaattagaactagaataatcagaattaaggattttcattttaaaaaaaatac
aagtcttagccataaaacgtacaataatttaaataaattaaagaacaagattcctataat
aaagaaaataaagataacactactcctacaaatattttagagtagatataagaaggaaaa
taagagtatagagaaaacaccattttctagaaatttaagagttatgttgagaaattcaga
agtgttttttctaaaaaaaggggtgagtaaaaaaattaaaaaccctaaaacaaacaaatt
caaattattgaaattacttaactgccaaagttaagaaataataaaataaataccattcaa
aataacgaaacccaacatgttcaaagtcagtattactaaaagtatagaaaatctccaagt
agcaatataaaattgcataaaagatctaaaaatatttcctaaataaatagaaaaagaagt
taactaagctcaaaagaatataattattctaagcctaatttgctattttaaaatacccta
aataattctaataaatataccaaacaaattattaactcctctgctcaaaattcatttaat
tagataaatgccaataaaagctataaataataaggctctatccatcattttaattatttg
tctggcaattctagttttggaactaattaaattaatttaagttaaaaataaaaattatat
ttcataaactaataaataagttaaaaccatgagtaatagcaaaagagtttgagtatttag
atctcaaaaataaaaaaaaattacaacgatgaataaatttctcgaaatatatttccttag
agtattcttgattgtttcttggctctttaataatcagagctattgtatttaaagggagag
tattataaagcagcataactgctaacttaacagttgtaagatgaagaactttatttataa
catttaagacataaaagacttttgatgctccaaaaaatattttatagagcagatattcaa
aatatataattagacaaaatgataaaaaatcaaatgcataattatatttttaaaatttaa
tttgtttcaaattgcagagacagctaatctctttcgagatcatttgaattgatcaatgac
attttctatgagattttaaagtaagacctagactaactagggctcgttacttataattat
gatgaaaaatgctactgctaagaactataaatgacttaatatgcttagcttaaattatct
aatagttcatttatagataatttattgatatctgtattttaaaagtcttcaagtaataaa
aacataaataatgattttaaaaacctaaaaataaccaaatgtattagttactaaaattaa
gaaggacaaataaagtaggatcctaagaattctttctaaagttaggctaattattaggaa
tctctttaaagtgaatcgaataaccatgaaaaggaaaatattttcaaataataattgtag
aataaaacaaaattacagtaaccttattaagctgatagcatctttgaaaacctatttcat
aaataagactcataaaaaaataattaaatgcatattagtaatttagaattctaggactta
taaataaatactttcacaaattagaaaaattaaaatgaatagactctaggcaatacttaa
attatttagaatagtgtttataatacaaatgaattgaaatcaataaattaattatacgac
aactagaaaacattttagcaattacaaaataaacaaaaacttttagatgaaaactattaa
gattaaagtttagcaaatatgagcatttatagtaatttacttaattaaaaaaacagaagg
taaagtaataaactgcttttaaattaagtaactaaagaagctaaagatcttaatattata
aataactctaatcgtggatgttttaaagatgatgagtactctgcagcaacgtttaaaaat
caaaaaagtaactttttcaacgactacgaagatctaaatgatttttagtagctagttagt
aaataagaattgttccaagattctttttccaataatttatactccccaatcaaaattgat
tccccatttgagtaatagaaaaattaaaaaccataaatattttttggatcaagcgttaaa
gaagaagcacactaataaatttttagaaatcaaacagttgcttaaacttttgaaaaaaat
agttcaaatttataaaaattagatgttgatttgatagttaatgcagcataaaaaaatgct
tatcaaatctaggatgcttagtctaaaattgaatcagctcgttcaagtataaattattag
gtatcaccaccaaatattagaaaagcagagtctttcttatatgtctaatagcctattgat
agtttagaataaacaaacaaataacaataaatcgattcttaataaaaactgagcttattt
tctaaatagtagaacctataaaaaacaaactatttggagcaccaatcctaaataaattag
aattctattaatccaaattaggttacatcatctattgaaaagtaaaagcttattgaataa
attaaaaagaaatcattaagcttacaaaaacaaaaatctaatccttacaaattaaatact
aacaatcattaataaaatttaattataaatgacttgtctcaagaataaacagaataagac
gattcattttttagtaatataaacgaaagcaaagtagaataatcttttagtgttagtagc
taacttaatacatacgataaataaagccaaattaaaagtcccataagttaaagagctaaa
ccattaaaataaatgaatgtaaacttaaaaaaaataaattcattgcaaaatttctaggat
tattctagttaatcataataagtaaattaaaatgatatttaaagcaaataatctaacaat
ataaacgaagataaaaacagtatttaaatatataaaagaaacctgtttagaagactttct
gtttaatcttaccattaaaaatagtaaatttttaaaagggaaagctactcattaacacca
accagtaataaaaactatatactataagaatttaacagaaataatgcaaatacaaatgta
taatcgtatgaacattaataataaaattcaagtgaaaattaatagtttttgaatctacca
taatcaccatgctttttaacttttcctcaaagctccaatcatcttgaaagctaaagcaaa
attgactaaagagttcttaaagattacaaaaataaccaaccctaaattaaaatgcaatca
aatgaagacaaataattccatttaggtatgtaaaaggccatcgtatctttattgtaatct
aataatgaaaactaaacatacaattttataaagtcaaagtttgagtttaattagtgcata
agcaaagtagaaaaataaaaaatcactttaaaaaagcaatgcgaaagtccaaaatagaaa
tttcaataataaaagtaaaattcagaaagttaatttacccatcaatatttaacagaccaa
gtagctataagtgtaaagaagtttatcatatttgccacagattaaaattaaatagattaa
aatactgaaatgtattctaaattatgctaaatgctgtataatagcgagatagaacttctt
atacttcaattaaatagctaagactctgtgaatgagacatcaatagactcagattcatac
tattaataaaagtgtgtcattaaatttttcttttcctcaaataaattactataatatata
tattcataaagatcaaatttcaatgtaaacttactaccgcttattatagagcatttttaa
acgaccttcttgtttgtatttcttttctga
DBGET
integrated database retrieval system